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当前共找到 40869 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-06-19 |
Genetic Associations of Clonal Hematopoiesis With Cardioembolic Stroke: Insights From Genome-Wide Mendelian Randomization, Bulk RNA, Single-Cell RNA Sequencing
2025-07, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70515
PMID:40702735
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化、批量RNA和单细胞RNA测序探索克隆造血与心源性栓塞性中风的遗传关联 | 首次利用双向双样本孟德尔随机化、多组学整合及机器学习方法，系统揭示克隆造血不确定潜能（CHIP）与心源性栓塞性中风（CES）的因果关系，并发现PARP1和CD3G作为关键治疗靶点 | 研究基于GWAS数据和公共转录组数据集，可能存在未校正的混杂因素，且样本量有限，需进一步验证因果关系和靶点的临床适用性 | 阐明克隆造血不确定潜能（CHIP）与缺血性中风（IS）的因果机制，识别关键遗传驱动因子和潜在治疗策略 | 克隆造血不确定潜能（CHIP）和缺血性中风（IS）患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | 图像 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 542 | 2026-06-19 |
CXCL10highTNFαhighKi67+ Microglia Recruit and Activate CD8+ T Cells in the Brainstem During Experimental Cerebral Malaria
2025-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70425
PMID:40457525
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研究论文 | 本研究探讨实验性脑型疟疾中小胶质细胞的异质性及其在招募和活化CD8+ T细胞中的作用 | 首次鉴定出CXCL10highTNFαhighKi67+的独特小胶质细胞亚型，并阐明其通过持续相互作用介导CD8+ T细胞招募和活化的机制 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；未深入探讨该亚型在其他神经系统疾病中的角色 | 揭示实验性脑型疟疾中小胶质细胞的异质性和功能，及其与CD8+ T细胞相互作用的分子机制 | C57BL/6J小鼠感染伯氏疟原虫ANKA诱导的脑型疟疾模型 | 数字病理学 | 脑型疟疾 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 电子显微镜, 共培养系统, 跨孔迁移实验, 粘附实验, 细胞毒性实验 | NA | 基因表达数据, 图像 | C57BL/6J小鼠感染伯氏疟原虫ANKA，具体数量未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 543 | 2026-06-19 |
Antiviral CD4 + T and myeloid cell responses to influenza vaccines are attenuated in older adults
2025-May-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651528
PMID:40654992
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研究论文 | 结合体外和离体实验及人类样本，探究老年人在接种流感疫苗后B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞反应的差异 | 首次通过单细胞转录组学揭示老年人T辅助细胞和髓系细胞中干扰素转录信号减弱，并指出髓系细胞转录编程改变是抗病毒T细胞反应降低的原因 | 未明确疫苗配方对髓系细胞反应的具体影响机制，且样本量可能有限 | 评估老年人对流感疫苗的细胞免疫反应，尤其是CD4+ T细胞和髓系细胞反应，并分析年龄相关免疫衰减的机制 | 年轻人和老年人的外周血免疫细胞（B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞） | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及年轻和老年人类样本（具体数量未在摘要中明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'文库制备 |
| 544 | 2026-06-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity in the aortas of Takayasu arteritis
2025-03-10, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03523-w
PMID:40065428
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示大动脉炎患者主动脉的细胞异质性 | 首次在单细胞水平上描绘了大动脉炎患者主动脉的细胞图谱，发现多种免疫和结构细胞的亚型特异性基因表达特征以及补体信号通路在外周血T细胞中的上调 | 样本量较小（仅3例患者主动脉样本和8例外周血样本），对照组数据来自公开数据库可能存在批次效应 | 探究大动脉炎主动脉组织的细胞异质性并发现潜在治疗靶点 | 大动脉炎患者的主动脉组织及外周血CD4+和CD8+ T细胞 | 机器学习和生物信息学 | 大动脉炎 | 单细胞转录组测序和批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据和批量RNA测序数据 | 3例患者主动脉样本和8例患者及8例健康志愿者的外周血T细胞 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞转录组分析和批量RNA测序 |
| 545 | 2026-06-19 |
Evaluating predictive patterns of antigen-specific B cells by single-cell transcriptome and antibody repertoire sequencing
2024-12-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.11.005
PMID:39662471
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research paper | 利用单细胞转录组和抗体库测序评估抗原特异性B细胞的预测模式 | 首次结合单细胞转录组和抗体库测序数据，使用机器学习预测抗原特异性B细胞，并评估了基于基因表达和抗体序列特征的模型性能 | 仅使用小鼠免疫B细胞数据，可能无法直接应用于人类或其他物种；机器学习模型的泛化能力需进一步验证 | 评估机器学习和基于基因表达与抗体库特征的模型在预测抗原特异性B细胞方面的性能 | 来自免疫小鼠的B细胞，标记为抗原特异性或非特异性 | machine learning | NA | 单细胞转录组测序, 抗体库测序 | CNN, LSTM, GAN, 线性模型, 非线性模型, 基于蛋白质语言模型的迁移学习 | 单细胞转录组数据, 抗体库序列数据 | 来自免疫小鼠的B细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 抗体库测序 | NA | NA |
| 546 | 2026-06-19 |
Tracking the gene expression programs and clonal relationships that underlie mast, myeloid, and T lineage specification from stem cells
2024-12-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.11.001
PMID:39615483
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研究论文 | 利用多能干细胞分化系统，结合时间分辨单细胞RNA测序和转录谱系条形码技术，追踪从干细胞到肥大细胞、髓系和T细胞谱系规范过程中的基因表达程序和克隆关系 | 首次使用时间分辨单细胞RNA测序和转录谱系条形码技术，实时捕捉人类T细胞规范的转录动态和细胞命运限制事件，鉴定出YBX1在T细胞谱系规范中的作用，并揭示肥大细胞和髓系潜能早期在造血过程中相互分叉 | 可能受限于体外分化系统的模型特性，未涉及体内微环境的影响 | 理解人类T细胞规范的转录动态和细胞命运限制事件 | 人类多能干细胞分化而来的造血祖细胞及其衍生的肥大细胞、髓系和T细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序、转录谱系条形码 | 基因调控网络推断 | 单细胞转录组数据 | 时间分辨的单细胞RNA测序数据，涉及体外分化系统的多个时间点样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 547 | 2026-06-19 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the retina under acute high intraocular pressure
2024-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.389363
PMID:38526288
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析急性高眼压下视网膜的细胞组成和分子特征 | 首次揭示高眼压下视网膜的分子变化和细胞间相互作用 | NA | 阐明高眼压下视网膜细胞的分子特征和损伤机制 | 大鼠急性高眼压模型的视网膜细胞 | 机器学习 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 548 | 2026-06-19 |
Putting proteins in context
2024-10-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009
PMID:39418999
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研究论文 | Li 等人提出了一种几何深度学习方法 PINNACLE，通过综合分析蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组学，生成具有生物或环境上下文的蛋白质表示 | 通过结合蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组学数据，生成了具有上下文信息的蛋白质表示，填补了传统蛋白质表示方法缺乏生物或环境背景的空白 | NA | 解决蛋白质表示缺乏生物或环境背景的问题，生成具有上下文信息的蛋白质表示 | 蛋白质及其在不同细胞类型中的功能和相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、几何深度学习 | 几何深度学习 | 蛋白质相互作用数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 549 | 2026-06-19 |
Skin in the game: a review of single-cell and spatial transcriptomics in dermatological research
2024-09-25, Clinical chemistry and laboratory medicine
IF:3.8Q1
DOI:10.1515/cclm-2023-1245
PMID:38656304
|
综述 | 综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在皮肤病学研究中的应用 | 系统总结了单细胞和空间转录组学技术在皮肤病研究中的最新进展，为理解皮肤病发病机制提供了新视角 | 未具体说明，但综述类文章可能缺乏原始数据验证 | 回顾单细胞RNA测序和空间转录组学在皮肤病学中的应用现状及未来前景 | 健康皮肤及特应性皮炎、银屑病、皮肤恶性肿瘤等皮肤病 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 550 | 2026-06-19 |
Imputing abundance of over 2,500 surface proteins from single-cell transcriptomes with context-agnostic zero-shot deep ensembles
2024-09-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.08.006
PMID:39243755
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研究论文 | 提出了基于单细胞转录组的上下文无关零样本深度集成模型SPIDER，可预测超过2500种表面蛋白的丰度 | 首次实现零样本预测超过2500种表面蛋白丰度，并具有良好的跨上下文泛化能力 | 未提及模型预测在真实实验验证中的具体准确率限制 | 开发能够从单细胞转录组数据大规模预测表面蛋白丰度的计算方法 | 单细胞转录组数据与表面蛋白丰度预测 | 机器学习 | 肝细胞癌，结直肠癌 | 单细胞RNA测序，CITE-seq | 深度集成模型（零样本学习） | 转录组数据（单细胞水平） | 涉及肝细胞癌和结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | NA |
| 551 | 2026-06-19 |
Increased autoreactivity and maturity of EBI2+ antibody-secreting cells from nasal polyps
2024-09-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177729
PMID:39253973
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研究论文 | 该研究探究了鼻息肉组织中表达EBI2的抗体分泌细胞的自身反应性和成熟度增加的特征 | 首次揭示了鼻息肉中EBI2+抗体分泌细胞具有更高的自身抗体产生倾向及其分子特征，包括抗dsDNA IgG的增加和成熟浆细胞分化标志 | 未具体说明研究局限性 | 研究鼻息肉中表达EBI2的B细胞对自身抗体产生的倾向性，并评估鼻息肉抗体分泌细胞的分子特征 | 鼻息肉和扁桃体组织中的B细胞及抗体分泌细胞 | 自然语言处理 | 鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 基因表达数据 | 包括鼻息肉和扁桃体样本，具体数量未提及 | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 552 | 2026-06-19 |
Transcriptomic dysregulation and autistic-like behaviors in Kmt2c haploinsufficient mice rescued by an LSD1 inhibitor
2024-09, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02479-8
PMID:38528071
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研究论文 | 本研究通过Kmt2c单倍性不足小鼠模型，发现转录组失调与自闭症样行为，并证明LSD1抑制剂可缓解社交缺陷 | 首次整合单细胞RNA测序与ChIP-seq分析，揭示Kmt2c单倍性不足导致径向胶质细胞和未成熟神经元中ASD相关转录组改变，并发现LSD1抑制剂可逆转大部分差异表达基因 | 未详细说明样本量及行为测试的性别差异；仅关注成年小鼠和新生小鼠的大脑，缺乏发育全过程的纵向分析 | 探究KMT2C单倍性不足导致神经发育缺陷的分子机制及潜在治疗方法 | Kmt2c杂合移码突变小鼠（Kmt2c+/-） | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序，ChIP-seq，批量RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据（基因表达） | 未明确说明，涉及成年小鼠和新生小鼠的大脑样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，ChIP-seq | NA | NA |
| 553 | 2026-06-19 |
PanIN and CAF transitions in pancreatic carcinogenesis revealed with spatial data integration
2024-08-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.001
PMID:39116880
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研究论文 | 该研究引入一种新的成像、空间转录组学和单细胞RNA测序整合流程，以表征胰腺癌发生过程中肿瘤细胞状态转变 | 开发了一种半监督分析流程，整合了全转录组FFPE空间转录组学与单细胞RNA测序数据，首次在低级别和高级别PanIN病变中追踪癌变进程并映射细胞表型，揭示了CAF相关炎症信号向细胞增殖的转变 | 无法在FFPE样本中对人类PanIN进行严格诊断，限制了其微环境中单细胞水平的表征 | 利用空间多组学整合解析胰腺癌发生过程中的时空动态 | 低级别和高级别胰腺上皮内瘤变样本及其微环境中的肿瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、高维成像蛋白质组学 | 半监督学习框架 | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 罕见队列的低级别和高级别PanIN病变样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 554 | 2026-06-19 |
Global transcription regulation revealed from dynamical correlations in time-resolved single-cell RNA sequencing
2024-08-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.002
PMID:39121860
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研究论文 | 通过时间分辨单细胞RNA测序中的动态相关性揭示全局转录调控机制 | 提出结合细胞大小和细胞周期依赖率的随机基因表达模型，利用代谢标记和细胞周期报告基因捕获时间维度，并开发并行可扩展的近似贝叶斯计算方法校正技术变异，准确量化全转录组的爆发频率、爆发大小和降解率 | 未在摘要中明确提及局限性 | 利用时间分辨单细胞RNA测序中的动态相关性识别全局转录调控机制 | 单细胞中的基因表达动态，包括转录爆发和降解过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，代谢标记 | 随机模型，近似贝叶斯计算 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2026-06-19 |
Imputing abundance of over 2500 surface proteins from single-cell transcriptomes with context-agnostic zero-shot deep ensembles
2024-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.31.605432
PMID:39131290
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研究论文 | 提出SPIDER模型，利用单细胞转录组数据预测超过2500种表面蛋白丰度，并展示其在细胞类型注释、生物标志物/靶点识别和细胞间相互作用分析中的广泛应用 | 首次实现上下文无关的零样本深度集成模型，能够大规模预测细胞表面蛋白丰度并泛化至不同组织或疾病状态 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够从单细胞转录组数据大规模预测细胞表面蛋白丰度的计算方法，并验证其泛化性能和应用价值 | 利用CITE-seq技术同时测量的表面蛋白丰度和转录表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌、结直肠癌 | 单细胞RNA-seq、CITE-seq | 深度集成模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质丰度数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 与CITE-seq结合 |
| 556 | 2026-06-19 |
Immunological landscape of human lymphoid explants during measles virus infection
2024-07-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172261
PMID:39253971
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，研究了人类淋巴组织外植体中麻疹病毒感染的免疫学景观 | 首次在人类淋巴组织外植体模型中系统描绘了麻疹病毒对不同免疫细胞亚群的感染偏好性，并揭示了感染B细胞中干扰素刺激基因转录和蛋白水平的关联 | 未提及，原文未明确说明 | 阐明麻疹病毒感染人类淋巴组织过程中的免疫学事件 | 人类淋巴组织外植体及Raji细胞 | 机器学习 | 麻疹病毒感染 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 质谱分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质组数据 | 多例供体，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 557 | 2026-06-19 |
Targeting CEBPA to restore cellular identity and tissue homeostasis in pulmonary fibrosis
2024-07-16, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175290
PMID:39012710
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研究论文 | 通过公开RNA-Seq数据集挖掘，发现CEBPA缺失与特发性肺纤维化有关，利用条件性敲除小鼠、单细胞RNA测序、肺类器官等方法探究其在肺纤维化和修复中的作用 | 首次建立CEBPA抑制、AT2细胞身份受损、组织稳态破坏与肺纤维化之间的直接机制联系，并发现S100A8/A9抑制剂可缓解实验性肺纤维化 | 未明确提及局限性，可能包括小鼠模型与人类疾病的差异，以及临床转化需进一步验证 | 探究CEBPA在肺纤维化中调节细胞身份和组织稳态的分子机制 | CEBPA基因及其在肺泡2型上皮细胞中的作用 | 机器学习 | 肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除, 肺类器官, 小分子抑制 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 条件性敲除小鼠，长期观察6个月以上，博来霉素诱导纤维化模型 | Illumina | RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公开RNA-Seq数据集分析 |
| 558 | 2026-06-19 |
Spatial transcriptomics implicates impaired BMP signaling in NF1 fracture pseudarthrosis in murine and patient tissues
2024-07-11, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176802
PMID:38990653
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研究论文 | 通过空间转录组学技术揭示了NF1骨折假关节中BMP信号受损的分子机制，并在小鼠模型和患者组织中验证了这一发现 | 首次利用空间转录组学在完整组织背景下解析NF1骨折不愈合的分子异质性，并证实了BMP信号缺陷是NF1假关节形成的关键机制 | 研究中空间转录组学的分辨率可能限制了对区域内单个细胞类型的精细解析 | 阐明NF1骨折假关节形成的分子机制，为临床使用BMP2治疗提供分子证据 | 小鼠骨折愈合组织及NF1患者假关节组织 | 空间转录组学 | 神经纤维瘤病1型（NF1）相关骨折假关节 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包含正常小鼠、Nf1Postn小鼠及一名NF1患者的假关节组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 559 | 2026-06-19 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2024-07-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175047
PMID:38954467
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研究论文 | 本文研究了肥胖背景下血小板反应蛋白-1（THBS1）如何促进膈肌纤维脂肪基质扩张和收缩功能障碍 | 首次揭示了THBS1在肥胖相关膈肌功能障碍中的关键作用，并通过基因敲除小鼠模型证明了THBS1缺失对膈肌的保护效应 | 未明确提及，但基于摘要可推断可能涉及动物模型向人类转化的局限性 | 阐明THBS1在肥胖诱导的膈肌纤维脂肪基质重塑和收缩功能障碍中的机制作用 | 野生型和Thbs1基因敲除小鼠的膈肌组织及纤维脂肪祖细胞 | 机器学习 | 肥胖相关呼吸功能障碍 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 野生型和Thbs1基因敲除小鼠各一组，具体样本量未明确 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 560 | 2026-06-19 |
Single-cell RNA-Seq analysis reveals cell subsets and gene signatures associated with rheumatoid arthritis disease activity
2024-07-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178499
PMID:38954480
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研究论文 | 通过对36名个体的外周血单核细胞进行单细胞RNA测序，揭示与类风湿关节炎疾病活动相关的细胞亚群和基因特征 | 首次在单细胞水平上识别出与类风湿关节炎疾病活动度相关的IFN激活单核细胞亚群、CD4+ T效应记忆细胞和非经典单核细胞的变化，以及中度-高度疾病活动度的基因特征 | 样本量相对有限（18例患者和18例对照），未提及功能验证或外部队列验证 | 研究类风湿关节炎疾病活动相关的细胞亚群和细胞类型特异性基因特征 | 类风湿关节炎患者和匹配对照的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 36名个体（18例RA患者和18例匹配对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |