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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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541 | 2025-09-28 |
Unveiling the mechanisms of yanhusuo's therapeutic effects in neuropathic pain through network pharmacology, single-cell RNA sequencing, and molecular docking
2025-Sep-24, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00551-z
PMID:40993792
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接技术,系统揭示延胡索治疗神经病理性疼痛的多靶点作用机制 | 首次结合单细胞测序与网络药理学分析延胡索抗神经病理性疼痛的免疫细胞互作机制,并通过分子对接验证关键化合物与靶点的结合能力 | 研究结果主要基于生物信息学预测,需要后续实验验证其生物学功能 | 阐明延胡索治疗神经病理性疼痛的分子作用机制 | 神经病理性疼痛患者样本和延胡索活性成分 | 生物信息学 | 神经病理性疼痛 | 网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、生物信息学分析 | NA | 基因组数据、化合物结构数据 | 未明确样本数量,包含神经病理性疼痛患者分组样本 | NA | NA | NA | NA |
542 | 2025-09-28 |
JMJD6-driven epigenetic activation of COL4A2 reprograms glioblastoma vascularization via integrin α1β1-dependent PI3K/MAPK signaling
2025-Sep-24, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02114-9
PMID:40993804
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现JMJD6通过表观遗传激活COL4A2,进而通过整合素α1β1依赖的PI3K/MAPK信号通路调控胶质母细胞瘤血管生成 | 首次揭示JMJD6-COL4A2-ITGA1/ITGB1轴作为胶质母细胞瘤抗血管生成治疗的新靶点 | NA | 探究胶质母细胞瘤血管生成的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤细胞和肿瘤相关内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、多组学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
543 | 2025-09-28 |
Comprehensive profiling of immune cell infiltration and biomarker identification in intervertebral disc degeneration
2025-Sep-24, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-06250-9
PMID:40993805
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和实验验证,系统描绘了椎间盘退变中的免疫细胞浸润动态并识别了关键治疗靶点 | 首次结合CIBERSORT、WGCNA和单细胞RNA测序技术全面解析IDD免疫浸润景观,发现术后第14天为免疫浸润高峰,并鉴定VAMP8/JUN为巨噬细胞相关调控因子 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验,人类样本验证不足 | 揭示椎间盘退变的免疫浸润机制并筛选治疗靶点 | 大鼠椎间盘组织及髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退行性疾病 | 生物信息学分析、scRNA-seq、流式细胞术、Western blot、免疫组化 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | 公共数据集分析+大鼠椎间盘穿刺模型实验验证 | NA | NA | NA | NA |
544 | 2025-09-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the ameliorative effects of Kai-Xin-San on depression via regulating neuroplasticity and inflammation in the hypothalamus of rats
2025-Sep-24, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示开心散通过调节下丘脑神经可塑性和炎症改善大鼠抑郁的分子机制 | 首次运用单细胞RNA测序技术系统解析开心散抗抑郁作用的下丘脑微环境调控机制 | 研究局限于大鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究开心散改善抑郁症状的分子作用机制 | 慢性不可预见温和应激诱导的抑郁模型大鼠 | 生物医学研究 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、分子生物学实验、行为学测试 | 动物模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 45,482个下丘脑细胞(来自对照组、CUMS模型组、开心散治疗组和氟西汀治疗组大鼠) | NA | NA | NA | NA |
545 | 2025-09-28 |
Loss of RPL22 Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1 Deficient Endometrial Cancers with Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes
2025-Sep-24, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100899
PMID:41005533
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研究论文 | 本研究通过免疫组化发现RPL22蛋白缺失可识别MLH1缺陷型子宫内膜癌中免疫细胞浸润较少的特殊亚型 | 首次揭示RPL22缺失与肿瘤微环境免疫抑制特征的相关性,并开发可临床应用的免疫组化检测方法 | 未明确RPL22突变与肿瘤突变负荷或PD-L1表达之间的关联机制 | 探索RPL22在MLH1缺陷型子宫内膜癌免疫调控中的作用 | 子宫内膜癌组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 免疫组化、数字空间转录组学、基因敲低 | NA | 组织切片图像、基因表达数据 | 子宫内膜癌队列(具体数量未明确) | NA | NA | NA | NA |
546 | 2025-09-28 |
Lipid-laden macrophages in atherosclerosis and cancer
2025-Sep-24, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.09.007
PMID:41005549
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综述 | 探讨脂质负载巨噬细胞在动脉粥样硬化和癌症中的双重作用及分子机制 | 通过单细胞RNA测序技术系统比较不同疾病背景下LL-Macs的基因特征差异 | 存在研究空白需要开发新的LL-TAM靶向疗法 | 阐明脂质代谢调控巨噬细胞极化在疾病中的作用机制 | 脂质负载巨噬细胞(LL-Macs) | 分子病理学 | 动脉粥样硬化, 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
547 | 2025-09-28 |
Integrating multi-omic Mendelian randomization, microarray, single-cell RNA sequencing, and spatial RNA sequencing to identify potential therapeutic targets for vitiligo
2025-Sep-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.09.015
PMID:41005615
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化等方法识别CTSS作为白癜风潜在治疗靶点 | 首次整合多组学孟德尔随机化、单细胞和空间转录组技术系统筛选白癜风药物靶点 | NA | 识别白癜风的新型治疗靶点 | 人类白癜风患者样本(黑色素细胞、晕痣) | 生物信息学 | 白癜风 | 多组学孟德尔随机化、微阵列、单细胞RNA测序、空间RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、临床样本数据 | 4,479个可成药基因的QTL数据,结合GWAS Catalog和FinnGen联盟的白癜风GWAS数据 | NA | NA | NA | NA |
548 | 2025-09-28 |
MMP13- and COL11A1-expressing cancer-associated fibroblasts: key drivers of esophageal squamous cell carcinoma progression and prognostic indicators
2025-Sep-24, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104247
PMID:41005711
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定食管鳞癌中三种肌纤维母细胞性癌症相关成纤维细胞亚型,并揭示MMP13和COL11A1亚型与不良预后的关联 | 首次报道癌症相关成纤维细胞与食管鳞癌病理分期进展的关联,并发现MMP13和COL11A1两种特异性CAF亚型是预后不良的关键驱动因子 | 研究样本限于晚期食管鳞癌手术切除标本,未涵盖早期病例 | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞癌进展中的作用及其预后价值 | 食管鳞癌患者肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、RNA原位杂交 | NA | 基因表达数据、组织标本 | 晚期食管鳞癌手术切除标本(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
549 | 2025-09-28 |
Human brain cell types shape host-rabies virus transcriptional interactions revealing a preexisting pro-viral astrocyte subpopulation
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116159
PMID:40864551
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究狂犬病毒与人脑细胞共培养中的宿主-病毒转录互作 | 发现存在预先存在的促病毒星形胶质细胞亚群,且解除先天免疫抑制反而增强狂犬病毒转录 | 研究基于体外共培养模型,未直接验证在体人脑中的情况 | 揭示先天免疫抑制如何影响不同脑细胞类型中宿主与病毒基因组的转录调控 | 人脑细胞共培养体系中的不同细胞类型 | 单细胞转录组学 | 狂犬病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人脑细胞共培养样本(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
550 | 2025-09-28 |
CD226 identifies effector CD8+ T cells during tuberculosis and costimulates recognition of Mycobacterium tuberculosis-infected macrophages
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116184
PMID:40886314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD226是区分结核病中效应CD8+T细胞的关键标志物,并证实其参与对结核分枝杆菌感染巨噬细胞的识别 | 首次在结核病模型中通过scRNA-seq鉴定CD226作为效应CD8+T细胞的关键区分标志,并证明其共刺激功能对感染巨噬细胞识别的重要性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究慢性结核感染中肺实质CD8+T细胞的多样性及其识别机制 | C57BL/6J小鼠的肺实质CD8+T细胞和结核分枝杆菌感染的巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、IFNγ-EYFP报告基因系统 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 感染6周和41周的C57BL/6J小鼠肺组织细胞 | NA | NA | NA | NA |
551 | 2025-09-28 |
Next-gen tools in cancer neuroscience
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116258
PMID:40934086
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综述 | 本文综述了推动癌症神经科学领域发展的新一代技术工具 | 系统整合单细胞/空间转录组学、光遗传学、化学遗传学等前沿技术,革新神经系统与癌症相互作用的研究方法 | NA | 探讨连接肿瘤学与神经科学的关键技术进展 | 癌症神经科学领域的研究工具与方法 | 癌症神经科学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学、光遗传学、化学遗传学、工程病毒、神经元活动可视化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
552 | 2025-09-28 |
Innate Immune-Cloaked Microgel-Coated Mesenchymal Stromal Cells Reverse Persistent Pulmonary Fibrosis via Reparative Macrophages
2025-Sep-23, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504590
PMID:40984773
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研究论文 | 本研究开发了一种先天免疫伪装微凝胶包被的间充质基质细胞,用于治疗持续性肺纤维化 | 通过微凝胶包被和CD47自身标记激动剂功能化,使治疗细胞逃逸组织驻留巨噬细胞的清除,并发现过渡性抗原呈递巨噬细胞亚群介导修复效应 | NA | 开发新型细胞疗法逆转持续性肺纤维化 | 间充质基质细胞和肺纤维化模型 | 组织工程与再生医学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 细胞工程平台 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
553 | 2025-09-28 |
Tertiary lymphoid structures in Merkel cell carcinoma facilitate naïve and central memory T-cell infiltration linked to immunotherapy response
2025-Sep-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012224
PMID:40992783
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示默克尔细胞癌中三级淋巴结构通过招募初始和中央记忆T细胞促进免疫治疗反应的机制 | 首次在MCC中结合空间转录组学和TCR克隆型映射,证实TLS作为 naïve T细胞进入门户的功能及其与免疫治疗响应的直接关联 | 样本量较小(27例患者),且为观察性研究难以确立因果关系 | 阐明三级淋巴结构在默克尔细胞癌免疫微环境中的作用机制 | 27例接受免疫检查点抑制剂治疗的默克尔细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理 | 默克尔细胞癌 | 转录组测序、多重免疫可视化分析、TCR克隆型映射、空间转录组学、WGCNA | NA | 组织样本、转录组数据、空间转录组数据 | 27例MCC患者治疗前肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
554 | 2025-09-28 |
Spatial regulation of CD8+ T cells at the HLA-E-NKG2A axis drives HIV persistence in lymph node B cell follicles
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116181
PMID:40849901
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和高维组织细胞计量技术,揭示了HIV在淋巴结B细胞滤泡中持续存在的免疫调控机制 | 首次发现HLA-E-NKG2A轴通过空间调控CD8+ T细胞功能驱动HIV免疫逃逸的新机制 | 研究样本局限于HIV感染者,未涉及其他免疫疾病模型的验证 | 探究淋巴结B细胞滤泡中HIV病毒库的免疫逃逸机制 | HIV感染者的淋巴结组织样本 | 免疫学 | HIV/AIDS | 空间转录组学、高维组织细胞计量、FACS分析 | NA | 空间转录组数据、流式细胞数据、组织切片数据 | 不同抗逆转录病毒治疗阶段的HIV感染者淋巴结样本 | NA | NA | NA | NA |
555 | 2025-09-28 |
Distinct roles for NF-κB in hematopoietic stem cells and the bone marrow milieu in promoting hematopoietic aging
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116193
PMID:40875292
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研究论文 | 本研究通过NF-κB活性升高实验模型揭示其在造血衰老中的双重作用机制 | 首次明确区分NF-κB在造血干细胞自主功能与骨髓微环境中的不同作用,并建立单细胞RNA测序标记框架进行跨物种验证 | 实验模型为基因修饰小鼠,与自然衰老过程可能存在差异 | 解析炎症信号通路NF-κB在造血衰老表型形成中的具体作用机制 | 造血干细胞(HSC)及骨髓微环境 | 造血干细胞生物学 | 衰老相关血液疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、表观基因组学、转录组学分析 | IκB缺陷小鼠模型 | 基因表达数据、功能实验数据 | 小鼠模型及人类HSC数据集(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
556 | 2025-09-28 |
Junctional adhesion molecule C limits glioblastoma stem-like cell invasion by regulating integrin adhesion at the endothelial interface
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116194
PMID:40875295
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研究论文 | 本研究揭示了连接粘附分子C(JAMC)通过调节整合素粘附在胶质母细胞瘤干细胞样细胞(GSCs)与内皮界面相互作用中的关键抑制作用 | 首次发现JAMC通过调控整合素-SHARPIN轴限制GSCs在内皮界面的粘附和侵袭行为 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究胶质母细胞瘤干细胞样细胞与内皮细胞相互作用的分子机制 | 胶质母细胞瘤干细胞样细胞(GSCs)和内皮细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 脱细胞基质、共培养、器官型脑切片、空间转录组学、定量蛋白质组学 | NA | 分子生物学数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 小鼠模型和人类样本(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
557 | 2025-09-28 |
Single-cell transcriptomic reconstruction of the human hair cycle: Capturing the temporal dynamics of skin tissue remodeling
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116196
PMID:40884793
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序重建人类毛发生长周期的时空动态变化 | 首次建立人类毛发周期的伪时间序列模型,揭示16种细胞群体在组织重塑中的动态基因表达 | 样本量有限(19个皮肤组织),仅包含单个毛囊样本 | 解析人类皮肤组织重塑过程中的分子和细胞机制 | 人类皮肤组织中的毛囊及相关细胞群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 伪时间序列分析 | 单细胞转录组数据 | 19个人类皮肤组织样本(每个样本含单个毛囊) | NA | NA | NA | NA |
558 | 2025-09-28 |
Advances in artificial intelligence for spatial transcriptomics in cancer: Special focus on Yin Yang 1 (YY1) and Raf kinase inhibitor protein (RKIP)
2025-Sep-22, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189456
PMID:40992707
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综述 | 本文综述人工智能在癌症空间转录组学中的应用,特别关注YY1和RKIP基因 | 聚焦AI与空间转录组学融合的新兴领域,通过YY1和RKIP案例展示机器学习方法如何揭示癌症微环境新机制 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 探讨人工智能技术解析空间转录组数据在癌症研究中的应用价值 | 癌症微环境中的基因表达模式(重点关注YY1和RKIP) | 生物信息学 | 癌症 | 空间转录组学、机器学习、统计分析 | 支持向量机(SVM)、随机森林(RF)、PCA、t-SNE、UMAP | 空间基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
559 | 2025-09-28 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2025-Sep-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
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研究论文 | 本研究通过基因敲除技术探讨Epac1在缺血性视网膜病变中对Müller胶质细胞病理激活和视网膜神经变性的作用机制 | 首次揭示Epac1通过调节Müller细胞中VEGF信号通路促进视网膜神经变性的新机制 | 研究仅限于小鼠OIR模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究Epac1在缺血性视网膜病变中的作用及其分子机制 | 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型和原代Müller细胞 | 眼科疾病机制研究 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫染色、qPCR、Western blot、邻近连接分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织形态学数据 | OIR小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
560 | 2025-09-28 |
Immune microenvironment and fibroblast subpopulation in diabetic wound healing
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113440
PMID:40995117
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析糖尿病足溃疡愈合过程中的免疫微环境和成纤维细胞亚群 | 首次在单细胞水平揭示糖尿病伤口愈合中炎症单核细胞轴和成纤维细胞亚群的特定变化 | NA | 探究糖尿病足溃疡愈合障碍的细胞分子机制 | 糖尿病足溃疡患者的肉芽组织 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质影像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |