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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5581 - 5600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5581 | 2025-10-06 |
Malignant epithelial cell marker-driven risk signature enables precise stratification in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610991
PMID:40496864
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了食管癌恶性上皮细胞标志物驱动的风险特征模型 | 首次在单细胞分辨率下系统表征食管癌上皮细胞异质性，基于恶性上皮亚群标志基因构建六基因预后模型，并实验验证关键基因HMGB3的致癌功能 | 研究样本量有限，主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发能够精确预测食管癌预后、免疫状态和药物反应的风险分层模型 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)组织和细胞系 | 数字病理 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, 细胞功能实验 | 多基因风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO(GSE53624)队列的食管癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5582 | 2025-10-06 |
Deciphering mitochondrial dysfunction in keratoconus: Insights into ACSL4 from machine learning-based bulk and single-cell transcriptome analyses and experimental validation
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.05.013
PMID:40496889
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研究论文 | 通过机器学习驱动的转录组分析和实验验证揭示ACSL4在圆锥角膜线粒体功能障碍中的关键作用 | 首次结合机器学习算法、单细胞转录组分析和体外实验验证，系统阐明ACSL4作为圆锥角膜线粒体功能障碍的关键生物标志物 | 研究主要基于转录组数据，功能机制验证仍需进一步深入 | 探究线粒体功能障碍在圆锥角膜发病机制中的作用 | 圆锥角膜患者转录组数据和人类基质角质细胞 | 机器学习 | 圆锥角膜 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, Western blot | 多种机器学习算法 | 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5583 | 2025-06-13 |
[ELUCIDATION OF PATHOGENESIS IN HUMAN INFLAMMATORY SKIN DISEASES USING SINGLE-CELL RNA-SEQ ANALYSIS]
2025, Arerugi = [Allergy]
DOI:10.15036/arerugi.74.107
PMID:40500185
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5584 | 2025-10-06 |
OrthologAL: A Shiny application for quality-aware humanization of non-human pre-clinical high-dimensional gene expression data
2024-Nov-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.25.625000
PMID:39651293
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研究论文 | 开发了一个名为OrthologAL的Shiny应用程序，用于将非临床前高维基因表达数据质量感知地转换为人类同源基因数据 | 利用BioMart数据库访问Ensembl中的不同基因集，无需用户编写代码即可实现非人类转录组向人类同源基因的转换 | NA | 促进药理学转录组学数据库在临床前研究模型中的应用，并促进非人类转录组的人类同源基因转换 | 单细胞、单核和空间转录组数据，包括髓母细胞瘤患者来源原位异种移植模型以及小鼠和大鼠脊髓损伤模型 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤, 脊髓损伤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5585 | 2025-10-06 |
Chromosome-contiguous genome for the Haecon-5 strain of Haemonchus contortus reveals marked genetic variability and enables the discovery of essential gene candidates
2024-11, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2024.08.003
PMID:39168434
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研究论文 | 本研究报道了澳大利亚Haemonchus contortus寄生虫Haecon-5菌株的高质量染色体水平基因组，并利用机器学习方法预测了潜在的关键基因 | 首次提供了Haecon-5菌株的染色体连续基因组，揭示了与英国ISE菌株的显著遗传差异，并采用跨物种机器学习方法预测了必需基因 | 研究主要基于计算预测，候选基因的功能验证需要后续实验研究 | 构建高质量基因组资源以支持捻转血矛线虫的基础研究和药物靶点发现 | Haemonchus contortus寄生虫Haecon-5菌株 | 基因组学 | 寄生虫感染 | 基因组测序, 转录组分析, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习 | 基因组序列, 转录组数据, 表观遗传数据 | 一个特定菌株(Haecon-5)的完整基因组分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 5586 | 2025-10-06 |
Matrisomics: Beyond the extracellular matrix for unveiling tumor microenvironment
2024-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2024.189178
PMID:39241895
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综述 | 本文系统回顾了肿瘤微环境中基质组的研究进展，涵盖多组学方法和新技术应用 | 首次整合多组学水平（表观基因组学、基因组学、转录组学、蛋白质组学）和新兴测序技术研究肿瘤基质组 | 肿瘤基质组的具体机制和临床应用尚未完全阐明 | 探索肿瘤微环境中基质组的表达模式和功能作用 | 肿瘤组织中的基质组蛋白及其相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5587 | 2025-10-06 |
Hematopoietic cells emerging from hemogenic endothelium exhibit lineage-specific oxidative stress responses
2024-11, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107815
PMID:39326495
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类胚胎造血过程中不同血细胞谱系对缺氧和氧化应激的特异性反应 | 首次在单细胞水平描述不同造血谱系对缺氧的转录反应，发现红细胞对氧化应激的特殊敏感性及代谢途径差异 | 研究主要基于体外模型，体内验证仍需进一步研究 | 探究缺氧对人类内皮-造血转变及后续造血过程的影响 | 人造血内皮细胞衍生的不同血细胞谱系 | 单细胞生物学 | 血液发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5588 | 2025-10-06 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
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研究论文 | 本研究通过构建结核分枝杆菌单克隆抗体库并筛选具有限制细菌能力的抗体，揭示了抗体Fab和Fc区域在结核病免疫防御中的协同作用机制 | 首次系统性地通过Fc区域交换技术优化保护性抗体，并利用单细胞转录组学揭示了抗体介导的结核分枝杆菌限制依赖于中性粒细胞的早期激活 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；抗体作用机制仍需进一步深入探索 | 探究抗体介导的结核分枝杆菌限制机制 | 结核分枝杆菌单克隆抗体及其Fc变异体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学，Fc区域交换技术，单克隆抗体筛选 | NA | 转录组数据，免疫学数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 5589 | 2025-10-06 |
The frequency of CD38+ alveolar macrophages correlates with early control of M. tuberculosis in the murine lung
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52846-w
PMID:39358361
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CD38+肺泡巨噬细胞在控制结核分枝杆菌感染中的关键作用 | 首次发现CD38+肺泡巨噬细胞亚群在结核感染控制中的动态作用及其表观遗传预激活特征 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究肺泡巨噬细胞亚群在结核病控制中的作用机制 | 小鼠肺泡巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5590 | 2025-10-06 |
The estrogen response in fibroblasts promotes ovarian metastases of gastric cancer
2024-09-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52615-9
PMID:39349474
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素通过激活ER-MDK-LRP1信号轴促进胃癌卵巢转移的分子机制 | 首次在单细胞水平发现卵巢转移灶中成纤维细胞高表达雌激素受体和中期因子，并阐明雌激素-MDK-LRP1信号轴在胃癌卵巢转移中的关键作用 | 样本量相对有限（18例患者），需要更大规模研究验证 | 探究胃癌卵巢转移的分子机制，特别是雌激素在其中的作用 | 18例伴有卵巢转移的胃癌患者的45个肿瘤样本 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例患者的45个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5591 | 2025-10-06 |
CD38+ Alveolar macrophages mediate early control of M. tuberculosis proliferation in the lung
2024-Jul-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3934768/v1
PMID:39070650
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研究论文 | 通过多模态单细胞RNA测序分析揭示了CD38+肺泡巨噬细胞在结核分枝杆菌感染早期控制细菌增殖的关键作用 | 首次发现CD38+单核细胞来源的肺泡巨噬细胞和组织驻留肺泡巨噬细胞在结核感染过程中作为细菌生长的重要控制器，并揭示其表观遗传预激活特征 | 研究聚焦于特定感染时间点的巨噬细胞亚群分析，尚未完全阐明所有巨噬细胞亚型在结核控制中的具体机制 | 探究不同巨噬细胞亚群在结核分枝杆菌感染过程中的功能作用和动态变化 | 肺泡巨噬细胞亚群，包括CD38+单核细胞来源的肺泡巨噬细胞和组织驻留肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序，scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 5592 | 2025-10-06 |
An inducible genetic tool to track and manipulate specific microglial states reveals their plasticity and roles in remyelination
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.005
PMID:38821054
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研究论文 | 开发了一种可诱导的遗传工具Clec7a-CreER，用于追踪和操纵特定小胶质细胞状态，揭示其可塑性及在髓鞘再生中的作用 | 创建了首个特异性靶向PAMs和DAMs小胶质细胞状态的可诱导Cre驱动工具，首次直接证明了小胶质细胞状态的可塑性及其在疾病恢复中的功能 | 未明确说明样本规模和技术重复次数，疾病模型范围有限 | 研究小胶质细胞状态的可塑性及其在神经系统发育和疾病中的功能 | 大脑实质中的增殖区域相关小胶质细胞(PAMs)和疾病相关小胶质细胞(DAMs) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，遗传谱系追踪，细胞特异性消融 | 遗传工程小鼠模型 | 基因表达数据，细胞追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5593 | 2025-10-06 |
Loss of function of male-specific lethal 3 (Msl3) does not affect spermatogenesis in rodents
2024-05, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.669
PMID:37847071
|
研究论文 | 本研究探讨了Msl3基因在啮齿类动物精子发生中的作用 | 首次在哺乳动物中使用条件性基因敲除模型研究Msl3在减数分裂中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不适用于其他哺乳动物 | 探究Msl3基因在哺乳动物减数分裂进入中的作用 | 小鼠精子发生过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5594 | 2025-10-06 |
An individualized stemness-related signature to predict prognosis and immunotherapy responses for gastric cancer using single-cell and bulk tissue transcriptomes
2024-01, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6908
PMID:38168907
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研究论文 | 开发基于胃癌干性特征的个体化签名用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次构建基于样本内基因相对表达排序的个体化干性特征签名，克服批次效应限制 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床验证 | 开发个体化胃癌预后和免疫治疗反应预测模型 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 基于基因对相对表达排序的签名模型 | 基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5595 | 2025-10-06 |
Abomasal RNA-seq reveals a strong local cellular response in suckling lambs with resistance against Haemonchus contortus
2023-11, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2023.06.008
PMID:37673202
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析比较了抗蠕虫感染的Santa Ines羊和易感Ile de France羊皱胃组织的转录组差异 | 首次在哺乳羔羊中结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据揭示抗蠕虫感染的黏膜特异性免疫机制 | 样本量较小（每组4只），仅针对特定品种和年龄段的羔羊 | 探索羊对Haemonchus contortus蠕虫感染的抗性分子机制 | Santa Ines和Ile de France品种的哺乳羔羊 | 转录组学 | 寄生虫感染 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 差异表达分析 | RNA测序数据 | 8只羔羊（SI和IF各4只） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5596 | 2025-10-06 |
3D-printed advanced scaffold armed with exosomes derived from human skeletal stem cell identified by single-cell RNA sequencing enhances osteochondral regeneration
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.04.028
PMID:40487240
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研究论文 | 本研究开发了一种装载人骨骼干细胞外泌体的3D打印水凝胶支架，用于增强骨软骨再生 | 利用单细胞RNA测序鉴定具有高分化潜能的骨骼干细胞，并首次将其外泌体与3D打印技术结合构建新型生物支架 | 研究仅在动物模型中进行验证，尚未进行临床试验 | 开发有效的骨软骨缺损修复策略 | 大鼠骨软骨缺损模型、人骨骼干细胞、骨髓间充质干细胞 | 组织工程 | 骨软骨缺损 | 单细胞RNA测序, 3D打印, 流式细胞术, 高通量测序 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5597 | 2025-10-06 |
l-Cysteine Alleviates Peritoneal Fibrosis by Repressing PKM2 in Peritoneal Mesothelial Cells
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500229R
PMID:40497367
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研究论文 | 本研究探讨了L-半胱氨酸通过抑制PKM2缓解腹膜纤维化的分子机制 | 首次揭示PKM2通过乙酰化H3K9促进SNAI2表达进而诱导间皮-间质转化的新机制 | 分子机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验验证 | 探索腹膜纤维化的发病机制及治疗策略 | 腹膜间皮细胞和腹膜透析患者 | 分子生物学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 染色质免疫沉淀, 基因沉默 | NA | 单细胞RNA测序数据, 分子实验数据 | 长期腹膜透析患者的腹腔积液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5598 | 2025-10-06 |
Engineering CRISPR System-Based Bacterial Outer Membrane Vesicle Potentiates T Cell Immunity for Enhanced Cancer Immunotherapy
2025-Jun-11, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501565
PMID:40495695
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR系统的工程化细菌外膜囊泡，用于增强T细胞免疫以改善癌症免疫治疗效果 | 通过工程化改造大肠杆菌BL21来源的外膜囊泡，实现了多基因的高效包装和递送，显著增强了T细胞的趋化和活化能力 | 研究主要基于小鼠模型和人工人源化小鼠模型，尚未在真实人体环境中验证 | 开发新型癌症免疫治疗平台，克服免疫检查点阻断治疗的耐药性问题 | 细菌外膜囊泡、T细胞、肿瘤微环境 | 生物医学工程 | 膀胱癌、黑色素瘤、乳腺癌 | CRISPR系统、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | MB49和B16F10小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5599 | 2025-10-06 |
Filtering for Highly Variable Genes and High-Quality Spots Improves Phylogenetic Analysis of Cancer Spatial Transcriptomics Visium Data
2025-Jun-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0614
PMID:40495757
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研究论文 | 探索通过筛选高变异基因和高质量位点来改进癌症空间转录组学Visium数据系统发育分析的方法 | 首次在空间转录组学数据中应用高变异基因筛选和考虑RNA捕获异质性的预处理方法，改进了系统发育重建的准确性 | 仅针对Visium平台数据，方法在其他空间转录组技术中的适用性有待验证 | 开发优化的空间转录组数据预处理流程以提高癌症系统发育分析的准确性 | 癌症空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组测序 | 系统发育分析模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 5600 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Study on Two Synovial Derived Tumors in the Temporomandibular Joint
2025-Jun-11, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70003
PMID:40495754
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫型腱鞘巨细胞瘤的细胞组成与分化轨迹 | 首次在颞下颌关节肿瘤中应用单细胞RNA测序技术，揭示COMP/TGFβ/SMAD信号通路在滑膜软骨瘤病软骨分化中的关键作用 | 样本来源仅限于颞下颌关节，未涉及其他关节的同类疾病 | 探究颞下颌关节两种滑膜来源肿瘤的细胞组成和分化轨迹 | 滑膜软骨瘤病(SC)和弥漫型腱鞘巨细胞瘤(D-TSGCT)患者样本 | 单细胞测序分析 | 颞下颌关节肿瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞培养, 形态学实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种颞下颌关节肿瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |