单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5581 - 5600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5581 | 2025-10-06 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656712
PMID:40501607
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序开发了造血细胞注释方法和分化模型，揭示了应急髓系生成的多层次调控机制 | 开发了通用的细胞注释方法HemaScribe和造血分化定量模型HemaScape，发现了跨不同炎症挑战的髓系祖细胞应急响应模块 | NA | 阐明不同应急髓系生成诱导剂调控造血干细胞和祖细胞的分子机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPC) | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 定量分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5582 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing + TCR Sequencing Reveal the Proportion and Characteristics of Dual TCR T Cells in Tertiary Lymphoid Structures in Pemphigus
2025-May-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.05.008
PMID:40419016
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和TCR测序分析，揭示天疱疮三级淋巴结构中双TCR T细胞的比例和特征 | 首次发现天疱疮三级淋巴结构中含有更高比例的双TCR T细胞，并鉴定出独特的克隆扩增双TCR CXCL13+CD4+ T细胞亚群 | 样本量有限，仅比较了天疱疮、慢性特发性红皮病和健康对照皮肤组织 | 探索天疱疮病理皮肤组织中三级淋巴结构内淋巴细胞的起源、特征及其在发病机制中的作用 | 天疱疮患者、慢性特发性红皮病患者和健康对照者的皮肤组织 | 单细胞组学 | 天疱疮 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 天疱疮、慢性特发性红皮病和健康对照皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 5583 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling demonstrates the combined effect of wheeze phenotype and infant viral infection on airway epithelial development
2025-May-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr9995
PMID:40408478
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了喘息表型和婴儿期病毒感染对2-3岁儿童鼻气道上皮细胞发育的联合影响 | 首次在预先设计的嵌套出生队列中，通过单细胞RNA测序系统比较了四种不同临床表型儿童的气道上皮发育特征 | 样本量相对有限，仅针对2-3岁儿童，且为观察性研究 | 探究喘息表型和呼吸道合胞病毒感染对气道上皮发育的影响机制 | 2-3岁儿童的鼻气道上皮细胞 | 单细胞组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序，体外病毒感染实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自四种临床表型儿童的鼻气道上皮细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5584 | 2025-10-06 |
SCIG: Machine learning uncovers cell identity genes in single cells by genetic sequence codes
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf431
PMID:40433981
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研究论文 | 开发了一种名为SCIG的机器学习方法，通过遗传序列特征识别单细胞中的细胞身份基因 | 首次发现细胞身份基因具有独特的遗传序列特征，并开发了不依赖细胞间比较的识别方法 | NA | 识别单细胞中的细胞身份基因，以理解细胞分化、发育和疾病相关的细胞身份失调 | 人类内皮细胞图谱中的单细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据、遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5585 | 2025-10-06 |
CellTypeAgent: Trustworthy cell type annotation with Large Language Models
2025-May-13, ArXiv
PMID:40463689
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研究论文 | 开发了一种结合大语言模型与数据库验证的可信细胞类型注释工具CellTypeAgent | 首次将大语言模型与数据库验证相结合用于细胞类型注释，有效减轻幻觉问题 | NA | 提高单细胞RNA测序分析中细胞类型注释的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本 | 9个真实数据集，包含36个组织的303种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5586 | 2025-10-06 |
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513
PMID:40203764
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研究论文 | 比较帕博利珠单抗单药或联合低剂量化疗治疗体能状态差的非小细胞肺癌患者的随机二期临床试验 | 首次在PS2患者群体中直接比较免疫单药与免疫联合低剂量化疗的疗效 | 样本量较小（43例患者），为二期临床试验需要更大规模验证 | 探索体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者的最佳免疫治疗方案 | 东部肿瘤协作组体能状态评分为2的晚期非小细胞肺癌患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 临床数据，血液样本分析数据 | 43例患者入组，40例可评估疗效 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5587 | 2025-10-06 |
Single‑cell transcriptomic analysis revealed the tumor‑associated microenvironment of papillary thyroid carcinoma with metastasis
2025-Mar, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2025.14876
PMID:40496475
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了转移性甲状腺乳头状癌的肿瘤相关微环境特征 | 首次在单细胞水平上系统比较了转移性PTC、非转移性PTC和正常组织中免疫细胞的异质性，发现M2巨噬细胞、DC2s和Tregs与淋巴结转移相关 | 样本数量有限，仅分析了单个转移性PTC病例 | 探究甲状腺乳头状癌转移的免疫微环境机制 | 转移性甲状腺乳头状癌患者组织、非转移性PTC组织和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例转移性PTC患者的多组组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5588 | 2025-10-06 |
Pharmacological insights into targeting PI3K/Akt and NF-κB pathways for treating endometriosis-associated infertility
2025 Mar-Apr, Pakistan journal of pharmaceutical sciences
IF:0.7Q4
PMID:40501243
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研究论文 | 本研究通过靶向PI3K/Akt和NF-κB信号通路探讨子宫内膜异位症相关不孕的机制及潜在药物治疗靶点 | 首次在子宫内膜异位症不孕研究中系统整合单细胞RNA测序、细胞培养和动物模型验证PI3K/Akt和NF-κB通路的治疗潜力 | 样本量有限（300例），缺乏多中心验证数据 | 阐明子宫内膜异位症相关不孕的分子机制并识别潜在药物靶点 | 300例子宫内膜异位症患者（轻度和重度）及对照组人群 | 生殖医学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序，细胞培养，动物模型 | 动物模型 | 临床数据，分子表达数据，单细胞测序数据 | 300例患者（分轻度、重度和对照组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5589 | 2025-10-06 |
Unraveling the tumor microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma through single-cell sequencing: A comprehensive review
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189264
PMID:39805342
|
综述 | 通过单细胞测序技术系统综述食管鳞癌肿瘤微环境的研究进展 | 首次在单细胞水平系统整合食管鳞癌肿瘤微环境中各类细胞的异质性特征及相互作用网络 | NA | 阐明食管鳞癌肿瘤微环境的细胞组成与分子特征 | 食管鳞癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞、内皮细胞及成纤维细胞等 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞多组学技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 5590 | 2025-10-06 |
A Risk Model Based on Ferroptosis-Related Genes OSMR, G0S2, IGFBP6, IGHG2, and FMOD Predicts Prognosis in Glioblastoma Multiforme
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70161
PMID:39815665
|
研究论文 | 本研究基于铁死亡相关基因构建了一个风险模型，用于预测多形性胶质母细胞瘤的预后 | 首次基于铁死亡相关基因构建了包含OSMR、G0S2、IGFBP6、IGHG2和FMOD五个基因的风险预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索铁死亡分类及其风险模型在GBM中的意义，评估其在预后评估中的潜力 | 多形性胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 单变量Cox回归, LASSO回归 | 风险预测模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | TCGA-GBM和CGGA-GBM数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5591 | 2025-10-06 |
Exploring the mechanism of action of succinic acid in ovarian cancer via single-cell sequencing of the tumor immune microenvironment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1535504
PMID:40196737
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索琥珀酸在卵巢癌肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 首次结合生物信息学和单细胞测序技术系统分析琥珀酸在卵巢癌治疗中的潜在靶点和作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索琥珀酸在卵巢癌治疗中的潜在靶点和治疗机制 | 卵巢癌患者和正常个体的肿瘤免疫微环境细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5592 | 2025-10-06 |
Gene set optimization for single cell transcriptomics
2025, Computational intelligence methods for bioinformatics and biostatistics : ... international meeting, CIBB ... : revised selected papers. CIBB (Meeting)
DOI:10.1007/978-3-031-89704-7_14
PMID:40487192
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研究论文 | 本文提出了一种针对单细胞转录组数据的基因集优化方法 | 利用人类蛋白质图谱单细胞类型图谱中的细胞类型特异性信息，为基因集计算权重，实现基因集测试的定制化 | 方法依赖于HPA数据库的81种人类细胞类型数据，可能不适用于其他物种或罕见细胞类型 | 提高单细胞RNA测序数据中基因集测试的统计功效和可解释性 | 单细胞转录组数据和基因集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于HPA单细胞类型图谱的81种人类细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5593 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis and single-cell sequencing revealed the lysosome associated molecular subtypes and prognostic model development of papillary thyroid carcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325486
PMID:40493560
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研究论文 | 通过多组学分析和单细胞测序揭示了甲状腺乳头状癌的溶酶体相关分子亚型并开发了预后模型 | 首次系统研究溶酶体在PTC中的作用，开发了基于五个预后相关LAGs的评分系统，并通过单细胞测序解析了这些基因在不同细胞类型中的表达 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证；样本量可能有限 | 研究溶酶体在甲状腺乳头状癌中的作用机制并开发预后预测模型 | 甲状腺乳头状癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 多组学分析, 单细胞测序, western blot, qRT-PCR, 集落形成实验, Transwell实验 | 预后评分模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的PTC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 5594 | 2025-10-06 |
Malignant epithelial cell marker-driven risk signature enables precise stratification in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610991
PMID:40496864
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了食管癌恶性上皮细胞标志物驱动的风险特征模型 | 首次在单细胞分辨率下系统表征食管癌上皮细胞异质性，基于恶性上皮亚群标志基因构建六基因预后模型，并实验验证关键基因HMGB3的致癌功能 | 研究样本量有限，主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发能够精确预测食管癌预后、免疫状态和药物反应的风险分层模型 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)组织和细胞系 | 数字病理 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, 细胞功能实验 | 多基因风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO(GSE53624)队列的食管癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5595 | 2025-10-06 |
Deciphering mitochondrial dysfunction in keratoconus: Insights into ACSL4 from machine learning-based bulk and single-cell transcriptome analyses and experimental validation
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.05.013
PMID:40496889
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研究论文 | 通过机器学习驱动的转录组分析和实验验证揭示ACSL4在圆锥角膜线粒体功能障碍中的关键作用 | 首次结合机器学习算法、单细胞转录组分析和体外实验验证，系统阐明ACSL4作为圆锥角膜线粒体功能障碍的关键生物标志物 | 研究主要基于转录组数据，功能机制验证仍需进一步深入 | 探究线粒体功能障碍在圆锥角膜发病机制中的作用 | 圆锥角膜患者转录组数据和人类基质角质细胞 | 机器学习 | 圆锥角膜 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, Western blot | 多种机器学习算法 | 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5596 | 2025-06-13 |
[ELUCIDATION OF PATHOGENESIS IN HUMAN INFLAMMATORY SKIN DISEASES USING SINGLE-CELL RNA-SEQ ANALYSIS]
2025, Arerugi = [Allergy]
DOI:10.15036/arerugi.74.107
PMID:40500185
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5597 | 2025-10-06 |
OrthologAL: A Shiny application for quality-aware humanization of non-human pre-clinical high-dimensional gene expression data
2024-Nov-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.25.625000
PMID:39651293
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研究论文 | 开发了一个名为OrthologAL的Shiny应用程序，用于将非临床前高维基因表达数据质量感知地转换为人类同源基因数据 | 利用BioMart数据库访问Ensembl中的不同基因集，无需用户编写代码即可实现非人类转录组向人类同源基因的转换 | NA | 促进药理学转录组学数据库在临床前研究模型中的应用，并促进非人类转录组的人类同源基因转换 | 单细胞、单核和空间转录组数据，包括髓母细胞瘤患者来源原位异种移植模型以及小鼠和大鼠脊髓损伤模型 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤, 脊髓损伤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5598 | 2025-10-06 |
Chromosome-contiguous genome for the Haecon-5 strain of Haemonchus contortus reveals marked genetic variability and enables the discovery of essential gene candidates
2024-11, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2024.08.003
PMID:39168434
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研究论文 | 本研究报道了澳大利亚Haemonchus contortus寄生虫Haecon-5菌株的高质量染色体水平基因组，并利用机器学习方法预测了潜在的关键基因 | 首次提供了Haecon-5菌株的染色体连续基因组，揭示了与英国ISE菌株的显著遗传差异，并采用跨物种机器学习方法预测了必需基因 | 研究主要基于计算预测，候选基因的功能验证需要后续实验研究 | 构建高质量基因组资源以支持捻转血矛线虫的基础研究和药物靶点发现 | Haemonchus contortus寄生虫Haecon-5菌株 | 基因组学 | 寄生虫感染 | 基因组测序, 转录组分析, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习 | 基因组序列, 转录组数据, 表观遗传数据 | 一个特定菌株(Haecon-5)的完整基因组分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 5599 | 2025-10-06 |
Matrisomics: Beyond the extracellular matrix for unveiling tumor microenvironment
2024-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2024.189178
PMID:39241895
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综述 | 本文系统回顾了肿瘤微环境中基质组的研究进展，涵盖多组学方法和新技术应用 | 首次整合多组学水平（表观基因组学、基因组学、转录组学、蛋白质组学）和新兴测序技术研究肿瘤基质组 | 肿瘤基质组的具体机制和临床应用尚未完全阐明 | 探索肿瘤微环境中基质组的表达模式和功能作用 | 肿瘤组织中的基质组蛋白及其相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5600 | 2025-10-06 |
Hematopoietic cells emerging from hemogenic endothelium exhibit lineage-specific oxidative stress responses
2024-11, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107815
PMID:39326495
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类胚胎造血过程中不同血细胞谱系对缺氧和氧化应激的特异性反应 | 首次在单细胞水平描述不同造血谱系对缺氧的转录反应，发现红细胞对氧化应激的特殊敏感性及代谢途径差异 | 研究主要基于体外模型，体内验证仍需进一步研究 | 探究缺氧对人类内皮-造血转变及后续造血过程的影响 | 人造血内皮细胞衍生的不同血细胞谱系 | 单细胞生物学 | 血液发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |