单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 5581 - 5600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5581 | 2024-12-11 |
Targeting lymphoid-derived IL-17 signaling to delay skin aging
2023-Jun, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00431-z
PMID:37291218
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研究论文 | 本文研究了皮肤老化过程中IL-17信号通路的作用，并探讨了通过靶向IL-17信号来延缓皮肤老化的可能性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了老年皮肤中T辅助细胞、γδ T细胞和先天淋巴细胞向IL-17表达表型的偏移，并证明了IL-17信号通路的阻断可以减少皮肤炎症并延缓老化特征的出现 | 研究仅在老鼠模型上进行，尚未在人类中验证其效果 | 探讨皮肤老化过程中炎症信号的作用，并寻找延缓皮肤老化的方法 | 皮肤老化过程中的IL-17信号通路及其对皮肤炎症和功能的影响 | NA | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老鼠皮肤样本 |
| 5582 | 2024-12-11 |
Reprogramming Müller glia to regenerate ganglion-like cells in adult mouse retina with developmental transcription factors
2022-11-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq7219
PMID:36417510
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研究论文 | 研究通过过表达特定的转录因子，在成年小鼠视网膜中重新编程Müller胶质细胞以再生类似神经节细胞的细胞 | 首次展示了通过靶向过表达发育性视网膜神经节细胞转录因子，在成年小鼠视网膜中再生类似神经节细胞的能力 | 研究仅在成年小鼠视网膜中进行，尚未在其他物种或神经系统中验证 | 探索通过转录因子调控在成年哺乳动物视网膜中再生特定类型神经元的可能性 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和神经节样细胞 | 神经科学 | NA | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、单细胞转座酶可及染色质测序和电生理学 | NA | 单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据和电生理数据 | 成年小鼠视网膜样本 |
| 5583 | 2024-12-11 |
Multiscale PHATE identifies multimodal signatures of COVID-19
2022-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01186-x
PMID:35228707
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Multiscale PHATE的方法，通过扫描数据的所有粒度级别来学习直接预测疾病结果的抽象生物特征 | 提出了Multiscale PHATE方法，结合扩散凝聚过程，能够在不同分辨率下分析数据拓扑结构，从而提取生物学见解 | NA | 开发一种能够处理复杂和高维数据的计算工具，以提取生物学见解 | COVID-19患者的细胞数据，包括5400万细胞来自168名住院患者 | 生物信息学 | COVID-19 | Multiscale PHATE, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单细胞转座酶可及染色质测序 (scATAC-seq) | NA | 细胞数据 | 5400万细胞来自168名住院患者 |
| 5584 | 2024-12-11 |
SARS-CoV-2 exacerbates proinflammatory responses in myeloid cells through C-type lectin receptors and Tweety family member 2
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.006
PMID:34048708
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2通过C型凝集素受体和Tweety家族成员2在髓系细胞中加剧促炎反应的机制 | 首次识别出SARS-CoV-2刺突蛋白的多个C型凝集素受体和TTYH2作为糖依赖性结合伙伴，并发现这些受体在髓系细胞中的表达与COVID-19严重程度相关 | 研究主要集中在髓系细胞的受体上，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探讨SARS-CoV-2如何通过特定受体在髓系细胞中引发促炎反应，并寻找潜在的治疗靶点 | SARS-CoV-2刺突蛋白与髓系细胞受体的相互作用及其引发的炎症反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的肺部细胞 |
| 5585 | 2024-12-10 |
Heterogeneity of mature oligodendrocytes in the central nervous system
2025-May-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00055
PMID:38934385
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研究论文 | 本文探讨了中枢神经系统中成熟少突胶质细胞的异质性 | 本文通过回顾早期研究并结合现代分子技术，揭示了成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的多样性及其在不同疾病状态下的变化 | 由于研究的时间限制，对成熟少突胶质细胞的亚分类需谨慎，未来研究需利用更先进的技术 | 研究成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的异质性及其在疾病中的变化 | 中枢神经系统中的成熟少突胶质细胞 | NA | 多发性硬化症、阿尔茨海默病、精神疾病 | 单细胞/核RNA测序 | NA | RNA | 至少六个成熟少突胶质细胞亚群 |
| 5586 | 2024-12-10 |
Local ablation disrupts immune evasion in pancreatic cancer
2025-Jan-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217327
PMID:39580047
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研究论文 | 研究局部消融技术在胰腺癌中打破免疫逃逸的作用 | 首次探讨了局部消融技术在胰腺癌中激活宿主免疫系统并克服免疫治疗抵抗的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本，需要进一步的临床试验验证 | 探讨局部消融技术在胰腺癌中的免疫调节作用及其与免疫治疗的协同效应 | 胰腺癌模型、人类胰腺癌样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 局部消融技术 | NA | 空间转录组学、组织学技术 | 小鼠模型、人类样本 |
| 5587 | 2024-12-10 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in ophthalmology]
2024-Dec-11, [Zhonghua yan ke za zhi] Chinese journal of ophthalmology
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼科领域的最新进展 | 单细胞RNA测序技术提供了研究细胞间基因表达和功能特征差异的强大工具 | 本文未提及具体的局限性 | 提供关于眼科疾病发病机制的新见解，并改进诊断和治疗策略 | 眼科疾病的发病机制和诊断治疗策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5588 | 2024-12-10 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-Dec, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
|
研究论文 | 本文讨论了单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的优势 | 利用单细胞和空间转录组学技术，能够以前所未有的细节水平研究共生相互作用 | 主要限制在于同时捕获植物和微生物转录本的技术挑战 | 探讨新型空间和单细胞转录组学技术在研究植物-微生物内共生关系中的应用 | 植物-微生物共生关系 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5589 | 2024-12-10 |
AOPPs induces EMT and fibrosis by activating oxidative stress through ERK/p38 MAPK signaling pathway in endometriosis
2024-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100950
PMID:39241657
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研究论文 | 研究探讨了高级氧化蛋白产物（AOPPs）通过激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导子宫内膜异位症（EMs）中的上皮-间质转化（EMT）和纤维化的机制 | 首次揭示了AOPPs在EMs中通过氧化应激激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导EMT和纤维化的机制 | 研究主要基于临床样本、单细胞测序和体内外模型，缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨AOPPs在子宫内膜异位症中诱导EMT和纤维化的分子机制 | 子宫内膜异位症（EMs）中的上皮-间质转化（EMT）和纤维化 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 使用正常大鼠进行慢性给药研究 |
| 5590 | 2024-12-10 |
The relationship between Sjögren's syndrome and recurrent pregnancy loss: a bioinformatics analysis
2024-Dec, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104363
PMID:39299134
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研究论文 | 研究Sjögren综合征与复发性流产之间的基因关联 | 首次揭示Sjögren综合征与复发性流产共享生物学途径，并鉴定出关键基因KCNN3 | NA | 探讨Sjögren综合征与复发性流产之间的基因关联 | Sjögren综合征和复发性流产的基因数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、limma分析、基因本体论和京都基因与基因组百科全书分析 | NA | 基因表达数据 | 从Gene Expression Omnibus数据库获取的基因数据 |
| 5591 | 2024-12-10 |
ATN-161 alleviates caerulein-induced pancreatitis
2024-Dec, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.002
PMID:39396744
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研究论文 | 研究显示ATN-161通过阻断Integrin-α5信号减轻caerulein诱导的急性胰腺炎病理状况 | 首次揭示了ATN-161作为Integrin-α5拮抗剂在减轻急性胰腺炎症状中的治疗潜力 | NA | 探索减轻急性胰腺炎病理状况的药物干预方法 | ATN-161对caerulein诱导的急性胰腺炎的影响 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 5592 | 2024-12-10 |
Targeting cancer-associated fibroblasts with pirfenidone: A novel approach for cancer therapy
2024-Dec, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102624
PMID:39581071
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研究论文 | 本文探讨了使用吡非尼酮靶向癌症相关成纤维细胞（CAFs）作为癌症治疗的新方法 | 本文提出了一种新的癌症治疗方法，通过吡非尼酮靶向CAFs，并结合化疗药物和纳米载体递送系统，以提高疗效和减少副作用 | 尽管吡非尼酮显示出抗肿瘤潜力，但其安全性和有效性仍需通过临床试验进一步验证 | 研究吡非尼酮在癌症治疗中的应用，特别是通过靶向CAFs来抑制癌症进展 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在癌症进展中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 5593 | 2024-12-10 |
Endothelial KDM5B Regulated by Piezo1 Contributes to Disturbed Flow Induced Atherosclerotic Plaque Formation
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70237
PMID:39643939
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研究论文 | 研究了Piezo1调控的内皮细胞KDM5B在扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的作用 | 首次揭示了Piezo1通过上调KDM5B表达促进动脉粥样硬化斑块形成的机制 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在人体中验证 | 探讨扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的表观遗传调控机制 | 内皮细胞中的KDM5B表达及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了HUVECs细胞和小鼠模型 |
| 5594 | 2024-12-09 |
Statistical and computational methods for enabling the clinical and translational application of spatial transcriptomics
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70119
PMID:39644148
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5595 | 2024-12-10 |
M2 macrophage derived HMOX1 defines chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Dec, Clinical and translational allergy
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/clt2.70014
PMID:39644500
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研究论文 | 本研究旨在开发与慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）相关的巨噬细胞诊断特征 | 提出了基于M2巨噬细胞来源的HMOX1作为CRSwNP的创新诊断标志物 | NA | 开发与CRSwNP相关的巨噬细胞诊断特征 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者和健康对照组的转录组数据 | NA | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | 诊断模型 | 转录组数据 | 54名CRSwNP患者和37名健康对照组，以及29个验证样本 |
| 5596 | 2024-12-10 |
Decoding Functional and Developmental Trajectories of Tissue-Resident Uterine Dendritic Cells Through Integrative Omics
2024-Nov-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5424920/v1
PMID:39606471
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研究论文 | 本文通过综合组学方法解码了组织驻留的子宫树突状细胞的功能和发育轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术，揭示了子宫树突状细胞在不同月经周期和早期妊娠阶段的亚型及其功能角色 | 研究主要集中在子宫树突状细胞的功能和发育轨迹，未涉及其在疾病中的具体应用 | 揭示子宫树突状细胞的分子特征及其在人类子宫内膜中的特定作用 | 子宫树突状细胞及其在不同月经周期和早期妊娠阶段的亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | RNA | 涉及不同月经周期和早期妊娠阶段的子宫组织样本 |
| 5597 | 2024-12-10 |
Single-cell spatial transcriptomics of fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.11.623014
PMID:39605355
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研究论文 | 本文开发了一种用于分析固定石蜡包埋（FFPE）组织样本的单细胞空间转录组学（iSCST）框架，并应用于炎症性肠病（IBD）患者的临床FFPE黏膜活检样本 | 本文首次将iSCST技术应用于FFPE组织样本，并展示了其在识别和量化不同细胞亚群及疾病状态中的差异表达基因方面的优势 | 本文仅分析了57个FFPE黏膜活检样本，样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 开发一种适用于FFPE组织样本的单细胞空间转录组学框架，并应用于炎症性肠病患者的临床样本分析 | 炎症性肠病（IBD）患者的FFPE黏膜活检样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学（iSCST） | NA | 转录组数据 | 57个FFPE黏膜活检样本，包括9个非IBD对照组和11个溃疡性结肠炎患者 |
| 5598 | 2024-12-10 |
The Risk Genes S1PR5, CMC1, and ASAH1 as Potential Targets for the Diagnosis, Immunotherapy, and Treatment of Colon Adenocarcinoma by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Analysis
2024-11-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据构建了一个新的免疫细胞功能风险模型，用于预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次提出了S1PR5、CMC1和ASAH1作为结肠腺癌的新型治疗靶点，并通过单细胞和批量RNA测序数据验证了其潜在的临床应用价值 | 本研究仅在特定的数据集和临床队列中验证了模型的有效性，未来需要在更多独立队列中进行验证 | 开发新的风险模型以预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果，并发现新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Lasso回归分析 | RNA测序数据 | 使用了来自Tumour Immune Single Cell Hub数据库的COAD单细胞数据集GSE146771，并在多个独立队列中进行了验证 |
| 5599 | 2024-12-10 |
Analysis of the heterogeneity and complexity of murine extraorbital lacrimal gland via single-cell RNA sequencing
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.06.005
PMID:38945476
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠眶外泪腺的细胞异质性和复杂性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了小鼠眶外泪腺的细胞多样性，并构建了细胞异质性的图谱 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠的眶外泪腺，未涉及其他物种或组织 | 研究小鼠眶外泪腺的细胞类型和异质性，以了解其对维持眼表健康的作用 | 小鼠眶外泪腺的细胞类型和异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 43,850个高质量细胞 |
| 5600 | 2024-12-10 |
Joint Bayesian estimation of cell dependence and gene associations in spatially resolved transcriptomic data
2024-04-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60002-z
PMID:38664448
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研究论文 | 本文提出了一种联合贝叶斯方法，用于同时估计空间转录组数据中的基因关联和细胞依赖性 | 本文的创新点在于提出了一种联合贝叶斯方法，能够同时估计基因和空间细胞的相关性，从而保留基因表达的依赖结构 | 本文的局限性在于仅通过模拟和真实数据集进行了方法的验证，未探讨其在其他类型数据上的适用性 | 本文的研究目的是开发一种新的方法，用于分析空间转录组数据中的基因关联和细胞依赖性 | 本文的研究对象是空间转录组数据中的基因表达和细胞空间位置 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | 多个真实空间转录组数据集 |