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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5601 | 2025-10-06 |
C-C Chemokine Receptor 2 is a Tissue Biomarker for Abdominal Aortic Aneurysmal and Occlusive Disease
2025-Jun-11, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006778
PMID:40495781
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研究论文 | 本研究评估CCR2作为主动脉疾病严重程度的组织生物标志物,特别是在腹主动脉瘤患者中的应用价值 | 首次系统评估CCR2在腹主动脉瘤和闭塞性疾病中的表达特征,并通过单细胞RNA测序技术明确其主要表达细胞类型 | 样本量相对有限(42例),且为观察性研究,需要更大规模研究验证 | 探索CCR2作为主动脉疾病生物标志物的潜力 | 人类主动脉组织样本,包括非破裂和破裂腹主动脉瘤、主髂动脉闭塞性疾病及正常主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,细胞因子检测 | NA | 组织样本,基因表达数据 | 42例个体主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5602 | 2025-10-06 |
Novel GABAAR antagonists target networked gene hubs at the leading-edge in high-grade gliomas
2025-Jun-11, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf143
PMID:40497637
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研究论文 | 通过基因共表达网络分析识别高级别胶质瘤前沿的关键离子通道基因,并验证GABAAR拮抗剂对肿瘤进展的抑制作用 | 首次发现GABAAR基因在高级别胶质瘤前沿形成网络枢纽,并验证特异性拮抗剂可有效抑制肿瘤侵袭 | 胶质瘤外植体类器官未能保留突触结构,可能影响部分机制的完全验证 | 确定离子通道基因在高级别胶质瘤中的网络作用并寻找靶向治疗药物 | 弥漫性中线胶质瘤和胶质母细胞瘤患者肿瘤样本及衍生类器官 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 | WGCNA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | 高级别胶质瘤患者肿瘤样本及衍生类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
5603 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Unveils the Blueprint of Mammalian Lung Development
2025-Jun-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf053
PMID:40493888
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研究论文 | 通过空间转录组学技术构建小鼠肺部发育的全面图谱,揭示肺发育过程中的基因表达模式和调控机制 | 首次提供从假腺期到肺泡期的小鼠肺发育空间转录组图谱,发现新型TF-增强子驱动的调控子(eRegulons)和BMP8B介导的细胞间通讯 | 研究仅限于小鼠模型,人类肺发育可能存在差异 | 解析哺乳动物肺发育的空间基因表达模式和调控机制 | 小鼠肺部发育过程中的不同细胞类型和结构 | 空间转录组学 | 肺部发育疾病 | 空间转录组学,空间表观基因组分析 | NA | 空间基因表达数据,表观基因组数据 | 小鼠肺发育多个阶段的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5604 | 2025-10-06 |
Integrated muti-omics data and machine learning reveal CD151 as a key biomarker inducing chemoresistance in metabolic syndrome-related early-onset left-sided colorectal cancer
2025-Jun-09, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01634-w
PMID:40484863
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,发现CD151是代谢综合征相关早发性左侧结直肠癌诱导化疗耐药的关键生物标志物 | 首次将代谢综合征与早发性左侧结直肠癌联系起来,并利用机器学习算法识别出CD151作为关键生物标志物 | 研究主要基于医院队列数据,需要更大规模的外部验证 | 识别和表征与代谢综合征相关早发性左侧结直肠癌进展和治疗反应相关的关键生物标志物 | 早发性左侧结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学染色 | 随机森林, 支持向量机-递归特征消除 | 多组学数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 医院队列的早发性结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5605 | 2025-10-06 |
SERPINA1 is a new frontier in cancer immunotherapy and drug targeting by pan-cancer analysis
2025-Jun-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02832-5
PMID:40483643
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研究论文 | 通过泛癌分析发现SERPINA1在癌症免疫治疗和药物靶向中的新作用 | 首次通过多组学数据库全面分析SERPINA1在多种癌症中的表达、预后价值及免疫调节功能 | 研究主要基于数据库分析,需要进一步实验验证 | 探索SERPINA1作为癌症免疫治疗和靶向治疗新靶点的潜力 | 多种癌症类型,重点关注乳腺癌和胶质瘤 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞测序,多组学分析,DNA甲基化分析,基因突变分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
5606 | 2025-10-06 |
Establishment of M2 macrophage-related prognostic signature in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Jun-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02838-z
PMID:40483657
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序建立了胰腺导管腺癌中M2巨噬细胞相关的预后特征模型 | 首次在PDAC中鉴定出M2巨噬细胞的三种分化状态,并构建了基于M2标记基因的预后特征模型 | 研究结果仅为初步发现,需要通过体外/体内实验敲除特征基因或配体-受体对基因来验证其在巨噬细胞发育中的作用 | 探索M2巨噬细胞在胰腺导管腺癌中的潜在通讯机制和临床意义 | 胰腺导管腺癌(PDAC)中的M2巨噬细胞、恶性PDAC细胞和成纤维细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq) | LASSO算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
5607 | 2025-10-06 |
Glutamate transporter SLC1A6 promotes resistance to immunotherapy in cancer
2025-Jun-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04074-4
PMID:40481876
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研究论文 | 本研究探讨谷氨酸转运蛋白SLC1A6在癌症免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次发现SLC1A6在免疫治疗耐药肿瘤中高表达,并证实其通过影响CD8⁺ T细胞功能介导耐药 | 研究主要基于膀胱癌和肺癌数据,需在其他癌种中验证 | 探究SLC1A6在癌症免疫治疗耐药中的作用及机制 | 膀胱癌和肺癌患者样本、CD8⁺ T细胞、体内肿瘤模型 | 癌症免疫学 | 膀胱癌,肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光染色,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 膀胱癌新辅助免疫治疗患者队列,肺癌单细胞数据集,膀胱癌和肺癌转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,转录组分析 | NA | NA |
5608 | 2025-10-06 |
Annexin A1-FPR1 Interaction in dendritic cells promotes immune microenvironment modulation in Thyroid Cancer
2025-Jun-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10042-6
PMID:40483281
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示甲状腺癌中树突状细胞通过ANXA1-FPR1相互作用调控免疫微环境的机制 | 首次发现ANXA1与FPR1在树突状细胞中的相互作用及其在甲状腺癌免疫调控中的关键作用 | NA | 探索甲状腺癌免疫微环境中树突状细胞的功能及其调控机制 | 甲状腺癌组织中的树突状细胞群体 | 单细胞生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组RNA测序,meta分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
5609 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize mouse long bone fracture healing process
2025-Jun-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08316-0
PMID:40483363
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术,系统表征了小鼠长骨骨折愈合过程中的细胞定位和相互作用 | 优化了使用Morse溶液的去钙化方法显著提高RNA质量,结合Visium CytAssist平台和多种分析工具,首次实现了骨折愈合过程中关键细胞群体的精确定位和转化过程解析 | 研究仅限于小鼠模型,且仅分析了骨折后特定时间点(第0、5、15天),未能覆盖完整愈合过程的所有阶段 | 阐明骨折愈合过程中细胞间的协调相互作用和分子调控机制 | 小鼠股骨骨折模型 | 空间转录组学 | 骨折 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠股骨骨折模型在骨折前(第0天)和骨折后第5、15天的时间点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组平台 |
5610 | 2025-10-06 |
Unraveling the genetic blueprint of doxorubicin-induced cardiotoxicity through systems genetics approaches
2025-Jun-03, Cardio-oncology (London, England)
DOI:10.1186/s40959-025-00349-y
PMID:40462234
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研究论文 | 本研究通过系统遗传学方法利用BXD重组近交系小鼠群体揭示多柔比星诱导心脏毒性的遗传基础 | 首次在BXD小鼠遗传参考群体中系统定位与多柔比星心脏毒性相关的数量性状位点和候选基因 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类中验证候选基因的功能 | 阐明多柔比星诱导心脏毒性的遗传机制 | BXD重组近交系小鼠群体(58个品系)及亲本C57BL/6J和DBA/2J小鼠 | 系统遗传学 | 心血管疾病 | 数量性状位点定位、孟德尔随机化分析、超声心动图、单细胞RNA测序 | 遗传定位模型 | 基因型数据、表型数据、生存数据、心脏功能数据 | 58个BXD品系及亲本品系,每个品系每性别至少4只小鼠,总计超过464只3-4月龄小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5611 | 2025-10-06 |
mNSF: multi-sample non-negative spatial factorization
2025-Jun-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03601-x
PMID:40457480
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研究论文 | 提出一种用于多样本空间转录组数据分析的无对齐框架mNSF | 将单样本空间因子分解扩展到多样本数据集,无需空间对齐即可建模样本特异性空间相关性 | 未明确说明方法在复杂生物系统中的适用性限制 | 开发多样本空间转录组数据的分析方法 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非负空间因子分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5612 | 2025-10-06 |
Insights of immune cell heterogeneity, tumor-initiated subtype transformation, drug resistance, treatment and detecting technologies in glioma microenvironment
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.033
PMID:39097088
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综述 | 全面分析胶质瘤微环境中免疫细胞异质性、亚型转化机制及其对化疗耐药和治疗策略的影响 | 系统阐述胶质瘤诱导免疫细胞亚型转化的具体机制,并探索单细胞测序技术在免疫细胞亚型研究中的应用潜力 | NA | 深入理解胶质瘤微环境中免疫细胞的异质性及其在肿瘤进展和治疗中的作用 | 胶质瘤微环境中的中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞等主要免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5613 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.028
PMID:39084404
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研究论文 | 通过单细胞测序构建人牙龈单细胞图谱,揭示NETs相关中性粒细胞亚群在牙周免疫中的调控作用 | 首次在牙周炎中发现并鉴定NETs相关中性粒细胞亚群(NrNeu),揭示牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴促进NETs产生的调控机制 | NA | 阐明NETs在牙周免疫病理中的具体功能和机制 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,伪时间分析,细胞间通讯分析 | 六种机器学习方法构建的预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5614 | 2025-10-06 |
RNA modification gene WDR4 facilitates tumor progression and immunotherapy resistance in breast cancer
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.029
PMID:38960276
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研究论文 | 本研究基于RNA修饰相关基因开发了RMscore评分系统,用于预测乳腺癌患者的治疗反应和生存结局 | 首次整合13种RNA修饰模式相关基因建立九基因标志物,并发现WDR4通过m7G修饰调控细胞周期和mTORC1信号通路 | NA | 探索RNA修饰相关基因在乳腺癌中的临床价值并建立治疗反应预测策略 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 批量转录组分析、单细胞转录组分析、基因组学分析、流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光染色 | 基因特征评分模型 | 转录组数据、基因组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5615 | 2025-10-06 |
Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.029
PMID:39107200
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶通过CDK6/ID2轴促进Th17细胞分化和致病性在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 首次发现HDACs通过CDK6/ID2正反馈环路调控Th17细胞分化和致病性的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,临床样本验证相对有限 | 探究组蛋白去乙酰化酶在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用 | 自身免疫性葡萄膜炎患者外周血单核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,siRNA敲低,特异性抑制剂,过继转移实验 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | AU患者PBMCs和EAU小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5616 | 2025-10-06 |
ST6GALNAC1-mediated sialylation in uterine endometrial epithelium facilitates the epithelium-embryo attachment
2025-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.021
PMID:39111624
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研究论文 | 本研究揭示了ST6GALNAC1介导的子宫内膜上皮细胞唾液酸化通过sTn-Siglecs轴促进胚胎附着的分子机制 | 首次证实ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎植入过程中的关键作用,并鉴定CD44作为sTn修饰的关键载体蛋白 | 研究主要基于细胞模型和小鼠实验,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎植入过程中的作用机制 | 人类和小鼠子宫内膜、胚胎、AN3CA细胞系、JAR细胞球 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 免疫组织化学、体外植入模型、免疫沉淀-质谱分析、单细胞RNA测序、蛋白互作检测、免疫荧光染色 | NA | 图像、测序数据、蛋白质互作数据 | 人类和小鼠子宫内膜组织、细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5617 | 2025-10-06 |
Interrogating mediators of single-cell transcriptional changes in the acute damaged cerebral cortex: Insights into endothelial-astrocyte interactions
2025-Jun, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2025.104003
PMID:40090391
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究内皮细胞EphA4在脑损伤后调控星形胶质细胞转录组变化的作用机制 | 首次揭示内皮细胞特异性敲除EphA4可通过影响星形胶质细胞基因表达和亚群分布促进神经保护反应 | 研究基于实验性TBI模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究脑损伤后细胞特异性转录变化的介导机制 | 大脑皮层中的内皮细胞和星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5618 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis based on IFN-γ and SASP related genes, bulk RNA and single-cell sequencing to evaluate the prognosis and immune landscape of stomach adenocarcinoma
2025-Jun, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01646-7
PMID:40293675
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研究论文 | 基于IFN-γ和SASP相关基因开发胃腺癌预后风险模型并评估免疫景观 | 首次结合IFN-γ和衰老相关分泌表型相关基因对胃腺癌进行分子分型,并整合bulk RNA和单细胞测序数据构建预后模型 | 数据主要来源于TCGA数据库,需要外部验证 | 识别胃腺癌分子亚型并开发预后风险模型 | 胃腺癌患者 | 生物信息学 | 胃腺癌 | Cox回归分析, LASSO回归分析, 非负矩阵分解, 单细胞测序, bulk RNA测序 | 预后风险模型 | 基因组数据, 临床数据, 单细胞数据 | TCGA数据库中的胃腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
5619 | 2025-10-06 |
One probe fits all: a highly customizable modular RNA in situ hybridization platform expanding the application of SABER DNA probes
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204775
PMID:40446186
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研究论文 | 开发了一种高度可定制的模块化RNA原位杂交平台OneSABER,扩展了SABER DNA探针的应用 | 创建统一开放平台连接多种常用和新开发的原位杂交方法,使用单一类型DNA探针实现信号扩增 | NA | 开发通用型RNA原位杂交平台以简化实验流程并降低研究成本 | 再生性扁虫Macrostomum lignano和Schmidtea mediterranea的整体样本,以及福尔马林固定石蜡包埋的小鼠肠道切片 | 分子生物学 | NA | RNA原位杂交,信号扩增交换反应 | NA | 图像数据 | 多种生物样本包括扁虫和小鼠组织 | NA | RNA原位杂交,单重和多重检测,比色和荧光检测 | OneSABER平台 | 基于SABER方法的模块化DNA探针系统,支持多种信号检测技术 |
5620 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Defines N7-Methylguanosine (m7G)-Mediated Modifications' Role in Prognosis and the Tumor Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70992
PMID:40485623
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析,揭示m7G修饰在肝细胞癌预后和肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次系统分析m7G修饰模式与肝细胞癌免疫微环境的关系,并建立m7Gscore评分系统 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索m7G修饰在肝细胞癌预后和免疫治疗反应中的作用机制 | 肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, ssGSEA, GSVA, 主成分分析, 蛋白质印迹, 免疫组化, RT-qPCR | 无监督聚类, 主成分分析 | 转录组数据, 蛋白质数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的多个肝细胞癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |