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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5601 | 2026-04-10 |
Transfer of Damaged Mitochondria from Cancer Cells to Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Tyrosine Kinase Inhibitor Tolerance in EGFR-Mutant Lung Cancer
2026-Mar-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0433
PMID:41329713
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研究论文 | 本研究揭示了EGFR突变型肺癌中,癌细胞通过将受损线粒体转移至癌症相关成纤维细胞,从而促进酪氨酸激酶抑制剂耐受的新机制 | 首次发现RGS5+MYL9+癌症相关成纤维细胞可作为“代谢池”接受肿瘤来源的受损线粒体,并揭示了通过CCL11信号招募、Miro1/RhoA激活形成隧道纳米管的线粒体转移机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和体内实验,临床样本验证及具体分子机制的深入解析有待进一步开展 | 探究EGFR突变型肺腺癌中酪氨酸激酶抑制剂耐受的机制,并寻找克服耐药性的潜在治疗策略 | EGFR突变型肺腺癌的耐药持久性细胞及癌症相关成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5602 | 2026-04-10 |
Immune regulation and cellular crosstalk drive non-fibrotic lung remodeling in pre-metamorphic frogs exposed to paraquat
2026-Feb-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02546-2
PMID:41709280
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研究论文 | 本研究利用组织学分析、行为学检测和单细胞RNA测序技术,探究了环境相关浓度百草枯暴露对Microhyla fissipes蝌蚪的急性肺部反应,揭示了其非纤维化的、免疫驱动的肺重塑程序 | 首次在蝌蚪模型中揭示了急性百草枯暴露诱导的非纤维化肺重塑,并阐明了其涉及上皮-间质协调改变、氧化应激反应和细胞外基质组织的免疫介导适应机制,以及发育信号通路(如Wnt/β-catenin)的重新激活 | 研究结论仅适用于蝌蚪阶段和短期暴露,需要进一步研究评估长期或变态后的结果 | 研究环境化学应激(百草枯暴露)对脊椎动物早期发育阶段肺部急性损伤反应、恢复力和发育可塑性的影响 | Microhyla fissipes(一种蛙)的蝌蚪 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),组织学分析,行为学检测 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据,行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5603 | 2026-04-10 |
A comprehensive evaluation of long-read de novo transcriptome assembly
2026-Feb-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04001-5
PMID:41709347
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研究论文 | 本文对RATTLE、RNA-Bloom2和isONform等长读长从头转录组组装工具进行了全面评估,并与短读长组装工具Trinity进行了性能比较 | 首次在多种数据集(包括模拟数据、spike-in序列和真实生物样本)上系统评估长读长从头转录组组装工具,并分析组装选择对差异基因/转录本表达检测的下游影响 | 长读长组装方法在准确性和冗余度方面仍存在局限,与参考基因组引导的方法相比仍有差距 | 评估长读长从头转录组组装工具的性能,为无高质量参考基因组情况下的差异表达分析提供策略指导 | 人类和豌豆(Pisum sativum)样本的转录组数据 | 生物信息学 | NA | 长读长测序、转录组组装、差异表达分析 | NA | 测序数据(模拟数据、真实生物样本数据) | 多种数据集,覆盖6-60百万读长的测序深度 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | cDNA测序、直接RNA测序、单细胞测序 | ONT, PacBio | Oxford Nanopore Technologies (ONT) cDNA测序、ONT直接RNA测序、Pacific Biosciences (PacBio) 10×单细胞测序 |
| 5604 | 2026-04-10 |
Upregulation of TNFR2 Precedes TOX Expression by Exhausted T cells and Restricts Antitumor and Antiviral Immunity
2026-Feb-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3455
PMID:41269210
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研究论文 | 本研究揭示了TNFR2上调在T细胞耗竭过程中的关键作用,并探索了其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 首次发现TNFR2上调是T细胞从祖细胞耗竭向终末耗竭转变的上游调控因子,并证明TNFR2拮抗可增强抗肿瘤和抗病毒免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床转化仍需进一步验证 | 探究TNFR2在调节T细胞耗竭和TOX表达中的作用,以及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 人类和小鼠肿瘤浸润CD8+ T细胞,以及TNFR2敲除小鼠模型 | 免疫学 | 肿瘤和慢性病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 人类和小鼠肿瘤浸润CD8+ T细胞样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 5605 | 2026-04-10 |
Dissection of Gαs and Hedgehog Signaling Cross-talk Reveals Therapeutic Opportunities to Target Hedgehog-Dependent Tumors
2026-Feb-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1109
PMID:41460725
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研究论文 | 本研究通过组织学、批量RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs和Hedgehog信号通路的交叉调控机制,并提出了针对Hedgehog依赖性肿瘤(如基底细胞癌)的潜在治疗策略 | 发现Gαs通路失活驱动的肿瘤与经典Hedgehog信号激活的肿瘤高度相似,且这些肿瘤独立于SMO和GPR161,为SMO非依赖的致癌Hedgehog信号模型提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类BCC样本,尚未在大型临床试验中验证BAY60-6583的治疗效果 | 探索Gαs和Hedgehog信号通路的交叉调控机制,并寻找针对Hedgehog依赖性肿瘤的治疗机会 | 小鼠基底细胞癌样肿瘤和人类基底细胞癌样本 | 分子生物学与肿瘤学 | 基底细胞癌 | 组织学、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织学图像 | 未明确指定具体样本数量,涉及小鼠肿瘤模型和人类BCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5606 | 2026-04-10 |
Spatiotemporal interplay between epithelial and mesenchymal cells drives human dentinogenesis
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69545-3
PMID:41690906
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建了人类牙齿从起始到萌出阶段的发育图谱,聚焦于上皮-间充质相互作用 | 揭示了牙上皮通过WNT-NOTCH顺序激活模型调控牙乳头细胞分化,并识别了关键信号分子;首次发现DLX6-AS1牙乳头细胞可响应牙上皮信号,且能从成体牙髓干细胞中分离,成功在体内疾病模型中生成管状牙本质 | 未明确提及研究的具体局限性,如样本规模、技术验证或临床转化挑战 | 探究人类牙齿发育过程中上皮与间充质细胞的时空相互作用机制,为牙本质缺陷修复提供再生医学基础 | 人类牙齿发育过程中的牙上皮细胞和牙乳头细胞,以及成体牙髓干细胞 | 数字病理学 | 牙本质缺陷 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 未明确指定样本数量,但涵盖从起始到萌出阶段的人类牙齿发育过程 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5607 | 2026-04-10 |
Molecular Mechanisms of FLASH Radiotherapy in Alleviating Lung Normal Tissue Injury: Insights from Single-Cell Sequencing
2026-Feb-12, Radiation research
IF:2.5Q2
DOI:10.1667/RADE-25-00125
PMID:41679749
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了FLASH放疗在减轻肺正常组织损伤中的分子机制 | 首次在肺癌小鼠模型中结合单细胞测序全面比较FLASH放疗与传统放疗对正常肺组织和肿瘤的差异分子响应 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;分子机制尚未完全阐明 | 探究FLASH放疗减轻正常组织毒性的分子机制 | 肺癌小鼠模型中的正常肺组织和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达谱 | 肺癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5608 | 2026-04-10 |
PURE-seq integrates FACS and PIP-seq for single-cell genomics of ultra-rare cells
2026-Jan-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68146-w
PMID:41565684
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PURE-seq的新方法,该技术整合了FACS和PIP-seq,用于对超稀有细胞进行单细胞基因组学研究 | 开发了PURE-seq技术,通过直接FACS分选细胞到PIP-seq反应中,实现了对超稀有细胞(如稀有度达百万分之一的细胞)的高效捕获和单细胞测序 | NA | 开发一种高灵敏度的方法,用于单细胞测序超稀有细胞,以解决传统单细胞转录组学中稀有细胞群体被稀释的问题 | 循环肿瘤细胞(来自转移性黑色素瘤患者血液)以及年轻、老年和中年小鼠的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞基因组学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学,FACS,PIP-seq | NA | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5609 | 2026-04-10 |
CD19 CAR T-Cell Therapy for Autoimmune Hemolytic Anemia
2026-Jan-15, The New England journal of medicine
DOI:10.1056/NEJMoa2509820
PMID:41534043
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研究论文 | 本研究评估了CD19 CAR T细胞疗法在治疗多难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和疗效 | 首次将CD19 CAR T细胞疗法应用于多难治性自身免疫性溶血性贫血,并利用多组学分析揭示了复发特异性B细胞生态位的细胞间相互作用 | 样本量较小(11例患者),中位随访时间仅12.2个月,需要更大规模和更长期的随访研究 | 评估CD19 CAR T细胞疗法在多难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和疗效 | 多难治性自身免疫性溶血性贫血患者 | NA | 自身免疫性溶血性贫血 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、配对B细胞受体测序 | NA | 临床数据、多组学数据 | 11例患者(5例来自同情使用项目,6例来自1期研究) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5610 | 2026-04-10 |
MIF-mediated reprogramming of myeloid lineage within the glioma tumor microenvironment impacts the efficacy of immune stimulatory gene therapy
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.699283
PMID:41648606
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析野生型和突变型IDH1胶质瘤的细胞异质性,重点关注髓系细胞群,揭示了MIF-CD74轴在调节胶质瘤免疫微环境中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和MIF-CD74轴机制研究,在胶质瘤中揭示MIF介导的髓系细胞重编程对免疫刺激基因疗法疗效的影响 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限,且未详细探讨其他免疫细胞亚群的作用 | 探究胶质瘤肿瘤微环境中髓系细胞的异质性及其对免疫疗法疗效的影响 | 野生型和突变型IDH1胶质瘤的髓系细胞群,特别是单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及wtIDH1和mIDH1胶质瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5611 | 2026-04-10 |
Reversing lysosomal dysfunction restores youthful state in aged hematopoietic stem cells
2025-Dec-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.012
PMID:41289991
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研究论文 | 本研究揭示了溶酶体功能障碍是造血干细胞衰老的关键驱动因素,通过抑制溶酶体过度活化可恢复老年造血干细胞的年轻状态 | 首次发现老年造血干细胞中溶酶体呈现过度酸化、耗竭、损伤和异常激活状态,并证明通过抑制v-ATPase逆转溶酶体功能障碍可显著恢复造血干细胞的再生能力 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 | 探究溶酶体在造血干细胞衰老中的作用机制,并寻找恢复老年造血干细胞功能的干预策略 | 老年造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组学、功能分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5612 | 2026-04-10 |
Standardized metrics for assessment and reproducibility of imaging-based spatial transcriptomics datasets
2025-Dec-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02811-9
PMID:41339526
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研究论文 | 本研究通过生成Spatial Touchstone数据集,评估了Xenium和CosMx平台在成像空间转录组学中的标准化指标,并开发了SpatialQM软件以促进数据评估和整合 | 首次提出了标准化指标和操作程序(STSOPs)以及开源软件SpatialQM,用于评估成像空间转录组学技术的可重复性和性能,并建立了多组学数据整合的最佳实践 | 研究仅评估了Xenium和CosMx两个平台,可能未覆盖所有成像空间转录组学技术;样本来源和数量(254个空间谱)可能限制通用性 | 评估成像空间转录组学技术的标准化指标,提高数据可重复性和跨平台比较能力 | 六种组织类型的空间转录组学数据,使用Xenium和CosMx平台进行分析 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学,原位杂交技术 | NA | 空间转录组学数据,图像数据 | 254个空间谱,涵盖六种组织类型 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学,单细胞分析 | Xenium, CosMx | Xenium和CosMx平台用于成像空间转录组学分析,具有不同的化学方法 |
| 5613 | 2026-04-10 |
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Nov-14, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf367
PMID:40628395
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研究论文 | 本研究通过比较血浆蛋白质组学和单细胞转录组学,描述了HIV-1治疗停止后病毒反弹前的免疫反应特征 | 发现病毒反弹前CD16++单核细胞显著增加并具有增强的抗病毒基因表达,以及血浆中炎症蛋白在可检测反弹后出现 | 研究样本可能有限,且未详细探讨长期临床影响或治疗策略的具体验证 | 识别治疗停止后病毒反弹前的早期信号,以延长病毒反弹时间并治愈HIV-1 | 外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞转录组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组学, 血浆蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5614 | 2026-04-10 |
CREBBP Mutation as a Culprit for Negative SSTR2 PET in Neuroendocrine Tumors
2025-Oct, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-025-02040-1
PMID:40779286
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研究论文 | 本研究旨在揭示导致神经内分泌肿瘤68Ga-DOTATATE PET成像阴性的分子和遗传因素 | 首次通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序,揭示了CREBBP突变与SSTR2表达阴性/低表达及PET成像阴性之间的关联 | 回顾性研究,样本量较小(18例患者),需要更大规模的前瞻性研究验证 | 阐明神经内分泌肿瘤中68Ga-DOTATATE PET成像阴性的分子遗传机制 | 肺、回肠或胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 单细胞体细胞变异检测, PET/CT成像 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 医学影像数据 | 18例神经内分泌肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 5615 | 2026-04-10 |
Autophagy Upregulation in Mutant Isocitrate Dehydrogenase 1 (IDH1) Glioma Uncovers a Novel Therapeutic Target
2025-Sep-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7483444/v1
PMID:40964044
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研究论文 | 本研究揭示了突变型异柠檬酸脱氢酶1(mIDH1)胶质瘤中自噬上调作为关键生存途径,并探索了通过自噬抑制增强放射敏感性的新治疗策略 | 首次发现mIDH1胶质瘤中自噬上调作为能量来源,并利用合成蛋白纳米颗粒递送siRNA靶向Atg7抑制自噬,从而增强放射敏感性并诱导肿瘤消退 | 研究主要基于人类和小鼠细胞模型及小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的生存机制并开发新的治疗靶点 | 人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞及小鼠模型 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 5616 | 2026-04-10 |
Co-development of mesoderm and endoderm enables organotypic vascularization in lung and gut organoids
2025-Aug-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.041
PMID:40592324
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研究论文 | 本研究通过共分化中胚层和内胚层,在诱导多能干细胞衍生的肺和肠道类器官中实现器官特异性血管化 | 首次在类器官中通过共分化策略实现器官特异性血管化,并揭示BMP信号调控内皮-上皮祖细胞比例的关键作用 | 研究主要基于体外模型,体内移植实验仅在小鼠中进行,人类疾病模型的临床转化仍需进一步验证 | 研究人类器官发生和疾病中复杂细胞间通讯的机制 | 诱导多能干细胞衍生的肺和肠道类器官 | 发育生物学 | FOXF1突变相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5617 | 2026-04-10 |
Single-cell elderly blood-CSF atlas implicates peripherally influenced immune dysregulation in normal pressure hydrocephalus
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412159122
PMID:40324076
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了特发性正常压力脑积水患者外周血和脑脊液的细胞图谱,揭示了与认知功能下降相关的免疫失调 | 首次创建了特发性正常压力脑积水的单细胞转录组图谱,并发现了外周血和脑脊液单核细胞的促炎性改变与认知功能的相关性 | 样本仅来自特发性正常压力脑积水患者,缺乏健康对照组或其他神经系统疾病对照 | 探究特发性正常压力脑积水的免疫失调机制及其与认知功能的关系 | 特发性正常压力脑积水患者的外周血和脑脊液细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 140,207个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5618 | 2026-04-10 |
Single-cell transcriptomic analysis identified resistant MDSCs and a stress-tolerant gene co-expression network as common MDSC features across multiple disease settings
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565211
PMID:40264770
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析,识别了在多种疾病环境中常见的耐药性MDSCs和一个应激耐受基因共表达网络,作为MDSC的共同特征 | 首次结合炎症信号和细胞应激(血清饥饿)诱导出具有保留MDSC特征的细胞群(耐药性MDSCs),并识别了一个特异性于这些细胞的应激耐受基因共表达模块 | 研究主要基于体外诱导模型和已发表的转录组数据集,可能未完全反映体内复杂环境 | 识别跨多个疾病环境的MDSC共同分子特征,以帮助细胞分类 | 人源单核细胞性MDSCs(M-MDSCs)和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5619 | 2026-04-10 |
Regulatory T cell therapies: from patient data to biological insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675114
PMID:41246323
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综述 | 本文综述了调节性T细胞(Treg)疗法在治疗自身免疫性疾病、炎症性疾病、移植物抗宿主病和促进器官移植耐受方面的应用,并探讨了如何从临床样本和数据中学习以优化Treg疗法 | 整合了临床样本数据与先进的多组学监测技术(如单细胞多组学分析、表观遗传分析和空间转录组学),以优化Treg疗法作为“活体药物” | NA | 优化调节性T细胞疗法,以建立跨多种临床环境的免疫耐受 | 调节性T细胞(Treg),包括多克隆、抗原特异性、转化型、TCR工程化和CAR工程化Treg | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病、炎症性疾病、移植物抗宿主病 | 单细胞多组学分析、表观遗传分析、空间转录组学 | NA | 临床样本数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 5620 | 2026-04-10 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微孔微针与CAR-TREM2-巨噬细胞的策略,通过调节纤维化微环境来管理疤痕 | 工程化构建了能够靶向DPP4成纤维细胞并调节疤痕微环境中内皮细胞亚型的CAR-TREM2-巨噬细胞,并首次将其与微孔微针递送系统结合用于疤痕治疗 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序分析,缺乏大规模的体内长期疗效和安全性验证 | 开发一种通过多因子调节疤痕微环境来抑制疤痕形成的有效治疗策略 | 皮肤损伤后的疤痕组织,重点关注DPP4阳性成纤维细胞、异质性血管内皮细胞和TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤疤痕 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |