单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5521 - 5540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5521 | 2025-10-06 |
Impact of HLA alloimmunization on clinical outcomes of severe aplastic anemia treated with immunosuppressive therapy
2025-Jun-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015301
PMID:40085951
|
研究论文 | 研究HLA同种免疫对接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者临床结局的影响 | 首次在大型iAA患者队列中系统评估HLA同种免疫的临床意义，并利用单细胞RNA测序揭示免疫机制 | 研究基于5项前瞻性试验的观察性数据，需要进一步验证 | 探讨HLA同种免疫在免疫性再生障碍性贫血中的临床相关性 | 444名接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者 | 血液病学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、测序数据 | 444例患者（其中99例存在HLA同种免疫） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5522 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis of tumor necrosis factor superfamily 4 reveals its prognostic value with T cell exhaustion feature in cancer
2025-Jun-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02666-1
PMID:40493100
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示TNFSF4在泛癌中的预后价值及其与T细胞耗竭特征的关系 | 首次在泛癌水平系统分析TNFSF4的表达特征、预后价值及其与T细胞耗竭的关联 | 主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证和机制研究 | 探究TNFSF4在泛癌中的表达模式、预后价值及其在免疫调节中的作用 | TCGA和GEO数据库中的多种癌症样本 | 生物信息学 | 泛癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化染色, 基因集富集分析 | Cox回归模型, 相关性分析 | RNA测序数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据库的多种癌症样本和GEO数据库的免疫治疗队列 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5523 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis of canine aging markers and evaluation of stem cell intervention
2025-Jun-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08333-z
PMID:40494876
|
研究论文 | 通过多组学技术分析犬类衰老标志物并评估干细胞干预效果 | 首次在犬类中鉴定出9个衰老相关细胞群和9个跨物种保守的CD8+T细胞衰老标志物，发现两个一致的代谢衰老标志物，并证明过表达NMNAT1的间充质干细胞可延缓或逆转犬类衰老 | 样本规模有限，研究结果需要在更大群体中验证 | 探索犬类衰老的分子机制并开发抗衰老干预策略 | 不同年龄的犬类 | 生物医学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 多组学技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 不同年龄的犬类样本 | NA | single-cell RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 5524 | 2025-10-06 |
spaMGCN: a graph convolutional network with autoencoder for spatial domain identification using multi-scale adaptation
2025-Jun-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03637-z
PMID:40495225
|
研究论文 | 提出一种基于图卷积网络和自编码器的空间域识别方法spaMGCN，专门用于处理离散组织分布 | 整合空间转录组和空间表观基因组数据，采用多尺度自适应图卷积网络，特别针对离散组织分布进行优化 | NA | 开发能够有效识别离散空间域的空间转录组分析方法 | 小鼠脾脏中的离散T细胞区域和人类淋巴结中的滤泡细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，空间表观基因组学 | 图卷积网络(GCN)，自编码器 | 空间转录组数据，空间表观基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5525 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell and spatial transcriptomics by SEU-TCA reveals the spatial origin of early cardiac progenitors
2025-Jun-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03633-3
PMID:40495257
|
研究论文 | 开发SEU-TCA方法提高单细胞空间映射精度，并应用于小鼠原肠胚形成研究 | 利用迁移成分分析开发SEU-TCA方法，显著提升单细胞空间映射准确性 | NA | 提高空间转录组学中单细胞空间定位的准确性 | 小鼠原肠胚形成过程中的心脏前体细胞 | 空间转录组学 | 先天性心脏病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | 迁移成分分析 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 多个单细胞和空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5526 | 2025-10-06 |
SLC6A6-Mediated Taurine Uptake Sustains Corneal Epithelial Stem/Progenitor Cell Function to Counteract Age-Related Dysfunction
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.25
PMID:40478558
|
研究论文 | 本研究揭示了SLC6A6介导的牛磺酸转运在维持角膜缘干细胞功能及对抗年龄相关功能障碍中的作用 | 首次发现SLC6A6介导的牛磺酸摄取通过Notch1信号通路调控角膜缘干细胞稳态，为年龄相关性角膜疾病提供了新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，需要进一步验证在人类角膜组织中的适用性 | 阐明SLC6A6介导的牛磺酸转运在维持角膜缘干细胞功能及年龄相关性角膜愈合中的作用机制 | C57BL/6J小鼠角膜组织、小鼠角膜上皮干细胞/祖细胞(TKE2细胞) | 干细胞生物学 | 角膜疾病 | 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、单细胞RNA测序、定量PCR、免疫荧光染色、转录组分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、代谢物浓度数据 | 小鼠角膜组织样本和TKE2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5527 | 2025-10-06 |
Age-Dependent Clonal Expansion of Non-Sperm-Forming Spermatogonial Stem Cells in Mouse Testes
2025-Jun, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70019
PMID:39985763
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示了老年小鼠睾丸中不形成精子的精原干细胞克隆的年龄依赖性扩增现象 | 首次发现老年小鼠睾丸中存在不参与精子形成的精原干细胞克隆，这些克隆在睾丸开放微环境中发生空间扩增 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 阐明生理衰老对睾丸开放微环境中精原干细胞克隆命运行为的影响 | 年轻和老年小鼠的精原干细胞 | 单细胞生物学 | 生殖衰老 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 活体实时成像 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 年轻和老年小鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5528 | 2025-10-06 |
Single-cell technology grows up: Leveraging high-resolution omics approaches to understand neurodevelopmental disorders
2025-Jun, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.102990
PMID:40036988
|
综述 | 探讨利用单细胞和空间转录组学技术研究神经发育障碍的病因和机制 | 系统整合突变模型与高通量组学方法，在细胞分辨率层面定义神经发育障碍病因 | NA | 理解神经发育障碍的分子、细胞和环路水平机制 | 神经发育障碍基因模型和人类脑组织 | 基因组学 | 神经发育障碍 | 单细胞基因组学，空间转录组学 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 5529 | 2025-10-06 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas Characterizes the Immune Landscape of Human Testes During Aging
2025-Jun, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70032
PMID:40051066
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类睾丸在衰老过程中的免疫细胞图谱 | 首次系统揭示了人类睾丸中免疫细胞在衰老过程中的变化特征，发现单核细胞和MRC1组织驻留巨噬细胞随年龄变化的规律 | 样本数量相对有限（33例），年龄跨度较大但样本分布可能不均 | 探究衰老对人类睾丸免疫细胞的影响 | 人类睾丸组织样本 | 单细胞组学 | 生殖系统衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 33例人类睾丸样本（年龄21-69岁） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5530 | 2025-10-06 |
Macrophage Subpopulation Promotes Skeletal Muscle Regeneration Through HGF/MET Signaling-Mediated Skeletal Muscle Stem Cell Proliferation
2025-Jun, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70042
PMID:40132988
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Mac_1巨噬细胞亚群通过HGF/MET信号通路促进骨骼肌干细胞增殖，从而驱动骨骼肌再生 | 首次在单细胞水平鉴定出促进骨骼肌再生的特异性巨噬细胞亚群，并阐明其通过HGF/c-Met信号通路调控肌肉干细胞增殖的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究巨噬细胞亚群在骨骼肌再生中的作用机制及与年龄相关再生障碍的关系 | 年轻(8周)和老年(24个月)小鼠的骨骼肌组织、肌肉卫星细胞、巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5531 | 2025-10-06 |
Peripheral blood neutrophils contribute to Claudin18.2-specific CAR-T cell treatment resistance in advanced gastric cancer
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03015-3
PMID:40246985
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞与淋巴细胞比率(NLR)在CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗晚期胃癌中的预后价值及耐药机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出与疾病进展相关的循环中性粒细胞亚群(NE-3)，并揭示其通过表达MMP-9和IL-17信号通路促进CAR-T治疗耐药 | 需要进一步验证和探索减轻中性粒细胞诱导免疫抑制的策略 | 研究CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗在晚期胃癌中的疗效差异机制 | 接受CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的胃癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析 | 临床数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5532 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling in ovarian germ cell and sex cord-stromal tumours
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03012-6
PMID:40269311
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤微环境蓝图 | 首次对罕见卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤的肿瘤微环境进行单细胞水平解析 | 样本量相对有限，仅包含12个新鲜肿瘤样本 | 探索卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤的免疫和基质景观 | 卵巢肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 12个新鲜肿瘤样本(66,919个细胞), 46个OGCTs和66个SCSTs用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5533 | 2025-10-06 |
The transcriptomes, connections and development of submucosal neuron classes in the mouse small intestine
2025-Jun, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01962-x
PMID:40442499
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠小肠黏膜下神经丛的神经元分类、连接和发育过程 | 发现了两个新的分泌运动神经元类别和一个先前未被识别的黏膜下内在初级传入神经元类别，并揭示了它们与肠嗜铬细胞的意外紧密关联 | 研究仅限于小鼠小肠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 解析肠道黏膜下神经丛的神经元组成和发育机制 | 小鼠小肠黏膜下神经丛神经元 | 单细胞生物学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序，病毒介导标记，谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据，形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5534 | 2025-10-06 |
Identification and Mapping of Human Lymph Node Stromal Cell Subsets by Combining Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics
2025-Jun, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451218
PMID:40498289
|
研究论文 | 通过结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，识别并定位人类淋巴结基质细胞亚群 | 首次系统鉴定人类淋巴结基质细胞的10个成纤维细胞亚型，并通过空间转录组学预测其在淋巴结组织中的定位 | 研究样本数量有限，仅分析了13个淋巴结供体的数据 | 解析人类淋巴结基质细胞的异质性及其空间分布特征 | 人类淋巴结基质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 9267个淋巴结基质细胞，来自13个淋巴结供体 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5535 | 2025-10-06 |
T2T-CHM13 versus hg38: accurate identification of immunoglobulin isotypes from scRNA-seq requires a genome reference matched for ancestry
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf074
PMID:40503052
|
研究论文 | 比较T2T-CHM13和hg38基因组参考在单细胞RNA测序中准确识别免疫球蛋白同种型的能力 | 首次证明基因组参考序列的祖先起源对免疫球蛋白同种型准确识别的重要性 | 研究样本的遗传背景有限，仅测试了欧洲和东亚来源的样本 | 评估不同基因组参考序列在单细胞RNA测序中识别免疫球蛋白同种型的准确性 | B细胞和抗体分泌细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5536 | 2025-10-06 |
Grape-Derived Exosome-Like Nanovesicles Effectively Ameliorate Skin Photoaging by Protecting Epithelial Cells
2025-Jun, Journal of food science
IF:3.2Q2
DOI:10.1111/1750-3841.70309
PMID:40504599
|
研究论文 | 本研究探讨葡萄来源的外泌体样纳米颗粒对光老化皮肤的保护作用及机制 | 首次发现葡萄来源的外泌体样纳米颗粒可通过调节上皮细胞增殖分化有效改善皮肤光老化 | 未明确说明样本量及具体作用机制细节 | 开发新型抗光老化治疗方法 | 光老化皮肤及上皮细胞 | 皮肤生物学 | 皮肤光老化 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5537 | 2025-10-06 |
Huangqi decoction ameliorated intestinal barrier dysfunction via regulating NF-κB signaling pathway in slow transit constipation model mice
2025-May-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i5.106000
PMID:40502512
|
研究论文 | 本研究探讨黄芪汤通过调控NF-κB信号通路改善慢传输型便秘小鼠肠道屏障功能障碍的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组测序技术系统揭示黄芪汤通过抑制NF-κB通路修复肠道屏障功能的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究黄芪汤是否通过下调NF-κB信号通路恢复肠道屏障功能来缓解慢传输型便秘 | KM小鼠和LS174T细胞系 | 单细胞组学 | 慢传输型便秘 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学, Western blot | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | KM小鼠分组（对照组、模型组、黄芪汤治疗组） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 5538 | 2025-10-06 |
Efficacy, safety and exploratory analysis of neoadjuvant tislelizumab (a PD-1 inhibitor) plus nab-paclitaxel followed by epirubicin/cyclophosphamide for triple-negative breast cancer: a phase 2 TREND trial
2025-May-26, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02254-3
PMID:40414961
|
研究论文 | 评估替雷利珠单抗联合白蛋白紫杉醇及表柔比星/环磷酰胺作为三阴性乳腺癌新辅助治疗方案的疗效与安全性 | 首次采用PD-1抑制剂替雷利珠单抗联合特定化疗方案的新辅助治疗模式，并整合多组学技术探索生物标志物 | 单臂II期试验设计，样本量有限（53例），缺乏对照组 | 确定三阴性乳腺癌新辅助免疫治疗的最佳化疗方案和获益人群 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR测序, 质谱流式细胞术, 全外显子组测序 | 预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 53例患者（44例完成治疗） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR测序, 质谱流式细胞术, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 5539 | 2025-10-06 |
Dissecting PTPN7-driven aggressiveness in IDH-wildtype astrocytomas: multi-omics, clinical validation, and spatial transcriptomics for prognostic insights
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02662-5
PMID:40413344
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨PTPN7在IDH野生型星形细胞瘤中的预后意义和免疫调节功能 | 首次系统研究PTPN7在胶质瘤中的空间分布特征及其与免疫微环境的相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证PTPN7的功能机制 | 评估PTPN7作为胶质瘤预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | IDH野生型星形细胞瘤患者样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 基因集富集分析 | Cox生存分析, CIBERSORT | 基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | TCGA、CGGA数据库样本，70例免疫组化验证病例 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间转录组平台 |
| 5540 | 2025-10-06 |
Functional heterogeneity and clinical implications of CD4+ T cell subtypes in high-grade serous ovarian carcinoma
2025-May-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i5.104138
PMID:40503412
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌中CD4+ T细胞亚型的功能异质性及其临床意义 | 首次系统揭示了HGSOC中CD4+ T细胞亚型在附件组织和腹水中的空间分布差异，并鉴定出与不良预后相关的Treg3亚型 | 样本量相对有限（42例患者），且仅分析了附件组织和腹水两种组织类型 | 表征HGSOC中CD4+ T细胞亚型的功能异质性和组织特异性分布，并识别治疗生物标志物 | 42例高级别浆液性卵巢癌患者的附件组织和腹水样本 | 单细胞生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类，Cox比例风险模型 | 单细胞转录组数据 | 42例HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |