单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 5581 - 5600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5581 | 2024-12-25 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Skin Photoaging
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496328
PMID:39713718
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组测序探索皮肤光老化的分子机制 | 发现了三个关键基因（Atp2b1、Plekho2和Tspan13）在光老化过程中的重要作用，并验证了这些基因在免疫细胞浸润和代谢途径中的关键作用 | NA | 揭示皮肤光老化的分子机制 | 光老化患者的基因表达谱和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞测序、转录组测序、RT-qPCR、免疫荧光标记、Western blotting | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的光老化患者基因表达数据 |
| 5582 | 2024-12-25 |
Construction and clinical application of a risk model based on N6-methyladenosine regulators for colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18719
PMID:39717046
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研究论文 | 本研究基于N6-甲基腺苷（m6A）调控因子构建了一个结直肠癌（CRC）的风险模型，并探讨了其在临床中的应用 | 首次基于m6A调控因子构建了CRC的风险评分模型，并验证了其在区分高风险和低风险患者中的有效性 | 研究主要基于现有数据集，缺乏大规模的临床验证 | 开发一个基于m6A调控因子的风险模型，用于预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者的m6A调控因子表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | RNA序列数据 | AC-ICAM和GSE33113数据集中的结直肠癌样本，以及GSE146771单细胞RNA-seq数据集 |
| 5583 | 2024-12-25 |
Neuron stress-related genes serve as new biomarkers in hypothalamic tissue following high fat diet
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1443880
PMID:39717104
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研究论文 | 研究探讨了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化及其作为新生物标志物的潜力 | 首次揭示了高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中神经应激相关基因的表达变化，并发现Bmi1基因作为关键基因反映肥胖的病理生理机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床转化和人类应用仍需进一步验证 | 探讨高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中基因表达变化，寻找新的生物标志物 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠下丘脑组织中的神经应激相关基因 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞测序 RNA-seq 蛋白质印迹 免疫荧光染色 | LASSO模型 | 基因表达数据 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型 |
| 5584 | 2024-12-25 |
Vascular Smooth Muscle Cells Transdifferentiate into Chondrocyte-Like Cells and Facilitate Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0555
PMID:39717465
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研究论文 | 本文研究了血管平滑肌细胞向类软骨细胞的转分化及其在半月板纤维软骨再生中的作用 | 首次发现血管平滑肌细胞可以转分化为纤维软骨细胞，并参与自发性的半月板再生；低强度脉冲超声刺激可以增强这种转分化过程 | 研究主要在动物模型中进行，尚未在人体中验证其有效性和安全性 | 探索有效的半月板纤维软骨再生策略 | 血管平滑肌细胞、半月板纤维软骨、低强度脉冲超声刺激 | NA | NA | 低强度脉冲超声（LIPUS）、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了平滑肌细胞系追踪转基因小鼠和比格犬的半月板缺损模型 |
| 5585 | 2024-12-25 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Reveal Molecular Mechanisms and Causal Relationships of Immune-Related Biomarkers in Periodontitis
2024, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9983323
PMID:39717623
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研究论文 | 本研究利用机器学习和孟德尔随机化方法，揭示了牙周炎中免疫相关生物标志物的分子机制和因果关系 | 本研究整合了机器学习、孟德尔随机化和单细胞测序，提供了一种新颖的方法来增强对牙周炎中免疫动态和基因相互作用的理解 | 研究受限于数据集的人口统计和样本量，可能影响结果的普遍性 | 探讨牙周炎的分子机制并识别关键的免疫相关生物标志物 | 牙周炎中的免疫相关生物标志物及其分子机制 | 机器学习 | 牙周疾病 | 机器学习算法、孟德尔随机化、单细胞测序 | XGBoost | 基因表达数据 | 682个差异表达基因，19个核心基因 |
| 5586 | 2024-12-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals That C5AR1 in Follicle Monocyte Cells Could Predict the Development of POI
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S490996
PMID:39717665
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了卵泡单核细胞中的C5AR1基因在预测早发性卵巢功能不全（POI）发展中的潜在作用 | 首次揭示了C5AR1基因在卵泡单核细胞中的高表达，并发现其在预测POI发展中的潜在作用 | 样本量较小，仅包括9名接受IVF或ICSI治疗的女性 | 探讨早发性卵巢功能不全（POI）患者的卵泡微环境，并识别潜在的治疗靶点 | 早发性卵巢功能不全（POI）患者的卵泡微环境 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9名接受IVF或ICSI治疗的女性 |
| 5587 | 2024-12-25 |
Integration of Microarray Data and Single-Cell Sequencing Analysis to Explore Key Genes Associated with Macrophage Infiltration in Heart Failure
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S475633
PMID:39717663
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研究论文 | 本文整合了微阵列数据和单细胞测序分析，探索与心力衰竭中巨噬细胞浸润相关的关键基因 | 本文通过整合单细胞和批量RNA测序数据，结合机器学习算法，识别出具有诊断价值的巨噬细胞相关基因，并进行了体内验证 | 本文的局限性在于其依赖于现有的测序数据和机器学习算法，可能存在数据偏差和算法局限性 | 探索心力衰竭中巨噬细胞的机制及其相关的关键基因 | 心力衰竭中的巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA |
| 5588 | 2024-12-25 |
Innovative strategies to optimise colorectal cancer immunotherapy through molecular mechanism insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1509658
PMID:39717768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析结直肠癌患者的肿瘤微环境，识别关键细胞类型和分子通路，以优化免疫治疗策略 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了结直肠癌中的关键细胞亚型，并验证了DLX2基因作为潜在治疗靶点的可行性 | 研究样本量较小，仅包括4名患者的13个组织样本，可能影响结果的普适性 | 通过分子机制研究优化结直肠癌的免疫治疗策略 | 结直肠癌患者的肿瘤微环境和分子机制 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名患者的13个组织样本 |
| 5589 | 2024-12-24 |
Evaluation of the digestion protocol of mouse neonatal epidermis for single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151159
PMID:39681052
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研究论文 | 本文比较了三种酶（Trypsin、TrypLE 和 Liberase）在分离小鼠新生表皮细胞以进行单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）中的效果 | 首次系统比较了不同酶在分离小鼠新生表皮细胞中的效果，并揭示了酶选择对细胞群体恢复的显著影响 | 本文仅比较了三种酶的效果，未探讨其他可能的分离方法 | 优化小鼠新生表皮细胞的单细胞 RNA 测序分离方法 | 小鼠新生表皮细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞 RNA 测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 5590 | 2024-12-24 |
Exploring the Role of Ccn3 in Type III Cell of Mice Taste Buds
2025-Jan, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16291
PMID:39709613
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研究论文 | 研究探讨了Ccn3在鼠味蕾III型细胞中的表达和功能 | 首次通过单细胞RNA测序发现Ccn3在鼠味蕾III型细胞中高表达，并通过多种实验方法验证了其表达模式 | Ccn3敲除对味觉反应没有显著影响，其具体功能仍需进一步研究 | 探索Ccn3在鼠味蕾细胞中的表达和功能 | 鼠味蕾的III型细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）、原位杂交、免疫组织化学（IHC） | NA | RNA | 鼠味蕾细胞 |
| 5591 | 2024-12-24 |
Chondroitin sulfate proteoglycan 4 increases invasion of recessive dystrophic epidermolysis bullosa-associated cutaneous squamous cell carcinoma by modifying transforming growth factor-β signalling
2024-Dec-23, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae295
PMID:39018437
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研究论文 | 研究评估了硫酸软骨素蛋白聚糖4（CSPG4）在隐性营养不良性大疱性表皮松解症相关皮肤鳞状细胞癌（RDEB cSCC）中的表达和功能，发现CSPG4通过调节转化生长因子-β信号传导增强肿瘤的侵袭性 | 首次揭示了CSPG4在RDEB cSCC中的表达及其通过SMAD3磷酸化增强膜近端TGF-β信号传导的机制 | 研究主要基于体外实验和已发表的单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 评估CSPG4在RDEB cSCC中的表达和功能，探索其作为治疗靶点的潜力 | 隐性营养不良性大疱性表皮松解症相关皮肤鳞状细胞癌（RDEB cSCC）细胞系 | NA | 皮肤鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 多个RDEB cSCC细胞系及RDEB cSCC和非RDEB cSCC肿瘤样本 |
| 5592 | 2024-12-24 |
scEGOT: single-cell trajectory inference framework based on entropic Gaussian mixture optimal transport
2024-Dec-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05988-z
PMID:39710672
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scEGOT的单细胞轨迹推断框架，基于熵高斯混合最优传输理论，用于推断细胞分化轨迹 | scEGOT框架具有高解释性和低计算成本，能够应用于单细胞RNA-seq数据并扩展到其他单细胞数据类型如scATAC-seq | NA | 研究细胞分化机制并推断细胞分化轨迹 | 人类原始生殖细胞样细胞（PGCLC）诱导系统 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生成模型 | 单细胞数据 | NA |
| 5593 | 2024-12-24 |
Elevation of ANXA1 associated with potential protective mechanism against ferroptosis and immune cell infiltration in age-related macular degeneration
2024-Dec-23, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-02163-1
PMID:39710756
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研究论文 | 本研究探讨了铁死亡相关基因及其与免疫细胞浸润在年龄相关性黄斑变性（AMD）中的作用 | 本研究首次揭示了ANXA1在AMD中通过抑制铁死亡和调节免疫细胞浸润发挥潜在保护作用 | 本研究主要基于数据集分析和细胞模型验证，未来需要进一步在临床样本中验证ANXA1的作用 | 探讨铁死亡相关基因及其与免疫细胞浸润在AMD中的作用机制 | 年龄相关性黄斑变性（AMD）患者及正常对照的基因表达和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 老年性疾病 | RT-qPCR, 免疫荧光, CIBERSORT | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自Gene Expression Omnibus的数据集, 细胞模型和小鼠模型 |
| 5594 | 2024-12-24 |
A novel human pluripotent stem cell gene activation system identifies IGFBP2 as a mediator in the production of haematopoietic progenitors in vitro
2024-Dec-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94884
PMID:39714446
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研究论文 | 开发了一种新的可诱导CRISPR介导的激活策略（iCRISPRa），用于驱动多个人类多能干细胞中内源性转录因子的表达，以促进体外造血祖细胞的分化 | 首次使用iCRISPRa系统激活内源性转录因子，并发现IGFBP2在造血祖细胞发育中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验，尚未验证该系统在体内环境中的有效性 | 探索从诱导多能干细胞（iPSCs）中生成功能性细胞的方法，并研究造血祖细胞分化的机制 | 人类多能干细胞（iPSCs）及其向造血祖细胞的分化过程 | 干细胞生物学 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 九个候选转录因子 |
| 5595 | 2024-12-24 |
Programmed cell death pathways in lung adenocarcinoma: illuminating tumor drug resistance and therapeutic opportunities through single-cell analysis
2024-Dec-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01736-0
PMID:39714518
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了程序性细胞死亡途径在肺腺癌中的作用，揭示了肿瘤异质性、免疫浸润和预后的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了程序性细胞死亡途径在肺腺癌中的作用，并发现了铁死亡和焦亡与良好生存结果的显著关联 | 研究仅限于肺腺癌，且样本量未在摘要中明确提及 | 探讨程序性细胞死亡途径在肺腺癌中的作用，揭示肿瘤药物抵抗和治疗机会的机制 | 肺腺癌中的程序性细胞死亡途径，包括凋亡、坏死、焦亡和铁死亡 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 5596 | 2024-12-24 |
Exploring the role of Disulfidptosis in glioma progression: insights into tumor heterogeneity and therapeutic potential through single-cell RNA sequencing
2024-Dec-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01685-8
PMID:39714742
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研究论文 | 本研究探讨了Disulfidptosis在胶质瘤进展中的作用，通过单细胞RNA测序揭示肿瘤异质性和治疗潜力 | 首次研究了Disulfidptosis在胶质瘤中的作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了肿瘤异质性和潜在的治疗靶点 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行体内或体外实验验证 | 探讨Disulfidptosis在胶质瘤进展中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 胶质瘤细胞及其对Disulfidptosis的响应 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自胶质瘤患者的单细胞RNA测序数据 |
| 5597 | 2024-12-24 |
Construction and validation of a regulatory T cells-based classification of renal cell carcinoma: an integrated bioinformatic analysis and clinical cohort study
2024-Dec-23, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-01030-9
PMID:39714755
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研究论文 | 本文通过综合生物信息学分析和临床队列研究，构建并验证了基于调节性T细胞的肾细胞癌分类 | 首次建立了基于调节性T细胞状态的肾细胞癌预后分类（RCC-TSC），并验证了其在不同预后和个性化治疗中的应用 | NA | 探索调节性T细胞与肾细胞癌异质性之间的关系，并建立新的分类方法以指导个性化治疗 | 肾细胞癌患者及其肿瘤中的调节性T细胞状态 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组织化学染色 | NA | RNA测序数据、临床数据 | 537个bulk RNA测序样本和370名肾肿瘤患者的临床队列 |
| 5598 | 2024-12-24 |
Combination of spatial transcriptomics analysis and retrospective study reveals liver infection of SARS-COV-2 is associated with clinical outcomes of COVID-19
2024-Dec-21, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105517
PMID:39709771
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研究论文 | 本研究结合空间转录组分析和回顾性研究，揭示了SARS-CoV-2感染肝脏与COVID-19临床结果的关联 | 首次通过空间转录组分析和免疫组化技术，揭示了SARS-CoV-2在肝脏中的感染机制及其对临床结果的影响 | 样本量较小，仅基于6名患者的肝脏组织进行分析，且回顾性研究的样本量也有限 | 探讨SARS-CoV-2感染肝脏的机制及其对COVID-19患者临床结果的影响 | COVID-19患者的肝脏组织和临床数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 免疫组化（IHC）、10x Genomics Visium CytAssist空间基因分析、TCR CDR3序列分析 | NA | 组织、基因表达数据、临床数据 | 6名COVID-19患者的肝脏组织，650名住院COVID-19患者的临床数据 |
| 5599 | 2024-12-24 |
Dynamics of liver cancer cellular taxa revealed through single-cell RNA sequencing: Advances and challenges
2024-Dec-15, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217394
PMID:39689824
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术揭示肝癌细胞动态的研究进展和挑战 | 单细胞RNA测序技术揭示了肝癌异质性和肿瘤微环境的关键分子驱动因素和表型景观 | 本文主要讨论了当前研究的挑战和局限性 | 探讨肝癌细胞动态的研究进展和挑战，推动个性化治疗的发展 | 肝癌的细胞动态、肿瘤微环境及其分子驱动因素 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 5600 | 2024-12-24 |
Integrative Protocol for Generation of iPSC-Derived 3D Human Hepatic Organoids
2024-Dec-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67070
PMID:39714036
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研究论文 | 本文描述了一种利用人诱导多能干细胞（hiPSCs）生成3D人肝类器官（HHOs）的优化方法 | 提出了一个从hiPSC生成HHOs的直接3D协议，模拟人类胚胎发育阶段，并优化了细胞解离策略以进行单细胞RNA测序 | NA | 开发一种稳定生成肝细胞培养物的方法，以用于肝脏研究 | 人诱导多能干细胞（hiPSCs）生成的3D人肝类器官（HHOs） | NA | NA | 免疫荧光、定量RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |