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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5621 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.028
PMID:39084404
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研究论文 | 通过单细胞测序构建人牙龈单细胞图谱,揭示NETs相关中性粒细胞亚群在牙周免疫中的调控作用 | 首次在牙周炎中发现并鉴定NETs相关中性粒细胞亚群(NrNeu),揭示牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴促进NETs产生的调控机制 | NA | 阐明NETs在牙周免疫病理中的具体功能和机制 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,伪时间分析,细胞间通讯分析 | 六种机器学习方法构建的预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5622 | 2025-10-06 |
RNA modification gene WDR4 facilitates tumor progression and immunotherapy resistance in breast cancer
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.029
PMID:38960276
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研究论文 | 本研究基于RNA修饰相关基因开发了RMscore评分系统,用于预测乳腺癌患者的治疗反应和生存结局 | 首次整合13种RNA修饰模式相关基因建立九基因标志物,并发现WDR4通过m7G修饰调控细胞周期和mTORC1信号通路 | NA | 探索RNA修饰相关基因在乳腺癌中的临床价值并建立治疗反应预测策略 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 批量转录组分析、单细胞转录组分析、基因组学分析、流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光染色 | 基因特征评分模型 | 转录组数据、基因组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5623 | 2025-10-06 |
Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.029
PMID:39107200
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶通过CDK6/ID2轴促进Th17细胞分化和致病性在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 首次发现HDACs通过CDK6/ID2正反馈环路调控Th17细胞分化和致病性的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,临床样本验证相对有限 | 探究组蛋白去乙酰化酶在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用 | 自身免疫性葡萄膜炎患者外周血单核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,siRNA敲低,特异性抑制剂,过继转移实验 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | AU患者PBMCs和EAU小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5624 | 2025-10-06 |
ST6GALNAC1-mediated sialylation in uterine endometrial epithelium facilitates the epithelium-embryo attachment
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.021
PMID:39111624
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研究论文 | 本研究揭示了ST6GALNAC1介导的子宫内膜上皮细胞唾液酸化通过sTn-Siglecs轴促进胚胎附着的分子机制 | 首次证实ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎植入过程中的关键作用,并鉴定CD44作为sTn修饰的关键载体蛋白 | 研究主要基于细胞模型和小鼠实验,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎植入过程中的作用机制 | 人类和小鼠子宫内膜、胚胎、AN3CA细胞系、JAR细胞球 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 免疫组织化学、体外植入模型、免疫沉淀-质谱分析、单细胞RNA测序、蛋白互作检测、免疫荧光染色 | NA | 图像、测序数据、蛋白质互作数据 | 人类和小鼠子宫内膜组织、细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5625 | 2025-10-06 |
Interrogating mediators of single-cell transcriptional changes in the acute damaged cerebral cortex: Insights into endothelial-astrocyte interactions
2025-Jun, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2025.104003
PMID:40090391
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究内皮细胞EphA4在脑损伤后调控星形胶质细胞转录组变化的作用机制 | 首次揭示内皮细胞特异性敲除EphA4可通过影响星形胶质细胞基因表达和亚群分布促进神经保护反应 | 研究基于实验性TBI模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究脑损伤后细胞特异性转录变化的介导机制 | 大脑皮层中的内皮细胞和星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5626 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis based on IFN-γ and SASP related genes, bulk RNA and single-cell sequencing to evaluate the prognosis and immune landscape of stomach adenocarcinoma
2025-Jun, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01646-7
PMID:40293675
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研究论文 | 基于IFN-γ和SASP相关基因开发胃腺癌预后风险模型并评估免疫景观 | 首次结合IFN-γ和衰老相关分泌表型相关基因对胃腺癌进行分子分型,并整合bulk RNA和单细胞测序数据构建预后模型 | 数据主要来源于TCGA数据库,需要外部验证 | 识别胃腺癌分子亚型并开发预后风险模型 | 胃腺癌患者 | 生物信息学 | 胃腺癌 | Cox回归分析, LASSO回归分析, 非负矩阵分解, 单细胞测序, bulk RNA测序 | 预后风险模型 | 基因组数据, 临床数据, 单细胞数据 | TCGA数据库中的胃腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
5627 | 2025-10-06 |
One probe fits all: a highly customizable modular RNA in situ hybridization platform expanding the application of SABER DNA probes
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204775
PMID:40446186
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研究论文 | 开发了一种高度可定制的模块化RNA原位杂交平台OneSABER,扩展了SABER DNA探针的应用 | 创建统一开放平台连接多种常用和新开发的原位杂交方法,使用单一类型DNA探针实现信号扩增 | NA | 开发通用型RNA原位杂交平台以简化实验流程并降低研究成本 | 再生性扁虫Macrostomum lignano和Schmidtea mediterranea的整体样本,以及福尔马林固定石蜡包埋的小鼠肠道切片 | 分子生物学 | NA | RNA原位杂交,信号扩增交换反应 | NA | 图像数据 | 多种生物样本包括扁虫和小鼠组织 | NA | RNA原位杂交,单重和多重检测,比色和荧光检测 | OneSABER平台 | 基于SABER方法的模块化DNA探针系统,支持多种信号检测技术 |
5628 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Defines N7-Methylguanosine (m7G)-Mediated Modifications' Role in Prognosis and the Tumor Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70992
PMID:40485623
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析,揭示m7G修饰在肝细胞癌预后和肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次系统分析m7G修饰模式与肝细胞癌免疫微环境的关系,并建立m7Gscore评分系统 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索m7G修饰在肝细胞癌预后和免疫治疗反应中的作用机制 | 肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, ssGSEA, GSVA, 主成分分析, 蛋白质印迹, 免疫组化, RT-qPCR | 无监督聚类, 主成分分析 | 转录组数据, 蛋白质数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的多个肝细胞癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
5629 | 2025-10-06 |
Long Noncoding RNA Interleukin 6 Antisense RNA 1 Promotes Inflammatory Effects in Lung Macrophages via Exosomes Through the S100A9/TLR4 Pathway in Chronic Obstructive Pulmonary Disease Progression
2025-Jun, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70204
PMID:40487749
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研究论文 | 探讨长链非编码RNA IL6-AS1通过外泌体和S100A9/TLR4通路在慢性阻塞性肺疾病进展中促进肺部炎症的作用机制 | 首次揭示IL6-AS1通过外泌体介导的S100A9/TLR4通路促进成纤维细胞与巨噬细胞间通讯,加剧COPD肺部炎症 | 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养系统,人类样本验证相对有限 | 阐明IL6-AS1在COPD发病机制中的具体作用机制 | 小鼠模型、COPD患者样本、肺成纤维细胞-巨噬细胞共培养系统 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型和COPD患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5630 | 2025-10-06 |
scEVE: a single-cell RNA-seq ensemble clustering algorithm capitalizing on the differences of predictions between multiple clustering methods
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf073
PMID:40491972
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研究论文 | 开发了一种名为scEVE的单细胞RNA测序集成聚类算法,通过利用多种聚类方法预测差异而非最小化差异来改进细胞群体识别 | 提出了一种新的集成聚类方法,通过描述聚类结果之间的差异而不是最小化差异,能够生成具有不确定性值和多分辨率的聚类结果 | NA | 开发改进的单细胞RNA测序集成聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成聚类算法 | 基因表达数据 | 15个实验数据集和最多1200个合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5631 | 2025-10-06 |
BPIFB1 is a prognostic biomarker and mediated collagen synthesis in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-May-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042671
PMID:40441200
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研究论文 | 本研究探讨BPIFB1在特发性肺纤维化中的表达特征及其与肺功能和胶原合成的关联 | 首次发现BPIFB1在IPF中高表达于分化纤毛细胞和MUC5B阳性细胞,并揭示其与肺功能负相关及参与胶原合成的分子机制 | 血液BPIFB1表达在对照组和IPF组间无显著差异,具体分子通路机制仍需进一步实验验证 | 阐明BPIFB1在特发性肺纤维化中的预后价值和分子功能 | 特发性肺纤维化患者样本和基因表达数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,转录组分析,功能富集分析 | Cox回归,Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据,临床样本数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的IPF样本数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
5632 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals an immune microenvironment and JUN-mediated NK cell exhaustion in relapsed T-ALL
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102098
PMID:40306275
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示复发T-ALL的免疫微环境特征及JUN介导的NK细胞耗竭机制 | 首次在复发T-ALL中发现JUN是NK细胞耗竭的关键因子,并证实JUN抑制剂可同时杀伤白血病细胞和改善NK细胞功能 | 研究样本量有限,需进一步验证临床疗效 | 解析T-ALL复发机制并探索免疫治疗新策略 | T细胞急性淋巴细胞白血病患者骨髓免疫微环境 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | CDX/PDX小鼠模型、NOTCH1突变小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | T-ALL患者骨髓样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5633 | 2025-10-06 |
Low T cell diversity associates with poor outcome in bladder cancer: A comprehensive longitudinal analysis of the T cell receptor repertoire
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102101
PMID:40315845
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研究论文 | 本研究通过纵向分析膀胱癌患者的T细胞受体库,发现低T细胞多样性与不良预后相关 | 首次在膀胱癌中系统分析TCR多样性的临床意义,并发现高扩增克隆与细胞毒性T细胞的关联 | 样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探讨T细胞受体库多样性在膀胱癌中的临床意义 | 膀胱癌患者 | 免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
5634 | 2025-10-06 |
Targeting mitochondrial complex I of CD177+ neutrophils alleviates lung ischemia-reperfusion injury
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102140
PMID:40398393
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学识别CD177+中性粒细胞在肺缺血再灌注损伤中的关键作用,并探索线粒体复合物I抑制剂的治疗潜力 | 首次发现CD177+中性粒细胞亚群通过线粒体复合物I驱动肺损伤,并验证其作为原发性移植物功能障碍早期生物标志物的价值 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探究中性粒细胞亚群在肺缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗靶点 | 小鼠肺缺血再灌注损伤模型、大鼠左肺移植模型、人类肺移植受者 | 数字病理学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
5635 | 2025-10-06 |
Simvastatin inhibits proliferation and migration, promotes oxidative stress and ferroptosis in colon cancer
2025-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i5.104522
PMID:40487942
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研究论文 | 本研究探讨辛伐他汀通过调控SERPINE1和cGMP/PKG信号通路抑制结肠癌细胞增殖迁移并促进氧化应激和铁死亡的机制 | 首次揭示辛伐他汀通过下调SERPINE1激活cGMP/PKG通路诱导铁死亡的新机制 | 仅进行体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 研究辛伐他汀对结肠癌细胞功能的影响及其作用机制 | NCM460、HCT-116和SW620结肠癌细胞系 | 癌症研究 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、实时PCR、Western blot、流式细胞术、Transwell实验 | 细胞系模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 三种结肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5636 | 2025-10-06 |
Exploring the potential function of high expression of ANAPC1 in regulating ubiquitination in hepatocellular carcinoma
2025-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i5.103594
PMID:40487972
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研究论文 | 本研究探讨ANAPC1在肝细胞癌中通过泛素化途径调控细胞周期和代谢水平的潜在功能 | 首次整合多种数据源全面研究ANAPC1在肝细胞癌中的表达及其通过泛素化途径的调控机制 | 研究主要基于细胞系和测序数据,缺乏体内实验验证 | 阐明ANAPC1在肝细胞癌中的表达及其与泛素化相关的潜在调控机制 | 肝细胞癌组织样本和JHH2等肝癌细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、微阵列、免疫组化、单细胞RNA测序、CRISPR基因敲除 | NA | RNA测序数据、微阵列数据、免疫组化图像、单细胞RNA测序数据 | 多种肝细胞癌组织和细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
5637 | 2025-10-06 |
Expression of Immune-Related Genes and Possible Regulatory Mechanisms in Chronic Antibody-Mediated Rejection after Kidney Transplantation
2025-May, Archivos espanoles de urologia
IF:0.6Q4
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析慢性抗体介导排斥反应患者外周血单核细胞中免疫相关基因的表达模式和调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统分析cABMR患者外周血单核细胞与肾脏组织中免疫相关基因的共同表达特征及关键转录因子 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源有限 | 阐明肾脏移植后慢性抗体介导排斥反应中免疫相关基因的表达模式和潜在调控机制 | 慢性抗体介导排斥反应患者的外周血单核细胞和肾脏组织 | 生物信息学 | 肾脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | AUCell软件包, STRING数据库分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
5638 | 2025-10-06 |
The Lung Is Not a Primary Site of Platelet Biogenesis
2025-Apr-30, Physiological research
IF:1.9Q3
PMID:40432441
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研究论文 | 本研究通过多物种实验验证肺脏是否为血小板生成的主要场所 | 首次通过跨物种比较(人类、小鼠、大鼠、兔子)系统评估肺脏血小板生成能力,结合血液参数分析、免疫组化和单细胞RNA测序技术 | 样本量有限,物种间差异可能影响结论的普适性 | 探究肺脏在血小板生物发生中的主要作用 | 人类、小鼠、大鼠、兔子的血小板和巨核细胞 | 生物医学研究 | 血液系统疾病 | 自动血液分析仪检测、免疫组织化学染色、单细胞RNA测序 | NA | 血液参数数据、组织染色图像、基因表达数据 | 人类124例、大鼠39例、兔子38例、小鼠未明确数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5639 | 2025-10-06 |
Nintedanib improves bleomycin-induced pulmonary fibrosis by inhibiting the Clec7a/SPP1 pathway in interstitial macrophages
2025-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111635
PMID:39892726
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和RNA-seq数据分析,揭示了尼达尼布通过抑制间质巨噬细胞中Clec7a/SPP1通路改善肺纤维化的新机制 | 首次发现尼达尼布通过抑制间质巨噬细胞中Clec7a来阻断NFκB/SPP1促纤维化通路的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证该机制 | 探索尼达尼布治疗特发性肺纤维化的精确作用机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞测序,RNA-seq | Monocle2,Cellchat,Scenic | 基因表达数据 | 纤维化和尼达尼布治疗的纤维化小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
5640 | 2025-10-06 |
Functional analysis of yak alveolar type II epithelial cells at high and low altitudes based on single-cell sequencing
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119889
PMID:39681250
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研究论文 | 基于单细胞测序技术研究高海拔和低海拔牦牛肺泡II型上皮细胞的功能差异 | 首次构建牦牛肺组织单细胞图谱,揭示AEC II在高海拔环境下的免疫调节、粘附和代谢活性增强机制 | 样本量有限,仅比较了两个海拔高度(4000米和2600米)的牦牛 | 探究牦牛肺泡II型上皮细胞对高海拔低氧环境的适应机制 | 高海拔(4000米)和低海拔(2600米)牦牛的肺泡II型上皮细胞 | 单细胞生物学 | 高原适应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海拔高度的牦牛肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序技术 |