单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 5601 - 5620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5601 | 2026-03-29 |
Comparative analysis of single-cell transcriptomics in human and Zebrafish oocytes
2020-Jul-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-06860-z
PMID:32640983
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq技术比较了人类和斑马鱼卵母细胞的转录组，揭示了二者在基因表达水平上的高度一致性和功能相似性 | 首次直接比较人类和斑马鱼卵母细胞的单细胞转录组，发现同源基因在两者中高度表达且功能类别相似 | 仅基于三个单细胞RNA-seq研究进行比较，样本量有限，且未涵盖所有卵母细胞发育阶段 | 评估斑马鱼作为研究人类卵母细胞的有效模型生物的可行性 | 人类和斑马鱼的卵母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼卵母细胞单细胞RNA-seq数据及两项人类卵母细胞单细胞RNA-seq研究数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5602 | 2026-03-29 |
Simple Method to Quantify Protein Abundances from 1000 Cells
2020-Jun-30, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c01191
PMID:32637829
|
研究论文 | 本文介绍了一种从1000个哺乳动物干细胞中量化蛋白质表达水平的简化蛋白质组学工作流程 | 整合并优化了多项近期技术进展，实现了从极少量细胞（低至1000个）中进行蛋白质定量，无需特殊设备，仅需细胞裂解工具 | 方法虽已验证于小鼠胚胎干细胞和体外分化运动神经元，但在其他细胞类型或更复杂组织中的适用性可能有限 | 开发一种从最小输入样本中获取蛋白质组学数据的简单准确方法 | 小鼠胚胎干细胞、体外分化运动神经元以及荧光激活细胞分选纯化的海鞘细胞 | 蛋白质组学 | NA | 化学肽标记 | NA | 蛋白质表达数据 | 低至1000个哺乳动物干细胞 | NA | 蛋白质组学 | NA | NA |
| 5603 | 2026-03-28 |
Integrated bioinformatics analysis reveals cross-talking hub genes and therapeutic agents between sepsis and acute myocardial infarction
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2645276
PMID:41863100
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析，识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因，并探讨了其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 | 首次系统性地识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的交叉核心基因（JAK2、MYD88、TIMP1），并验证了槲皮素作为潜在靶向治疗药物的结合亲和力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏临床前或临床试验数据来证实治疗效果的体内有效性 | 识别脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因，并探索其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 | 脓毒症和急性心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症和急性心肌梗死 | RNA测序、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接模拟、qPCR验证 | MCC/Degree算法 | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 5604 | 2026-03-28 |
Cell-type-specific genetic associations in Lewy body dementia identified using single-cell eQTL-based Mendelian randomization
2026-Jun, Archives of gerontology and geriatrics
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.archger.2026.106205
PMID:41855783
|
研究论文 | 本研究利用单细胞eQTL进行孟德尔随机化分析，识别了路易体痴呆中细胞类型特异的遗传关联 | 首次将单细胞转录组范围的孟德尔随机化与脑细胞类型特异性eQTL结合，揭示了ANKRD65在兴奋性神经元中表达与路易体痴呆风险的关联 | 研究主要基于遗传推断，需要进一步实验验证功能机制；样本分层可能影响统计效力 | 探索遗传变异通过细胞类型特异性机制影响路易体痴呆易感性的关联 | 路易体痴呆患者及对照人群的脑组织样本 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序，孟德尔随机化，贝叶斯共定位分析 | 逆方差加权模型 | 遗传与转录组数据 | 基于APOE ε4携带状态分层的独立路易体痴呆队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5605 | 2026-03-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2026-Apr-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0424
PMID:41563441
|
研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议，以增强胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议并采用胰岛素转录本靶向耗竭策略，提高了长读长测序在单细胞水平上的转录本检测效率和准确性 | 技术挑战包括读长不足和较高错误率，可能影响某些低丰度转录本的识别 | 优化单细胞长读长测序协议，以改善胰腺胰岛中异构体的检测和基因表达分析 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型，特别是胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5606 | 2026-03-28 |
Activation of the Pancreatic "Metabolic Synapse" Aggravates Type 2 Diabetes Mellitus by Inducing PANoptosis in β-Cells
2026-Apr-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0863
PMID:41701561
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序和体外实验，揭示了胰腺成纤维细胞通过分泌过量谷氨酸激活β细胞中的NMDAR，从而触发PANoptosis并加速2型糖尿病进展的新机制 | 首次提出“代谢突触”概念来描述胰腺成纤维细胞与β细胞间的相互作用，并发现谷氨酸-NMDAR轴在2型糖尿病发病中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，缺乏大规模临床验证；人类胰腺样本的NMDAR表达变化仅作为相关性观察，未进行功能验证 | 探究胰腺成纤维细胞对β细胞功能障碍和2型糖尿病进展的贡献，并阐明减肥手术改善糖尿病的机制 | 胰腺β细胞、胰腺成纤维细胞、2型糖尿病患者胰腺样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5607 | 2026-03-28 |
Identifying prognosis-associated spatial patterns by integrating bulk RNA-seq and spatial transcriptomic data
2026-Mar-26, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3677899
PMID:41886327
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为stSurvTrans的深度迁移学习框架，用于识别与预后相关的空间模式，通过整合bulk RNA-seq和空间转录组数据 | 利用条件变分自编码器（CVAE）整合bulk RNA-seq和空间转录组数据，并采用Weibull模块将临床生存信息从bulk样本迁移到空间数据中 | NA | 将空间特征与生存信息关联起来，以识别与预后相关的空间模式 | 肝细胞癌（HCC）的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | 条件变分自编码器（CVAE）, Weibull模块 | bulk RNA-seq数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5608 | 2026-03-28 |
Enhancing Proteasome Activity in T Cells Alleviates Exhaustion and Improves Antitumor Immunity
2026-Mar-26, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1246
PMID:41886620
|
研究论文 | 本研究通过增强T细胞中的蛋白酶体活性，延缓了T细胞耗竭，改善了其功能，并转化为更强的抗肿瘤免疫和肿瘤控制 | 首次提出并验证了蛋白酶体活性是T细胞耗竭的关键调节因素，并证明通过药理学和遗传学方法增强蛋白酶体活性可以改善T细胞功能和抗肿瘤免疫 | 研究主要在体外模型和单细胞转录组学分析中进行，体内验证和临床转化效果需要进一步研究 | 探究T细胞耗竭的机制并寻找改善抗肿瘤免疫的新策略 | 耗竭T细胞 (TEX) 和非耗竭T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 涵盖16种肿瘤类型的单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5609 | 2026-03-28 |
Microbiota-Driven microglia reprogramming reverses depressive-like behaviors through Peripheral-to-Central immune crosstalk
2026-Mar-26, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03545-z
PMID:41888425
|
研究论文 | 本研究通过肠道微生物干预逆转慢性不可预测轻度应激诱导的抑郁样行为，揭示了微生物群驱动的微胶质细胞重编程通过外周-中枢免疫轴调控抑郁表型 | 首次构建了中枢与外周免疫细胞单细胞图谱，发现稳态微胶质细胞2亚型通过激活轨迹调控微胶质状态，并鉴定Klf2作为单核细胞和HM2微胶质亚型的主调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化需进一步验证；微生物干预的具体机制尚未完全阐明 | 探究肠道微生物干预如何通过免疫轴调控改善抑郁样行为 | 小鼠脑组织、颅骨和外周血单核细胞中的微胶质细胞及非微胶质免疫细胞 | 神经免疫学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、染色质开放性测序、CD45免疫细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据 | 未明确样本数量，使用慢性不可预测轻度应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5610 | 2026-03-28 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveals senescence-associated changes in MIA-induced ASD male mouse brain
2026-Mar-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117191
PMID:41886454
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组和单核RNA测序分析，揭示了母体免疫激活诱导的自闭症谱系障碍小鼠大脑中衰老相关的变化机制 | 首次结合空间转录组和单核RNA测序技术，系统性地识别了MIA诱导的ASD大脑中衰老相关基因通路和细胞类型特异性调控机制 | 研究仅基于雄性小鼠模型，未涵盖雌性个体；机制验证主要在动物模型中进行，人类临床转化需进一步探索 | 探索母体免疫激活诱导的自闭症谱系障碍的神经生物学特征和调控机制 | MIA诱导的ASD雄性小鼠大脑组织 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 空间转录组测序, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5611 | 2026-03-28 |
p53: defender of lineage fidelity and foe of plasticity in cancer and regeneration
2026-Mar-25, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2026.02.004
PMID:41887985
|
综述 | 本文综述了p53在肿瘤抑制和组织修复中，通过调控细胞状态变化来维持谱系保真度和抑制可塑性的新功能 | 揭示了p53在可塑的过渡细胞状态中，通过驱动肺泡1型细胞分化来抑制肺癌和促进肺损伤修复，并扩展了其在其他组织损伤修复中的作用 | p53肿瘤抑制功能的分子程序仍未完全阐明，且研究主要基于基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序 | 探讨p53在肿瘤抑制和组织修复中的分子机制与功能 | p53蛋白、肺腺癌、肺损伤修复、损伤诱导的肠道再生干细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5612 | 2026-03-28 |
A single-cell transcriptional reference for the functional and developmental diversity of neonatal innate lymphoid cells
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117000
PMID:41706587
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合发育和功能分析，深入解析了脐带血中循环先天淋巴细胞的复杂性和多样性 | 首次在免疫学上未成熟的脐带血中，通过单细胞转录组学详细描绘了循环先天淋巴细胞的亚群多样性，并利用人工胸腺器官模型揭示了cILC1s的发育潜力仅限于NK细胞 | 研究主要基于脐带血样本，可能无法完全代表成人或其他组织中的先天淋巴细胞状态 | 旨在建立新生儿先天淋巴细胞的功能和发育多样性的单细胞转录参考图谱 | 脐带血中的循环先天淋巴细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但基于脐带血 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5613 | 2026-03-28 |
Single-cell transcriptional and epigenomic landscape of human blood immune cells across the lifespan
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117072
PMID:41818242
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，绘制了从胎儿中期到成年晚期人类外周血单个核细胞的转录组和表观基因组图谱，揭示了免疫细胞组成随年龄的动态变化 | 首次在单细胞水平上全面描绘了人类整个生命周期中外周血免疫细胞的转录和表观遗传景观，并识别了多个年龄相关的免疫细胞亚群和特征 | 研究仅基于健康供体的外周血单个核细胞，未涉及组织特异性免疫细胞或疾病状态，样本量可能有限 | 探究人类生命周期中免疫细胞组成的动态变化及其与年龄相关的特征 | 健康供体的外周血单个核细胞，涵盖从胎儿中期到成年晚期的不同年龄阶段 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 来自健康供体的外周血单个核细胞样本，覆盖多个年龄阶段 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 5614 | 2026-03-28 |
Spatiotemporal molecular profiling of macrophage-fibroblast crosstalk defines checkpoints orchestrating onset and resolution of inflammation
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117091
PMID:41832953
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术解析了炎症性关节炎中巨噬细胞与成纤维细胞在炎症起始和消退阶段的时空分子互作网络 | 首次结合单细胞RNA测序与单细胞ATAC测序技术，系统描绘了滑膜巨噬细胞与成纤维细胞亚群在炎症不同阶段的异质性信号回路，揭示了巨噬细胞亚群在促炎与消退过程中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分；未深入探究其他免疫细胞类型在炎症回路中的作用 | 阐明炎症性疾病中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的分子机制与时空动态 | 炎症性关节炎模型中的滑膜巨噬细胞与滑膜成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 生物信息学建模 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确（基于炎症不同阶段的滑膜组织样本） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 5615 | 2026-03-28 |
Dendritic Cells Remodel Eccrine Sweat Gland Niche Metabolism Via Oxidative Phosphorylation During Aging
2026-Mar-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.011
PMID:41887396
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能实验，揭示了树突状细胞通过氧化磷酸化调控汗腺代谢的免疫-上皮回路，并阐明其在衰老过程中的失调机制 | 首次发现树突状细胞作为汗腺代谢稳态的守护者，通过NAMPT-INSR信号轴促进氧化磷酸化，并揭示衰老过程中MIF-CD74-CYBB信号通路导致细胞功能障碍的可逆机制 | 研究主要基于小鼠爪部和人类手掌皮肤样本，可能无法完全代表其他皮肤区域或物种的衰老过程 | 探究衰老过程中汗腺功能下降的细胞和分子机制，特别是与年龄相关的微环境重塑 | 小鼠爪部汗腺和人类手掌皮肤中的汗腺细胞及树突状细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学, scRNA-seq, 免疫染色, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及老年小鼠爪部和人类手掌皮肤 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5616 | 2026-03-28 |
Protocol to evaluate mouse brain spatial cell type-resolved transcriptomic discoveries using 10× Visium spatial transcriptomics and FLEX scRNA-seq
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104277
PMID:41456279
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合10× Genomics Visium空间转录组学和FLEX单细胞RNA测序技术，用于研究小鼠脑组织中空间区域基因表达和细胞间信号变化的实验方案 | 整合了空间转录组学和单细胞RNA测序技术，提供了一种系统性的实验方案来解析小鼠脑组织在疾病状态下的空间分子特征 | NA | 研究疾病组织中空间区域基因表达和细胞间信号的变化机制 | 小鼠脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium, 10x FLEX | 10× Genomics Visium空间转录组学和10× Genomics FLEX单细胞RNA测序 |
| 5617 | 2026-03-28 |
Protocol for dual spatial transcriptomic profiling of infected tissues
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104282
PMID:41538322
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于感染组织的双重空间转录组学分析协议，旨在分析宿主和病原体的转录模式 | 开发了一种双重空间转录组学分析协议，能够同时分析宿主和病原体的转录模式，并建立病理适应特征以预测感染结果 | 协议的具体应用效果和局限性未在摘要中详细说明，需参考原始文献 | 建立感染组织中宿主和病原体转录模式的分析方法 | 感染组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5618 | 2026-03-28 |
Protocol for the generation of a human-derived nasal epithelial model and induction of tissue-resident memory-like T cells in a co-culture system
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104401
PMID:41758640
|
研究论文 | 本文介绍了一种生成人源性鼻上皮模型并在共培养系统中诱导组织驻留记忆样T细胞的实验方案 | 开发了一种体外模型系统，用于研究人源性组织驻留记忆T细胞（TRMs），通过共培养诱导TRM样T细胞 | NA | 研究人源性组织驻留记忆T细胞（TRMs）的诱导和分析方法 | 人源性鼻上皮模型和自体免疫细胞 | NA | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞因子释放分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5619 | 2026-03-28 |
Transcriptional landscape of CD4+ T cells in Systemic Sclerosis
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.03.697349
PMID:41889800
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术深入表征了系统性硬化症患者中CD4+ T细胞的亚群，揭示了疾病相关的转录组特征和细胞状态变化 | 采用新颖的单细胞RNA测序方法，首次全面描绘了系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录景观，并结合TCR库分析，提供了前所未有的疾病细胞和分子机制见解 | 样本量相对较小（8名患者和8名健康对照），可能限制结果的普适性；研究主要关注CD4+ T细胞，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录组特征和亚群变化，以揭示疾病的细胞和分子基础 | 系统性硬化症患者和健康对照者的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 超过80,000个CD4+ T细胞，来自8名系统性硬化症患者和8名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5620 | 2026-03-28 |
Patches: A Representation Learning Framework for Decoding Shared and Condition-Specific Transcriptional Programs in Wound Healing
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630186
PMID:41889850
|
研究论文 | 本文提出了一个名为Patches的表示学习框架，用于解码伤口愈合过程中共享和条件特异性的转录程序 | 开发了条件子空间学习方法，能够同时解析共享和条件特异性转录模式，特别适用于具有缺失数据、不匹配细胞群或复杂属性组合的实验设计 | 未明确说明框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 解码伤口愈合过程中共享和条件特异性的转录程序 | 皮肤损伤模型中的单细胞转录组数据 | 计算生物学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 条件子空间学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |