单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5561 - 5580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5561 | 2025-10-06 |
Insights into Keratinocyte and Immunologic Landscape in Cutaneous Graft-Versus-Host Disease through Single-Cell Transcriptomics
2025-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2025.100373
PMID:40492027
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析皮肤慢性移植物抗宿主病中角质形成细胞和免疫细胞的分子特征 | 首次在单细胞水平揭示慢性GVHD皮肤中角质形成细胞的非免疫学变化和免疫细胞的组成改变 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究皮肤慢性移植物抗宿主病的发病机制 | 慢性GVHD患者和健康对照的皮肤样本 | 单细胞组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性GVHD和健康对照皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5562 | 2025-10-06 |
SOAR elucidates biological insights and empowers drug discovery through spatial transcriptomics
2025-Jun-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt7450
PMID:40498826
|
研究论文 | 介绍空间转录组学分析资源SOAR平台及其在生物学发现和药物研发中的应用 | 开发了包含3461个样本的综合性空间转录组学平台，整合了多种物种、组织类型和技术平台的数据 | 未提及具体的技术限制或数据质量限制 | 通过空间转录组学数据挖掘生物学见解并推动药物发现 | 13个物种、42种组织类型的3461个空间转录组学样本 | 空间转录组学 | 癌症、溃疡性结肠炎 | 空间转录组学技术 | NA | 空间转录组数据 | 3461个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 涵盖19种不同的空间转录组学技术 |
| 5563 | 2025-10-06 |
NOTCH1 dimeric signaling is essential for T-cell leukemogenesis and leukemia maintenance
2025-Jun-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027020
PMID:40009499
|
研究论文 | 本研究揭示了NOTCH1二聚体信号在T细胞急性淋巴细胞白血病发生和维持中的关键作用 | 首次证明NOTCH1二聚体信号对T-ALL发生至关重要，并发现HES4通过调控Δ133p53亚型和BCL2L1表达促进白血病细胞存活 | 研究主要基于合成模型和患者来源的异种移植模型，在原发性人类T-ALL样本中的验证仍需进一步深入 | 探究NOTCH1二聚体信号在T细胞白血病发生和维持中的分子机制 | 人类造血干细胞/祖细胞、T-ALL细胞系、患者来源的异种移植模型和原发性T-ALL样本 | 癌症生物学 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序,染色质免疫沉淀测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,单细胞转录组数据 | 脐带血来源的造血干细胞/祖细胞、T-ALL细胞系和原发性T-ALL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5564 | 2025-10-06 |
Machine learning-driven construction and validation of an intra-tumoral heterogeneity-associated prognostic model for bladder urothelial carcinoma
2025-Jun-11, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2516767
PMID:40500142
|
研究论文 | 本研究构建并验证了一个基于肿瘤内异质性相关基因的膀胱尿路上皮癌预后模型 | 首次结合LASSO和随机生存森林算法开发14基因预后特征，并通过单细胞RNA测序分析验证模型基因的表达模式 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏前瞻性验证 | 构建膀胱尿路上皮癌的预后预测模型 | 膀胱尿路上皮癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | LASSO,随机生存森林 | 转录组数据,临床数据 | 多个公共队列数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 5565 | 2025-10-06 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Jun-11, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
|
研究论文 | 本研究探讨CD73抑制剂AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制小鼠胶质母细胞瘤的机制 | 首次揭示AB680通过改变GBM微环境中嘌呤代谢促进P2RY12+小胶质细胞向M1样抗肿瘤表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床效果仍需进一步验证 | 研究AB680在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤效果和作用机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析，单细胞RNA测序，核RNA测序 | NA | 代谢组数据，单细胞RNA测序数据，核RNA测序数据 | G422-GBM荷瘤小鼠模型和人类GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序，核RNA测序，代谢组学 | NA | NA |
| 5566 | 2025-10-06 |
Differentiation of lung tissue-resident c-Kit+ cells into microvascular endothelial cells alleviates pulmonary vascular remodeling
2025-Jun-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.01.010
PMID:39909047
|
研究论文 | 本研究揭示了肺组织驻留c-Kit+细胞通过分化为微血管内皮细胞缓解肺血管重构的机制 | 首次阐明肺组织驻留c-Kit+细胞在肺血管重构中的保护作用及其通过NR2F2调控的分化机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究肺c-Kit细胞分化在肺血管重构中的作用机制 | 肺组织驻留c-Kit+细胞及其分化的内皮细胞 | 病理生理学 | 肺动脉高压 | 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | SU5416/低氧诱导的肺血管重构小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5567 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals tryptophan metabolism restricting maturation of intratumoral tertiary lymphoid structures
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.011
PMID:40185093
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示色氨酸代谢抑制肝细胞癌内三级淋巴结构成熟的机制 | 首次发现恶性细胞塑造的色氨酸富集代谢微环境导致三级淋巴结构成熟偏离，并证明抑制色氨酸代谢可促进三级淋巴结构成熟并增强免疫治疗效果 | 研究主要聚焦于肝细胞癌，在其他癌种中的普适性需要进一步验证 | 探究三级淋巴结构成熟机制及其对免疫治疗的影响 | 肝细胞癌中的三级淋巴结构及其微环境 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 近单细胞空间转录组图谱 |
| 5568 | 2025-10-06 |
eIF5A maintains intestinal epithelial homeostasis by sustaining intestinal stem cells
2025-Jun-09, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00243-z
PMID:40488929
|
研究论文 | 本研究揭示了eIF5A通过调控线粒体翻译维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的关键作用 | 首次发现eIF5A通过调控线粒体翻译来维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官，尚未在人类样本中验证 | 探究eIF5A在肠道上皮稳态维持中的功能及其分子机制 | 小鼠肠道上皮细胞、肠道干细胞、肠道类器官 | 细胞生物学 | 肠道疾病 | 条件性基因敲除、质谱分析、单细胞RNA测序、线粒体功能检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、功能实验数据 | 成年小鼠肠道上皮细胞和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5569 | 2025-10-06 |
Prognostic and immune modulatory effects of ammonia-induced cell death in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02508-0
PMID:40490575
|
研究论文 | 本研究探讨了氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次建立氨死亡特征作为HNSC的新型预后生物标志物，揭示了氨代谢与肿瘤进展和免疫抑制的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 评估氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后意义和免疫调节机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者和单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 随机生存森林，单细胞RNA测序，ssGSEA，TIP分析 | RSF，Cox回归 | 转录组数据，单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5570 | 2025-10-06 |
Single-cell chromatin accessibility profiling reveals regulatory mechanisms and evolution in pig brains
2025-Jun-09, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02263-2
PMID:40490756
|
研究论文 | 通过单细胞染色质可及性测序揭示猪大脑的调控机制和进化特征 | 首次在家猪和野猪大脑中进行大规模单细胞染色质可及性分析，揭示了少突胶质细胞祖细胞可能具有更快的进化速率，并发现猪在阿尔茨海默病研究中的模型优势 | 研究仅聚焦于大脑皮层和小脑区域，未涵盖全脑所有区域；样本数量相对有限 | 探究猪大脑的调控机制及其在进化过程中的变化 | 家猪和野猪的大脑皮层和小脑细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞染色质可及性测序，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 71,798个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5571 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of immunoglobulin expression in the mouse brain from embryonic to adult stages
2025-Jun-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03457-9
PMID:40490799
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白谱分析，系统揭示了小鼠大脑从胚胎到成年阶段免疫球蛋白的表达谱 | 首次全面阐明大脑中免疫球蛋白从胚胎到成年的表达动态，发现小胶质细胞和神经元表达特定Ig亚型，并揭示其与B细胞不同的表达调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类大脑中的表达情况尚不清楚；功能验证实验相对有限 | 探究免疫球蛋白在小鼠大脑发育过程中的表达特征和潜在功能 | 小鼠大脑组织（从胚胎到成年阶段） | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫球蛋白谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠大脑多个发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5572 | 2025-10-06 |
Exploring the causal links between inflammation-related genes and atherosclerosis through Mendelian randomization analysis
2025-Jun-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042584
PMID:40489880
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析探索炎症相关基因与动脉粥样硬化之间的因果关系 | 整合多组学数据和单细胞RNA测序技术，系统分析颈动脉粥样硬化中关键基因在不同细胞类型中的表达特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 阐明动脉粥样硬化的分子机制和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的基因表达谱和细胞类型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | DESeq2, clusterProfiler, Cytoscape, TwoSampleMR | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE198600, GSE120521, GSE253903, GSE224273) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5573 | 2025-10-06 |
Spatial Heterogeneity of Macrophages in the Human Lung
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657106
PMID:40501812
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究人肺不同解剖结构中巨噬细胞亚群的空间分布特征 | 首次报告人肺巨噬细胞亚群按肺解剖结构的分数积累，并引入新的三级层次命名法 | 样本量较小（仅8名供体），仅关注吸烟因素而未涉及其他肺部疾病 | 确定转录定义的人巨噬细胞在主要肺解剖结构中的分布，以及吸烟引起的分布和编程变化 | 人肺组织中的间质巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序，显微解剖，免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 8名无肺部疾病的人类供体（4名吸烟者和4名非吸烟者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5574 | 2025-10-06 |
Microglia activation orchestrates CXCL10-mediated CD8+ T cell recruitment to promote aging-related white matter degeneration
2025-Jun, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01955-w
PMID:40404995
|
研究论文 | 本研究揭示小胶质细胞激活通过CXCL10介导的CD8+ T细胞招募促进衰老相关白质退化的机制 | 首次阐明小胶质细胞功能障碍通过CXCL10-CXCR3轴招募CD8+ T细胞导致衰老白质退化的完整机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究衰老过程中小胶质细胞功能与白质退化的关系 | 小鼠白质组织中的小胶质细胞和CD8+ T细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,药理学方法,遗传学方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 5575 | 2025-10-06 |
Intrathecal nivolumab and IL-2 for treatment of leptomeningeal metastases in EGFR-mutated lung adenocarcinoma
2025-Jun, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108586
PMID:40412102
|
病例报告 | 本研究报道了首例使用鞘内注射纳武利尤单抗联合IL-2治疗EGFR突变肺腺癌软脑膜转移的病例 | 首次报道鞘内联合免疫疗法在标准治疗失败的NSCLC软脑膜转移患者中的临床应用，并通过单细胞测序揭示免疫机制 | 单病例报告，样本量有限，需要前瞻性研究进一步验证 | 评估鞘内注射纳武利尤单抗联合IL-2治疗EGFR突变肺腺癌软脑膜转移的疗效和安全性 | 一例对多种EGFR酪氨酸激酶抑制剂和既往鞘内治疗耐药的NSCLC软脑膜转移患者 | 临床医学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者，治疗前后脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5576 | 2025-10-06 |
Proliferation of Early and Mature Osteoblasts Is Required for Bone Fracture Healing in Mice
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656371
PMID:40501538
|
研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探索成骨细胞增殖在小鼠骨折愈合过程中的作用机制 | 首次证实成熟成骨细胞在骨折后仍具有增殖能力，并系统阐明了不同分化阶段成骨细胞增殖对骨痂形成的贡献 | 研究仅限于小鼠模型，人类骨折愈合机制可能存在差异 | 探究成骨细胞增殖在骨折愈合过程中的具体作用机制 | 基因工程小鼠模型（Col1-TK、Osx-CreERT2、Ocn-Cre、Dmp1-CreERT2与ROSA-TK杂交品系） | 骨生物学 | 骨折 | 单细胞RNA测序，基因工程小鼠模型，放射学评估 | NA | 基因表达数据，影像学数据 | 多个基因工程小鼠品系，具体数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5577 | 2025-10-06 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656712
PMID:40501607
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序开发了造血细胞注释方法和分化模型，揭示了应急髓系生成的多层次调控机制 | 开发了通用的细胞注释方法HemaScribe和造血分化定量模型HemaScape，发现了跨不同炎症挑战的髓系祖细胞应急响应模块 | NA | 阐明不同应急髓系生成诱导剂调控造血干细胞和祖细胞的分子机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPC) | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 定量分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5578 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing + TCR Sequencing Reveal the Proportion and Characteristics of Dual TCR T Cells in Tertiary Lymphoid Structures in Pemphigus
2025-May-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.05.008
PMID:40419016
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和TCR测序分析，揭示天疱疮三级淋巴结构中双TCR T细胞的比例和特征 | 首次发现天疱疮三级淋巴结构中含有更高比例的双TCR T细胞，并鉴定出独特的克隆扩增双TCR CXCL13+CD4+ T细胞亚群 | 样本量有限，仅比较了天疱疮、慢性特发性红皮病和健康对照皮肤组织 | 探索天疱疮病理皮肤组织中三级淋巴结构内淋巴细胞的起源、特征及其在发病机制中的作用 | 天疱疮患者、慢性特发性红皮病患者和健康对照者的皮肤组织 | 单细胞组学 | 天疱疮 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 天疱疮、慢性特发性红皮病和健康对照皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 5579 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling demonstrates the combined effect of wheeze phenotype and infant viral infection on airway epithelial development
2025-May-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr9995
PMID:40408478
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了喘息表型和婴儿期病毒感染对2-3岁儿童鼻气道上皮细胞发育的联合影响 | 首次在预先设计的嵌套出生队列中，通过单细胞RNA测序系统比较了四种不同临床表型儿童的气道上皮发育特征 | 样本量相对有限，仅针对2-3岁儿童，且为观察性研究 | 探究喘息表型和呼吸道合胞病毒感染对气道上皮发育的影响机制 | 2-3岁儿童的鼻气道上皮细胞 | 单细胞组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序，体外病毒感染实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自四种临床表型儿童的鼻气道上皮细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5580 | 2025-10-06 |
SCIG: Machine learning uncovers cell identity genes in single cells by genetic sequence codes
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf431
PMID:40433981
|
研究论文 | 开发了一种名为SCIG的机器学习方法，通过遗传序列特征识别单细胞中的细胞身份基因 | 首次发现细胞身份基因具有独特的遗传序列特征，并开发了不依赖细胞间比较的识别方法 | NA | 识别单细胞中的细胞身份基因，以理解细胞分化、发育和疾病相关的细胞身份失调 | 人类内皮细胞图谱中的单细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据、遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |