单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39812 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-05-27 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-08-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
|
研究论文 | 一项针对未治疗淋巴浆细胞淋巴瘤患者的个性化新抗原DNA疫苗一期临床试验，评估其安全性和免疫反应 | 首次在人体中使用个性化新抗原DNA疫苗治疗无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者，并通过单细胞转录组学揭示了肿瘤B细胞减少和耐药机制 | 样本量小（9名患者），且为非随机化试验，未来需联合疫苗与靶向浆细胞亚群或阻断IGF-1信号的策略 | 评估个性化新抗原DNA疫苗在未治疗淋巴浆细胞淋巴瘤患者中的安全性和免疫治疗效果 | 9名无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴浆细胞淋巴瘤 | DNA疫苗，单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名未治疗的无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3’测序 |
| 542 | 2026-05-27 |
Hydrogel crosslinking modulates macrophages, fibroblasts, and their communication, during wound healing
2024-08-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50072-y
PMID:39122702
|
研究论文 | 本研究探讨明胶基水凝胶的交联程度如何影响伤口愈合过程中巨噬细胞和成纤维细胞的行为及其相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示不同交联程度水凝胶对巨噬细胞亚群形成及与成纤维细胞RANKL信号通路的差异性调控机制 | 未明确说明样本量及临床转化可行性 | 阐明水凝胶物理特性通过调控免疫-基质细胞通讯优化伤口愈合的机制 | 雌性小鼠的伤口愈合组织 | 机器学习 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 明胶基水凝胶交联程度调控巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的单细胞转录组分析 |
| 543 | 2026-05-27 |
Deubiquitylase ubiquitin-specific protease 7 plays a crucial role in the lineage differentiation of preimplantation blastocysts†
2024-07-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae034
PMID:38438135
|
研究论文 | 本研究探讨了去泛素化酶USP7在植入前胚胎发育中的关键作用，尤其对谱系分化的调控机制 | 首次揭示USP7通过稳定YAP蛋白调控桑椹胚向囊胚转换，并影响表观遗传修饰和关键基因表达 | 未详细说明动物实验的伦理审批及样本量统计效力 | 阐明USP7在植入前胚胎谱系分化和表观遗传重编程中的功能及机制 | 小鼠植入前胚胎 | 机器学习 | NA | RNA干扰，单细胞RNA测序，逆转录定量聚合酶链反应，蛋白质印迹，免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据，DNA甲基化数据，蛋白质数据 | 小鼠胚胎样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序平台（未说明具体型号） |
| 544 | 2026-05-27 |
Spatial transcriptomics reveals influence of microenvironment on intrinsic fates in melanoma therapy resistance
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601416
PMID:39005406
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示黑色素瘤治疗抵抗中微环境对内在命运的影响 | 首次通过空间转录组学揭示黑色素瘤抵抗程序与肿瘤微环境免疫特征的空间共定位关系，证明组织特征（如坏死区域）可影响抵抗命运的选择 | NA | 探究黑色素瘤治疗抵抗中内在细胞状态与肿瘤微环境的相互作用机制 | 黑色素瘤细胞系、患者样本、异种移植模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 共识非负矩阵分解 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 多种细胞系、患者肿瘤样本、异种移植模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 545 | 2026-05-27 |
Interstitial macrophages are a focus of viral takeover and inflammation in COVID-19 initiation in human lung
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232192
PMID:38597954
|
研究论文 | 利用健康人肺组织感染SARS-CoV-2并进行单细胞RNA测序，揭示间质巨噬细胞是病毒感染和炎症的关键靶点 | 首次发现活化的间质巨噬细胞是SARS-CoV-2病毒大量复制和转录组劫持的主要场所，并鉴定病毒进入该细胞的受体为DC-SIGN/CD209 | 研究基于体外感染模型，可能无法完全反映体内早期感染的复杂微环境 | 阐明SARS-CoV-2在人类肺组织中的细胞嗜性和转录组效应 | 健康人类肺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 健康人类肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 546 | 2026-05-27 |
Targeting Monocyte Derived CCL17 Attenuates Murine Crescentic Glomerulonephritis by Affecting Renal CCR4+ Regulatory T-Cell Recruitment
2024, American journal of nephrology
IF:4.3Q1
DOI:10.1159/000534151
PMID:37742620
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现单核细胞来源的CCL17在肾小球肾炎中影响CCR4+调节性T细胞的招募，靶向CCL17可减轻小鼠新月体性肾小球肾炎 | 首次揭示了CCL17-CCR4轴在免疫介导的新月体性肾小球肾炎中对肾内调节性T细胞招募的功能重要性，并验证了靶向CCL17的治疗潜力 | 研究仅基于小鼠模型，结果向人类疾病转化需要进一步验证 | 探索CCR4及其配体CCL17和CCL22在免疫介导的新月体性肾小球肾炎中白细胞招募的功能意义 | 人类和小鼠肾小球肾炎肾脏中的白细胞，特别是CD4+ T细胞亚群和调节性T细胞 | machine learning | 肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和鼠源性肾炎肾脏分离的白细胞样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 547 | 2026-05-27 |
First-in-human clinical trial of personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma
2023-Sep-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3315017/v1
PMID:37790486
|
研究论文 | 首次人体临床试验评估个性化新抗原疫苗作为无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者的早期干预措施 | 首次在无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者中进行DNA个体型新抗原疫苗的人体临床试验，通过单细胞转录组分析揭示疫苗诱导肿瘤免疫微环境的双相抗肿瘤反应，发现B细胞与浆细胞亚群的不同响应机制 | 样本量较小（仅9例患者），主要观察到疾病稳定而非显著缓解，且肿瘤浆细胞亚群对疫苗存在内在及获得性耐药，未来需联合靶向浆细胞亚群或阻断IGF-1信号及髓系检查点的策略 | 评估个性化新抗原疫苗治疗无症状淋巴浆细胞淋巴瘤的安全性和有效性，并探索其免疫机制 | 9例无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴浆细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9例患者的骨髓样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒（用于单细胞转录组分析） |
| 548 | 2026-05-27 |
Single-cell transcriptome profiles of Drosophila fruitless-expressing neurons from both sexes
2023-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78511
PMID:36724009
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对果蝇中表达fruitless基因的神经元进行了转录组图谱分析，揭示了性别间的差异和共性 | 首次构建了果蝇雄性化和雌性化fruitless表达神经元的单细胞转录组图谱，并鉴定出113个细胞簇，发现性别差异在神经元数量和基因表达中普遍存在 | 未明确说明局限性，可能包括样本数量和实验条件下的潜在偏差 | 研究果蝇fruitless表达神经元的单细胞转录组特征，探索性别差异的分子基础 | 果蝇的fruitless表达神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 549 | 2026-05-27 |
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo3932
PMID:36197983
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析、转录因子调控网络分析、高分辨率共聚焦显微镜及胰岛素分泌测量，揭示了人类胰岛β细胞在衰老过程中发生的分子和功能变化 | 首次通过跨人类生命周期的综合分析，揭示了衰老导致β细胞转录因子网络重组、内质网应激激活和胰岛素分泌功能减退的分子机制 | 研究基于非糖尿病供体样本，可能无法完全代表糖尿病患者的β细胞衰老特征 | 探究衰老对人类胰岛β细胞功能和特性的影响机制 | 人类非糖尿病供体的胰岛β细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、高分辨率共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 覆盖人类大部分生命周期的非糖尿病供体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 550 | 2026-05-27 |
Integrated single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2021-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27599-5
PMID:34921160
|
研究论文 | 对食管鳞状细胞癌微环境进行单细胞转录组测序分析，揭示其细胞异质性和免疫抑制特征 | 首次鉴定出具有预后价值的肿瘤特异性CST1肌成纤维细胞亚群，并在其他癌症类型中验证其高肿瘤特异性；发现并验证了抗原呈递成纤维细胞亚群 | 样本量相对有限（11例患者），可能需要更大规模研究验证发现的普遍性 | 揭示食管鳞状细胞癌微环境的细胞异质性和免疫特性 | 食管鳞状细胞癌患者的血液、癌旁正常组织和肿瘤组织样本 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 11例食管鳞状细胞癌患者的62,161个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 551 | 2026-05-27 |
Retinal Organoids Long-Term Functional Characterization Using Two-Photon Fluorescence Lifetime and Hyperspectral Microscopy
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.796903
PMID:34955757
|
研究论文 | 采用双光子荧光寿命和超光谱显微技术对视网膜类器官进行长期功能表征 | 首次引入基于双光子显微镜的活体成像技术，结合荧光寿命成像（FLIM）和超光谱成像，无损监测和表征视网膜类器官的长期发育过程，发现代谢从糖酵解向氧化磷酸化的转变及光感受器基因表达的时序规律 | 研究未明确提及局限性，但可能包括样本量有限、技术依赖复杂设备、结果外推至临床需进一步验证 | 改进视网膜类器官的质量控制，通过活体成像技术无损监测其长期发育过程 | 人诱导多能干细胞来源的视网膜类器官 | 计算机视觉 | NA | 双光子荧光寿命成像, 超光谱成像, 定量PCR, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | NA |
| 552 | 2026-05-26 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf9941
PMID:37824646
|
研究论文 | 利用单细胞和多重空间转录组学揭示人类丘脑发育过程中的时空分子动态 | 首次在人类发育中的丘脑中描绘分子定义的神经元分化轨迹和空间组织模式，鉴定出不同丘脑核团中富集的谷氨酸能和GABA能神经元亚型 | 对丘脑发育的分子架构理解仍不完整，尤其对人类而言 | 阐明人类丘脑发育中细胞命运特化和组织的分子轨迹 | 人类发育中的丘脑组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、多重空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类发育中期（第二孕期）的丘脑样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组平台 |
| 553 | 2026-05-26 |
Mitochondrial variant enrichment from high-throughput single-cell RNA sequencing resolves clonal populations
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01210-8
PMID:35210612
|
研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序富集线粒体变异，解析克隆群体 | 结合常见3'单细胞RNA测序方案与线粒体转录组富集技术，将覆盖率提高50倍以上，实现高置信度突变检测 | NA | 建立可扩展且高灵敏度的线粒体DNA变异检测方法，以解析复杂组织中细胞克隆关系 | 原代人细胞（克隆造血中的免疫细胞） | 机器学习 | 克隆造血 | 单细胞RNA测序, 线粒体转录组富集 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 常见3'单细胞RNA测序方案 |
| 554 | 2026-05-26 |
Novel bi-allelic variants in KASH5 are associated with meiotic arrest and non-obstructive azoospermia
2022-06-30, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaac021
PMID:35674372
|
研究论文 | 本研究在非梗阻性无精子症患者中鉴定出KASH5基因的新型双等位变异，证实其与减数分裂阻滞和男性不育相关 | 首次在人类细胞中评估KASH5蛋白表达，并揭示LINC复合物在人类和小鼠中的保守调控机制 | 功能验证主要依赖小鼠模型，人类样本数量有限，具体分子机制尚需进一步研究 | 探究KASH5基因变异与非梗阻性无精子症和减数分裂阻滞的关联 | 非梗阻性无精子症患者及其不孕姐妹 | 机器学习 | 男性不育症 | 全外显子组测序、CNV芯片、单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据、单细胞转录组数据 | 1例先证者及其姐妹，以及Kash5基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2026-05-25 |
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2650234
PMID:41913413
|
研究论文 | 通过整合肿瘤和免疫细胞转录组学预测转移性黑色素瘤对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 | 使用单细胞RNA测序指导的免疫解卷积方法，识别出四种免疫细胞亚群作为耐药预后指标，并构建了82基因转录组特征签名 | 样本量较小（46例发现队列和54例验证队列），且液态活检仅用于8例患者的scRNA-seq分析 | 基于新型基因表达特征预测免疫检查点抑制剂原发性耐药的生物标志物 | 转移性皮肤黑色素瘤患者治疗前的肿瘤微环境转录组和外周血单核细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 46例发现队列FFPE RNA-seq样本，54例独立验证队列样本，8例scRNA-seq液态活检样本，46例流式细胞术样本 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 556 | 2026-05-25 |
Decoding the gut microbiota metabolite-matrix metalloproteinase-3 axis in breast cancer: a multi-omics and network pharmacology study
2026-Jun, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-025-11351-y
PMID:40946247
|
研究论文 | 采用多组学整合框架，结合网络药理学、机器学习、SHAP分析和单细胞RNA测序，系统研究肠道菌群代谢产物与基质金属蛋白酶-3（MMP3）在乳腺癌中的相互作用 | 首次整合网络药理学、机器学习与单细胞测序揭示肠道菌群代谢物-MMP3轴在乳腺癌中的作用，发现8种无毒菌群代谢物具有靶向MMP3的治疗潜力 | 结果基于计算分析和数据库验证，尚未进行体外和体内实验验证，缺乏临床样本的直接证据 | 探索肠道菌群代谢产物与乳腺癌相关靶点（尤其是MMP3）的相互作用机制 | 乳腺癌相关的肠道菌群代谢产物及其靶点MMP3 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 网络药理学, 分子对接, 孟德尔随机化 | 机器学习模型（SHAP分析） | 基因表达数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2026-05-25 |
18-β-glycyrrhetinic acid facilitates nuclear-mitochondrial communications to alleviate oxidative stress through HMGB1-cGAS-Mul1 axis in tendinopathy
2026-04-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08091-4
PMID:41998635
|
研究论文 | 研究18-β-甘草次酸通过HMGB1-cGAS-Mul1轴减轻肌腱病中氧化应激的机制 | 首次阐明GA通过DOT1L介导的HMGB1甲基化调控cGAS降解的分子机制，揭示了核-线粒体通讯在肌腱病中的作用 | 仅在大鼠模型和细胞实验中验证，缺乏临床人体试验数据 | 阐明18-β-甘草次酸缓解肌腱病的分子机制，特别是对HMGB1-cGAS-STING通路和氧化应激的调控 | 肌腱病大鼠模型和H2O2诱导的肌腱干细胞氧化应激模型 | 机器学习 | 肌腱病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 临床样本单个细胞，大鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 558 | 2026-05-25 |
ANP32E drives lung adenocarcinoma progression via GSK3β-mediated glycolytic reprogramming
2026-Apr-14, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08712-2
PMID:41980942
|
研究论文 | 发现ANP32E通过KDM3B/EGFR介导的GSK3β失活促进肺腺癌糖酵解重编程和进展 | 首次揭示ANP32E通过表观遗传-代谢串扰调控肺腺癌进展的机制，并筛选出靶向ANP32E的化合物PGG | 未提及临床验证PGG在人体中的疗效和安全性 | 探究ANP32E在肺腺癌进展中的表观遗传-代谢调控机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌细胞系A549/H1975和异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 多重组学分析 | NA | 基因表达数据 | TCGA和临床样本分析，具体数量未提及 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina Novaseq (推断) | NA |
| 559 | 2026-05-25 |
Regulation of mitochondrial ROS by C15ORF48 in a basal cell subpopulation contributes to chemotherapy resistance in TNBC
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8684
PMID:41931605
|
研究论文 | 研究C15ORF48在基底细胞亚群中调节线粒体ROS导致三阴性乳腺癌化疗耐药的机制 | 首次发现C15ORF48在基底细胞亚群中上调并通过抑制ROS积累导致化疗耐药，并鉴定其为潜在的AC化疗耐药治疗靶点 | 研究主要基于患者来源异种移植模型，可能未完全反映人体内微环境的复杂性 | 阐明三阴性乳腺癌对AC化疗耐药的分子机制 | 三阴性乳腺癌肿瘤上皮细胞（特别是基底细胞亚群） | 单细胞转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 原位三阴性乳腺癌患者来源异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 560 | 2026-05-25 |
Research progress in heterogeneity of dental mesenchymal stem cells
2026-Apr-03, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00433-8
PMID:41932866
|
综述 | 综述了牙间充质干细胞在发育和亚群层面的异质性研究进展 | 系统总结了单细胞RNA测序等新技术揭示的牙间充质干细胞发育层级和异质性，为组织再生工程提供新框架 | 未提及现有研究的局限性 | 整合牙间充质干细胞及其相关细胞的发育异质性和亚群异质性研究，促进牙齿和牙周组织发育的理解及组织再生修复工程 | 牙间充质干细胞及其相关细胞，包括牙胚祖细胞、牙囊干细胞、脱落乳牙干细胞、根尖牙乳头干细胞、牙髓干细胞、牙周膜干细胞、牙龈间充质干细胞和牙槽骨间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |