单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 5601 - 5620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5601 | 2024-12-10 |
Cross-modality mapping using image varifolds to align tissue-scale atlases to molecular-scale measures with application to 2D brain sections
2024-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47883-4
PMID:38664422
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研究论文 | 本文提出了一种在分子尺度转录组学和组织尺度图谱之间建立对应关系的方法 | 通过将空间转录组数据表示为编码位置和高维特征（基因、细胞类型）身份的广义函数，解决了传统图像表示无法有效建模高维数据的问题 | NA | 解决在图谱构建和跨样本/技术对齐中，由于样本稀少和传统图像表示无法有效建模高维数据的问题 | 小鼠脑图谱与基于基因和细胞的转录组数据（来自MERFISH和BARseq技术）以及组织病理学和跨物种图谱 | 数字病理学 | NA | LDDMM | NA | 图像 | NA |
| 5602 | 2024-12-10 |
Glioblastoma-instructed microglia transition to heterogeneous phenotypic states with phagocytic and dendritic cell-like features in patient tumors and patient-derived orthotopic xenografts
2024-04-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01321-8
PMID:38566128
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研究论文 | 研究了胶质母细胞瘤（GBM）患者肿瘤和患者来源的同种异体移植瘤中，GBM诱导的微胶质细胞向具有吞噬和树突状细胞样特征的异质表型状态的转变 | 首次系统地描述了GBM患者肿瘤和PDOX中肿瘤微环境（TME）的单细胞和空间水平特征，揭示了GBM细胞与宿主细胞之间的相互作用及其在TME中的异质性 | 研究主要集中在GBM患者肿瘤和PDOX中的TME，未涉及其他类型的肿瘤或更广泛的免疫细胞群体 | 深入了解GBM生态系统及其在临床前模型中的再现，以提高临床试验的准确性和成功率 | GBM患者肿瘤和患者来源的同种异体移植瘤中的肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多色流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 不同肿瘤表型的GBM PDOX和患者肿瘤样本 |
| 5603 | 2024-12-10 |
Integrated analysis of disulfidptosis-related immune genes signature to boost the efficacy of prognostic prediction in gastric cancer
2024-Mar-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03294-5
PMID:38528532
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研究论文 | 研究探讨了二硫化物应激相关免疫基因在胃癌中的潜在生物标志物价值，并构建了一个预测模型 | 首次揭示了二硫化物应激相关免疫基因在胃癌中的潜在生物标志物价值 | NA | 探索二硫化物应激与免疫相关基因在胃癌中的内在关联，并评估其作为生物标志物的潜力 | 胃癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | Cox和LASSO分析 | 基因表达数据 | 63对胃癌组织样本 |
| 5604 | 2024-12-10 |
Integrative genotyping of cancer and immune phenotypes by long-read sequencing
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44137-7
PMID:38167262
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研究论文 | 本文介绍了一种名为nanoranger的长读长测序工作流程和分析管道，用于整合癌症和免疫表型的基因分型 | 开发了一种灵活的长读长测序工作流程和分析管道nanoranger，能够检测细胞系定义特征，如单核苷酸变异、融合基因、异构体等 | NA | 提高单细胞肿瘤和免疫细胞共进化的追踪能力 | 急性髓系白血病（AML）的亚克隆和骨髓浸润免疫细胞的异质性异构体景观 | 数字病理学 | 血液病 | 长读长测序 | NA | 基因组数据 | 数千个骨髓浸润免疫细胞 |
| 5605 | 2024-12-10 |
Single-cell sequencing reveals the evolution of immune molecules across multiple vertebrate species
2024-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.02.017
PMID:36871615
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了多个脊椎动物物种免疫细胞的转录组特征，揭示了免疫分子在进化过程中的变化 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，系统地比较了多个脊椎动物物种的免疫细胞转录组特征，揭示了免疫分子在进化过程中的保守性和特异性 | 本文仅分析了七个脊椎动物物种的免疫细胞，可能无法全面代表所有脊椎动物的免疫进化特征 | 研究免疫系统在不同脊椎动物物种中的进化特征 | 七个脊椎动物物种的免疫细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 七个脊椎动物物种的免疫细胞 |
| 5606 | 2024-12-10 |
Cytotoxic CD4+ tissue-resident memory T cells are associated with asthma severity
2023-Dec-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.09.003
PMID:37865091
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研究论文 | 研究探讨了细胞毒性CD4+组织驻留记忆T细胞与哮喘严重程度之间的关系 | 发现了在严重哮喘患者中，CD4+组织驻留记忆T细胞（TRM）显著增加，并且这些细胞表达与细胞毒性和炎症相关的基因 | 研究样本仅包括30名患者，可能不足以代表所有哮喘患者的情况 | 探讨不同CD4+ T细胞亚群在哮喘发病机制中的作用 | 从30名轻度和重度哮喘患者中提取的50,000多个气道CD4+ T细胞 | NA | 哮喘 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 30名轻度和重度哮喘患者 |
| 5607 | 2024-12-10 |
Differential abundance testing on single-cell data using k-nearest neighbor graphs
2022-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01033-z
PMID:34594043
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Milo的统计框架，通过在k近邻图上分配细胞到部分重叠的邻域来进行单细胞数据的差异丰度测试 | Milo能够识别被离散化成簇的细胞所掩盖的扰动，并保持批次效应下的错误发现率控制，优于其他差异丰度测试策略 | NA | 开发一种新的统计框架，用于在单细胞数据中进行差异丰度测试，以克服现有方法的局限性 | 单细胞RNA测序数据和模拟数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | NA |
| 5608 | 2024-12-09 |
Rapid and efficient immune response induced by a designed modular cholera toxin B subunit (CTB)-based self-assembling nanoparticle
2025-Apr, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文设计了一种基于霍乱毒素B亚单位（CTB）的自组装纳米颗粒，并研究了其快速免疫激活机制 | 该纳米疫苗通过CTB五聚体和非天然三聚体域自组装，展示了S. Paratyphi A O-多糖抗原，并揭示了其在淋巴结中的动态变化和强大的体液免疫反应能力 | 免疫激活机制的深入理解仍有限，限制了此类纳米载体的进一步扩展 | 研究新型自组装纳米疫苗的快速免疫激活机制，并评估其在不同感染模型中的预防效果 | 基于CTB的自组装纳米颗粒及其在免疫激活中的作用 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 5609 | 2024-12-09 |
A 3D-printed microdevice encapsulates vascularized islets composed of iPSC-derived β-like cells and microvascular fragments for type 1 diabetes treatment
2025-Apr, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文介绍了一种3D打印的微型装置，用于封装血管化的胰岛，这些胰岛由诱导多能干细胞（iPSC）衍生的β样细胞和微血管片段组成，用于治疗1型糖尿病 | 创新点在于使用3D打印技术制造了一种可回收的微型装置，封装了血管化的胰岛，用于长期治疗1型糖尿病 | 研究仅在C57BL/6小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 开发一种新的治疗方法，通过移植血管化的胰岛来治疗1型糖尿病 | 诱导多能干细胞衍生的β样细胞和微血管片段 | NA | 1型糖尿病 | 3D打印技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6小鼠 |
| 5610 | 2024-12-09 |
Granuloma Annulare Exhibits Mixed Immune and Macrophage Polarization Profiles with Spatial Transcriptomics
2025-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.04.024
PMID:38844128
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研究论文 | 研究了环状肉芽肿（GA）的空间转录组学特征，揭示了其免疫和巨噬细胞极化的混合模式 | 首次使用空间转录组学技术分析GA的空间基因表达模式，揭示了GA微环境中T辅助1和T辅助2信号的混合特征以及M1和M2巨噬细胞的极化特性 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者，可能影响结果的普遍性 | 通过空间转录组学技术深入理解环状肉芽肿（GA）的空间基因表达模式 | 环状肉芽肿（GA）患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 6名环状肉芽肿（GA）患者 |
| 5611 | 2024-12-09 |
PTX3 exacerbates hepatocyte pyroptosis in hepatic ischemia-reperfusion injury by promoting macrophage M1 polarization
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113604
PMID:39549552
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研究论文 | 研究探讨了PTX3在肝缺血-再灌注损伤中通过促进巨噬细胞M1极化加剧肝细胞焦亡的作用 | 首次揭示了PTX3在肝缺血-再灌注损伤中通过调节巨噬细胞极化影响肝细胞焦亡的作用 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探讨PTX3在巨噬细胞介导的肝缺血-再灌注损伤中的潜在作用 | PTX3在肝缺血-再灌注损伤中的表达及其对巨噬细胞极化和肝细胞焦亡的影响 | NA | 肝病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和鼠肝缺血-再灌注损伤模型样本 |
| 5612 | 2024-11-29 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity in ovarian cancer and constructs a prognostic signature for prognostic prediction and immunotherapy" [Int. Immunopharmacol. 140 (2024) 112855]
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113489
PMID:39603953
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5613 | 2024-12-09 |
Dynamic transcriptome analysis of osteal macrophages identifies a distinct subset with senescence features in experimental osteoporosis
2024-Dec-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182418
PMID:39480497
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研究论文 | 研究了实验性骨质疏松症中骨髓巨噬细胞的动态转录组分析，识别出具有衰老特征的特定亚群 | 首次揭示了骨质疏松症中骨髓巨噬细胞的异质性及其在衰老和炎症过程中的作用 | 实验仅在卵巢切除的小鼠模型中进行，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨骨髓巨噬细胞在实验性骨质疏松症中的具体功能及其在骨病理生理学中的潜在作用 | 骨髓巨噬细胞及其在骨质疏松症中的基因表达变化 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 卵巢切除的小鼠模型中的骨髓巨噬细胞样本 |
| 5614 | 2024-12-09 |
NK cell subsets define sustained remission in rheumatoid arthritis
2024-Dec-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182390
PMID:39418106
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研究论文 | 研究旨在通过高维表型平台定义类风湿性关节炎持续缓解的免疫学特征 | 首次发现CD8+CD57+KIR2DL1+ NK细胞与类风湿性关节炎的持续缓解相关 | 研究仅限于外周血和滑液中的NK细胞分析，未涉及其他免疫细胞类型 | 探索类风湿性关节炎持续缓解的免疫学标志物 | 类风湿性关节炎患者的外周血和滑液中的NK细胞 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及外周血和滑液中的NK细胞样本 |
| 5615 | 2024-12-09 |
Metabolism and spatial transcription resolved heterogeneity of glutamine metabolism in cervical carcinoma
2024-Dec-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-13275-6
PMID:39639273
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研究论文 | 研究通过AFADESI-MSI和空间转录组技术分析宫颈鳞状细胞癌（CSCC）的代谢和转录特征，揭示了谷氨酰胺代谢的异质性及其与ASCT2表达的关系 | 首次结合AFADESI-MSI和空间转录组技术，全面分析了CSCC的代谢和转录特征，揭示了谷氨酰胺代谢的异质性及其与ASCT2表达的关系 | 研究样本量有限，且仅限于CSCC，未来需扩大样本量并验证其他类型癌症中的适用性 | 探讨宫颈鳞状细胞癌中谷氨酰胺代谢的异质性及其潜在机制 | 宫颈鳞状细胞癌（CSCC）及其正常组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | AFADESI-MSI和空间转录组技术 | NA | 代谢和转录数据 | 122例宫颈癌和30例宫颈炎 |
| 5616 | 2024-12-09 |
Computer-aided analysis reveals metallothionein-positive cancer-associated fibroblasts promote angiogenesis in gastric adenocarcinoma
2024-Dec-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01614-9
PMID:39636347
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研究论文 | 研究分析了胃腺癌中的肿瘤微环境，特别是癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞的异质性及其在肿瘤血管生成中的作用 | 首次发现了一种新型金属硫蛋白阳性癌症相关成纤维细胞（mtCAF），其高表达金属硫蛋白1X（MT1X）并分泌血管内皮生长因子A（VEGFA），可能在胃腺癌的血管生成中起重要作用 | 研究主要基于单细胞测序和空间转录组数据，缺乏体内实验验证 | 探讨胃腺癌肿瘤微环境的异质性及其在肿瘤血管生成中的作用 | 胃腺癌中的肿瘤细胞、癌症相关成纤维细胞（CAFs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、空间转录组 | NA | 单细胞测序数据、空间转录组数据 | 56个胃腺癌单细胞测序样本 |
| 5617 | 2024-12-09 |
Parallel measurement of transcriptomes and proteomes from same single cells using nanodroplet splitting
2024-Dec-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54099-z
PMID:39638780
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研究论文 | 介绍了一种名为nanoSPLITS的平台，通过纳米液滴分裂技术同时测量单细胞的转录组和蛋白质组 | 首次实现了通过纳米液滴分裂技术同时测量单细胞的转录组和蛋白质组，提供了全面的基因调控网络、细胞多样性和时间动态的见解 | NA | 开发一种能够同时测量单细胞转录组和蛋白质组的新技术，以深入理解基因调控网络和细胞多样性 | 单细胞的转录组和蛋白质组 | 生物信息学 | NA | RNA测序和基于质谱的蛋白质组学 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 涉及从人胰腺胰岛分离的初级细胞 |
| 5618 | 2024-12-09 |
Synaptic connectome of the Drosophila circadian clock
2024-Dec-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54694-0
PMID:39638801
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研究论文 | 本文通过Drosophila FlyWire脑连接组生成果蝇昼夜节律钟的全面连接图 | 发现了额外的背侧时钟神经元，揭示了新的间接光输入途径和时钟神经元与下游高级脑中心及神经分泌细胞的稀疏单突触连接 | NA | 研究果蝇昼夜节律网络的连接和功能 | 果蝇的昼夜节律神经网络 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学和受体映射 | NA | 连接组数据 | 约240个神经元 |
| 5619 | 2024-12-09 |
NiCo identifies extrinsic drivers of cell state modulation by niche covariation analysis
2024-Dec-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54973-w
PMID:39639035
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研究论文 | 本文介绍了一种名为NiCo的计算框架，用于整合单细胞分辨率的空间转录组学数据与匹配的单细胞RNA测序参考数据，以推断空间微环境对细胞状态的影响 | NiCo能够预测新的微环境相互作用，这些相互作用调控细胞状态变化，从而影响组织发育和稳态 | NA | 理解细胞状态的调节机制，特别是在组织发育、稳态和疾病中的作用 | 细胞状态的内在和外在驱动因素，特别是微环境对细胞状态的影响 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠胚胎发育、成年小肠和肝脏的数据 |
| 5620 | 2024-12-09 |
Engineering regional diversity: A morphogen screen for patterned brain organoids
2024-Dec-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.11.007
PMID:39642861
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研究论文 | 本文介绍了一种结合形态发生素调节剂筛选和单细胞测序的平台，用于增强脑类器官的区域化 | 本文首次系统性地利用形态发生素信号在干细胞分化中实现神经系统发育的细胞多样性 | NA | 探索形态发生素在神经系统发育中的作用，并开发一种系统性方法来利用这些信号 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |