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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5581 | 2026-03-19 |
Reconstitution of the uterine immune milieu after uterus or hematopoietic stem cell transplantation
2026-Mar-11, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adp2583
PMID:41811987
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术,探讨了子宫移植或造血干细胞移植后人类子宫免疫微环境的重建过程 | 首次在人类中系统评估子宫移植和造血干细胞移植后子宫免疫系统的重建,利用单核苷酸多态性和HLA表达差异追踪供体与受体细胞起源,揭示了免疫细胞在转录组、表型和空间层面的恢复能力 | 研究样本量有限,且受他克莫司药物影响,可能限制了组织驻留淋巴细胞特征的体外诱导观察 | 探究人类组织特异性免疫系统的建立与重建机制,特别是在子宫这一持续再生器官中的免疫持久性和恢复能力 | 接受子宫移植或造血干细胞移植的女性患者的子宫内膜免疫细胞 | 单细胞组学 | 移植免疫 | 单细胞RNA测序, 高参数流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确具体样本数量,涉及接受子宫移植或造血干细胞移植的女性患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5582 | 2026-03-19 |
Macrophage SLC9A1 Links Endocytic Trafficking to Innate Immune Activation in Myocardial Injury
2026-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708643
PMID:41847017
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞中的钠氢交换体SLC9A1通过调节巨胞饮作用,连接膜离子转运与心肌损伤后先天免疫激活的新机制 | 首次发现SLC9A1作为连接膜离子转运与炎症信号传导的桥梁,并证实巨噬细胞巨胞饮作用是心肌梗死后先天免疫激活的关键调节器 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;SLC9A1抑制剂EIPA的特异性可能影响其他细胞功能 | 探究心肌梗死后巨噬细胞感知缺血危险信号的上游机制,特别是巨胞饮作用和SLC9A1在先天免疫激活中的作用 | 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞,特别是梗死相关巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,药理学抑制,基因敲除技术 | NA | 基因表达数据,功能表型数据 | 使用单核细胞和单核细胞来源巨噬细胞特异性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5583 | 2026-03-19 |
Crohn's disease under single-cell map: from INFLARE metaplastic cells to rare immune cell subpopulations
2026-03-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153347
PMID:41610714
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术在克罗恩病中发现的多种新型免疫细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 | 系统总结了单细胞测序揭示的克罗恩病相关新型免疫细胞亚群,如INFLAREs、CAITs等,并探讨了它们作为未来治疗靶点的潜力 | 这是一篇综述文章,主要整合现有研究发现,未提供新的原始实验数据 | 总结克罗恩病中通过单细胞测序技术鉴定的关键免疫细胞亚群,并探讨其病理作用与治疗潜力 | 克罗恩病患者样本中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5584 | 2026-03-19 |
Spatial transcriptomics reveals mechanism of autoimmunity driven by internalized autoantibodies
2026-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.14.26346329
PMID:41757163
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了自身抗体内化作为多种自身免疫性疾病共享的致病机制 | 首次通过空间转录组学证明抗体分泌细胞将细胞质物质(如免疫球蛋白RNA)转移到邻近受影响的细胞中,并揭示了自身抗体诱导的转录程序与细胞损伤和特异性炎症反应相关 | NA | 探究自身抗体内化在自身免疫性疾病发病机制中的作用及其普遍性 | 抗Mi2皮肌炎、抗PM/Scl硬化性肌炎、抗U1RNP混合性结缔组织病、抗Ku重叠综合征和抗Scl70系统性硬化症患者的肌肉活检组织和其他组织样本 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 空间转录组学、bulk RNA测序、直接免疫荧光 | NA | 转录组数据、图像数据 | 多个独立队列的患者肌肉活检样本 | NA | 空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5585 | 2026-03-19 |
Systematic analyses uncover endocrine-disrupting chemical-responsive genes linked to endometriosis
2026-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2025.109148
PMID:41443441
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序,识别了与内分泌干扰物反应相关并可能影响子宫内膜异位症风险的基因 | 首次将孟德尔随机化、贝叶斯共定位与单细胞RNA测序整合,系统性地揭示了内分泌干扰物通过特定基因影响子宫内膜异位症风险的分子通路 | 研究主要基于遗传学和转录组学数据,需要进一步的实验验证来确认这些基因在EDC暴露下的功能机制 | 识别内分泌干扰物反应基因,并探究它们如何影响子宫内膜异位症的发病风险 | 与内分泌干扰物反应相关的基因及其在子宫内膜异位症中的潜在作用 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析, 全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5586 | 2026-03-19 |
Mapping kinase-dependent tumor immune adaptation with multiplexed single-cell CRISPR screens
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698516
PMID:41542636
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研究论文 | 本文介绍了一种集成的高通量单细胞CRISPR筛选框架,用于绘制胶质母细胞瘤中T细胞驱动免疫压力的肿瘤内在调控机制 | 结合了CRISPR干扰与激活技术、免疫匹配的肿瘤-T细胞共培养以及大规模单细胞转录组学,系统量化遗传扰动对肿瘤状态和适应性反应的影响 | 研究主要针对胶质母细胞瘤,可能不适用于其他癌症类型;且依赖于体外共培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 绘制肿瘤免疫适应的激酶依赖性调控网络,并识别潜在的免疫逃逸靶点 | 胶质母细胞瘤细胞与T细胞的相互作用 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞CRISPR筛选、单细胞转录组学、CRISPR干扰与激活 | 深度生成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5587 | 2026-03-19 |
A non-canonical role of Myc in programming basal cells as sentinels of upper airway immunity during influenza infection
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696065
PMID:41509430
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研究论文 | 本研究探讨了流感感染期间,Myc在编程基底细胞作为上呼吸道免疫哨兵中的非经典作用 | 揭示了基底细胞作为上皮哨兵,通过MYC依赖的CXCL10-CXCR3轴协调急性修复并招募细胞毒性效应细胞的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类上呼吸道感染后的区域特异性机制仍需进一步验证 | 阐明流感病毒感染后上呼吸道的损伤与修复机制,特别是基底细胞在免疫协调中的作用 | 小鼠上呼吸道(声门下和气管)的假复层上皮细胞,包括纤毛细胞、分泌细胞、神经内分泌细胞和基底细胞 | 数字病理学 | 流感感染 | 单细胞转录组学、成像技术 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5588 | 2026-03-19 |
MANTIS: Analytics toolkit for spatial metabolomics with matching spatial transcriptomics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.20.700581
PMID:41648596
|
研究论文 | 介绍MANTIS,一个用于分析空间代谢组学与空间转录组学数据的统计框架工具包 | 首个统一空间代谢组学、空间转录组学、细胞类型信息和空间域的工具包,强调空间统计、假设检验和混杂因素校正 | NA | 开发一个统计框架,用于分析共注册的空间代谢组学和空间转录组学数据,以发现代谢物空间模式和基因-代谢物关系 | 空间代谢组学和空间转录组学数据,涵盖不同空间技术、组织和物种 | 空间组学 | NA | 空间代谢组学,空间转录组学 | 统计框架 | 空间代谢组学和空间转录组学数据 | NA | NA | 空间代谢组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 5589 | 2026-03-19 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2026-02-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69797-z
PMID:41723121
|
研究论文 | 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序技术,揭示了肝癌中肿瘤细胞“村庄”与微环境之间的分子共依赖性及其对患者预后的影响 | 开发了基于深度学习的策略来空间映射肿瘤细胞状态及其周围环境结构,首次提出肿瘤细胞“村庄”概念,并揭示了村庄特异性分子共依赖性 | 研究主要聚焦于肝癌,结论在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 | 肝癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像, 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像, 转录组数据 | 50个肿瘤生物样本(超过200万个细胞),740名肝癌患者的验证数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5590 | 2026-02-21 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover SPP1⁺ and HLA-DRB5⁺ macrophages as key modulators of the immune microenvironment in colorectal cancer liver metastasis
2026-Feb-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07853-4
PMID:41715121
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5591 | 2026-03-19 |
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.700850
PMID:41756925
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研究论文 | 本研究通过体外和体内模型探讨了维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了维生素D缺乏在前列腺发育和癌症进展中的关键作用,并验证了其作为激素的生物学功能 | 研究主要基于小鼠模型和特定人类癌细胞系,可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探究维生素D缺乏作为前列腺癌侵袭性风险因素的作用机制 | 小鼠前列腺类器官、MDA-PCa-2b人类前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5592 | 2026-03-19 |
Deciphering epileptogenic and activity-dependent gene programs in the human brain
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.18.706645
PMID:41757101
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研究论文 | 本研究通过单核和空间转录组学技术,解析了人类大脑中癫痫发生和活动依赖性基因程序,揭示了神经元脆弱性和炎症特征 | 首次在人类药物抵抗性癫痫患者中,结合单核与空间转录组学,系统分析了癫痫发生与急性刺激下的基因表达程序,并识别了细胞类型特异性反应和代谢适应缺陷 | 研究样本来源于特定癫痫患者群体,可能无法完全代表其他类型癫痫或神经系统疾病;且空间转录组学分辨率有限,可能影响细胞间相互作用的精确解析 | 探究人类大脑中神经元活动依赖性基因程序,特别是在癫痫发生和急性刺激下的转录变化,以理解癫痫的病理机制 | 药物抵抗性癫痫患者的癫痫发生、非癫痫发生及术中刺激的非癫痫发生皮质组织 | 数字病理学 | 癫痫 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自药物抵抗性癫痫患者的皮质组织样本,涉及26种细胞类型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5593 | 2026-03-19 |
Spatial immune hubs defined by conserved activated dendritic cells are remodeled by immunotherapy
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.703136
PMID:41726948
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研究论文 | 本研究通过整合跨物种的单细胞转录组数据和空间成像技术,揭示了肿瘤微环境中树突状细胞的保守激活状态及其空间组织,并展示了免疫疗法如何重塑这些细胞的空间生态位 | 首次构建了跨物种(小鼠和人类)的肿瘤浸润树突状细胞整合图谱,结合单细胞转录组学和空间多组学成像技术,揭示了两种保守的DC激活状态(CCR7 DCs和ISG DCs)及其在肿瘤微环境中的空间组织模式,并发现免疫疗法能重塑这些DC-T细胞生态位而无需改变DC的转录状态 | 研究主要基于已发表数据集和新生成的小鼠模型数据,人类样本的空间转录组分析可能受样本量限制;免疫疗法重塑机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 阐明肿瘤微环境中树突状细胞的表型多样性、空间动态及其在免疫治疗中的重塑机制 | 小鼠肿瘤模型和人类癌症数据集中的肿瘤浸润树突状细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多重组织成像 | NA | 转录组数据, 空间成像数据 | 12项小鼠肿瘤研究 + 28个已发表人类癌症数据集 + 新生成的小鼠模型数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5594 | 2026-02-12 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to identify hub pathways and diagnostic biomarkers in active pulmonary tuberculosis
2026-Feb-10, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12805-w
PMID:41667975
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5595 | 2026-03-19 |
A novel integrative machine learning-based prognostic model reveals lactylation regulation in hepatocellular carcinoma progression
2026-Feb-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04203-8
PMID:41668073
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研究论文 | 本研究构建了一个基于乳酸化相关代谢基因的预后模型,用于预测肝细胞癌的进展和治疗效果 | 首次开发了一个整合机器学习框架的代谢相关乳酸化指数(MRLI),并验证其在多个独立队列中的预后准确性,揭示了乳酸化在肿瘤微环境重塑中的作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,需要进一步在更大规模的临床队列中进行验证 | 构建肝细胞癌的预后预测模型,并探索乳酸化在肿瘤进展中的调控机制 | 肝细胞癌(HCC)患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞分析, 空间转录组学 | 整合机器学习框架 | RNA-seq数据, 蛋白质组学数据, 单细胞数据, 空间转录组学数据 | 四个独立HCC队列,包括40个HCC样本的验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5596 | 2026-03-19 |
Deletion of hepatic growth hormone receptor contributes to the pathogenesis of lean MAFLD by elevating CD36
2026-Feb, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loaf037
PMID:41847434
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研究论文 | 本研究通过构建肝脏特异性生长激素受体敲除小鼠模型,揭示了肝GHR缺失通过上调CD36表达驱动非肥胖型MAFLD的发病机制,并利用单细胞RNA测序和人类遗传学分析验证了GH-IGF信号通路与MAFLD风险的因果关系 | 首次建立能准确模拟非肥胖型MAFLD的肝脏特异性GHR敲除小鼠模型,并通过单细胞测序揭示肝细胞特异性转录改变,结合孟德尔随机化等人类遗传学方法验证机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;未深入探讨CD36上游调控机制 | 阐明肝脏生长激素受体在非肥胖型代谢功能障碍相关脂肪肝病发病中的作用机制 | 肝脏特异性GHR敲除小鼠模型、人类遗传数据 | 单细胞组学与代谢疾病研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、动物模型构建 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、人类遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5597 | 2026-03-19 |
Whole genome sequence analysis of pulmonary function and COPD in 44,287 multi-ancestry participants
2026-Jan-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03921-y
PMID:41535900
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析,在44,287名多族裔参与者中探索了肺功能和慢性阻塞性肺病的遗传关联 | 利用多族裔样本的全基因组测序数据,发现了与肺功能和COPD相关的低频或群体特异性遗传变异,并通过单细胞RNA-seq数据验证了候选基因的细胞类型特异性表达 | 研究可能受限于样本的多样性和规模,且功能验证主要在细胞系中进行,需进一步在体内模型确认 | 识别与肺功能和慢性阻塞性肺病相关的遗传变异,并提高精细定位的分辨率 | 44,287名多族裔参与者,包括肺功能测量和COPD病例对照状态 | 基因组学 | 慢性阻塞性肺病 | 全基因组测序,单细胞RNA-seq,CRISPR靶向 | NA | 基因组序列数据,基因表达数据 | 44,287名多族裔参与者 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5598 | 2026-03-19 |
Screening Co-Diagnostic Genes for Lung Adenocarcinoma and Myocardial Infarction and Analysis of the Molecular Functions and Drug Value of the Genes
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析筛选了肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因,并分析了其分子功能和药物价值 | 首次将肺腺癌和心肌梗死两种疾病联系起来,通过多步骤生物信息学方法筛选出共同诊断基因MMP9,并揭示了其在炎症和免疫调节中的作用 | 研究主要基于公开数据库的转录组数据,缺乏实验验证,且样本来源可能存在异质性 | 发现肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因,分析其分子功能和潜在药物价值 | 肺腺癌和心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌,心血管疾病 | 差异表达分析,WGCNA分析,功能富集分析,PPI网络分析,机器学习方法(LASSO,SVM-RFE),免疫浸润分析,药物预测,分子对接分析,单细胞测序分析 | LASSO,SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5599 | 2026-03-19 |
Network toxicology and machine learning reveal the impact of acetyl tributyl citrate on erectile dysfunction and identify cathepsin S as a critical regulator
2026-01, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2025.109101
PMID:41187890
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研究论文 | 本研究利用网络毒理学和机器学习方法,探讨了乙酰柠檬酸三丁酯对勃起功能障碍的影响,并确定了组织蛋白酶S作为关键调控因子 | 首次结合网络毒理学、单细胞测序和多种机器学习算法,系统性地揭示了ATBC通过调控CTSS表达影响内皮功能并导致ED的分子机制 | 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内动物模型或临床样本的验证,且环境暴露的剂量效应关系未充分探讨 | 探究环境内分泌干扰物ATBC在勃起功能障碍中的具体作用和分子机制 | 乙酰柠檬酸三丁酯、勃起功能障碍、阴茎海绵体组织、内皮细胞 | 机器学习 | 勃起功能障碍 | 单细胞测序、分子对接、网络毒理学、富集分析 | 多种机器学习算法(未具体说明类型) | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5600 | 2026-03-19 |
Integrated Multiomics Analysis Reveals a Migrasome-Related Signature for Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8778797
PMID:41523912
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了迁移体相关基因在肺腺癌中的特征,并构建了一个预后和免疫治疗响应的预测模型 | 首次在肺腺癌中系统性地表征迁移体相关分子特征,并构建了首个基于迁移体的预后模型,为肿瘤-免疫相互作用提供了新的生物学见解 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;模型在独立验证集中的AUC值(0.678)仍有提升空间 | 解析迁移体在肺腺癌中的分子特征及其临床意义,开发预后和免疫治疗响应的预测工具 | 肺腺癌(LUAD)患者样本 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学整合分析,包括bulk转录组、单细胞RNA-seq、WGCNA、差异表达分析、机器学习 | Lasso-Cox回归模型,结合10种算法的机器学习框架 | 转录组数据(bulk和单细胞RNA-seq) | 541个LUAD样本(来自TCGA/GEO),加上单细胞RNA-seq数据集GSE156632 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |