单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5621 - 5640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5621 | 2025-10-06 |
Long Noncoding RNA Interleukin 6 Antisense RNA 1 Promotes Inflammatory Effects in Lung Macrophages via Exosomes Through the S100A9/TLR4 Pathway in Chronic Obstructive Pulmonary Disease Progression
2025-Jun, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70204
PMID:40487749
|
研究论文 | 探讨长链非编码RNA IL6-AS1通过外泌体和S100A9/TLR4通路在慢性阻塞性肺疾病进展中促进肺部炎症的作用机制 | 首次揭示IL6-AS1通过外泌体介导的S100A9/TLR4通路促进成纤维细胞与巨噬细胞间通讯，加剧COPD肺部炎症 | 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养系统，人类样本验证相对有限 | 阐明IL6-AS1在COPD发病机制中的具体作用机制 | 小鼠模型、COPD患者样本、肺成纤维细胞-巨噬细胞共培养系统 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型和COPD患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5622 | 2025-10-06 |
scEVE: a single-cell RNA-seq ensemble clustering algorithm capitalizing on the differences of predictions between multiple clustering methods
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf073
PMID:40491972
|
研究论文 | 开发了一种名为scEVE的单细胞RNA测序集成聚类算法，通过利用多种聚类方法预测差异而非最小化差异来改进细胞群体识别 | 提出了一种新的集成聚类方法，通过描述聚类结果之间的差异而不是最小化差异，能够生成具有不确定性值和多分辨率的聚类结果 | NA | 开发改进的单细胞RNA测序集成聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成聚类算法 | 基因表达数据 | 15个实验数据集和最多1200个合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5623 | 2025-10-06 |
BPIFB1 is a prognostic biomarker and mediated collagen synthesis in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-May-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042671
PMID:40441200
|
研究论文 | 本研究探讨BPIFB1在特发性肺纤维化中的表达特征及其与肺功能和胶原合成的关联 | 首次发现BPIFB1在IPF中高表达于分化纤毛细胞和MUC5B阳性细胞，并揭示其与肺功能负相关及参与胶原合成的分子机制 | 血液BPIFB1表达在对照组和IPF组间无显著差异，具体分子通路机制仍需进一步实验验证 | 阐明BPIFB1在特发性肺纤维化中的预后价值和分子功能 | 特发性肺纤维化患者样本和基因表达数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,转录组分析,功能富集分析 | Cox回归,Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据,临床样本数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的IPF样本数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 5624 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals an immune microenvironment and JUN-mediated NK cell exhaustion in relapsed T-ALL
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102098
PMID:40306275
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示复发T-ALL的免疫微环境特征及JUN介导的NK细胞耗竭机制 | 首次在复发T-ALL中发现JUN是NK细胞耗竭的关键因子，并证实JUN抑制剂可同时杀伤白血病细胞和改善NK细胞功能 | 研究样本量有限，需进一步验证临床疗效 | 解析T-ALL复发机制并探索免疫治疗新策略 | T细胞急性淋巴细胞白血病患者骨髓免疫微环境 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | CDX/PDX小鼠模型、NOTCH1突变小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | T-ALL患者骨髓样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5625 | 2025-10-06 |
Low T cell diversity associates with poor outcome in bladder cancer: A comprehensive longitudinal analysis of the T cell receptor repertoire
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102101
PMID:40315845
|
研究论文 | 本研究通过纵向分析膀胱癌患者的T细胞受体库，发现低T细胞多样性与不良预后相关 | 首次在膀胱癌中系统分析TCR多样性的临床意义，并发现高扩增克隆与细胞毒性T细胞的关联 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探讨T细胞受体库多样性在膀胱癌中的临床意义 | 膀胱癌患者 | 免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5626 | 2025-10-06 |
Targeting mitochondrial complex I of CD177+ neutrophils alleviates lung ischemia-reperfusion injury
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102140
PMID:40398393
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学识别CD177+中性粒细胞在肺缺血再灌注损伤中的关键作用，并探索线粒体复合物I抑制剂的治疗潜力 | 首次发现CD177+中性粒细胞亚群通过线粒体复合物I驱动肺损伤，并验证其作为原发性移植物功能障碍早期生物标志物的价值 | 研究主要基于动物模型，人类临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探究中性粒细胞亚群在肺缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗靶点 | 小鼠肺缺血再灌注损伤模型、大鼠左肺移植模型、人类肺移植受者 | 数字病理学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5627 | 2025-10-06 |
Simvastatin inhibits proliferation and migration, promotes oxidative stress and ferroptosis in colon cancer
2025-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i5.104522
PMID:40487942
|
研究论文 | 本研究探讨辛伐他汀通过调控SERPINE1和cGMP/PKG信号通路抑制结肠癌细胞增殖迁移并促进氧化应激和铁死亡的机制 | 首次揭示辛伐他汀通过下调SERPINE1激活cGMP/PKG通路诱导铁死亡的新机制 | 仅进行体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 研究辛伐他汀对结肠癌细胞功能的影响及其作用机制 | NCM460、HCT-116和SW620结肠癌细胞系 | 癌症研究 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、实时PCR、Western blot、流式细胞术、Transwell实验 | 细胞系模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 三种结肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5628 | 2025-10-06 |
Exploring the potential function of high expression of ANAPC1 in regulating ubiquitination in hepatocellular carcinoma
2025-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i5.103594
PMID:40487972
|
研究论文 | 本研究探讨ANAPC1在肝细胞癌中通过泛素化途径调控细胞周期和代谢水平的潜在功能 | 首次整合多种数据源全面研究ANAPC1在肝细胞癌中的表达及其通过泛素化途径的调控机制 | 研究主要基于细胞系和测序数据，缺乏体内实验验证 | 阐明ANAPC1在肝细胞癌中的表达及其与泛素化相关的潜在调控机制 | 肝细胞癌组织样本和JHH2等肝癌细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、微阵列、免疫组化、单细胞RNA测序、CRISPR基因敲除 | NA | RNA测序数据、微阵列数据、免疫组化图像、单细胞RNA测序数据 | 多种肝细胞癌组织和细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5629 | 2025-10-06 |
Expression of Immune-Related Genes and Possible Regulatory Mechanisms in Chronic Antibody-Mediated Rejection after Kidney Transplantation
2025-May, Archivos espanoles de urologia
IF:0.6Q4
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析慢性抗体介导排斥反应患者外周血单核细胞中免疫相关基因的表达模式和调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，系统分析cABMR患者外周血单核细胞与肾脏组织中免疫相关基因的共同表达特征及关键转录因子 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源有限 | 阐明肾脏移植后慢性抗体介导排斥反应中免疫相关基因的表达模式和潜在调控机制 | 慢性抗体介导排斥反应患者的外周血单核细胞和肾脏组织 | 生物信息学 | 肾脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | AUCell软件包, STRING数据库分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5630 | 2025-10-06 |
The Lung Is Not a Primary Site of Platelet Biogenesis
2025-Apr-30, Physiological research
IF:1.9Q3
PMID:40432441
|
研究论文 | 本研究通过多物种实验验证肺脏是否为血小板生成的主要场所 | 首次通过跨物种比较（人类、小鼠、大鼠、兔子）系统评估肺脏血小板生成能力，结合血液参数分析、免疫组化和单细胞RNA测序技术 | 样本量有限，物种间差异可能影响结论的普适性 | 探究肺脏在血小板生物发生中的主要作用 | 人类、小鼠、大鼠、兔子的血小板和巨核细胞 | 生物医学研究 | 血液系统疾病 | 自动血液分析仪检测、免疫组织化学染色、单细胞RNA测序 | NA | 血液参数数据、组织染色图像、基因表达数据 | 人类124例、大鼠39例、兔子38例、小鼠未明确数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5631 | 2025-10-06 |
Nintedanib improves bleomycin-induced pulmonary fibrosis by inhibiting the Clec7a/SPP1 pathway in interstitial macrophages
2025-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111635
PMID:39892726
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和RNA-seq数据分析，揭示了尼达尼布通过抑制间质巨噬细胞中Clec7a/SPP1通路改善肺纤维化的新机制 | 首次发现尼达尼布通过抑制间质巨噬细胞中Clec7a来阻断NFκB/SPP1促纤维化通路的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证该机制 | 探索尼达尼布治疗特发性肺纤维化的精确作用机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞测序,RNA-seq | Monocle2,Cellchat,Scenic | 基因表达数据 | 纤维化和尼达尼布治疗的纤维化小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5632 | 2025-10-06 |
Functional analysis of yak alveolar type II epithelial cells at high and low altitudes based on single-cell sequencing
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119889
PMID:39681250
|
研究论文 | 基于单细胞测序技术研究高海拔和低海拔牦牛肺泡II型上皮细胞的功能差异 | 首次构建牦牛肺组织单细胞图谱，揭示AEC II在高海拔环境下的免疫调节、粘附和代谢活性增强机制 | 样本量有限，仅比较了两个海拔高度（4000米和2600米）的牦牛 | 探究牦牛肺泡II型上皮细胞对高海拔低氧环境的适应机制 | 高海拔（4000米）和低海拔（2600米）牦牛的肺泡II型上皮细胞 | 单细胞生物学 | 高原适应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海拔高度的牦牛肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序技术 |
| 5633 | 2025-10-06 |
Coupling of response biomarkers between tumor and peripheral blood in patients undergoing chemoimmunotherapy
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101882
PMID:39731918
|
研究论文 | 本研究通过分析接受化疗免疫治疗的间皮瘤患者肿瘤组织和外周血样本，揭示了治疗反应相关的生物标志物 | 首次将外周血单细胞RNA测序与肿瘤转录组数据相结合，发现CD8 T效应记忆细胞在应答者外周血中更丰富且治疗后扩增 | 单臂二期临床试验，样本量有限（N=54），需要更大规模研究验证 | 探索化疗免疫治疗在间皮瘤中的免疫学机制并寻找预测性生物标志物 | 间皮瘤患者 | 生物信息学 | 间皮瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, TCR-seq | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 54例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5634 | 2025-10-06 |
Innate immune cell barrier-related genes inform precision prognosis in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1559373
PMID:40486509
|
研究论文 | 本研究通过整合先天免疫细胞屏障相关基因和机器学习算法，开发了胰腺癌预后预测模型并发现新的治疗靶点 | 首次系统研究先天免疫细胞屏障相关基因在胰腺癌预后中的作用，开发了基于随机生存森林的CDRG-RSF预后模型，并鉴定出UBASH3B作为新的免疫抑制和耐药标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的临床应用价值 | 识别胰腺癌预后生物标志物，开发预测模型，发现个性化治疗新靶点 | 胰腺癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，功能富集分析，免疫浸润分析 | 随机生存森林(RSF)，14种机器学习算法 | 基因表达数据，临床生存数据 | TCGA和GTEx数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5635 | 2025-10-06 |
TSLP pretreatment inhibits M1 macrophage polarization and attenuates LPS-induced iNKT cell-dependent acute lung injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583235
PMID:40486522
|
研究论文 | 本研究探讨TSLP预处理通过抑制M1巨噬细胞极化和iNKT细胞依赖途径减轻LPS诱导的急性肺损伤 | 首次揭示TSLP在脓毒症相关ARDS中的保护作用机制，发现其通过调控iNKT细胞和巨噬细胞极化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究尚未完全阐明所有信号通路 | 探究TSLP在脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征中的作用机制 | 野生型小鼠、Jα18-/-基因敲除小鼠、骨髓源性巨噬细胞 | 免疫学 | 急性肺损伤/ARDS | 转录组测序、单细胞转录组测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5636 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals KRAS/TP53-Driven Neutrophil Reprogramming in Luad: A Multi-Gene Prognostic Model and Therapeutic Targeting of RHOV
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.062584
PMID:40486872
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了KRAS/TP53突变驱动的中性粒细胞重编程在肺腺癌中的作用，并开发了五基因预后模型 | 首次系统揭示KRAS/TP53突变通过OSM/CALCR/IL-1信号通路驱动中性粒细胞异质性重编程，建立首个中性粒细胞中心的五基因预后特征 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于细胞系模型，缺乏体内动物实验验证 | 阐明KRAS/TP53突变对肿瘤微环境异质性的影响，开发肺腺癌预后预测模型 | 肺腺癌患者样本、A549/H1299肺癌细胞系 | 生物信息学、癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、siRNA敲低、CCK8检测、伤口愈合实验、transwell实验 | hdWGCNA、Cox回归、LASSO回归、预后列线图 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、临床数据 | TCGA-LUAD队列、IMvigor210免疫治疗队列、GSE78220数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5637 | 2025-10-06 |
Topology entropy: Enhancing graph partitioning for TAD identification and single-cell clustering
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.04.037
PMID:40487196
|
研究论文 | 本文提出拓扑熵概念用于量化生物图复杂度，并开发了TEC-O和TEC-U两种图分区方法 | 首次将拓扑熵应用于生物图复杂度量化，证明最小化熵等价于最优图分区，开发了针对有序和无序生物图的专用方法 | NA | 开发能够捕捉生物图复杂结构的有效度量方法 | Hi-C接触图谱中的拓扑关联域和单细胞测序数据中的细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 图分区算法 | TEC-O, TEC-U | Hi-C接触图谱，单细胞测序数据 | 5个细胞系的Hi-C数据和10个单细胞测序数据集 | NA | Hi-C，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5638 | 2025-10-06 |
Exploring the anti-gastric cancer mechanisms of Diosgenin through integrated network analysis, bioinformatics, single-cell sequencing, and cell experiments
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1600960
PMID:40487391
|
研究论文 | 本研究通过整合网络分析、生物信息学、单细胞测序和细胞实验，系统探索薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 首次采用多方法策略（网络分析、生物信息学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和细胞实验）系统研究薯蓣皂苷元的抗胃癌机制 | NA | 全面研究薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 胃癌细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化, 蛋白质印迹分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5639 | 2025-10-06 |
Single-cell and transcriptomic analyses reveal the role of PCDH17 in the non-inflammatory tumor microenvironment of pancreatic cancer
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1559909
PMID:40487760
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组分析揭示了PCDH17在胰腺癌非炎症性肿瘤微环境中的作用机制 | 首次系统阐明PCDH17在胰腺癌内皮细胞中的表达特征及其与炎症基因和免疫细胞浸润的关联 | PCDH17调控肿瘤微环境的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究PCDH17在胰腺癌肿瘤微环境调控中的作用机制 | 胰腺癌组织样本和单细胞测序数据 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5640 | 2025-10-06 |
Utilizing Multi-omics analysis to elucidate the role of mitochondrial gene defects in Gastric cancer progression
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325520
PMID:40489463
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA测序数据，识别出8个线粒体自噬相关预后基因并构建风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用机制 | 胃癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO-Cox回归, 风险评分模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |