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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5561 | 2025-10-06 |
Single-cell chromatin accessibility profiling reveals regulatory mechanisms and evolution in pig brains
2025-Jun-09, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02263-2
PMID:40490756
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研究论文 | 通过单细胞染色质可及性测序揭示猪大脑的调控机制和进化特征 | 首次在家猪和野猪大脑中进行大规模单细胞染色质可及性分析,揭示了少突胶质细胞祖细胞可能具有更快的进化速率,并发现猪在阿尔茨海默病研究中的模型优势 | 研究仅聚焦于大脑皮层和小脑区域,未涵盖全脑所有区域;样本数量相对有限 | 探究猪大脑的调控机制及其在进化过程中的变化 | 家猪和野猪的大脑皮层和小脑细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞染色质可及性测序,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 71,798个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5562 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of immunoglobulin expression in the mouse brain from embryonic to adult stages
2025-Jun-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03457-9
PMID:40490799
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白谱分析,系统揭示了小鼠大脑从胚胎到成年阶段免疫球蛋白的表达谱 | 首次全面阐明大脑中免疫球蛋白从胚胎到成年的表达动态,发现小胶质细胞和神经元表达特定Ig亚型,并揭示其与B细胞不同的表达调控机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类大脑中的表达情况尚不清楚;功能验证实验相对有限 | 探究免疫球蛋白在小鼠大脑发育过程中的表达特征和潜在功能 | 小鼠大脑组织(从胚胎到成年阶段) | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫球蛋白谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠大脑多个发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5563 | 2025-10-06 |
Exploring the causal links between inflammation-related genes and atherosclerosis through Mendelian randomization analysis
2025-Jun-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042584
PMID:40489880
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研究论文 | 通过孟德尔随机化分析探索炎症相关基因与动脉粥样硬化之间的因果关系 | 整合多组学数据和单细胞RNA测序技术,系统分析颈动脉粥样硬化中关键基因在不同细胞类型中的表达特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 阐明动脉粥样硬化的分子机制和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的基因表达谱和细胞类型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | DESeq2, clusterProfiler, Cytoscape, TwoSampleMR | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE198600, GSE120521, GSE253903, GSE224273) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
5564 | 2025-10-06 |
Spatial Heterogeneity of Macrophages in the Human Lung
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657106
PMID:40501812
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究人肺不同解剖结构中巨噬细胞亚群的空间分布特征 | 首次报告人肺巨噬细胞亚群按肺解剖结构的分数积累,并引入新的三级层次命名法 | 样本量较小(仅8名供体),仅关注吸烟因素而未涉及其他肺部疾病 | 确定转录定义的人巨噬细胞在主要肺解剖结构中的分布,以及吸烟引起的分布和编程变化 | 人肺组织中的间质巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序,显微解剖,免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 8名无肺部疾病的人类供体(4名吸烟者和4名非吸烟者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5565 | 2025-10-06 |
Microglia activation orchestrates CXCL10-mediated CD8+ T cell recruitment to promote aging-related white matter degeneration
2025-Jun, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01955-w
PMID:40404995
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研究论文 | 本研究揭示小胶质细胞激活通过CXCL10介导的CD8+ T细胞招募促进衰老相关白质退化的机制 | 首次阐明小胶质细胞功能障碍通过CXCL10-CXCR3轴招募CD8+ T细胞导致衰老白质退化的完整机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 探究衰老过程中小胶质细胞功能与白质退化的关系 | 小鼠白质组织中的小胶质细胞和CD8+ T细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,药理学方法,遗传学方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
5566 | 2025-10-06 |
Intrathecal nivolumab and IL-2 for treatment of leptomeningeal metastases in EGFR-mutated lung adenocarcinoma
2025-Jun, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108586
PMID:40412102
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病例报告 | 本研究报道了首例使用鞘内注射纳武利尤单抗联合IL-2治疗EGFR突变肺腺癌软脑膜转移的病例 | 首次报道鞘内联合免疫疗法在标准治疗失败的NSCLC软脑膜转移患者中的临床应用,并通过单细胞测序揭示免疫机制 | 单病例报告,样本量有限,需要前瞻性研究进一步验证 | 评估鞘内注射纳武利尤单抗联合IL-2治疗EGFR突变肺腺癌软脑膜转移的疗效和安全性 | 一例对多种EGFR酪氨酸激酶抑制剂和既往鞘内治疗耐药的NSCLC软脑膜转移患者 | 临床医学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者,治疗前后脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5567 | 2025-10-06 |
Proliferation of Early and Mature Osteoblasts Is Required for Bone Fracture Healing in Mice
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656371
PMID:40501538
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探索成骨细胞增殖在小鼠骨折愈合过程中的作用机制 | 首次证实成熟成骨细胞在骨折后仍具有增殖能力,并系统阐明了不同分化阶段成骨细胞增殖对骨痂形成的贡献 | 研究仅限于小鼠模型,人类骨折愈合机制可能存在差异 | 探究成骨细胞增殖在骨折愈合过程中的具体作用机制 | 基因工程小鼠模型(Col1-TK、Osx-CreERT2、Ocn-Cre、Dmp1-CreERT2与ROSA-TK杂交品系) | 骨生物学 | 骨折 | 单细胞RNA测序,基因工程小鼠模型,放射学评估 | NA | 基因表达数据,影像学数据 | 多个基因工程小鼠品系,具体数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
5568 | 2025-10-06 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656712
PMID:40501607
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序开发了造血细胞注释方法和分化模型,揭示了应急髓系生成的多层次调控机制 | 开发了通用的细胞注释方法HemaScribe和造血分化定量模型HemaScape,发现了跨不同炎症挑战的髓系祖细胞应急响应模块 | NA | 阐明不同应急髓系生成诱导剂调控造血干细胞和祖细胞的分子机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPC) | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 定量分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5569 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing + TCR Sequencing Reveal the Proportion and Characteristics of Dual TCR T Cells in Tertiary Lymphoid Structures in Pemphigus
2025-May-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.05.008
PMID:40419016
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和TCR测序分析,揭示天疱疮三级淋巴结构中双TCR T细胞的比例和特征 | 首次发现天疱疮三级淋巴结构中含有更高比例的双TCR T细胞,并鉴定出独特的克隆扩增双TCR CXCL13+CD4+ T细胞亚群 | 样本量有限,仅比较了天疱疮、慢性特发性红皮病和健康对照皮肤组织 | 探索天疱疮病理皮肤组织中三级淋巴结构内淋巴细胞的起源、特征及其在发病机制中的作用 | 天疱疮患者、慢性特发性红皮病患者和健康对照者的皮肤组织 | 单细胞组学 | 天疱疮 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 天疱疮、慢性特发性红皮病和健康对照皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
5570 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling demonstrates the combined effect of wheeze phenotype and infant viral infection on airway epithelial development
2025-May-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr9995
PMID:40408478
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了喘息表型和婴儿期病毒感染对2-3岁儿童鼻气道上皮细胞发育的联合影响 | 首次在预先设计的嵌套出生队列中,通过单细胞RNA测序系统比较了四种不同临床表型儿童的气道上皮发育特征 | 样本量相对有限,仅针对2-3岁儿童,且为观察性研究 | 探究喘息表型和呼吸道合胞病毒感染对气道上皮发育的影响机制 | 2-3岁儿童的鼻气道上皮细胞 | 单细胞组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,体外病毒感染实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自四种临床表型儿童的鼻气道上皮细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5571 | 2025-10-06 |
SCIG: Machine learning uncovers cell identity genes in single cells by genetic sequence codes
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf431
PMID:40433981
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研究论文 | 开发了一种名为SCIG的机器学习方法,通过遗传序列特征识别单细胞中的细胞身份基因 | 首次发现细胞身份基因具有独特的遗传序列特征,并开发了不依赖细胞间比较的识别方法 | NA | 识别单细胞中的细胞身份基因,以理解细胞分化、发育和疾病相关的细胞身份失调 | 人类内皮细胞图谱中的单细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据、遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5572 | 2025-10-06 |
CellTypeAgent: Trustworthy cell type annotation with Large Language Models
2025-May-13, ArXiv
PMID:40463689
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研究论文 | 开发了一种结合大语言模型与数据库验证的可信细胞类型注释工具CellTypeAgent | 首次将大语言模型与数据库验证相结合用于细胞类型注释,有效减轻幻觉问题 | NA | 提高单细胞RNA测序分析中细胞类型注释的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本 | 9个真实数据集,包含36个组织的303种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5573 | 2025-10-06 |
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513
PMID:40203764
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研究论文 | 比较帕博利珠单抗单药或联合低剂量化疗治疗体能状态差的非小细胞肺癌患者的随机二期临床试验 | 首次在PS2患者群体中直接比较免疫单药与免疫联合低剂量化疗的疗效 | 样本量较小(43例患者),为二期临床试验需要更大规模验证 | 探索体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者的最佳免疫治疗方案 | 东部肿瘤协作组体能状态评分为2的晚期非小细胞肺癌患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 流式细胞术,单细胞测序 | NA | 临床数据,血液样本分析数据 | 43例患者入组,40例可评估疗效 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
5574 | 2025-10-06 |
Single‑cell transcriptomic analysis revealed the tumor‑associated microenvironment of papillary thyroid carcinoma with metastasis
2025-Mar, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2025.14876
PMID:40496475
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了转移性甲状腺乳头状癌的肿瘤相关微环境特征 | 首次在单细胞水平上系统比较了转移性PTC、非转移性PTC和正常组织中免疫细胞的异质性,发现M2巨噬细胞、DC2s和Tregs与淋巴结转移相关 | 样本数量有限,仅分析了单个转移性PTC病例 | 探究甲状腺乳头状癌转移的免疫微环境机制 | 转移性甲状腺乳头状癌患者组织、非转移性PTC组织和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例转移性PTC患者的多组组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5575 | 2025-10-06 |
Pharmacological insights into targeting PI3K/Akt and NF-κB pathways for treating endometriosis-associated infertility
2025 Mar-Apr, Pakistan journal of pharmaceutical sciences
IF:0.7Q4
PMID:40501243
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研究论文 | 本研究通过靶向PI3K/Akt和NF-κB信号通路探讨子宫内膜异位症相关不孕的机制及潜在药物治疗靶点 | 首次在子宫内膜异位症不孕研究中系统整合单细胞RNA测序、细胞培养和动物模型验证PI3K/Akt和NF-κB通路的治疗潜力 | 样本量有限(300例),缺乏多中心验证数据 | 阐明子宫内膜异位症相关不孕的分子机制并识别潜在药物靶点 | 300例子宫内膜异位症患者(轻度和重度)及对照组人群 | 生殖医学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,细胞培养,动物模型 | 动物模型 | 临床数据,分子表达数据,单细胞测序数据 | 300例患者(分轻度、重度和对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5576 | 2025-10-06 |
Unraveling the tumor microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma through single-cell sequencing: A comprehensive review
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189264
PMID:39805342
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综述 | 通过单细胞测序技术系统综述食管鳞癌肿瘤微环境的研究进展 | 首次在单细胞水平系统整合食管鳞癌肿瘤微环境中各类细胞的异质性特征及相互作用网络 | NA | 阐明食管鳞癌肿瘤微环境的细胞组成与分子特征 | 食管鳞癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞、内皮细胞及成纤维细胞等 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞多组学技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
5577 | 2025-10-06 |
A Risk Model Based on Ferroptosis-Related Genes OSMR, G0S2, IGFBP6, IGHG2, and FMOD Predicts Prognosis in Glioblastoma Multiforme
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70161
PMID:39815665
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研究论文 | 本研究基于铁死亡相关基因构建了一个风险模型,用于预测多形性胶质母细胞瘤的预后 | 首次基于铁死亡相关基因构建了包含OSMR、G0S2、IGFBP6、IGHG2和FMOD五个基因的风险预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索铁死亡分类及其风险模型在GBM中的意义,评估其在预后评估中的潜力 | 多形性胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 单变量Cox回归, LASSO回归 | 风险预测模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | TCGA-GBM和CGGA-GBM数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
5578 | 2025-10-06 |
Exploring the mechanism of action of succinic acid in ovarian cancer via single-cell sequencing of the tumor immune microenvironment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1535504
PMID:40196737
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索琥珀酸在卵巢癌肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 首次结合生物信息学和单细胞测序技术系统分析琥珀酸在卵巢癌治疗中的潜在靶点和作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索琥珀酸在卵巢癌治疗中的潜在靶点和治疗机制 | 卵巢癌患者和正常个体的肿瘤免疫微环境细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5579 | 2025-10-06 |
Gene set optimization for single cell transcriptomics
2025, Computational intelligence methods for bioinformatics and biostatistics : ... international meeting, CIBB ... : revised selected papers. CIBB (Meeting)
DOI:10.1007/978-3-031-89704-7_14
PMID:40487192
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研究论文 | 本文提出了一种针对单细胞转录组数据的基因集优化方法 | 利用人类蛋白质图谱单细胞类型图谱中的细胞类型特异性信息,为基因集计算权重,实现基因集测试的定制化 | 方法依赖于HPA数据库的81种人类细胞类型数据,可能不适用于其他物种或罕见细胞类型 | 提高单细胞RNA测序数据中基因集测试的统计功效和可解释性 | 单细胞转录组数据和基因集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于HPA单细胞类型图谱的81种人类细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5580 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis and single-cell sequencing revealed the lysosome associated molecular subtypes and prognostic model development of papillary thyroid carcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325486
PMID:40493560
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研究论文 | 通过多组学分析和单细胞测序揭示了甲状腺乳头状癌的溶酶体相关分子亚型并开发了预后模型 | 首次系统研究溶酶体在PTC中的作用,开发了基于五个预后相关LAGs的评分系统,并通过单细胞测序解析了这些基因在不同细胞类型中的表达 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;样本量可能有限 | 研究溶酶体在甲状腺乳头状癌中的作用机制并开发预后预测模型 | 甲状腺乳头状癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 多组学分析, 单细胞测序, western blot, qRT-PCR, 集落形成实验, Transwell实验 | 预后评分模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的PTC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |