单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 39702 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-05-21 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Mar-04, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2026.02.030
PMID:41791482
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肿瘤浸润自然杀伤细胞亚型，为非小细胞肺癌患者治疗分层提供依据 | 首次发现吸烟相关的两种自然杀伤细胞亚型（应激反应性和适应性免疫调节性）可预测手术或新辅助化学免疫治疗的疗效，为治疗策略优化提供细胞层面标志 | 样本量有限（单细胞RNA测序61例，验证集19例，转录组去卷积102例及24例新辅助治疗患者），结论需更大规模队列验证；仅基于转录组分析，缺乏功能性实验验证 | 识别与吸烟相关的免疫细胞决定因素，以指导可切除非小细胞肺癌的治疗分层 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织及相邻肺组织中的自然杀伤细胞亚型 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 61例肺组织（单细胞RNA测序）、19例侵袭性肺腺癌（验证）、102例切除非小细胞肺癌（批量RNA测序）、24例新辅助化学免疫治疗患者（批量RNA测序） | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台处理单细胞RNA-seq；Illumina NovaSeq用于批量RNA测序 |
| 542 | 2026-05-21 |
Multiscale confidence quantification for virtual spatial transcriptomics with UTOPIA
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.01.708850
PMID:41847009
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研究论文 | 提出了UTOPIA框架，用于虚拟空间转录组学的多尺度置信度量化，从组织学图像预测基因表达或细胞类型 | 提出了模型无关的UTOPIA框架，能对虚拟空间转录组预测进行统计校准的置信度评分，并控制基因和细胞类型检测的假发现率 | NA | 解决虚拟空间转录组学预测的统计可靠性问题，确保预测的可信度并防止虚假生物学结论 | 虚拟空间转录组学预测的空间分辨率和生物粒度 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 543 | 2026-05-21 |
Chronic cerebral hypoperfusion exacerbates amyloid and tau pathology by impairing glymphatic transport via AQP4- and VEGF-mediated pathways: insights from a vascular to mixed-type dementia model
2026-03, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71290
PMID:41841574
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研究论文 | 本研究探讨慢性脑低灌注通过AQP4和VEGF介导的通路损伤类淋巴运输，加剧淀粉样蛋白和tau蛋白病理，并构建从血管性到混合型痴呆的模型 | 首次揭示CCH通过AQP4去极化和VEGF抑制导致类淋巴功能障碍及毒性蛋白积累的机制，并发现恢复血管张力可改善认知功能 | 未提及具体局限性 | 阐明慢性脑低灌注导致认知障碍的机制及其与神经退行性疾病的关系 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠 | 神经科学 | 血管性痴呆,阿尔茨海默病 | 磁共振成像,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 图像,基因表达数据 | 小鼠模型样本量未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 544 | 2026-05-21 |
Population and single-cell analyses reveal immune cell-specific expression profiles associated with Alzheimer's disease risk
2026-03, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71282
PMID:41866337
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研究论文 | 通过群体和单细胞分析揭示了与阿尔茨海默病风险相关的免疫细胞特异性表达谱 | 整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞表达数量性状位点数据，结合脑组织空间转录组学，鉴定了13个与AD风险相关的基因，并揭示了其在未刺激和刺激的外周免疫细胞及脑浸润免疫细胞中的细胞类型和状态特异性表达 | NA | 探究外周免疫系统失调增加阿尔茨海默病风险的细胞类型特异性机制 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞和脑组织样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因组关联研究 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 基因组关联研究样本量455,258 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 545 | 2026-05-21 |
Harnessing Inflammatory Monocytes to Overcome Resistance to Anti-PD-1 Immunotherapy
2026-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704029
PMID:41676732
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研究论文 | 研究利用炎症单核细胞克服抗PD-1免疫治疗耐药性的机制 | 发现CD40激动剂抗体可通过诱导炎症单核细胞产生IFNγ应答，在缺乏抗原呈递的肿瘤中激活CD8+ T细胞和NK细胞，从而克服免疫检查点抑制剂耐药性 | 研究基于小鼠模型和公开数据库分析，尚未在临床试验中验证 | 探索克服抗PD-1免疫治疗获得性耐药的策略 | B2m缺失的黑色素瘤和结直肠癌小鼠模型以及人类肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤，结直肠癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，体外功能实验，RNA测序数据分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，体外功能数据 | 小鼠模型（具体数量未说明）及已发表的人类RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2026-05-21 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
|
研究论文 | 本研究揭示了NOTCH4基因功能获得性变异在系统性硬化症中破坏血管生成的作用机制 | 首次发现NOTCH4基因变异与非洲裔美国系统性硬化症患者更严重的血管表型相关，并证明通过抑制NOTCH4信号可恢复血管生成 | 未明确说明研究局限性 | 探讨NOTCH4基因在系统性硬化症血管病变中的作用及其治疗潜力 | 非洲裔美国系统性硬化症患者 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 547 | 2026-05-21 |
Identification of potential drug targets for Alzheimer's disease from genetic insights: A Mendelian randomization study
2026-Jan-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045715
PMID:41630303
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化研究，从遗传学角度识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 结合孟德尔随机化分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子对接和单细胞测序等多种方法，系统性地识别了10个与阿尔茨海默病相关的核心基因，并预测了5个候选药物 | 血浆蛋白数据来源于公开的GWAS汇总统计，样本可能具有人群特异性；孟德尔随机化分析无法完全排除潜在混杂因素；分子对接结果需要进一步的实验验证 | 探索血浆蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关系，识别潜在的药物靶点 | 4907种血浆蛋白和阿尔茨海默病 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化、分子对接 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 548 | 2026-05-21 |
BDCD: a comprehensive Brain Disease Cell-cell communication Database
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baag017
PMID:41925140
|
研究论文 | BDCD是首个专注于脑疾病细胞间通讯网络的综合数据库，整合了来自单细胞RNA-seq和空间转录组学的大量数据 | 首次构建了覆盖多种脑疾病的特异性细胞间通讯资源，整合了配体-受体相互作用与遗传关联、通路和药物调节剂等多维度数据，支持跨疾病比较和动态假说生成 | 现有资源在脑部特异性、区域覆盖和功能注释方面仍存在局限，且数据库可能尚未涵盖所有已知脑疾病或最新研究数据 | 为脑疾病病理机制和治疗发现提供综合性的细胞间通讯资源 | 脑疾病中涉及的单细胞和空间转录组数据，覆盖阿尔茨海默病、帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍和多发性硬化症 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病, 精神分裂症, 双相情感障碍, 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 8519425个单细胞和140744个空间转录组点，来自38个手动整理的数据集，涵盖14个脑区和13种经典细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 549 | 2026-05-21 |
Spatial Imbalance of Innate-like T-Cell Niches Underlies Clinical Trajectories in Psoriasis
2026-01-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020715
PMID:41596369
|
研究论文 | 利用空间转录组学解析银屑病中γδT细胞和MAIT细胞的空间分布及其与临床轨迹的关系 | 首次通过空间转录组学揭示银屑病中γδT细胞和MAIT细胞在皮肤不同层次上的不对称分布及各自独特的转录程序，并建立其与临床严重程度的关联 | 未明确说明 | 研究银屑病中先天性样T细胞（iLTCs）的空间组织和组织相关程序，以及它们与临床轨迹的关系 | 银屑病患者皮肤及外周血中的γδT细胞和MAIT细胞 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学，CITE-seq | NA | 转录组数据 | 多个独立队列 | NA | 空间转录组学，CITE-seq | NA | NA |
| 550 | 2026-01-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals metabolic reprogramming and tumor microenvironment remodeling in aldosterone-producing adenoma
2026-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111164
PMID:41317749
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了醛固酮瘤（APA）中的代谢重编程和肿瘤微环境重塑 | 首次构建了APA的单细胞图谱，揭示了CAPS zona glomerulosa样细胞的代谢重编程特征、分化轨迹紊乱以及肿瘤微环境中免疫浸润和基质重塑的关键机制 | 样本量较小（仅3例APA患者和3例对照），且为单中心研究，需要更大规模队列验证 | 阐明醛固酮瘤的细胞异质性、肿瘤发生机制及潜在治疗靶点 | 肾上腺组织（来自APA患者和对照个体） | 数字病理学 | 肾上腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例APA患者和3例对照的肾上腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 551 | 2026-05-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals a cellular atlas of the sheep testis
2026-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111159
PMID:41325971
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建绵羊睾丸细胞图谱，揭示精子发生过程中的细胞异质性和分化轨迹 | 首次在绵羊中通过单细胞转录组分析鉴定出六种体细胞亚型和五种生殖细胞亚型，并发现Leydig细胞和管周肌样细胞可能起源于共同祖细胞谱系 | 仅分析了6月龄性成熟湖羊的睾丸组织，缺乏不同发育阶段或病理状态的比较 | 解析绵羊睾丸中不同细胞类型的转录组特征及精子发生的分化轨迹 | 3只6月龄性成熟湖羊的睾丸细胞 | 机器学习和生物信息学 | NA | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞转录组数据 | 3只绵羊，共15,826个睾丸细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium™ 单细胞3'转录组测序 |
| 552 | 2026-05-21 |
TOGAR: Token-gated generative refinement for high-fidelity spatial transcriptomics and robust spatial domain clustering
2026-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111179
PMID:41422986
|
研究论文 | 提出TOGAR模型，一种基于令牌门控生成式细化的空间转录组学方法，统一去噪、空间增强和聚类，实现高保真空间转录组分析和稳健的空间域聚类 | 创新性地提出令牌门控（token gating）与门控线性注意力（gated linear attention）结合的扩散骨干网络（UGate-based diffusion backbone），并整合图卷积网络损失与零膨胀负二项分布损失以处理稀疏计数数据噪声，同时利用扩散轨迹上的相似性引导平均生成稳定的点级估计 | 标题和摘要未提及方法局限性信息 | 解决空间转录组学数据稀疏性和噪声对长程依赖建模的限制，提高空间域划分的准确性 | 空间转录组学数据中的组织切片的空间域聚类及生物结构识别 | 计算机视觉, 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 图卷积网络, 扩散模型, 门控线性注意力 | 基因表达数据 | 12个切片（来自三个空间转录组学平台） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 553 | 2026-05-21 |
Single-cell sequencing reveals dynamic immune features of paraneoplastic pemphigus in a patient with follicular lymphoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1733718
PMID:41929499
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示一位滤泡性淋巴瘤伴副肿瘤性天疱疮患者治疗过程中的动态免疫特征 | 首次利用单细胞转录组和TCR测序纵向追踪副肿瘤性天疱疮患者从治疗前到康复后的免疫动态变化，发现特定T细胞亚群和B细胞亚群的相对丰度变化，以及TCR克隆在治疗过程中的逐渐扩展 | 单患者描述性研究，结果仅为探索性且不具备普遍性，无法建立因果关系 | 阐明副肿瘤性淋巴瘤继发的副肿瘤性天疱疮的细胞和分子机制 | 一位滤泡性淋巴瘤伴副肿瘤性天疱疮患者的PBMC和骨髓细胞 | 机器学习 | 肿瘤相关自身免疫病 | 单细胞转录组测序， 单细胞TCR分析 | NA | 单细胞转录组数据， 单细胞TCR数据 | 1名患者，3个时间点（治疗前、治疗中、治疗后） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq， 单细胞TCR测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5' |
| 554 | 2026-05-21 |
Comprehensive Bioinformatics Analysis and Experimental Verification RNF186 Is a Recurrence Signature Gene of Hepatocellular Carcinoma that Promotes Cell Proliferation
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.071617
PMID:41930175
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据综合分析，识别肝细胞癌复发相关基因RNF186并构建预后模型 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出RNF186作为肝细胞癌复发特征基因，并通过实验验证其通过SESN2依赖方式促进细胞增殖 | 未明确说明，但从摘要中推断样本量可能有限（12例原发和6例复发样本），且未进行多中心外部验证 | 识别肝细胞癌复发相关基因并构建预后模型，预测生存结局和免疫治疗反应 | 12例原发和6例复发肝细胞癌样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 12个原发性HCC样本和6个复发性HCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 555 | 2026-05-21 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals glycolysis heterogeneity and NEK6-mediated progression in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802329
PMID:42131349
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学揭示了结直肠癌中糖酵解异质性和NEK6介导的进展 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析，解析了结直肠癌中糖酵解异质性的空间组织及驱动恶性高糖酵解状态的分子机制，并识别出NEK6作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 揭示结直肠癌中糖酵解异质性的空间分布及其分子驱动机制 | 结直肠癌细胞及肿瘤微环境中的巨噬细胞和B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据，GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 556 | 2026-05-21 |
Shared autonomous HERV loci transcription identifies a unique circulating CD14+-xCR1+ mononuclear cell phenotype in a patient group with post-acute sequelae of COVID-19
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349350
PMID:42154742
|
研究论文 | 本研究分析12名COVID-19后遗症患者外周血单核细胞中共享自主HERV基因座的转录特征，发现CD14+单核细胞中特定HERV基因座与xCR1表达相关 | 首次在CD14+单核细胞中识别出与xCR1基因内含子相关的自主HERV基因座，并发现其在COVID-19感染者支气管灌洗细胞中特异性表达 | 样本量较小（12名患者），且未在健康对照或更大规模队列中验证发现的HERV基因座特异性 | 探讨COVID-19后遗症患者中自主HERV基因座的转录模式及其与免疫功能障碍的关系 | 12名COVID-19后遗症患者的外周血单核细胞 | 机器学习 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名COVID-19后遗症患者的外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于窗口的HERV比对方法分析单细胞RNA测序数据 |
| 557 | 2026-05-21 |
KIM-1 as an Early Diagnostic Biomarker of Cisplatin-Induced Acute Kidney Injury
2026 Jan-Dec, Iranian journal of pharmaceutical research : IJPR
IF:1.8Q3
DOI:10.5812/ijpr-164432
PMID:42157797
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研究论文 | 本研究整合生物信息分析、体外实验以及系统综述与荟萃分析，全面评估KIM-1作为顺铂诱导急性肾损伤早期诊断生物标志物的潜力 | 该研究创新性地结合了单细胞RNA测序、大量RNA测序、体外实验和荟萃分析，多模态验证了KIM-1在顺铂诱导急性肾损伤早期诊断中的特异性和准确性 | 荟萃分析纳入的研究数量可能有限，且临床诊断标准基于血清肌酐，可能影响KIM-1的早期检测性能评估 | 综合评估KIM-1在顺铂诱导急性肾损伤中的表达、功能及早期诊断性能 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠模型及人肾近端小管细胞（HK-2细胞） | 生物信息学与医学诊断 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、大量RNA测序、实时定量PCR、酶联免疫吸附试验、CCK-8细胞活力检测 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床试验数据 | 荟萃分析涉及多个研究，具体样本量未在摘要中明确列出 | NA | 单细胞RNA测序、大量RNA测序 | NA | NA |
| 558 | 2026-05-21 |
The Role of Methylacrylylated Hyaluronic Acid Hydrogels in Promoting Skin Wound Healing
2026 Jan-Dec, Iranian journal of pharmaceutical research : IJPR
IF:1.8Q3
DOI:10.5812/ijpr-169881
PMID:42157798
|
研究论文 | 探究甲基丙烯酰化透明质酸水凝胶在促进皮肤伤口愈合中的作用及局部微环境特征 | 首次结合单细胞测序和CellChat软件分析HAMA水凝胶治疗下伤口局部成纤维细胞和巨噬细胞的亚群变化及细胞间通讯状态 | 仅在小鼠模型中进行，未在人体中验证，且样本量较小（每组6只），可能无法完全代表临床实际情况 | 探索甲基丙烯酰化透明质酸水凝胶在皮肤伤口愈合中的作用并分析伤口局部微环境特征 | 小鼠（C57BL/6）和RAW264.7小鼠巨噬细胞系 | 机器学习 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞测序、RT-qPCR、免疫组织荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 12只小鼠，分为对照组（n=6）和HAMA组（n=6） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat软件包进行细胞聚类分析，CellChat软件包分析细胞通讯 |
| 559 | 2026-05-21 |
Activation of GABBR1 by New Ligand Valerate Transcriptionally Regulates ATF4-NRF2-CXCL13 Axis Mediating CD8+ T Cell Anti-Tumor Immunity
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.127859
PMID:42157924
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研究论文 | 本研究鉴定戊酸作为GABBR1的新型配体，通过转录调节ATF4-NRF2-CXCL13轴介导CD8+ T细胞抗肿瘤免疫 | 首次发现戊酸作为GABA受体的偏向性配体，特异性结合GABBR1亚基并上调其表达，揭示其在非小细胞肺癌中介导CD8 T细胞抗肿瘤免疫的新机制 | 未提及明显局限性 | 探讨戊酸在非小细胞肺癌中通过GABBR1调节CD8+ T细胞抗肿瘤免疫的作用机制 | 非小细胞肺癌细胞和CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公共数据集及患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 560 | 2026-05-21 |
The SPP1-CD44 Signaling Axis Orchestrates Macrophage Metabolism to Promote Early Inflammation in Acute Kidney Injury
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.130922
PMID:42157927
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序、代谢组学和基因编辑方法，揭示SPP1-CD44信号轴通过PI3K/AKT-PKM2模块调控巨噬细胞代谢重编程，促进急性肾损伤早期炎症的机制 | 首次从单细胞和代谢水平阐明受损肾小管上皮细胞分泌的SPP1通过CD44受体调控巨噬细胞免疫代谢和炎症极化的完整机制，并验证了靶向该轴的潜在治疗价值 | 未明确说明局限性 | 探究急性肾损伤早期受损肾小管上皮细胞如何调控巨噬细胞代谢和表型，并揭示其分子机制 | 缺血再灌注诱导的急性肾损伤小鼠模型及巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据, 代谢组学数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |