单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5601 - 5620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5601 | 2025-10-06 |
An inducible genetic tool to track and manipulate specific microglial states reveals their plasticity and roles in remyelination
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.005
PMID:38821054
|
研究论文 | 开发了一种可诱导的遗传工具Clec7a-CreER，用于追踪和操纵特定小胶质细胞状态，揭示其可塑性及在髓鞘再生中的作用 | 创建了首个特异性靶向PAMs和DAMs小胶质细胞状态的可诱导Cre驱动工具，首次直接证明了小胶质细胞状态的可塑性及其在疾病恢复中的功能 | 未明确说明样本规模和技术重复次数，疾病模型范围有限 | 研究小胶质细胞状态的可塑性及其在神经系统发育和疾病中的功能 | 大脑实质中的增殖区域相关小胶质细胞(PAMs)和疾病相关小胶质细胞(DAMs) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，遗传谱系追踪，细胞特异性消融 | 遗传工程小鼠模型 | 基因表达数据，细胞追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5602 | 2025-10-06 |
Loss of function of male-specific lethal 3 (Msl3) does not affect spermatogenesis in rodents
2024-05, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.669
PMID:37847071
|
研究论文 | 本研究探讨了Msl3基因在啮齿类动物精子发生中的作用 | 首次在哺乳动物中使用条件性基因敲除模型研究Msl3在减数分裂中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不适用于其他哺乳动物 | 探究Msl3基因在哺乳动物减数分裂进入中的作用 | 小鼠精子发生过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5603 | 2025-10-06 |
An individualized stemness-related signature to predict prognosis and immunotherapy responses for gastric cancer using single-cell and bulk tissue transcriptomes
2024-01, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6908
PMID:38168907
|
研究论文 | 开发基于胃癌干性特征的个体化签名用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次构建基于样本内基因相对表达排序的个体化干性特征签名，克服批次效应限制 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床验证 | 开发个体化胃癌预后和免疫治疗反应预测模型 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 基于基因对相对表达排序的签名模型 | 基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5604 | 2025-10-06 |
Abomasal RNA-seq reveals a strong local cellular response in suckling lambs with resistance against Haemonchus contortus
2023-11, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2023.06.008
PMID:37673202
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析比较了抗蠕虫感染的Santa Ines羊和易感Ile de France羊皱胃组织的转录组差异 | 首次在哺乳羔羊中结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据揭示抗蠕虫感染的黏膜特异性免疫机制 | 样本量较小（每组4只），仅针对特定品种和年龄段的羔羊 | 探索羊对Haemonchus contortus蠕虫感染的抗性分子机制 | Santa Ines和Ile de France品种的哺乳羔羊 | 转录组学 | 寄生虫感染 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 差异表达分析 | RNA测序数据 | 8只羔羊（SI和IF各4只） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5605 | 2025-10-06 |
3D-printed advanced scaffold armed with exosomes derived from human skeletal stem cell identified by single-cell RNA sequencing enhances osteochondral regeneration
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.04.028
PMID:40487240
|
研究论文 | 本研究开发了一种装载人骨骼干细胞外泌体的3D打印水凝胶支架，用于增强骨软骨再生 | 利用单细胞RNA测序鉴定具有高分化潜能的骨骼干细胞，并首次将其外泌体与3D打印技术结合构建新型生物支架 | 研究仅在动物模型中进行验证，尚未进行临床试验 | 开发有效的骨软骨缺损修复策略 | 大鼠骨软骨缺损模型、人骨骼干细胞、骨髓间充质干细胞 | 组织工程 | 骨软骨缺损 | 单细胞RNA测序, 3D打印, 流式细胞术, 高通量测序 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5606 | 2025-10-06 |
l-Cysteine Alleviates Peritoneal Fibrosis by Repressing PKM2 in Peritoneal Mesothelial Cells
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500229R
PMID:40497367
|
研究论文 | 本研究探讨了L-半胱氨酸通过抑制PKM2缓解腹膜纤维化的分子机制 | 首次揭示PKM2通过乙酰化H3K9促进SNAI2表达进而诱导间皮-间质转化的新机制 | 分子机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验验证 | 探索腹膜纤维化的发病机制及治疗策略 | 腹膜间皮细胞和腹膜透析患者 | 分子生物学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 染色质免疫沉淀, 基因沉默 | NA | 单细胞RNA测序数据, 分子实验数据 | 长期腹膜透析患者的腹腔积液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5607 | 2025-10-06 |
Engineering CRISPR System-Based Bacterial Outer Membrane Vesicle Potentiates T Cell Immunity for Enhanced Cancer Immunotherapy
2025-Jun-11, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501565
PMID:40495695
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR系统的工程化细菌外膜囊泡，用于增强T细胞免疫以改善癌症免疫治疗效果 | 通过工程化改造大肠杆菌BL21来源的外膜囊泡，实现了多基因的高效包装和递送，显著增强了T细胞的趋化和活化能力 | 研究主要基于小鼠模型和人工人源化小鼠模型，尚未在真实人体环境中验证 | 开发新型癌症免疫治疗平台，克服免疫检查点阻断治疗的耐药性问题 | 细菌外膜囊泡、T细胞、肿瘤微环境 | 生物医学工程 | 膀胱癌、黑色素瘤、乳腺癌 | CRISPR系统、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | MB49和B16F10小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5608 | 2025-10-06 |
Filtering for Highly Variable Genes and High-Quality Spots Improves Phylogenetic Analysis of Cancer Spatial Transcriptomics Visium Data
2025-Jun-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0614
PMID:40495757
|
研究论文 | 探索通过筛选高变异基因和高质量位点来改进癌症空间转录组学Visium数据系统发育分析的方法 | 首次在空间转录组学数据中应用高变异基因筛选和考虑RNA捕获异质性的预处理方法，改进了系统发育重建的准确性 | 仅针对Visium平台数据，方法在其他空间转录组技术中的适用性有待验证 | 开发优化的空间转录组数据预处理流程以提高癌症系统发育分析的准确性 | 癌症空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组测序 | 系统发育分析模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 5609 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Study on Two Synovial Derived Tumors in the Temporomandibular Joint
2025-Jun-11, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70003
PMID:40495754
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫型腱鞘巨细胞瘤的细胞组成与分化轨迹 | 首次在颞下颌关节肿瘤中应用单细胞RNA测序技术，揭示COMP/TGFβ/SMAD信号通路在滑膜软骨瘤病软骨分化中的关键作用 | 样本来源仅限于颞下颌关节，未涉及其他关节的同类疾病 | 探究颞下颌关节两种滑膜来源肿瘤的细胞组成和分化轨迹 | 滑膜软骨瘤病(SC)和弥漫型腱鞘巨细胞瘤(D-TSGCT)患者样本 | 单细胞测序分析 | 颞下颌关节肿瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞培养, 形态学实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种颞下颌关节肿瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5610 | 2025-10-06 |
C-C Chemokine Receptor 2 is a Tissue Biomarker for Abdominal Aortic Aneurysmal and Occlusive Disease
2025-Jun-11, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006778
PMID:40495781
|
研究论文 | 本研究评估CCR2作为主动脉疾病严重程度的组织生物标志物，特别是在腹主动脉瘤患者中的应用价值 | 首次系统评估CCR2在腹主动脉瘤和闭塞性疾病中的表达特征，并通过单细胞RNA测序技术明确其主要表达细胞类型 | 样本量相对有限（42例），且为观察性研究，需要更大规模研究验证 | 探索CCR2作为主动脉疾病生物标志物的潜力 | 人类主动脉组织样本，包括非破裂和破裂腹主动脉瘤、主髂动脉闭塞性疾病及正常主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，细胞因子检测 | NA | 组织样本，基因表达数据 | 42例个体主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5611 | 2025-10-06 |
Novel GABAAR antagonists target networked gene hubs at the leading-edge in high-grade gliomas
2025-Jun-11, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf143
PMID:40497637
|
研究论文 | 通过基因共表达网络分析识别高级别胶质瘤前沿的关键离子通道基因，并验证GABAAR拮抗剂对肿瘤进展的抑制作用 | 首次发现GABAAR基因在高级别胶质瘤前沿形成网络枢纽，并验证特异性拮抗剂可有效抑制肿瘤侵袭 | 胶质瘤外植体类器官未能保留突触结构，可能影响部分机制的完全验证 | 确定离子通道基因在高级别胶质瘤中的网络作用并寻找靶向治疗药物 | 弥漫性中线胶质瘤和胶质母细胞瘤患者肿瘤样本及衍生类器官 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 | WGCNA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | 高级别胶质瘤患者肿瘤样本及衍生类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5612 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Unveils the Blueprint of Mammalian Lung Development
2025-Jun-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf053
PMID:40493888
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术构建小鼠肺部发育的全面图谱，揭示肺发育过程中的基因表达模式和调控机制 | 首次提供从假腺期到肺泡期的小鼠肺发育空间转录组图谱，发现新型TF-增强子驱动的调控子(eRegulons)和BMP8B介导的细胞间通讯 | 研究仅限于小鼠模型，人类肺发育可能存在差异 | 解析哺乳动物肺发育的空间基因表达模式和调控机制 | 小鼠肺部发育过程中的不同细胞类型和结构 | 空间转录组学 | 肺部发育疾病 | 空间转录组学，空间表观基因组分析 | NA | 空间基因表达数据，表观基因组数据 | 小鼠肺发育多个阶段的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5613 | 2025-10-06 |
Integrated muti-omics data and machine learning reveal CD151 as a key biomarker inducing chemoresistance in metabolic syndrome-related early-onset left-sided colorectal cancer
2025-Jun-09, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01634-w
PMID:40484863
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，发现CD151是代谢综合征相关早发性左侧结直肠癌诱导化疗耐药的关键生物标志物 | 首次将代谢综合征与早发性左侧结直肠癌联系起来，并利用机器学习算法识别出CD151作为关键生物标志物 | 研究主要基于医院队列数据，需要更大规模的外部验证 | 识别和表征与代谢综合征相关早发性左侧结直肠癌进展和治疗反应相关的关键生物标志物 | 早发性左侧结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学染色 | 随机森林, 支持向量机-递归特征消除 | 多组学数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 医院队列的早发性结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5614 | 2025-10-06 |
SERPINA1 is a new frontier in cancer immunotherapy and drug targeting by pan-cancer analysis
2025-Jun-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02832-5
PMID:40483643
|
研究论文 | 通过泛癌分析发现SERPINA1在癌症免疫治疗和药物靶向中的新作用 | 首次通过多组学数据库全面分析SERPINA1在多种癌症中的表达、预后价值及免疫调节功能 | 研究主要基于数据库分析，需要进一步实验验证 | 探索SERPINA1作为癌症免疫治疗和靶向治疗新靶点的潜力 | 多种癌症类型，重点关注乳腺癌和胶质瘤 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞测序,多组学分析,DNA甲基化分析,基因突变分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 5615 | 2025-10-06 |
Establishment of M2 macrophage-related prognostic signature in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Jun-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02838-z
PMID:40483657
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序建立了胰腺导管腺癌中M2巨噬细胞相关的预后特征模型 | 首次在PDAC中鉴定出M2巨噬细胞的三种分化状态，并构建了基于M2标记基因的预后特征模型 | 研究结果仅为初步发现，需要通过体外/体内实验敲除特征基因或配体-受体对基因来验证其在巨噬细胞发育中的作用 | 探索M2巨噬细胞在胰腺导管腺癌中的潜在通讯机制和临床意义 | 胰腺导管腺癌(PDAC)中的M2巨噬细胞、恶性PDAC细胞和成纤维细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq) | LASSO算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5616 | 2025-10-06 |
Glutamate transporter SLC1A6 promotes resistance to immunotherapy in cancer
2025-Jun-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04074-4
PMID:40481876
|
研究论文 | 本研究探讨谷氨酸转运蛋白SLC1A6在癌症免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次发现SLC1A6在免疫治疗耐药肿瘤中高表达，并证实其通过影响CD8⁺ T细胞功能介导耐药 | 研究主要基于膀胱癌和肺癌数据，需在其他癌种中验证 | 探究SLC1A6在癌症免疫治疗耐药中的作用及机制 | 膀胱癌和肺癌患者样本、CD8⁺ T细胞、体内肿瘤模型 | 癌症免疫学 | 膀胱癌,肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光染色,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 膀胱癌新辅助免疫治疗患者队列,肺癌单细胞数据集,膀胱癌和肺癌转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,转录组分析 | NA | NA |
| 5617 | 2025-10-06 |
Annexin A1-FPR1 Interaction in dendritic cells promotes immune microenvironment modulation in Thyroid Cancer
2025-Jun-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10042-6
PMID:40483281
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示甲状腺癌中树突状细胞通过ANXA1-FPR1相互作用调控免疫微环境的机制 | 首次发现ANXA1与FPR1在树突状细胞中的相互作用及其在甲状腺癌免疫调控中的关键作用 | NA | 探索甲状腺癌免疫微环境中树突状细胞的功能及其调控机制 | 甲状腺癌组织中的树突状细胞群体 | 单细胞生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组RNA测序,meta分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 5618 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize mouse long bone fracture healing process
2025-Jun-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08316-0
PMID:40483363
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术，系统表征了小鼠长骨骨折愈合过程中的细胞定位和相互作用 | 优化了使用Morse溶液的去钙化方法显著提高RNA质量，结合Visium CytAssist平台和多种分析工具，首次实现了骨折愈合过程中关键细胞群体的精确定位和转化过程解析 | 研究仅限于小鼠模型，且仅分析了骨折后特定时间点（第0、5、15天），未能覆盖完整愈合过程的所有阶段 | 阐明骨折愈合过程中细胞间的协调相互作用和分子调控机制 | 小鼠股骨骨折模型 | 空间转录组学 | 骨折 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠股骨骨折模型在骨折前（第0天）和骨折后第5、15天的时间点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组平台 |
| 5619 | 2025-10-06 |
Unraveling the genetic blueprint of doxorubicin-induced cardiotoxicity through systems genetics approaches
2025-Jun-03, Cardio-oncology (London, England)
DOI:10.1186/s40959-025-00349-y
PMID:40462234
|
研究论文 | 本研究通过系统遗传学方法利用BXD重组近交系小鼠群体揭示多柔比星诱导心脏毒性的遗传基础 | 首次在BXD小鼠遗传参考群体中系统定位与多柔比星心脏毒性相关的数量性状位点和候选基因 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类中验证候选基因的功能 | 阐明多柔比星诱导心脏毒性的遗传机制 | BXD重组近交系小鼠群体（58个品系）及亲本C57BL/6J和DBA/2J小鼠 | 系统遗传学 | 心血管疾病 | 数量性状位点定位、孟德尔随机化分析、超声心动图、单细胞RNA测序 | 遗传定位模型 | 基因型数据、表型数据、生存数据、心脏功能数据 | 58个BXD品系及亲本品系，每个品系每性别至少4只小鼠，总计超过464只3-4月龄小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5620 | 2025-10-06 |
mNSF: multi-sample non-negative spatial factorization
2025-Jun-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03601-x
PMID:40457480
|
研究论文 | 提出一种用于多样本空间转录组数据分析的无对齐框架mNSF | 将单样本空间因子分解扩展到多样本数据集，无需空间对齐即可建模样本特异性空间相关性 | 未明确说明方法在复杂生物系统中的适用性限制 | 开发多样本空间转录组数据的分析方法 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非负空间因子分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |