单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5661 - 5680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5661 | 2025-10-06 |
A protocol for acquiring high-quality single-cell multi-omics data from human peripheral blood
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103430
PMID:39488839
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研究论文 | 本文提出了一种从人外周血获取高质量单细胞多组学数据的实验方案 | 开发了改进的单细胞多组学样本处理方法，整合了单细胞测序、全基因组测序以及代谢组和蛋白质组分析 | NA | 建立获取高质量单细胞多组学数据的标准化实验流程 | 人外周血单个核细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞测序, 全基因组测序, 代谢组分析, 蛋白质组分析 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5662 | 2025-10-06 |
Protocol for Xenium spatial transcriptomics studies using fixed frozen mouse brain sections
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103420
PMID:39535916
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研究论文 | 本文介绍了使用固定冷冻小鼠脑切片进行Xenium空间转录组学研究的实验方案 | 证明了除10x Genomics验证的FFPE和新鲜冷冻切片外，固定冷冻薄脑切片也与Xenium平台兼容，并提供优异的成像和定量结果 | NA | 开发适用于Xenium平台的空间转录组学实验方案 | 小鼠脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium分析仪 |
| 5663 | 2025-10-06 |
Protocol for using scCURE to construct an immunotherapy outcome prediction model
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103476
PMID:39661506
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研究论文 | 介绍使用scCURE构建免疫治疗结果预测模型的协议 | 开发了基于单细胞RNA测序的scCURE方法，通过识别免疫治疗期间变化和未变化的细胞来构建预测模型 | NA | 构建免疫治疗结果预测模型 | 癌症患者 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | scCURE | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5664 | 2025-10-06 |
Profiling low-mRNA content cells in complex human tissues using BD Rhapsody single-cell analysis
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103475
PMID:39661509
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研究论文 | 本文介绍了一种使用BD Rhapsody单细胞分析平台高效回收低mRNA含量免疫细胞的实验方案 | 开发了针对前列腺、肺和肝组织的优化组织解离方案，结合Sample Tag抗体标记技术，显著提高了低mRNA含量免疫细胞的回收效率 | 仅针对特定组织类型（前列腺、肺、肝）进行了验证，未涉及其他组织类型 | 解决单细胞RNA测序中低mRNA含量免疫细胞难以成功回收的技术难题 | 人类前列腺、肺和肝组织中的低mRNA含量免疫细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | BD Biosciences | single-cell RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统，采用微孔板单细胞捕获技术 |
| 5665 | 2025-10-06 |
SRSF2 is essential for maintaining pancreatic beta-cell identity and regulating glucose homeostasis in mice
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119845
PMID:39265887
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研究论文 | 本研究揭示了剪接因子SRSF2在维持小鼠胰腺β细胞特性和调节葡萄糖稳态中的关键作用 | 首次发现SRSF2缺失会导致β细胞从适应性阶段向适应不良阶段转变，并丧失细胞特性 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究SRSF2对胰腺β细胞存活和葡萄糖稳态的影响 | 小鼠胰腺β细胞和Min6细胞系 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 10月龄SRSF2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5666 | 2025-10-06 |
Concerted transcriptional regulation of the morphogenesis of hypothalamic neurons by ONECUT3
2024-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52762-z
PMID:39366958
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子ONECUT3通过调控NAV2基因影响下丘脑神经元极化和形态发生的分子机制 | 首次发现ONECUT3在脊椎动物下丘脑神经元分化中的作用，并证明其通过NAV2调控神经元形态发生的保守机制 | 研究主要聚焦于特定神经元亚型，机制在其他神经元类型中的普适性需要进一步验证 | 探究ONECUT3转录因子在下丘脑神经元形态发生中的调控作用 | 脊椎动物下丘脑神经元、C. elegans神经系统 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 功能获得实验, siRNA敲低, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | 新生小鼠, C. elegans模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5667 | 2025-10-06 |
The lncRNA SNHG26 drives the inflammatory-to-proliferative state transition of keratinocyte progenitor cells during wound healing
2024-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52783-8
PMID:39366968
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA SNHG26在皮肤伤口愈合过程中驱动角质形成细胞前体细胞从炎症状态向增殖状态转变的关键作用 | 首次发现SNHG26通过调控转录因子ILF2的基因组定位，促进角质形成细胞前体细胞的炎症-增殖状态转换 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人类临床验证方面仍需进一步研究 | 探索皮肤伤口愈合过程中炎症相向增殖相转变的分子机制 | 角质形成细胞前体细胞 | 分子生物学 | 皮肤创伤 | 单细胞转录组分析、功能获得和功能缺失实验 | NA | 转录组数据 | Snhg26缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5668 | 2025-10-06 |
Trophoblast Side-Population Markers are Dysregulated in Preeclampsia and Fetal Growth Restriction
2024-10, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10764-w
PMID:39028417
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研究论文 | 本研究表征了人类胎盘中滋养细胞侧群标志物在先兆子痫和胎儿生长受限中的表达特征 | 首次在胎盘功能不全疾病中系统表征了8个滋养细胞侧群标志物的表达模式及其在滋养细胞分化过程中的动态变化 | 样本量相对有限，部分标志物在体外分化模型中表达水平较低或无法检测 | 探讨滋养细胞侧群标志物在胎盘功能不全疾病中的表达异常及其病理意义 | 人类胎盘组织、滋养细胞干细胞分化模型 | 发育生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组测序、免疫组织化学、实时荧光定量PCR | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | 胎盘组织切片n=3，体外分化实验n=5，临床胎盘样本n=126（先兆子痫78例，FGR 30例，对照组18例） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5669 | 2025-10-06 |
Suppression of GATA3 promotes epithelial-mesenchymal transition and simultaneous cellular senescence in human extravillous trophoblasts
2024-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119768
PMID:38838858
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研究论文 | 本研究探讨转录因子GATA3在早期妊娠胎盘绒毛外滋养细胞分化成熟过程中的调控机制及其与妊娠疾病的关系 | 首次揭示GATA3在调控上皮-间质转化和细胞衰老中的双重作用，并发现复发性流产患者中GATA3定位异常 | 研究主要基于细胞系模型，需要更多原代细胞和体内实验验证 | 阐明GATA3在绒毛外滋养细胞分化成熟过程中的调控机制 | 人类绒毛外滋养细胞、JEG3和HTR8/SVneo细胞系、胎盘类器官模型 | 单细胞生物学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种细胞模型和胎盘组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5670 | 2025-10-06 |
Protocol for optimized nasal mucosa sample processing to obtain high-quality scRNA-seq and scATAC-seq data
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103298
PMID:39244757
|
研究论文 | 提出优化的人类鼻黏膜样本处理流程，用于同时获取高质量单细胞转录组和表观基因组数据 | 开发了能够同时获得高质量scRNA-seq和scATAC-seq数据的鼻黏膜样本处理协议 | NA | 优化鼻黏膜样本处理流程以提高单细胞测序数据质量 | 人类鼻黏膜组织 | 单细胞测序技术 | 鼻腔疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 5671 | 2025-10-06 |
Single-cell Profiling of Reprogrammed Human Neural Stem Cells Unveils High Similarity to Neural Progenitors in the Developing Central Nervous System
2024-07, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10698-3
PMID:38519702
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示重编程人类神经干细胞与发育早期中枢神经系统神经祖细胞的高度相似性 | 首次在单细胞水平系统比较重编程iNSCs与生理状态下神经祖细胞的转录组特征 | 研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限 | 评估直接重编程的人类iNSCs与生理神经祖细胞的相似性 | 重编程的人类神经干细胞(iNSCs) | 单细胞生物学 | 神经系统发育 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5672 | 2025-10-06 |
Olfactory neuroblastoma mimics molecular heterogeneity and lineage trajectories of small-cell lung cancer
2024-Jun-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.05.003
PMID:38788720
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研究论文 | 本研究通过建立遗传工程小鼠模型，揭示了嗅觉神经母细胞瘤与正常嗅觉上皮发育轨迹相似的细胞命运异质性，及其与小细胞肺癌在分子特征上的保守相似性 | 首次建立高级别转移性嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型，发现其细胞命运异质性模拟正常球状基底细胞发育轨迹，并揭示与小细胞肺癌相似的分子异质性特征 | 研究基于小鼠模型，人类肿瘤的验证仍需进一步临床研究 | 探究嗅觉神经母细胞瘤的细胞起源和分子异质性特征 | 嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型和人类肿瘤样本 | 癌症生物学 | 嗅觉神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序,基于条形码的谱系追踪 | 遗传工程小鼠模型 | 转录组数据 | 小鼠模型和人类肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5673 | 2025-10-06 |
CACIMAR: cross-species analysis of cell identities, markers, regulations, and interactions using single-cell RNA sequencing data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae283
PMID:38856169
|
研究论文 | 开发了名为CACIMAR的工具，用于跨物种分析单细胞RNA测序数据中的细胞身份、标记基因、调控网络和细胞间相互作用 | 基于保守特征的加权和模型开发了多种保守性评分，能够同时分析细胞类型、调控网络和细胞间相互作用的保守性 | NA | 开发跨物种单细胞RNA测序数据分析工具，揭示细胞和分子层面的进化保守性 | 小鼠、斑马鱼和鸡的视网膜再生单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权和模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5674 | 2025-10-06 |
Microglial polarization pathways and therapeutic drugs targeting activated microglia in traumatic brain injury
2026-01-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00810
PMID:39665832
|
综述 | 本文综述了创伤性脑损伤中小胶质细胞的极化通路及靶向活化小胶质细胞的治疗药物 | 系统阐明TLR4/NF-κB、MAPK、JAK/STAT、PI3K/Akt、Notch和HMGB1等小胶质细胞极化通路，并综述基于这些通路的药物和细胞替代治疗新策略 | 药物和间充质干细胞治疗策略仍存在诸多挑战需要解决 | 探讨创伤性脑损伤中小胶质细胞的极化机制及靶向治疗策略 | 小胶质细胞及其在创伤性脑损伤中的极化过程 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5675 | 2025-10-06 |
Changes in border-associated macrophages after stroke: Single-cell sequencing analysis
2026-01-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01092
PMID:39927762
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示脑卒中后边界相关巨噬细胞的动态变化及其在神经炎症中的作用 | 首次对脑卒中后边界相关巨噬细胞进行全面的单细胞转录组分析，发现Stat3信号通路激活并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据库数据，人类样本验证不足 | 探究脑卒中后边界相关巨噬细胞的转录变化及其在神经炎症中的作用机制 | 小鼠边界相关巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | pySCENIC, CellChat | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的两个数据集(GSE174574和GSE225948) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5676 | 2025-10-06 |
Progress in single-cell sequencing of retinal vein occlusion or ischemic hypoxic retinopathy
2025-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110436
PMID:40414336
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变研究中的最新进展 | 整合了单核RNA测序、空间转录组学和多组学方法，增强对视网膜反应的空间和时间图谱绘制 | 样本保存、视网膜细胞类型注释和跨物种翻译等挑战尚未完全解决 | 探讨单细胞测序技术在视网膜血管疾病研究中的应用进展 | 视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变 | 数字病理学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5677 | 2025-10-06 |
Targeting SPP1+ macrophages via the SPP1-CD44 axis reveals a key mechanism of immune suppression and tumor progression in ovarian cancer
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114906
PMID:40446696
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动卵巢癌免疫抑制和T细胞耗竭 | 首次识别SPP1+TAM亚群在卵巢癌中的关键作用，揭示SPP1-CD44轴是免疫抑制的主要介质，并发现尼洛替尼作为潜在SPP1抑制剂 | 研究主要基于单细胞测序数据分析，需要更多临床验证 | 探究卵巢癌肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞介导免疫抑制的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本和Jurkat细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞测序，分子对接，分子动力学模拟，功能验证实验 | NA | 单细胞测序数据，实验数据 | 六个HGSOC单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5678 | 2025-10-06 |
Mefunidone treats pulmonary fibrosis by targeting SDH to regulate fibro-promoting macrophages
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114971
PMID:40449267
|
研究论文 | 本研究揭示美氟尼酮通过靶向琥珀酸脱氢酶调控促纤维化巨噬细胞表型治疗肺纤维化的新机制 | 首次发现美氟尼酮通过结合并抑制SDH活性减少琥珀酸生成，进而抑制MMP12+CCL2+促纤维化巨噬细胞转化 | 研究主要基于博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型，临床转化价值需进一步验证 | 阐明美氟尼酮治疗肺纤维化的分子靶点及作用机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型及巨噬细胞 | 单细胞测序 | 肺纤维化 | 单细胞测序，组织病理学检查，体外验证 | 动物疾病模型 | 单细胞测序数据，组织病理图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5679 | 2025-10-06 |
Multi-omics identifies OSM-OSMR as a key receptor-ligand in the tumor environment of endometrial adenocarcinoma
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114933
PMID:40450916
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OSM-OSMR是子宫内膜腺癌肿瘤微环境中的关键受体-配体对，并构建了七基因预后模型 | 首次系统识别OSM-OSMR在子宫内膜腺癌中的关键作用，并建立基于随机生存森林的七基因预后特征模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索肿瘤细胞与其他细胞间的配体-受体关系并构建预后模型 | 子宫内膜腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 子宫内膜腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据,临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 5680 | 2025-10-06 |
Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β
2025-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017
PMID:40359720
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研究论文 | 本研究探讨连翘酯苷通过抑制GSK-3β信号通路缓解脓毒症相关急性肺损伤的机制 | 首次通过多组学分析发现连翘酯苷与GSK-3β的稳定结合，并系统阐明其通过调控巨噬细胞极化改善急性肺损伤的作用机制 | 机制研究主要聚焦于GSK-3β信号通路，可能存在其他未被发现的调控途径 | 阐明连翘酯苷治疗脓毒症相关急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的分子机制 | 巨噬细胞、斑马鱼、小鼠模型 | 分子药理学 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 | 分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化分析、单细胞测序、体内外实验验证 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、分子模拟数据 | 从公共数据库筛选8331个ALI/ARDS相关靶基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |