本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
5541 | 2025-10-06 |
Exploring the role of neutrophils in inflammatory pain hypersensitivity via single-cell transcriptome profiling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1552993
PMID:40503232
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析探索中性粒细胞在炎症性疼痛超敏反应中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析术后和CFA诱导炎症中CD11b+细胞的组成,并发现CXCR2抑制剂NAMO通过抑制中性粒细胞分化成熟缓解疼痛 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探索中性粒细胞在炎症性疼痛中的作用机制 | 小鼠术后和CFA诱导炎症模型中的CD11b+细胞 | 单细胞转录组学 | 炎症性疼痛 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 小鼠炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5542 | 2025-10-06 |
Identification of mitophagy-related biomarkers in severe acute pancreatitis: integration of WGCNA, machine learning algorithms and scRNA-seq
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1594085
PMID:40503237
|
研究论文 | 本研究通过整合多种生物信息学方法和实验验证,识别出MAPK14作为重症急性胰腺炎中关键的线粒体自噬相关生物标志物 | 首次将WGCNA、机器学习算法和单细胞RNA测序技术相结合,系统性地识别重症急性胰腺炎中的线粒体自噬相关基因,并发现MAPK14在胰腺巨噬细胞中的重要作用 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别重症急性胰腺炎中关键的线粒体自噬相关基因,为深入研究其发病机制提供理论基础 | 重症急性胰腺炎患者基因表达数据、SAP小鼠模型 | 生物信息学 | 重症急性胰腺炎 | WGCNA, 机器学习算法, 单细胞RNA测序, ssGSEA | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GSE194331和GSE279876数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | NA |
5543 | 2025-10-06 |
A sexually dimorphic hepatic cycle of periportal VLDL generation and subsequent pericentral VLDLR-mediated re-uptake
2024-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52751-2
PMID:39341814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝脏功能在空间和时间上的性别二态性,特别是极低密度脂蛋白的生成与摄取循环 | 首次发现肝脏中存在性别二态性的门静脉周围VLDL生成和中央静脉周围VLDLR介导的再摄取循环 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 探究性别二态性如何影响肝脏功能的时空逻辑 | 小鼠肝脏和人类肝脏组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5544 | 2025-10-06 |
Hypoxia induces ROS-resistant memory upon reoxygenation in vivo promoting metastasis in part via MUC1-C
2024-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51995-2
PMID:39341835
|
研究论文 | 本研究揭示缺氧通过诱导MUC1-C上调形成ROS抵抗性记忆,促进乳腺癌转移的机制 | 首次发现缺氧细胞在复氧后仍保持缺氧诱导基因表达,并鉴定MUC1-C在介导ROS抵抗和转移中的关键作用 | 主要基于动物模型和体外实验,临床验证仍需进一步研究 | 探究缺氧诱导肿瘤转移的分子机制 | 乳腺癌细胞、循环肿瘤细胞(CTCs)、患者来源异种移植模型 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、基因敲除、药物抑制 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5545 | 2025-10-06 |
Introducing synthetic thermostable RNase inhibitors to single-cell RNA-seq
2024-09-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52717-4
PMID:39333520
|
研究论文 | 本研究在单细胞RNA测序中引入合成热稳定RNase抑制剂,证明其性能优于传统蛋白质类RNase抑制剂 | 首次将合成热稳定RNase抑制剂应用于单细胞RNA测序,可在热循环过程中保持RNase抑制活性 | 未明确说明样本规模和具体实验条件的局限性 | 改进单细胞RNA测序中的RNase抑制方法 | RNase抑制剂在单细胞RNA测序中的应用 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5546 | 2025-10-06 |
The chemokine receptor CXCR3 promotes CD8+ T cell-dependent lung pathology during influenza pathogenesis
2024-01-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1120
PMID:38170765
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了CXCR3在促进CD8+ T细胞依赖性流感肺部病理中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出调控CD8+ T细胞毒性反应的独特调控因子,并证明CXCR3阻断可减轻流感相关肺损伤而不影响病毒清除 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探索CD8+ T细胞在流感控制与肺部病理中的双重作用及其特定亚群功能 | 流感感染小鼠肺组织中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 流感感染小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5547 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell analysis demonstrates radiotherapy-induced infiltration of macrophages expressing immunosuppressive genes into tumor in esophageal squamous cell carcinoma
2023-12-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh9069
PMID:38091397
|
研究论文 | 通过综合空间和单细胞分析揭示放疗后食管鳞状细胞癌中表达免疫抑制基因的巨噬细胞浸润现象 | 首次采用CODEX多重免疫染色、VISIUM空间转录组和单细胞RNA测序的整合分析方法,系统揭示放疗后肿瘤微环境中免疫细胞的动态变化特征 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证发现 | 探索放疗后肿瘤免疫微环境的动态变化特征,为联合免疫治疗提供新靶点 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫染色图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | 10x Visium | VISIUM空间转录组技术 |
5548 | 2025-10-06 |
Opsonization-independent antigen-specific recognition by myeloid phagocytes expressing monoclonal antibodies
2023-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg1812
PMID:37656789
|
研究论文 | 本研究鉴定了一类新型先天免疫细胞VIREMs,证明其能表达单克隆抗体并执行抗原特异性识别功能 | 首次发现髓系细胞能通过基因重组表达抗体,打破了抗体产生仅限于淋巴细胞的传统认知 | 研究样本量有限,需要进一步验证VIREMs在不同疾病中的功能 | 探索先天免疫细胞中新型抗体表达细胞的功能特性 | 健康人血液中的B-VIREMs细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学, 全基因组表观遗传分析, 活细胞成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据, 影像数据 | 健康个体血液样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
5549 | 2025-10-06 |
Reprogramming Müller glia to regenerate ganglion-like cells in adult mouse retina with developmental transcription factors
2022-11-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq7219
PMID:36417510
|
研究论文 | 本研究通过过表达发育转录因子将成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞重编程为神经节样细胞 | 首次证明通过靶向过表达发育性视网膜神经节细胞转录因子可在成年哺乳动物视网膜中实现特定类型神经元再生 | 研究仅限于小鼠模型,再生细胞的长期功能和整合能力仍需进一步验证 | 探索特定转录因子组合引导Müller胶质细胞向特定视网膜神经元类型再生的能力 | 成年小鼠视网膜Müller胶质细胞 | 神经再生 | 青光眼 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,电生理学 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据,电生理数据 | 工程化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
5550 | 2025-10-06 |
Loss of Plxdc2 exacerbates microglia-mediated neuroinflammation and ischemic brain injury
2025-Sep, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115302
PMID:40345569
|
研究论文 | 本研究揭示了Plxdc2蛋白在调节小胶质细胞稳态和减轻缺血性脑损伤中的关键作用 | 首次发现Plxdc2在小胶质细胞中高表达并在脑卒中后显著下调,阐明了其通过PPARγ通路调控NF-κB信号和脂质代谢的新机制 | 研究主要聚焦于小胶质细胞,Plxdc2在其他神经细胞中的作用尚未完全阐明 | 探究Plxdc2在缺血性脑卒中中小胶质细胞功能调节中的作用机制 | 小胶质细胞和缺血性脑损伤模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | scRNA-seq, 转录组分析, 腺相关病毒(AAV)过表达, 慢病毒干扰 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5551 | 2025-10-06 |
Microglial colonization routes and their impacts on cellular diversity
2025-Jul, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2025.04.004
PMID:40288616
|
综述 | 探讨小胶质细胞通过不同定植路线进入大脑并影响其细胞多样性的机制 | 重点关注小胶质细胞通过多种定植路线形成细胞多样性的假说,整合单细胞转录组学最新发现 | 作为综述文章,未提供原始实验数据验证假说 | 阐明小胶质细胞多样性形成机制 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5552 | 2025-10-06 |
Insights into Keratinocyte and Immunologic Landscape in Cutaneous Graft-Versus-Host Disease through Single-Cell Transcriptomics
2025-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2025.100373
PMID:40492027
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析皮肤慢性移植物抗宿主病中角质形成细胞和免疫细胞的分子特征 | 首次在单细胞水平揭示慢性GVHD皮肤中角质形成细胞的非免疫学变化和免疫细胞的组成改变 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究皮肤慢性移植物抗宿主病的发病机制 | 慢性GVHD患者和健康对照的皮肤样本 | 单细胞组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性GVHD和健康对照皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5553 | 2025-10-06 |
SOAR elucidates biological insights and empowers drug discovery through spatial transcriptomics
2025-Jun-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt7450
PMID:40498826
|
研究论文 | 介绍空间转录组学分析资源SOAR平台及其在生物学发现和药物研发中的应用 | 开发了包含3461个样本的综合性空间转录组学平台,整合了多种物种、组织类型和技术平台的数据 | 未提及具体的技术限制或数据质量限制 | 通过空间转录组学数据挖掘生物学见解并推动药物发现 | 13个物种、42种组织类型的3461个空间转录组学样本 | 空间转录组学 | 癌症、溃疡性结肠炎 | 空间转录组学技术 | NA | 空间转录组数据 | 3461个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 涵盖19种不同的空间转录组学技术 |
5554 | 2025-10-06 |
NOTCH1 dimeric signaling is essential for T-cell leukemogenesis and leukemia maintenance
2025-Jun-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027020
PMID:40009499
|
研究论文 | 本研究揭示了NOTCH1二聚体信号在T细胞急性淋巴细胞白血病发生和维持中的关键作用 | 首次证明NOTCH1二聚体信号对T-ALL发生至关重要,并发现HES4通过调控Δ133p53亚型和BCL2L1表达促进白血病细胞存活 | 研究主要基于合成模型和患者来源的异种移植模型,在原发性人类T-ALL样本中的验证仍需进一步深入 | 探究NOTCH1二聚体信号在T细胞白血病发生和维持中的分子机制 | 人类造血干细胞/祖细胞、T-ALL细胞系、患者来源的异种移植模型和原发性T-ALL样本 | 癌症生物学 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序,染色质免疫沉淀测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,单细胞转录组数据 | 脐带血来源的造血干细胞/祖细胞、T-ALL细胞系和原发性T-ALL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5555 | 2025-10-06 |
Machine learning-driven construction and validation of an intra-tumoral heterogeneity-associated prognostic model for bladder urothelial carcinoma
2025-Jun-11, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2516767
PMID:40500142
|
研究论文 | 本研究构建并验证了一个基于肿瘤内异质性相关基因的膀胱尿路上皮癌预后模型 | 首次结合LASSO和随机生存森林算法开发14基因预后特征,并通过单细胞RNA测序分析验证模型基因的表达模式 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏前瞻性验证 | 构建膀胱尿路上皮癌的预后预测模型 | 膀胱尿路上皮癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | LASSO,随机生存森林 | 转录组数据,临床数据 | 多个公共队列数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
5556 | 2025-10-06 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Jun-11, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
|
研究论文 | 本研究探讨CD73抑制剂AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制小鼠胶质母细胞瘤的机制 | 首次揭示AB680通过改变GBM微环境中嘌呤代谢促进P2RY12+小胶质细胞向M1样抗肿瘤表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床效果仍需进一步验证 | 研究AB680在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤效果和作用机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析,单细胞RNA测序,核RNA测序 | NA | 代谢组数据,单细胞RNA测序数据,核RNA测序数据 | G422-GBM荷瘤小鼠模型和人类GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序,核RNA测序,代谢组学 | NA | NA |
5557 | 2025-10-06 |
Differentiation of lung tissue-resident c-Kit+ cells into microvascular endothelial cells alleviates pulmonary vascular remodeling
2025-Jun-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.01.010
PMID:39909047
|
研究论文 | 本研究揭示了肺组织驻留c-Kit+细胞通过分化为微血管内皮细胞缓解肺血管重构的机制 | 首次阐明肺组织驻留c-Kit+细胞在肺血管重构中的保护作用及其通过NR2F2调控的分化机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究肺c-Kit细胞分化在肺血管重构中的作用机制 | 肺组织驻留c-Kit+细胞及其分化的内皮细胞 | 病理生理学 | 肺动脉高压 | 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | SU5416/低氧诱导的肺血管重构小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5558 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals tryptophan metabolism restricting maturation of intratumoral tertiary lymphoid structures
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.011
PMID:40185093
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示色氨酸代谢抑制肝细胞癌内三级淋巴结构成熟的机制 | 首次发现恶性细胞塑造的色氨酸富集代谢微环境导致三级淋巴结构成熟偏离,并证明抑制色氨酸代谢可促进三级淋巴结构成熟并增强免疫治疗效果 | 研究主要聚焦于肝细胞癌,在其他癌种中的普适性需要进一步验证 | 探究三级淋巴结构成熟机制及其对免疫治疗的影响 | 肝细胞癌中的三级淋巴结构及其微环境 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 近单细胞空间转录组图谱 |
5559 | 2025-10-06 |
eIF5A maintains intestinal epithelial homeostasis by sustaining intestinal stem cells
2025-Jun-09, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00243-z
PMID:40488929
|
研究论文 | 本研究揭示了eIF5A通过调控线粒体翻译维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的关键作用 | 首次发现eIF5A通过调控线粒体翻译来维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官,尚未在人类样本中验证 | 探究eIF5A在肠道上皮稳态维持中的功能及其分子机制 | 小鼠肠道上皮细胞、肠道干细胞、肠道类器官 | 细胞生物学 | 肠道疾病 | 条件性基因敲除、质谱分析、单细胞RNA测序、线粒体功能检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、功能实验数据 | 成年小鼠肠道上皮细胞和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5560 | 2025-10-06 |
Prognostic and immune modulatory effects of ammonia-induced cell death in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02508-0
PMID:40490575
|
研究论文 | 本研究探讨了氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次建立氨死亡特征作为HNSC的新型预后生物标志物,揭示了氨代谢与肿瘤进展和免疫抑制的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 评估氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后意义和免疫调节机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者和单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 随机生存森林,单细胞RNA测序,ssGSEA,TIP分析 | RSF,Cox回归 | 转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |