单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5521 - 5540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5521 | 2025-10-06 |
Identification and Mapping of Human Lymph Node Stromal Cell Subsets by Combining Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics
2025-Jun, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451218
PMID:40498289
|
研究论文 | 通过结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，识别并定位人类淋巴结基质细胞亚群 | 首次系统鉴定人类淋巴结基质细胞的10个成纤维细胞亚型，并通过空间转录组学预测其在淋巴结组织中的定位 | 研究样本数量有限，仅分析了13个淋巴结供体的数据 | 解析人类淋巴结基质细胞的异质性及其空间分布特征 | 人类淋巴结基质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 9267个淋巴结基质细胞，来自13个淋巴结供体 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5522 | 2025-10-06 |
T2T-CHM13 versus hg38: accurate identification of immunoglobulin isotypes from scRNA-seq requires a genome reference matched for ancestry
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf074
PMID:40503052
|
研究论文 | 比较T2T-CHM13和hg38基因组参考在单细胞RNA测序中准确识别免疫球蛋白同种型的能力 | 首次证明基因组参考序列的祖先起源对免疫球蛋白同种型准确识别的重要性 | 研究样本的遗传背景有限，仅测试了欧洲和东亚来源的样本 | 评估不同基因组参考序列在单细胞RNA测序中识别免疫球蛋白同种型的准确性 | B细胞和抗体分泌细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5523 | 2025-10-06 |
Grape-Derived Exosome-Like Nanovesicles Effectively Ameliorate Skin Photoaging by Protecting Epithelial Cells
2025-Jun, Journal of food science
IF:3.2Q2
DOI:10.1111/1750-3841.70309
PMID:40504599
|
研究论文 | 本研究探讨葡萄来源的外泌体样纳米颗粒对光老化皮肤的保护作用及机制 | 首次发现葡萄来源的外泌体样纳米颗粒可通过调节上皮细胞增殖分化有效改善皮肤光老化 | 未明确说明样本量及具体作用机制细节 | 开发新型抗光老化治疗方法 | 光老化皮肤及上皮细胞 | 皮肤生物学 | 皮肤光老化 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5524 | 2025-10-06 |
Huangqi decoction ameliorated intestinal barrier dysfunction via regulating NF-κB signaling pathway in slow transit constipation model mice
2025-May-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i5.106000
PMID:40502512
|
研究论文 | 本研究探讨黄芪汤通过调控NF-κB信号通路改善慢传输型便秘小鼠肠道屏障功能障碍的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组测序技术系统揭示黄芪汤通过抑制NF-κB通路修复肠道屏障功能的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究黄芪汤是否通过下调NF-κB信号通路恢复肠道屏障功能来缓解慢传输型便秘 | KM小鼠和LS174T细胞系 | 单细胞组学 | 慢传输型便秘 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学, Western blot | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | KM小鼠分组（对照组、模型组、黄芪汤治疗组） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 5525 | 2025-10-06 |
Efficacy, safety and exploratory analysis of neoadjuvant tislelizumab (a PD-1 inhibitor) plus nab-paclitaxel followed by epirubicin/cyclophosphamide for triple-negative breast cancer: a phase 2 TREND trial
2025-May-26, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02254-3
PMID:40414961
|
研究论文 | 评估替雷利珠单抗联合白蛋白紫杉醇及表柔比星/环磷酰胺作为三阴性乳腺癌新辅助治疗方案的疗效与安全性 | 首次采用PD-1抑制剂替雷利珠单抗联合特定化疗方案的新辅助治疗模式，并整合多组学技术探索生物标志物 | 单臂II期试验设计，样本量有限（53例），缺乏对照组 | 确定三阴性乳腺癌新辅助免疫治疗的最佳化疗方案和获益人群 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR测序, 质谱流式细胞术, 全外显子组测序 | 预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 53例患者（44例完成治疗） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR测序, 质谱流式细胞术, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 5526 | 2025-10-06 |
Dissecting PTPN7-driven aggressiveness in IDH-wildtype astrocytomas: multi-omics, clinical validation, and spatial transcriptomics for prognostic insights
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02662-5
PMID:40413344
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨PTPN7在IDH野生型星形细胞瘤中的预后意义和免疫调节功能 | 首次系统研究PTPN7在胶质瘤中的空间分布特征及其与免疫微环境的相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证PTPN7的功能机制 | 评估PTPN7作为胶质瘤预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | IDH野生型星形细胞瘤患者样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 基因集富集分析 | Cox生存分析, CIBERSORT | 基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | TCGA、CGGA数据库样本，70例免疫组化验证病例 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间转录组平台 |
| 5527 | 2025-10-06 |
Functional heterogeneity and clinical implications of CD4+ T cell subtypes in high-grade serous ovarian carcinoma
2025-May-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i5.104138
PMID:40503412
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌中CD4+ T细胞亚型的功能异质性及其临床意义 | 首次系统揭示了HGSOC中CD4+ T细胞亚型在附件组织和腹水中的空间分布差异，并鉴定出与不良预后相关的Treg3亚型 | 样本量相对有限（42例患者），且仅分析了附件组织和腹水两种组织类型 | 表征HGSOC中CD4+ T细胞亚型的功能异质性和组织特异性分布，并识别治疗生物标志物 | 42例高级别浆液性卵巢癌患者的附件组织和腹水样本 | 单细胞生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类，Cox比例风险模型 | 单细胞转录组数据 | 42例HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5528 | 2025-10-06 |
Study on Liver Sinusoidal Endothelial Cell Fenestrations Based on Cellular Omics-Structure Integration Technology and Its Application in Metabolic Diseases
2025-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.653525
PMID:40475559
|
研究论文 | 开发了细胞组学-结构整合技术平台，实现单细胞水平基因表达谱与超分辨率细胞结构信息的同步获取 | 首创细胞组学-结构整合技术平台，突破传统技术无法同时获取单细胞基因表达和超分辨率结构的限制 | 未明确说明技术平台的具体应用范围和样本处理限制 | 研究肝窦内皮细胞窗孔形成机制及其在代谢疾病中的应用 | 原代肝窦内皮细胞、非酒精性脂肪性肝炎和糖尿病小鼠模型 | 数字病理 | 代谢疾病 | 单细胞转录组学、超分辨率荧光显微镜、电子显微镜、深度学习 | 深度学习 | 图像、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | COSI技术平台 | 包含单细胞转录组学与超分辨率荧光显微镜整合模块、电子显微镜与超分辨率荧光显微镜整合模块、综合分析模块 |
| 5529 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals SLC31A1-mediated M2 polarization of macrophages promotes malignant progression in triple-negative breast cancer
2025-May-14, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06191-0
PMID:40360897
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现SLC31A1介导的巨噬细胞M2极化促进三阴性乳腺癌恶性进展 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定SLC31A1在三阴性乳腺癌髓系细胞中的过表达及其在巨噬细胞M2极化中的关键作用 | NA | 研究三阴性乳腺癌免疫微环境中巨噬细胞极化的调控机制及其对肿瘤恶性进展的影响 | 三阴性乳腺癌样本中的巨噬细胞和癌细胞 | 单细胞测序分析 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 流式细胞术, Transwell实验, 划痕实验, 铜离子检测, 过氧化氢检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5530 | 2025-10-06 |
In situ profiling of plasma cell clonality with image-based single-cell transcriptomics
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.09.653118
PMID:40463110
|
研究论文 | 开发了一种基于图像的单细胞转录组学方法BCR-MERFISH，用于在原位分析浆细胞克隆性 | 首次结合V基因使用和转录组分析来区分浆细胞克隆，能够在组织原位同时分析细胞类型和免疫受体多样性 | 目前仅在细胞培养和小鼠模型中验证，尚未在人类样本中应用 | 开发能够分析适应性免疫系统中细胞克隆多样性的单细胞技术 | 浆细胞及其B细胞受体克隆多样性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，荧光原位杂交 | NA | 图像，转录组数据 | 细胞培养物和小鼠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | BCR-MERFISH（B细胞受体多重误差鲁棒荧光原位杂交） |
| 5531 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of Glomerulo-centric antibody mediated rejection in renal transplants
2025-May, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110460
PMID:39993695
|
案例研究 | 通过空间转录组技术分析肾移植患者抗体介导排斥反应中肾小球中心的分子特征变化 | 首次使用数字空间分析技术定位肾移植排斥反应中肾小球特异性转录本，揭示天然免疫细胞在肾小球中的空间分布 | 仅基于单个患者的4次活检样本，样本量有限 | 研究急性抗体介导排斥反应中肾小球中心的分子机制 | 肾移植患者的活检组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 数字空间分析 | NA | 空间转录组数据 | 来自单个患者的4次肾活检样本（治疗前、治疗中和治疗后） | NA | 空间转录组学 | NA | 数字空间分析技术 |
| 5532 | 2025-10-06 |
GAEDGRN: reconstruction of gene regulatory networks based on gravity-inspired graph autoencoders
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf232
PMID:40415678
|
研究论文 | 提出基于重力启发图自编码器的新型基因调控网络重建框架GAEDGRN | 通过重力启发图自编码器捕捉基因调控网络中的有向拓扑结构，并设计基因重要性评分方法 | 未明确说明方法在更广泛细胞类型或复杂疾病中的适用性 | 从单细胞RNA测序数据重建高分辨率基因调控网络 | 基因调控网络和基因间的潜在因果关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图自编码器, 图神经网络 | 基因表达数据 | 三种GRN类型的七种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5533 | 2025-10-06 |
The spatial transcriptome of the late-stage embryonic and postnatal mouse brain reveals spatiotemporal molecular markers
2025-Apr-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95496-8
PMID:40210990
|
研究论文 | 通过空间转录组分析研究小鼠胚胎晚期和出生后大脑发育过程中的时空分子标记 | 首次将空间转录组分析应用于发育中的胎儿大脑，发现了脉络丛、梨状皮层和丘脑的新分子标记，以及能够确定发育阶段背侧内嗅核的新型分子标记 | 研究主要基于小鼠模型，人类大脑发育可能存在差异；空间转录组数据的计算分析仍需进一步优化 | 研究小鼠大脑发育过程中基因表达的时空调控机制 | 胚胎晚期和出生后小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序，单细胞转录组数据整合 | 数据分析模型 | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | 小鼠大脑发育多个时间点的组织样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5534 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts in breast cancer in the single-cell era: Opportunities and challenges
2025-04, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189291
PMID:40024607
|
综述 | 本文探讨了单细胞时代乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性、生物标志物分类及其在肿瘤进展中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术系统分析乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性和功能亚群 | NA | 探索乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的亚群分类及其在肿瘤微环境中的功能作用 | 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5535 | 2025-10-06 |
CAD manipulates tumor intrinsic DHO/UBE4B/NF-κB pathway and fuels macrophage cross-talk, promoting HCC metastasis
2025-Mar-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001304
PMID:40073276
|
研究论文 | 本研究揭示了CAD通过调控DHO/UBE4B/NF-κB通路和巨噬细胞重编程促进肝细胞癌转移的机制 | 首次发现CAD通过调控嘧啶从头合成导致DHO积累，直接结合UBE4B并激活NF-κB通路，同时重编程巨噬细胞为促肿瘤表型 | 样本量相对有限（159例患者），需要更大规模研究验证 | 阐明PVTT形成和HCC转移的机制，寻找临床干预靶点 | 肝细胞癌患者样本（包括37例PVTT患者）和实验模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、单细胞RNA测序数据 | 159例HCC患者（包括37例PVTT患者） | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 转录组学, 蛋白质基因组学 | NA | NA |
| 5536 | 2025-10-06 |
The Society for Immunotherapy of Cancer Perspective on Tissue-Based Technologies for Immuno-Oncology Biomarker Discovery and Application
2025-Feb-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2469
PMID:39625818
|
综述 | 癌症免疫治疗学会对组织基技术在免疫肿瘤生物标志物发现与应用中的观点总结 | 整合多重免疫组化、单细胞转录组与空间蛋白质组学等前沿技术，提出生物标志物技术评估框架 | 未涉及具体临床验证数据，主要基于技术原理和现有研究进行展望 | 指导免疫肿瘤生物标志物技术发展方向和临床转化 | 组织基生物标志物检测技术 | 数字病理 | 多种癌症 | 多重免疫组化、免疫荧光、单细胞转录组学、质谱蛋白质组学 | NA | 多组学数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学成像 | NA | NA |
| 5537 | 2025-10-06 |
Identification of molecular characteristics in polycystic ovary syndrome using single-cell and transcriptome analysis
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81110-w
PMID:39848950
|
研究论文 | 通过单细胞和转录组分析揭示多囊卵巢综合征的分子特征 | 整合多个数据集进行综合分析，发现PCOS中新的共表达模块和信号通路，并通过伪时间轨迹分析揭示疾病发展轨迹 | NA | 揭示多囊卵巢综合征的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者基因表达数据 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自三个数据集(GSE138518, GSE155489, PRJNA600740) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5538 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers of sepsis and construction of ceRNA regulatory networks
2025-01-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78502-3
PMID:39843498
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序识别脓毒症预后生物标志物并构建ceRNA调控网络 | 首次结合RNA测序、单细胞RNA测序和meta分析筛选脓毒症预后相关核心基因，并构建了包含4个circRNA、26个miRNA和2个mRNA的ceRNA调控网络 | 样本量较小（幸存组26例，非幸存组6例），需要在更大样本中验证 | 识别脓毒症预后生物标志物并构建ceRNA调控网络以深入理解脓毒症发病机制 | 脓毒症患者血液样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序，单细胞RNA测序，差异表达分析，GO分析，meta分析 | ceRNA调控网络 | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 32例脓毒症患者（幸存组26例，非幸存组6例） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10×Single-cell RNA sequencing |
| 5539 | 2025-10-06 |
DiabetesOmic: A comprehensive multi-omics diabetes database
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.05.008
PMID:40502930
|
研究论文 | 介绍了一个名为DiabetesOmic的综合多组学糖尿病数据库，整合了五种高通量测序数据 | 首个专门针对糖尿病的综合多组学数据库，整合了五种测序模态数据并提供了临床并发症注释 | 目前仅包含487个样本，样本规模相对有限 | 为糖尿病研究提供分子资源，促进对糖尿病病理机制的深入理解 | 1型和2型糖尿病患者的多种组织样本 | 生物信息学 | 糖尿病 | ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq, scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 多组学测序数据 | 487个样本，涵盖1型和2型糖尿病的多种组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 批量ATAC-seq | NA | NA |
| 5540 | 2025-10-06 |
Exosomal BMPR2 Macromolecule Facilitates Alveolar Epithelial Cell Repair Through Functional Complex Formation with BMPR1B in Acute Lung Injury
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S519393
PMID:40502982
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的外泌体通过BMPR2-BMPR1B复合物形成促进急性肺损伤中肺泡上皮细胞修复的分子机制 | 首次发现外泌体BMPR2通过与上皮细胞BMPR1B形成功能复合物激活SMAD1信号通路，促进AT2向AT1细胞转分化 | 研究主要聚焦于分子机制，临床转化潜力需进一步验证 | 探索急性肺损伤中肺泡修复的分子机制和治疗策略 | 巨噬细胞来源的外泌体和肺泡上皮细胞 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 动态光散射,透射电镜,免疫印迹,蛋白质组学,分子对接,单细胞RNA测序,生化分析,共聚焦共定位,近红外成像,多重免疫荧光,伪时间轨迹分析 | NA | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |