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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-04-11 |
Multifaceted mechanistic exploration of Geranium wilfordii Maxim. in asthma treatment: integrating network pharmacology, machine learning, Mendelian randomization and experimental validation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1761424
PMID:41960185
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、机器学习、孟德尔随机化和实验验证,探讨了老鹳草治疗哮喘的多层面作用机制 | 首次将网络药理学、机器学习、孟德尔随机化分析与动物实验相结合,系统性地揭示了老鹳草通过调控NOTCH2、HDAC2和MAPK1等关键靶点,影响CD4+ T细胞和调节性T细胞活性,从而发挥抗哮喘作用的机制 | 研究主要基于公开的GEO数据集和动物模型,尚未在人体临床试验中得到验证,且具体化合物与靶点相互作用的详细分子通路有待进一步阐明 | 探究传统中药老鹳草治疗哮喘的活性成分及其通过免疫细胞调控发挥作用的分子机制 | 老鹳草(Geranium wilfordii Maxim.)的化合物、哮喘相关的分子靶点及免疫细胞 | 机器学习 | 哮喘 | UPLC-QE-Orbitrap-MS、网络药理学、机器学习、孟德尔随机化、分子对接、免疫浸润分析、单细胞RNA测序分析 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 质谱数据、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 542 | 2026-04-11 |
The LAMB3-ITGA6 axis orchestrates epithelial repair in periodontitis via hemidesmosomal regulation and keratinization modulation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1764896
PMID:41960183
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和体外细胞模型,揭示了LAMB3-ITGA6轴在牙周炎上皮修复中的核心调控作用,为牙周愈合提供了精准医学框架 | 首次利用单细胞测序解析牙周炎治疗后牙龈上皮的基因表达模式,并发现LAMB3-ITGA6轴作为协调上皮粘附和强度的中枢枢纽,通过视黄酸调控角质化过程 | 研究主要基于体外细胞模型和小鼠皮肤伤口模型,未直接在牙周炎动物模型中验证LAMB3-ITGA6轴的功能,且样本来源可能有限 | 探究牙周炎治疗后上皮修复的调控机制,特别是半桥粒相关基因的作用 | 牙周炎患者的牙龈上皮组织、人口腔角质细胞、小鼠背部全层皮肤伤口模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 牙周炎患者牙龈组织、人口腔角质细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 543 | 2026-04-11 |
Use of Single-Cell Data and scPagwas Analysis to Identify T Cell Subsets and Construct a Prognostic Model for Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/1916444
PMID:41960370
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、GWAS和TCGA等多组学数据,通过scPagwas算法识别T细胞亚群,构建了一个包含七个风险基因的临床预后模型,用于透明细胞肾细胞癌的预后预测和潜在治疗靶点探索 | 首次结合scPagwas算法将GWAS与单细胞RNA测序数据整合,识别KIRC中的特征性T细胞亚群,并构建基于机器学习的临床预后模型,同时通过药物敏感性分析和分子对接预测了针对DOCK8的潜在治疗药物 | 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应;模型验证仅使用了两个外部数据集,需要更多独立队列验证;药物预测结果尚未经过实验验证 | 构建透明细胞肾细胞癌的新预后模型以优化治疗决策、改善临床获益,并探索潜在治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, GWAS, 加权相关网络分析, 差异表达基因分析, 机器学习算法, 分子对接 | XGBoost, LightGBM | 单细胞RNA测序数据, 基因组关联研究数据, 转录组数据, 临床数据 | 包括GSE171306单细胞数据集、TCGA-KIRC数据集、GSE29609和E-MTAB-1980验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 544 | 2026-04-11 |
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2025-12-31, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxaf024
PMID:40795862
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研究论文 | 本文开发了一种名为scGBM的新方法,用于单细胞RNA-seq数据的模型降维,以解决标准方法可能引入虚假异质性和掩盖真实生物变异的问题 | 提出基于泊松双线性模型的scGBM方法,通过快速估计算法实现大规模数据集的可扩展性,并量化细胞潜在位置的不确定性以评估聚类置信度 | 未明确提及具体局限性,但暗示现有直接建模方法在计算上难以处理大型数据集且不量化低维表示的不确定性 | 开发一种模型降维方法,以更好地捕获单细胞RNA-seq数据中的生物信息并去除不需要的变异 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 泊松双线性模型 | 计数矩阵 | 数百万个细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 545 | 2026-04-11 |
The cell-type-specific genetic architecture of chronic pain in brain and dorsal root ganglia
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI197583
PMID:41055971
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研究论文 | 本研究通过整合慢性疼痛的GWAS数据与人类大脑、背根神经节的单细胞RNA-Seq数据,以及人类大脑和小鼠背角的单细胞染色质可及性数据,揭示了慢性疼痛在脑和外周神经系统中的细胞类型特异性遗传结构 | 首次系统性地整合了GWAS与单细胞多组学数据,识别了慢性疼痛相关遗传变异在特定神经元亚型(如谷氨酸能神经元和hPEP.TRPV1/A1.2神经元)中的富集,并揭示了中枢与外周神经系统中细胞类型特异性的遗传机制 | 研究主要基于关联分析,未进行功能验证实验;数据来源包括小鼠模型,可能不完全反映人类生物学;样本量在单细胞分析中可能有限 | 阐明慢性疼痛的细胞类型特异性遗传结构,为靶向转化研究提供基础 | 人类大脑、背根神经节(hDRG)、小鼠背角组织 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | GWAS, 单细胞RNA-Seq, 单细胞染色质可及性分析 | NA | 基因组关联数据, 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 546 | 2026-04-11 |
Promoting astrocyte-neuron triiodothyronine shuttling attenuates brain damage in neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy
2025-Dec-02, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03641-x
PMID:41331484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了新生儿缺氧缺血性脑病中星形胶质细胞与神经元之间的转录耦合,并发现了一个具有神经保护特性的Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群,其耗损与疾病相关,而增强该亚群或外源性T3递送可促进神经修复并改善行为功能 | 首次在全脑单细胞转录组水平上识别并功能表征了HIE中一个具有代谢和神经保护特征的Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群,揭示了其耗损动态及T3介导的星形胶质细胞-神经元交互机制作为治疗靶点 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证;单细胞测序和蛋白质组学分析可能受技术偏差影响;长期治疗效果和潜在副作用需更深入评估 | 探索新生儿缺氧缺血性脑病的病理机制,并寻找基于星形胶质细胞-神经元交互的治疗策略 | 出生后第7天的大鼠幼崽(通过Rice-Vannucci模型诱导缺氧缺血性脑损伤),以及体外氧糖剥夺处理的星形胶质细胞 | 神经科学 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,多重免疫荧光,ELISA,Western blotting,激光散斑对比成像,组织病理学,Morris水迷宫测试 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,图像数据,行为数据 | 大鼠幼崽模型及体外细胞样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 547 | 2026-04-11 |
Quantum annealing for enhanced feature selection in single-cell RNA sequencing data analysis
2025-Dec, Quantum machine intelligence
IF:4.1Q2
DOI:10.1007/s42484-025-00312-1
PMID:41884061
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研究论文 | 本研究探索了量子退火在单细胞RNA测序数据特征选择中的应用,以识别与细胞分化和抗癌药物耐药性相关的关键基因 | 首次将量子退火赋能的二次无约束二进制优化方法应用于单细胞RNA测序数据的特征选择,能够揭示传统方法可能遗漏的复杂基因表达模式 | 未明确说明量子退火与传统方法在计算效率或准确性方面的量化比较,也未讨论该方法在其他类型单细胞数据中的适用性 | 开发一种基于量子退火的增强型特征选择方法,以改进单细胞RNA测序数据的分析和解释 | 人类细胞分化系统和抗癌药物耐药性研究中的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 量子退火赋能的二次无约束二进制优化 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 548 | 2026-04-11 |
Lymphatic dysfunction is linked to disease pathogenesis in Duchenne muscular dystrophy animal models
2025-Sep-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505656122
PMID:40966282
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研究论文 | 本研究通过动物模型揭示了淋巴功能障碍与杜氏肌营养不良症(DMD)发病机制之间的关联 | 首次在DMD动物模型中系统性地研究了淋巴系统(特别是骨骼肌中的淋巴管)的结构与功能失调,并发现炎症性淋巴管生成与疾病进展相关 | 研究主要基于动物模型(小鼠和大鼠的淋巴肌细胞、D2小鼠和GRMD犬),尚未在DMD患者中得到直接验证 | 探究淋巴系统是否在DMD动物模型的骨骼肌中失调,并阐明其与疾病发病机制的联系 | 杜氏肌营养不良症(DMD)动物模型,包括小鼠、大鼠的淋巴肌细胞、D2小鼠和GRMD犬 | NA | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,显微淋巴管造影,磁共振淋巴管造影,基因表达谱分析,免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,影像数据 | 使用了多种动物模型(小鼠、大鼠、犬),具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 549 | 2026-04-11 |
Patient phenotyping for molecular profiling of neck and low back pain - Study protocol
2025 Jul-Dec, Neurobiology of pain (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1016/j.ynpai.2025.100186
PMID:40501484
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研究论文 | 本文介绍了针对慢性颈痛和腰痛患者进行分子特征分析的研究方案,旨在通过表型分型促进转录组学发现 | 结合全面的患者表型分型与多组学技术(包括单细胞和空间转录组学),在人类疼痛背景下研究分子神经生物学机制 | 研究依赖于手术获取的组织样本,可能无法完全代表所有慢性疼痛患者群体,且控制组织来自器官捐献者,可能存在匹配偏差 | 通过分子特征分析,揭示慢性颈痛和腰痛的分子神经生物学和神经免疫学机制,以发现治疗靶点 | 接受C1-2和腰椎融合手术的慢性颈痛和腰痛患者,以及器官捐献者的对照组织 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 转录组学 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 550 | 2026-04-11 |
Aberrant STAT signaling drives T cell dysregulation in a targetable pediatric sepsis endotype
2025-May-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.06.11.24308709
PMID:38946991
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研究论文 | 本研究通过整合深度免疫表型、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术,揭示了儿童脓毒症中IL-6/IFN-γ驱动的T细胞功能障碍作为一种独特的免疫失调内型 | 首次在儿童脓毒症中通过多组学方法识别出由IL-6和IFN-γ驱动的高严重性免疫亚群,并发现STAT1和STAT3的基线过度激活导致T细胞功能障碍 | 样本量相对较小(88名儿童),且为前瞻性队列研究,需要更大规模验证 | 阐明儿童脓毒症免疫异质性的机制,以开发靶向治疗 | 88名危重病儿童 | 数字病理学 | 脓毒症 | 深度免疫表型、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学、磷酸流式细胞术、T细胞受体库分析 | 无监督聚类 | 血浆样本、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 88名危重病儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 551 | 2026-04-11 |
Long-lasting B cell convergence to distinct broadly reactive epitopes following vaccination with chimeric influenza virus hemagglutinins
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.025
PMID:40132593
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和B细胞受体库测序,分析了嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞特异性、功能和亚群,发现该疫苗能诱导针对血凝素茎部保守域的持久且广泛的B细胞应答 | 首次结合单细胞RNA测序和B细胞受体库测序技术,详细解析了嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞应答的克隆重叠性和持久性,揭示了疫苗对记忆B细胞库的重塑作用 | 研究基于一期临床试验,样本量可能有限,且未涉及长期保护效果或不同人群的验证 | 评估嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞应答的特异性、功能和持久性,以验证其针对流感病毒保守域的广谱保护潜力 | 接种嵌合血凝素疫苗的临床试验参与者的B细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序,B细胞受体库测序 | NA | 单细胞转录组数据,B细胞受体序列数据 | 一期临床试验参与者(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 552 | 2026-04-11 |
Tumor-derived arachidonic acid reprograms neutrophils to promote immune suppression and therapy resistance in triple-negative breast cancer
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.002
PMID:40157359
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研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌细胞通过积累脂质并释放携带花生四烯酸的细胞外囊泡,重编程中性粒细胞,从而促进免疫抑制和疗法抵抗的机制 | 首次发现三阴性乳腺癌细胞通过脂质积累和细胞外囊泡介导的花生四烯酸传递,重编程中性粒细胞,驱动免疫抑制和疗法抵抗 | NA | 探究三阴性乳腺癌对免疫检查点阻断和化疗联合疗法产生获得性抵抗的机制 | 三阴性乳腺癌细胞、中性粒细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 553 | 2026-04-11 |
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14358
PMID:39370688
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,绘制了人类皮肤老化过程中表皮和真皮细胞衰老的图谱,并探讨了衰老细胞在光老化和时序老化中的作用 | 开发了皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™,并通过单细胞和空间分析揭示了衰老细胞在皮肤中的聚集趋势及其对色素沉着和胶原合成的影响 | NA | 通过细胞衰老的视角表征与年龄相关的皮肤功能障碍 | 人类皮肤中的表皮细胞(如黑色素细胞)和真皮细胞(如网状真皮成纤维细胞) | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 554 | 2026-04-11 |
RARS1 inhibits ENO1 ubiquitination and degradation to protect against ferroptosis in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1686597
PMID:41451236
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研究论文 | 本研究探讨了RARS1基因在肝细胞癌进展中的作用,揭示了其通过调控ENO1泛素化与降解来抑制铁死亡,并作为潜在的治疗靶点 | 首次将RARS1与ENO1的泛素化降解及铁死亡抑制联系起来,并基于AR-DEGs对LIHC进行分子亚型分类,识别了AH.6809作为潜在RARS1抑制剂 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内模型验证,且临床转化潜力需进一步评估 | 探究RARS1在肝细胞癌进展中的功能机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者数据、LIHC细胞系 | 生物信息学与分子生物学 | 肝细胞癌 | 差异表达分析、Cox回归分析、非负矩阵分解、转录组学、单细胞测序、空间转录组学、分子生物学技术 | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 555 | 2026-04-11 |
Side- and Disease-Dependent Changes in Human Aortic Valve Cell Population and Transcriptomic Heterogeneity Determined by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121623
PMID:39766890
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了人类主动脉瓣膜中细胞群体和转录组异质性在瓣膜不同侧面及疾病进展中的变化 | 首次采用新的取样方法,独立收集主动脉瓣膜纤维侧和心室侧的富集内皮细胞样本进行单细胞RNA测序,揭示了瓣膜内皮细胞在侧面和疾病依赖下的高度异质性,并识别出多个与疾病相关的独特细胞亚群和转录因子 | 样本量较小(仅5名捐赠者),且样本涵盖了从非病变到纤维钙化阶段的不同疾病状态,可能限制了统计效力或对特定疾病阶段的深入分析 | 探究钙化性主动脉瓣膜病(CAVD)在瓣膜纤维侧优先发展的细胞和分子机制 | 人类主动脉瓣膜细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名捐赠者的主动脉瓣膜小叶,共分析82,356个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 556 | 2026-04-11 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3功能获得性突变综合征中CD8+ T细胞功能失调的分子机制,重点关注嘌呤能信号通路的改变 | 首次揭示STAT3 GOF变异通过改变CD39、CD73和A2AR表达,导致嘌呤能信号失调,从而驱动CD8+ T细胞病理 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型,机制细节仍需进一步验证 | 阐明STAT3 GOF变异导致CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | STAT3 GOF患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节障碍 | 单细胞RNA测序、高维免疫分析、功能评估 | NA | 基因表达数据、功能数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2026-04-11 |
Isolation and Comprehensive Analysis of Cochlear Tissue-Derived Small Extracellular Vesicles
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408964
PMID:39497619
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研究论文 | 本研究评估了三种耳蜗组织消化及耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV)分离方法,首次提出使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为最优分离方法,并全面分析了CDsEV的内容物和细胞来源 | 首次提出并验证了使用胶原酶D和DNase I结合蔗糖密度梯度离心作为耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的最优分离方法,并首次通过单CDsEV测序与单细胞RNA测序数据的联合分析来追踪CDsEV的细胞来源 | 研究主要基于方法学优化和初步分析,未深入探讨CDsEV在耳蜗疾病中的具体作用机制或进行大规模临床验证 | 评估耳蜗组织来源小细胞外囊泡(CDsEV)的分离方法,并分析其内容物和细胞来源,以增强对耳蜗内CDsEV功能的理解 | 耳蜗组织来源的小细胞外囊泡(CDsEV)及其内容物(miRNAs和蛋白质) | 生物医学研究 | 听力相关疾病 | 小RNA测序、蛋白质组学、单CDsEV测序、单细胞RNA测序 | NA | 测序数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 558 | 2026-04-11 |
Targeting immune-fibroblast cell communication in heart failure
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08008-5
PMID:39443792
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞分析揭示了心力衰竭中免疫细胞与成纤维细胞间的通讯机制,并验证了靶向IL-1β信号通路可减轻心肌纤维化并改善心脏功能 | 首次在人类心脏疾病中系统解析免疫-成纤维细胞通讯的分子机制,并发现CCR2巨噬细胞通过IL-1β信号驱动FAP/POSTN成纤维细胞分化的空间特异性机制 | 样本量相对有限(45例),且主要依赖观察性数据和动物模型验证,未涉及长期临床疗效评估 | 探究人类心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞通讯的分子机制,并开发针对心肌纤维化的治疗策略 | 健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭的人类心脏组织样本,以及小鼠心脏损伤模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞多组学分析(基因表达、表位定位、染色质可及性)、空间转录组学、遗传谱系追踪 | NA | 单细胞基因表达数据、表位数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 45例人类心脏样本(包括健康、急性梗死和慢性心力衰竭)及多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 559 | 2026-04-11 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52490-4
PMID:39294132
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研究论文 | 本文提出了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性的顺式调控元件及其调控基因 | 开发了一种将高度多重CRISPRa扰动与scRNA-seq结合的新方法,首次在单细胞水平上系统评估细胞类型特异性增强子和启动子对基因表达的调控作用 | 研究仅针对K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元两种细胞类型,未涵盖更广泛的细胞类型或体内环境 | 开发一种高通量筛选方法,以识别细胞类型特异性的CRISPRa响应顺式调控元件及其靶基因 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用493个gRNA靶向候选顺式调控元件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 560 | 2026-04-11 |
In vivo single-cell CRISPR uncovers distinct TNF programmes in tumour evolution
2024-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07663-y
PMID:39020166
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研究论文 | 本研究开发了一种体内单细胞CRISPR策略,系统性研究了150个最常见突变的鳞状细胞癌基因在组织范围内的克隆动态,揭示了肿瘤坏死因子(TNF)信号模块在肿瘤演化中的不同作用 | 开发了结合超声引导子宫内慢病毒显微注射、单细胞RNA测序和引导捕获的体内单细胞CRISPR筛选策略,首次在哺乳动物组织中纵向监测克隆扩张并记录其单细胞转录组水平的基因程序 | 研究主要聚焦于鳞状细胞癌相关基因,其他癌症类型的普适性有待验证;体内模型的复杂性可能限制某些机制的完全解析 | 探究正常组织中克隆扩张的机制,以及为何仅有少数克隆最终转化为恶性肿瘤 | 鳞状细胞癌相关基因、上皮组织克隆、肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞CRISPR筛选、单细胞RNA测序、引导捕获测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及150个最常见突变的鳞状细胞癌基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |