单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-05-04 |
Single-cell RNA sequencing and immune microenvironment analysis reveal PLOD2-driven malignant transformation in cervical cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522655
PMID:39840054
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫微环境分析，揭示了PLOD2在宫颈癌恶性转化中的作用 | 鉴定了宫颈癌中的8种细胞类型和5种恶性上皮细胞亚群，建立了NNMT CAEPCs风险评分（NCRS）模型，并验证了PLOD2作为预后基因的重要性 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分仅限于体外实验 | 探索宫颈癌肿瘤微环境，寻找潜在治疗靶点 | 宫颈癌恶性上皮细胞（EPCs）及其亚群 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NCRS模型 | RNA测序数据 | 来自UCSC和ArrayExpress数据库的数据 |
| 542 | 2025-05-04 |
Targeting immune cellular populations and transcription factors: unraveling the therapeutic potential of JQF for NAFLD
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445924
PMID:39840059
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研究论文 | 本研究探讨了降糖清热方（JQF）对非酒精性脂肪肝病（NAFLD）的治疗潜力及其作用机制 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示JQF通过调节特定免疫细胞亚群和转录因子发挥治疗作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探索JQF对NAFLD的治疗机制 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠模型 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 组织病理学数据 | NAFLD小鼠模型（具体数量未说明） |
| 543 | 2025-05-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity and function of mast cells in human ccRCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494025
PMID:39840068
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学揭示了人类透明细胞肾癌（ccRCC）中肥大细胞的异质性和功能 | 首次在ccRCC中进行了全面的肥大细胞单细胞研究，鉴定了四种肥大细胞特征基因，并揭示了肥大细胞在ccRCC中的表型转变 | 样本量较小（仅4名ccRCC患者），且需要进一步验证肥大细胞在ccRCC中的具体作用机制 | 探究ccRCC中肥大细胞的异质性和功能 | 透明细胞肾癌（ccRCC）患者组织样本 | digital pathology | 肾癌 | 单细胞测序、空间转录组学、多重免疫组化（mIHC） | NA | 单细胞转录组数据、批量组织测序数据 | 4名ccRCC患者的组织样本，整合了在线测序数据库的数据 |
| 544 | 2025-05-04 |
Comprehensive bioinformatics analysis identifies metabolic and immune-related diagnostic biomarkers shared between diabetes and COPD using multi-omics and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1475958
PMID:39845878
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法，识别糖尿病和慢性阻塞性肺疾病（COPD）共有的代谢和免疫相关诊断生物标志物 | 首次通过多中心患者队列、多组学分析和多种机器学习算法，识别出糖尿病和COPD共有的4个生物标志物（CADPS、EDNRB、THBS4和TMEM27），并在单细胞测序、临床样本和动物模型中验证了其稳健性 | 未明确说明样本的具体数量或来源限制，且未提及外部验证队列的结果 | 探索糖尿病和COPD之间的分子机制联系，并识别共有的诊断生物标志物 | 糖尿病和COPD患者的多中心队列数据、临床样本和动物模型 | 生物信息学 | 糖尿病, 慢性阻塞性肺疾病 | 多组学分析（包括基因表达分析）、机器学习算法、单细胞测序 | 多种机器学习算法（未具体说明）、WGCNA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 多中心患者队列（具体数量未说明）、临床样本和动物模型 |
| 545 | 2025-05-04 |
Deciphering hub genes and immune landscapes related to neutrophil extracellular traps in rheumatoid arthritis: insights from integrated bioinformatics analyses and experiments
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1521634
PMID:39845946
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和实验，揭示了类风湿性关节炎中与中性粒细胞胞外陷阱相关的枢纽基因和免疫景观 | 首次阐明了RA滑膜微环境中中性粒细胞的异质性与成纤维细胞的通讯机制，并鉴定和验证了4个潜在的NET相关生物标志物 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床队列中进行验证 | 探索NETs在RA发病机制中的分子机制和关键基因 | 类风湿性关节炎患者和佐剂诱导的关节炎大鼠模型 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫组织化学、实时定量PCR | 机器学习（三种技术） | RNA测序数据、微阵列数据 | 多个GEO数据集和临床队列 |
| 546 | 2025-05-04 |
Impact of glioma metabolism-related gene ALPK1 on tumor immune heterogeneity and the regulation of the TGF-β pathway
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512491
PMID:39845963
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研究论文 | 该研究通过整合多源胶质瘤数据集，利用NMF和WGCNA方法识别关键代谢基因，并构建预测模型，探讨ALPK1基因在胶质瘤免疫异质性和TGF-β通路调控中的作用 | 采用多数据集策略和101种机器学习技术组合构建预测模型，首次阐明ALPK1基因在胶质瘤免疫调控中的相关性 | 研究结果需要进一步实验验证，且样本来源可能影响模型的泛化能力 | 探索胶质瘤分子分型、寻找新的预后生物标志物并理解其免疫微环境特征 | 胶质瘤患者及其相关基因表达数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | NMF, WGCNA, 单细胞测序 | LASSO+GBM | 基因表达数据 | 多源胶质瘤数据集（未明确具体数量） |
| 547 | 2025-05-04 |
Exploring the shared mechanism of fatigue between systemic lupus erythematosus and myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome: monocytic dysregulation and drug repurposing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1440922
PMID:39845969
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研究论文 | 探索系统性红斑狼疮(SLE)和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征(ME/CFS)之间疲劳的共同机制，包括单核细胞失调和药物再利用 | 首次识别了SLE和ME/CFS共有的58个重叠基因，并确定了5个关键靶点(IL1β、CCL2、TLR2、STAT1、IFIH1)，发现这些靶点在单核细胞中富集，并通过RT-qPCR验证了在激活的单核细胞中的上调表达 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索SLE和ME/CFS中疲劳的共同机制并预测潜在治疗药物 | 系统性红斑狼疮(SLE)和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征(ME/CFS) | 生物信息学 | 自身免疫性疾病/神经系统疾病 | 生物信息学分析(GO、KEGG、PPI网络构建)、单细胞聚类、RT-qPCR、分子对接 | THP-1细胞炎症模型 | 基因表达数据 | NA |
| 548 | 2025-05-04 |
Exploring the role of metabolic pathways in TNBC immunotherapy: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1528248
PMID:39850483
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review | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）中代谢途径与免疫功能之间的相互作用，强调了单细胞和空间转录组学技术的最新进展 | 探讨了代谢重编程在调节免疫细胞功能中的关键作用，并提出了针对代谢途径的策略可能增强免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的响应性 | NA | 研究TNBC中代谢途径与免疫功能的相互作用及其对免疫治疗的影响 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | digital pathology | breast cancer | single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics | NA | transcriptomics data | NA |
| 549 | 2025-05-04 |
Integrated single-cell RNA sequencing reveals the tumor heterogeneity and microenvironment landscape during liver metastasis in adenocarcinoma of esophagogastric junction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484234
PMID:39850884
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research paper | 利用单细胞RNA测序技术揭示食管胃结合部腺癌肝转移过程中的肿瘤异质性和微环境景观 | 首次在AEGJ肝转移中鉴定出一种特定的成纤维细胞类型，并发现SFRP2基因在周细胞中的高表达可能通过Wnt通路影响血管稳定性和血管生成 | 样本量较小，未进行功能验证实验 | 探究食管胃结合部腺癌肝转移的细胞和分子机制 | 食管胃结合部腺癌肝转移患者的肿瘤组织和微环境 | digital pathology | esophagogastric junction adenocarcinoma | single-cell RNA sequencing, immunofluorescence staining | NA | RNA-seq data, immunofluorescence images | AEGJ肝转移患者样本（具体数量未明确说明） |
| 550 | 2025-05-04 |
Combining single-cell analysis and molecular docking techniques to construct a prognostic model for colon adenocarcinoma and uncovering inhibin subunit βb as a novel therapeutic target
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1524560
PMID:39850875
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研究论文 | 结合单细胞分析和分子对接技术构建结肠腺癌预后模型，并揭示抑制素亚基βb作为新型治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序数据和分子对接技术，构建基于失巢凋亡相关基因的结肠腺癌预后模型，并发现INHBB作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于体外细胞实验 | 探索失巢凋亡与结肠腺癌的生物学联系及其在肿瘤进展中的机制，寻找新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者和细胞系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、分子对接、基因敲除 | Cox比例风险模型、Lasso回归 | 转录组数据、临床信息 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌患者数据 |
| 551 | 2025-05-04 |
Integrated single-cell and bulk transcriptome analysis of R-loop score-based signature with regard to immune microenvironment, lipid metabolism and prognosis in HCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487372
PMID:39850878
|
research paper | 该研究通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了一个基于R-loop评分的特征模型，以探索其在HCC免疫微环境、脂质代谢和预后中的作用 | 首次构建了基于R-loop评分的特征模型，揭示了R-loop调节基因（RLRGs）与HBV感染、脂质代谢及HCC进展的关系，并发现CLTC作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，缺乏对R-loop形成和功能机制的深入实验验证 | 探索R-loop在HCC进展中的作用，并构建预后风险模型以识别潜在治疗靶点 | HCC患者的单细胞和批量转录组数据，以及体外和体内实验验证 | digital pathology | hepatocellular carcinoma | scRNA-seq, WGCNA分析 | 预后风险模型 | 转录组数据 | 来自GSE149614和CRA002308的HCC患者数据，以及TCGA数据库的数据 |
| 552 | 2025-05-04 |
Macrophage heterogeneity and oncogenic mechanisms in lung adenocarcinoma: insights from scRNA-seq analysis and predictive modeling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491872
PMID:39850883
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析探索了肺腺癌中巨噬细胞的异质性及其潜在的致癌机制，并基于巨噬细胞相关基因构建了一个预后模型 | 揭示了巨噬细胞亚群的复杂性及其在肺腺癌中的潜在致癌作用，构建了一个基于巨噬细胞标记基因的预后模型，并验证了其在预测预后和免疫治疗效果方面的有效性 | 研究主要依赖于TCGA数据，可能受到样本量和数据质量的限制，且细胞实验仅验证了COL5A1的致癌机制 | 探索肺腺癌中巨噬细胞的特性及其对预后的影响，并构建一个有效的预后模型 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 | digital pathology | lung cancer | scRNA-seq, RT-PCR | Lasso regression, multivariate Cox regression | scRNA-seq data, clinical data | TCGA数据集及多个外部验证数据集 |
| 553 | 2025-05-04 |
The emergence of DNAM-1 as the facilitator of NK cell-mediated killing in ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1477781
PMID:39835114
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研究论文 | 本研究探讨了DNAM-1在卵巢癌中促进NK细胞介导的杀伤作用 | 揭示了DNAM-1在卵巢癌中作为NK细胞杀伤促进因子的新作用，并发现PVR/DNAM-1轴在肿瘤免疫逃逸中的关键作用 | 样本量相对有限(80例)，且主要为观察性研究，缺乏机制层面的深入探索 | 探索卵巢癌中NK细胞的表型和功能特征及其与临床预后的关系 | 80名卵巢癌患者的血液、原发肿瘤和转移组织中的NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 流式细胞术、scRNA-seq | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 80名卵巢癌患者样本 |
| 554 | 2025-05-04 |
Integrating single cell analysis and machine learning methods reveals stem cell-related gene S100A10 as an important target for prediction of liver cancer diagnosis and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1534723
PMID:39840058
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研究论文 | 结合单细胞分析和机器学习方法，揭示干细胞相关基因S100A10作为肝癌诊断和免疫治疗预测的重要靶点 | 首次将单细胞RNA测序与机器学习技术结合，识别出与肝癌干细胞相关的关键基因S100A10，并验证其作为预后标志物的潜力 | 研究仅针对肝癌，未在其他癌症类型中验证S100A10的普适性 | 提高肝癌的诊断精度和免疫治疗效果 | 肝癌干细胞相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未提及） |
| 555 | 2025-05-03 |
Prognostic significance of neutrophil extracellular trap-related genes in childhood acute lymphoblastic leukemia: insights from multi-omics and in vitro experiment
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2452701
PMID:39829399
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研究论文 | 本研究基于中性粒细胞胞外诱捕网相关基因(NETRGs)构建了一个儿童急性淋巴细胞白血病(cALL)的预后模型 | 首次将多组学数据与体外实验相结合，鉴定出7个预后相关基因并构建风险模型，揭示了TLR2等6个潜在治疗靶点 | 研究样本来自公共数据库，缺乏独立队列验证实验结果的临床适用性 | 开发儿童急性淋巴细胞白血病的预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 转录组测序、单细胞转录组测序、RT-qPCR | LASSO回归、Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | 来自TARGET-ALL-P2/P3队列和GSE26713/GSE130116数据集的样本 |
| 556 | 2025-05-03 |
Interferon Regulatory Factor 1 Promotes Diabetic Vasculopathy by Mediating Endothelial Cell Pyroptosis
2025-Jun, Annals of vascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.avsg.2025.02.018
PMID:40086624
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research paper | 该研究探讨了干扰素调节因子1（IRF-1）通过介导内皮细胞焦亡促进糖尿病血管病变的机制 | 首次揭示了IRF-1在糖尿病血管病变中通过调节内皮细胞焦亡的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足 | 探究糖尿病血管病变的分子机制 | 糖尿病模型小鼠BKS-db/db和内皮细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫组化、HE染色、Masson染色 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 两组样本（非糖尿病动脉粥样硬化和糖尿病动脉粥样硬化） |
| 557 | 2025-05-03 |
Single-cell sequencing reveals a regulatory role of WT1 in mast cell proliferation in endometrial polyps
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500116R
PMID:40304994
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究子宫内膜息肉中WT1在肥大细胞增殖中的调控作用 | 首次在单细胞水平上揭示了WT1作为关键转录调节因子在子宫内膜息肉肥大细胞增殖中的作用 | 研究样本量有限，需要更大规模的验证 | 探究子宫内膜息肉的细胞异质性和分子机制 | 子宫内膜息肉(EPs)及邻近正常子宫内膜组织(EUs) | 单细胞测序 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 子宫内膜息肉和邻近正常子宫内膜组织样本 |
| 558 | 2025-05-03 |
CCN5 suppresses injury-induced vascular restenosis by inhibiting smooth muscle cell proliferation and facilitating endothelial repair via thymosin β4 and Cd9 pathway
2025-May-02, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae911
PMID:39873228
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研究论文 | 本研究探讨了CCN5在抑制血管损伤后再狭窄中的作用及其机制 | 揭示了CCN5通过胸腺素β4和Cd9通路抑制平滑肌细胞增殖并促进内皮修复的双重保护作用 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究CCN5在预防支架内再狭窄(ISR)中的作用机制 | 猪冠状动脉和小鼠股动脉的血管细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 支架植入猪冠状动脉和小鼠损伤诱导的股动脉新生内膜样本 |
| 559 | 2025-05-03 |
Kindlin-2-Mediated Hematopoiesis Remodeling Regulates Triple-Negative Breast Cancer Immune Evasion
2025-May-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0698
PMID:39918417
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研究论文 | 研究探讨了kindlin-2在三阴性乳腺癌（TNBC）免疫逃逸中的作用及其通过造血重塑调节免疫反应的机制 | 揭示了kindlin-2通过调节造血过程和PD-L1表达促进TNBC免疫逃逸的新机制，并提出了kindlin-2作为联合免疫检查点阻断治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索kindlin-2在TNBC免疫逃逸中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组织化学（IHC） | 基因敲除（KO）小鼠模型 | 基因表达数据、免疫组织化学数据 | 未明确说明样本数量，但使用了TNBC肿瘤小鼠模型 |
| 560 | 2025-05-03 |
Denosumab Enhances Antitumor Immunity by Suppressing SPP1 and Boosting Cytotoxic T Cells
2025-May-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1094
PMID:40009710
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研究论文 | 本研究探讨了denosumab通过抑制SPP1基因表达和增强细胞毒性T细胞活性来增强抗肿瘤免疫的新作用 | 揭示了denosumab在抗肿瘤免疫中的新机制，即通过抑制SPP1表达和增加细胞毒性T细胞数量来增强免疫反应 | 研究样本量较小，仅包括9例GCTB患者，且pan-cancer分析为相关性研究，未进行机制验证 | 探索denosumab在抗肿瘤免疫中的作用及其机制 | 人类巨细胞瘤(GCTB)患者样本和34种不同类型的癌症数据 | 肿瘤免疫学 | 巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9例GCTB患者样本(6例未治疗，3例仅接受denosumab治疗)和34种癌症的pan-cancer数据 |