单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40543 篇文献，本页显示第 5501 - 5520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5501 | 2026-04-09 |
Androgen Receptor-Induced Lactoferrin Accelerates Prostate Tumorigenesis Through Modulating Ferroptosis
2026-Apr-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520109
PMID:41945871
|
研究论文 | 本文揭示了乳铁蛋白在雄激素受体调控下，通过抑制铁死亡促进前列腺癌发生发展的新机制 | 首次发现乳铁蛋白在前列腺癌中具有促癌功能，并阐明了其通过AR-LF-铁死亡轴调控铁代谢和细胞死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，临床转化仍需进一步验证 | 探究乳铁蛋白在前列腺癌发生发展中的作用机制 | 前列腺癌细胞、TRAMP小鼠模型、临床样本数据 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、基因敲除模型 | TRAMP小鼠遗传模型、异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、单细胞转录组数据 | TRAMP小鼠模型、TCGA-PARD临床数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5502 | 2026-04-09 |
The roles of NF-κB-activated theca cell subtypes in subclinical premature ovarian insufficiency
2026-Apr-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag032
PMID:41818683
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序，探索了早发性卵巢功能不全患者卵泡微环境中细胞和分子的改变，特别是炎症通路的作用 | 首次在早发性卵巢功能不全患者中，通过单细胞测序鉴定出NF-κB激活的卵泡膜/基质细胞亚型，并揭示了其可能通过影响颗粒细胞分化参与疾病早期发病机制 | 样本量有限（单细胞测序每组仅n=1），初步发现需要更大样本量的研究进一步验证 | 探究早发性卵巢功能不全的早期发病机制，特别是卵泡微环境中炎症通路的角色 | 早发性卵巢功能不全患者的卵泡微环境细胞（颗粒细胞、卵泡膜/基质细胞等） | 单细胞组学 | 卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 单细胞测序：每组1例（共2例）；批量RNA测序：每组4例（共8例） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5503 | 2026-04-09 |
Single-cell transcriptomics reveals cytotrophoblast subtypes and senescence in recurrent spontaneous abortion
2026-Apr-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag030
PMID:41849438
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了复发性自然流产中细胞滋养层细胞的亚型特征及细胞衰老现象 | 首次在复发性自然流产中鉴定出三种细胞滋养层细胞亚型，并发现CTB2和CTB3亚型存在显著的细胞衰老特征 | 研究样本量有限，且未深入探讨细胞衰老的具体分子机制 | 探究复发性自然流产的发病机制，特别是滋养层细胞的功能异常 | 对照和复发性自然流产患者的绒毛组织 | 数字病理学 | 复发性自然流产 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，但包括对照和RSA两组绒毛组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5504 | 2026-04-09 |
NRF2/SLC7A11 axis-mediated metabolic reprogramming drives Benzo[a]pyrene-induced malignant transformation: Evidence from lung organoid and 16HBE cell models
2026-Apr-03, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究利用肺类器官和BaP诱导的恶性转化细胞模型，揭示了NRF2/SLC7A11轴介导的氨基酸代谢重编程在苯并[a]芘诱导的细胞恶性转化中的关键作用 | 首次在肺类器官和细胞模型中系统阐明了NRF2通过直接结合SLC7A11启动子调控氨基酸代谢，从而驱动BaP诱导的恶性转化的分子机制 | 研究主要基于体外模型（类器官和细胞系），缺乏体内动物模型的验证，且临床相关性有待进一步探索 | 阐明苯并[a]芘诱导肺癌发生的分子机制 | 肺类器官和BaP诱导的恶性转化人支气管上皮细胞（16HBE-T） | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5505 | 2026-04-09 |
scGraphDap: Integrating Functional State Pseudo-Labels and Graph Structure Learning for Robust Cell Type Annotation in Tumor Microenvironments
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3607687
PMID:40928910
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scGraphDap的图神经网络框架，通过整合功能状态伪标签和图结构学习，以改善肿瘤微环境中的细胞类型注释和细胞间通讯推断 | 利用通路活性评分作为伪标签优化细胞-细胞图，以捕捉超越几何相似性的功能邻近性，并引入图域适应模块对齐不同患者间的细胞嵌入，增强跨个体泛化能力 | NA | 改善肿瘤微环境中基于非空间单细胞RNA测序数据的细胞类型注释和细胞间通讯推断 | 肿瘤微环境中的细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 来自15名患者的38,667个细胞，涵盖三种癌症 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5506 | 2026-04-09 |
AutoGRN: An Automated Graph Neural Network Framework for Gene Regulatory Network Inference
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3609408
PMID:40956752
|
研究论文 | 本文提出了AutoGRN，一个用于基因调控网络推断的自动化图神经网络框架，通过遗传搜索算法优化GNN架构以适应单细胞RNA测序数据的特性 | AutoGRN通过将影响GRN推断性能的多种组件纳入搜索空间，并利用信息熵约束的遗传搜索算法，自动适应不同单细胞RNA测序数据集的特征，从而优化GNN架构，解决了固定架构难以泛化的问题 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个自动化框架以提高基因调控网络推断的准确性和泛化能力 | 基因调控网络（GRN） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图神经网络（GNN） | 基因表达数据 | 多个公共数据集（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5507 | 2026-04-09 |
scProca: A Cross-Attention-Enhanced Deep Generative Model for Single-Cell Transcriptomics and Proteomics Integration and Imputation
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3615771
PMID:41021958
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scProca的深度生成模型，用于整合和插补单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | scProca通过交叉注意力机制整合细胞间关系，以处理异质性输入数据，并在高蛋白质稀疏性下保持鲁棒性，实现了最先进的整合和插补性能 | NA | 旨在通过整合单细胞转录组学和蛋白质组学数据，更深入地理解复杂疾病的分子机制和细胞状态 | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | 机器学习 | 复杂疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学和蛋白质组学共分析 | 深度生成模型（基于交叉注意力机制） | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学和蛋白质组学共分析 | NA | NA |
| 5508 | 2026-04-09 |
TMEM158-mediated TGF-β signaling pathway modulates the sensitivity of TP53-deficient osteosarcoma to USP14 inhibitors
2026-Apr, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05487-0
PMID:41642468
|
研究论文 | 本研究探讨了TMEM158介导的TGF-β信号通路在调节TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性中的作用 | 首次揭示了TMEM158作为关键调节因子，通过TGF-β信号通路介导TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂的敏感性，并发现其与USP14/UCHL5表达正相关且可作为独立预后标志物 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床转化需进一步验证；单细胞RNA测序数据的分析可能受样本量限制 | 阐明TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性的分子机制，探索TMEM158-TGF-β通路作为治疗靶点的潜力 | TP53缺陷型骨肉瘤细胞（原代肿瘤细胞、SAOS-2和U-2OS细胞系）、TP53缺陷型骨肉瘤小鼠模型、临床骨肉瘤数据库 | 癌症生物学 | 骨肉瘤 | 生物信息学分析（聚类分析、差异表达分析、功能富集分析）、qPCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 多个细胞系、动物模型及临床数据库数据（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5509 | 2026-04-09 |
Unraveling the role of cuproptosis in pulmonary fibrosis pathogenesis and prognosis: an integrative single-cell transcriptomics and microarray analysis
2026-Apr, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05510-4
PMID:41824199
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和微阵列分析，揭示了铜死亡在肺纤维化发病机制和预后中的作用，并建立了一个基于4个铜死亡相关基因的预后模型 | 首次将铜死亡与肺纤维化联系起来，并通过整合单细胞和批量RNA-seq数据构建了一个新的预后基因特征 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集，需要在更大队列的临床样本中进行验证 | 阐明铜死亡在肺纤维化中的生物学功能并建立预后模型 | 博来霉素诱导的小鼠模型、特发性肺纤维化患者样本以及TGF-β1刺激的成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, qRT-PCR, 免疫组织化学分析 | LASSO回归, Cox回归 | 转录组数据 | GSE70866队列中的特发性肺纤维化患者数据以及博来霉素诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5510 | 2026-04-09 |
Enhancing Deep Learning Inference of Gene Regulatory Networks via Construction of Image Representation of Cell-Cell Interactions From scRNA-Seq Data
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3617167
PMID:41052197
|
研究论文 | 本文提出了一种基于scRNA-seq数据构建细胞间相互作用图像表示（CelloGraph）并结合CNN进行基因调控网络推断的高精度计算方法 | 首次引入空间语义图像表示CelloGraph来描绘基因在细胞间的表达模式，并通过最大化细胞间相互作用的系统熵来确定细胞在空间网格中的位置，结合定制CNN进行模式识别 | 未明确说明方法在处理大规模数据集时的计算效率具体表现，以及在不同生物体系中的泛化能力验证 | 提高基于单细胞RNA测序数据的基因调控网络推断的准确性和计算效率 | 基因调控网络（GRNs） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 卷积神经网络（CNN） | 图像表示（基于scRNA-seq数据构建） | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5511 | 2026-04-09 |
Nuclear prostaglandin E synthase 3 promotes hepatocellular carcinoma growth with immunosuppressive macrophage polarization via the SP1/TGF-β axis
2026-Mar-25, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00431-6
PMID:41880053
|
研究论文 | 本文揭示了核内前列腺素E合成酶3（PTGES3）通过SP1/TGF-β轴促进肝细胞癌生长并诱导免疫抑制性巨噬细胞极化的新机制 | 发现了PTGES3的非经典核功能，作为连接肿瘤内在生长与外在免疫重塑的双功能调节因子，并阐明了其通过SP1介导的TGF-β分泌驱动肿瘤增殖和免疫抑制微环境形成的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限；机制研究虽深入，但潜在的其他信号通路或细胞类型相互作用可能未完全揭示 | 探究PTGES3在肝细胞癌进展和免疫微环境重塑中的作用及其分子机制 | 肝细胞癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、免疫活性小鼠模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、电泳迁移率变动分析、CUT&Tag技术、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 免疫活性小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5512 | 2026-04-09 |
The phosphatase DUSP2 constrains lymphoid remodeling and immunotherapy response in lung squamous carcinoma
2026-Mar-25, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.022
PMID:41883167
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肺鳞状细胞癌患者免疫检查点阻断治疗前后的样本，揭示了DUSP2磷酸酶通过调控NFAT信号通路限制免疫治疗响应的机制 | 首次在肺鳞状细胞癌中鉴定出IFN-I-DUSP2-NFAT轴作为免疫治疗抵抗的关键机制，并通过遗传学方法验证了DUSP2缺失能恢复T细胞功能和增强免疫治疗响应 | 研究样本量相对有限，且主要聚焦于肺鳞状细胞癌，未在其他肺癌亚型或癌症类型中验证该机制的普适性 | 探究肺鳞状细胞癌患者对免疫检查点阻断治疗产生抵抗的分子机制 | 肺鳞状细胞癌患者的肿瘤样本，包括治疗前和治疗后的组织 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及治疗前和治疗后的肺鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5513 | 2026-04-09 |
Immune checkpoints in a genetically engineered mouse model of spontaneous autoimmune uveitis
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf334
PMID:41847848
|
研究论文 | 本研究利用基因工程小鼠模型，探究了自发性自身免疫性葡萄膜炎中免疫检查点的作用 | 首次在AireGW/+Lyn-/-基因工程小鼠模型中，结合单细胞RNA测序和流式细胞术，系统表征了视网膜自身抗原特异性CD4+ T细胞，并揭示了眼引流淋巴结中Tregs作为免疫检查点限制视网膜炎症发展的新机制 | 研究基于特定基因工程小鼠模型，其发现是否完全适用于人类自身免疫性葡萄膜炎尚需进一步验证 | 探究自发性自身免疫性葡萄膜炎中免疫检查点的作用机制 | AireGW/+Lyn-/- C57BL/6基因工程小鼠（自发性自身免疫模型） | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 未明确具体样本数量，但涉及患有或不患有葡萄膜炎的小鼠眼引流淋巴结及视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5514 | 2026-04-09 |
Single-cell analysis of recruited ILC2 cell fate during transition from circulation to establishment of tissue residency
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf352
PMID:41847845
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术，追踪了循环ILC2细胞在寄生虫感染过程中向肺组织驻留细胞转化的命运 | 首次结合scRNA-seq和CITE-seq技术，实时追踪循环ILC2细胞在感染过程中向肺组织驻留表型转化的动态过程，并发现其保留肠道起源相关基因表达 | 研究仅使用小鼠模型，未在人体中验证；聚焦于单一寄生虫感染模型，可能不适用于其他感染或炎症条件 | 探究循环ILC2细胞在招募至肺组织过程中的命运转化及其与肺驻留ILC2细胞的关系 | 小鼠模型中的循环和肺组织驻留的2型固有淋巴细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5515 | 2026-04-09 |
ChemR23 prevents phenotypic switching of vascular smooth muscle cells into macrophage-like foam cells in atherosclerosis
2026-Mar-16, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf258
PMID:41264461
|
研究论文 | 本研究探讨了ChemR23在血管平滑肌细胞表型转换中的作用及其对动脉粥样硬化的影响 | 揭示了ChemR23在非造血细胞（特别是血管平滑肌细胞）中调节表型转换和泡沫细胞形成的新功能，并评估了其激动剂和抑制剂作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类数据来自单细胞转录组分析但样本有限，长期治疗效果和临床转化需进一步验证 | 阐明ChemR23在血管平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化发展中的具体作用机制 | 小鼠模型（Apoe-/-和ChemR23e/e双缺陷小鼠）、人类主动脉平滑肌细胞、人类动脉粥样硬化斑块单细胞数据 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组测序、bulk RNA测序、细胞培养、胆固醇摄取/流出实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、细胞功能数据 | 小鼠模型（具体数量未明确）、人类动脉粥样硬化斑块单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5516 | 2026-04-09 |
Equine endometrial organoids preserve tissue structure and cycle-stage transcriptional identity†
2026-Mar-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf232
PMID:41074771
|
研究论文 | 本研究评估了马子宫内膜类器官在生殖周期阶段和长期培养中的结构和分子保真度 | 首次详细表征了马子宫内膜类器官在生殖周期阶段的转录身份和组织结构保留情况 | 类器官中某些细胞类型（如纤毛细胞、内皮细胞）代表性不足，且周期特异性特征随培养时间延长而减弱 | 研究马子宫内膜类器官作为研究平台的适用性 | 马子宫内膜组织和类器官 | 数字病理学 | NA | 组织学、免疫组织化学、电子显微镜、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本（基因表达数据） | 从发情期和黄体期收集的活检样本生成的类器官 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5517 | 2026-04-09 |
CXCR6+ T Cells Drive Immune Checkpoint Inhibitor Myocarditis
2026-Mar-10, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点抑制剂（ICI）引发心肌炎的机制，特别是抗LAG-3/PD-1联合治疗下的风险，并识别了CXCR6+ T细胞在疾病发病中的关键作用 | 首次通过小鼠模型和临床数据验证了抗LAG-3/PD-1联合治疗增加心肌炎风险，并发现CXCR6作为心脏T细胞活化的关键标记物，其抗体治疗能预防疾病致死和心律失常 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据，临床转化需进一步验证；未详细探讨其他免疫细胞或信号通路在心肌炎中的作用 | 阐明ICI心肌炎的发病机制，特别是抗LAG-3/PD-1治疗下的风险因素，并探索潜在治疗靶点 | 小鼠模型（Lag3-/-, Pdcd1-/-小鼠）和临床患者数据，聚焦于心脏炎症和T细胞浸润 | 免疫学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析、心电图、抗体诱导细胞耗竭 | NA | 基因表达数据、临床数据、图像数据 | 小鼠模型和VigiBase国际药物警戒数据库中的临床数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5518 | 2026-04-09 |
Somatic gene mutations in the motor cortex of patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf460
PMID:41378777
|
研究论文 | 本研究利用尸检组织DNA和单细胞RNA测序数据，探索了散发性肌萎缩侧索硬化症（sALS）患者运动皮层中体细胞嵌合变异的存在及其在疾病发展中的作用 | 首次在sALS患者运动皮层中发现低等位基因频率体细胞变异的富集，并鉴定出导致FUS蛋白核质错误定位和聚集的体细胞突变p.E516X，同时通过单细胞RNA测序揭示了体细胞变异在兴奋性神经元中的特异性积累 | 研究基于尸检组织，可能无法完全反映疾病早期阶段的体细胞突变情况；样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究体细胞突变在散发性肌萎缩侧索硬化症（sALS）发病机制中的作用 | 散发性肌萎缩侧索硬化症（sALS）患者的尸检运动皮层组织 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 深度靶向panel测序, 单细胞RNA测序 | NA | DNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5519 | 2026-04-09 |
Class A scavenger receptors promote tumor progression and induce a unique macrophage phenotype in a mouse model of spontaneous breast cancer
2026-Mar-03, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag026
PMID:41749430
|
研究论文 | 本研究探讨了A类清道夫受体（SR-A）在自发性乳腺癌小鼠模型中促进肿瘤进展并诱导独特巨噬细胞表型的作用 | 首次在自发性乳腺癌模型中证实SR-A（而非FAP）缺失可显著延迟肿瘤发生并减少肺转移，并发现SR-A与乳腺癌细胞表面聚糖结合，通过单细胞RNA测序鉴定出具有高精氨酸酶1基因表达的SR-A依赖性肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；SR-A特异性配体在肿瘤微环境中的完整作用机制尚未完全阐明 | 评估成纤维细胞激活蛋白酶（FAP）和SR-A在乳腺癌进展中的作用机制 | 自发性乳腺癌小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和乳腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，通路分析 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 自发性乳腺癌小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5520 | 2026-04-09 |
CoMBCR: Co-Learning Multi-Modalities of BCRs and gene expressions
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag115
PMID:41803065
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CoMBCR的B细胞嵌入工具，能够共同学习B细胞受体（BCR）和基因表达谱这两种互补的数据模态，并将其表示在统一的潜在空间中以支持下游分析 | 首次开发了一种能够共同学习B细胞受体序列和基因表达谱多模态数据的嵌入方法，通过统一的潜在空间表示实现了对B细胞更全面的表征 | 未明确说明模型在不同数据集间的泛化能力，以及计算复杂度方面的限制 | 开发一种能够整合B细胞多模态数据的计算方法，以更好地理解B细胞的生物学特征和功能 | B细胞（特别是SARS-CoV-2特异性记忆B细胞和淋巴瘤患者的恶性B细胞） | 生物信息学 | 淋巴瘤、COVID-19 | 多模态学习、嵌入表示学习 | 多模态深度学习模型 | 序列数据（BCR）、基因表达数据、空间转录组数据 | 126,791个B细胞（来自多个数据集） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |