单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5501 - 5520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5501 | 2025-10-06 |
Analyses of single-cell RNA sequencing uncover the role of intratumoral Helicobacter pylori in shaping tumor progression and immunity in gastric cancer
2025-May-24, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04048-6
PMID:40411560
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示胃内幽门螺杆菌在胃癌进展和免疫调节中的作用 | 开发SAHMI流程系统性地恢复和去噪人类临床组织中的微生物信号，首次在单细胞转录组水平研究肿瘤-微生物相互作用 | 研究仅限于胃癌样本，未验证其他癌症类型中类似机制的普适性 | 探究胃内微生物群特别是幽门螺杆菌在胃癌发生发展中的作用机制 | 胃癌组织样本中的细胞群体和幽门螺杆菌 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，免疫组织化学 | SAHMI分析流程 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 大型胃癌队列（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5502 | 2025-10-06 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T-Cell Treatment Efficacy
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653878
PMID:40463198
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现低强度I型干扰素信号可增强CAR-T细胞疗效 | 首次揭示低强度IFN-I信号可增强CAR-T细胞杀伤活性和体内疗效，且与共刺激域无关 | 样本量较小（8例患者），需更大规模研究验证 | 探索提高CD19靶向CAR-T细胞治疗r/r DLBCL疗效的新策略 | 复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者和CAR-T细胞 | 单细胞组学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 8例r/r DLBCL患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5503 | 2025-10-06 |
ARHGDIB as a prognostic biomarker and modulator of the immunosuppressive microenvironment in glioma
2025-May-15, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04063-7
PMID:40372473
|
研究论文 | 本研究探讨ARHGDIB作为胶质瘤预后生物标志物及其在免疫抑制微环境调控中的作用 | 首次揭示ARHGDIB在胶质瘤免疫微环境中的调控机制，发现其与CD163相似的表达模式并能诱导M2巨噬细胞极化 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 探究ARHGDIB在胶质瘤免疫微环境中的调控作用及其预后价值 | 胶质瘤组织和细胞 | 生物信息学与肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | qPCR, IHC, 单细胞测序, 免疫荧光, 生物信息学分析 | LASSO-Cox回归, Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据, 临床数据, 免疫组化图像 | 公共数据库数据及自建队列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5504 | 2025-10-06 |
Din Oversees Mesenchymal Stem Cell Homeostasis in Mouse Incisors
2025-May-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6568233/v1
PMID:40470223
|
研究论文 | 本研究通过新开发的基因敲除小鼠模型揭示了Din基因在小鼠切牙间充质干细胞稳态调控中的关键作用 | 首次发现并验证了预测基因Din在牙髓间充质干细胞稳态维持中的核心功能，并阐明其通过Rho GTPases通路调控的分子机制 | 研究仅限于小鼠切牙模型，在人类牙齿中的功能尚需验证 | 探究Din基因在牙齿干细胞稳态调控中的作用机制 | 小鼠切牙中的间充质干细胞和上皮干细胞 | 干细胞生物学 | 牙齿发育异常 | 基因敲除模型,单细胞RNA测序,转录组学,蛋白质组学,GLISA分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 未明确样本数量的小鼠切牙组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5505 | 2025-06-15 |
scATD: a high-throughput and interpretable framework for single-cell cancer drug resistance prediction and biomarker identification
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf268
PMID:40501071
|
research paper | 提出了一种名为scATD的高通量、可解释的单细胞癌症耐药性预测和生物标志物识别框架 | scATD框架利用大型语言模型进行高通量药物敏感性预测，无需针对不同患者单细胞数据集进行模型微调，提高了预测速度和临床适用性 | 未明确提及具体局限性 | 开发一个能够快速预测单细胞水平癌症药物敏感性的高通量框架 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | cancer | single-cell RNA sequencing | scATD-sf, scATD-gf, scATD-sf-dist (基于scFoundation和Geneformer大型语言模型) | 单细胞基因表达数据 | 未明确提及具体样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 5506 | 2025-06-15 |
Showcasing the Comprehensive Understanding of Cellular Profiling and Human Neurophysiology
2025-May, Journal of pharmacy & bioallied sciences
DOI:10.4103/jpbs.jpbs_46_25
PMID:40511047
|
research paper | 本文系统性地探讨了细胞分析与人神经生理学的交叉领域，旨在揭示它们在理解神经过程、细胞反应及疾病中的相互作用 | 采用单细胞RNA测序和电生理学方法，探索人类样本中的细胞异质性和神经生理学表型，为设计高特异性治疗方案提供基础 | NA | 理解细胞分析与人神经生理学在神经过程和疾病中的相互作用 | 人类样本中的细胞异质性和神经生理学表型 | 分子生物学与神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 电生理学方法 | NA | 分子数据, 电生理数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5507 | 2025-10-06 |
A tumor necrosis factor-α-responsive cryptic promoter drives overexpression of the human endogenous retrovirus ERVK-7
2025-Apr-30, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108568
PMID:40316021
|
研究论文 | 本研究揭示了人内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中通过肿瘤坏死因子-α响应性隐蔽启动子驱动的过表达机制 | 发现了ERVK-7的两个新型转录本及其细胞谱系特异性表达模式，阐明了炎症信号通路对ERVK-7表达的差异性调控机制 | 主要聚焦于肺腺癌，对其他癌症类型的适用性需要进一步验证 | 探究ERVK-7在肺腺癌中的表达调控机制及其作为生物标志物的潜力 | 人内源性逆转录病毒ERVK-7及其在肺腺癌中的表达调控 | 基因组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,表观遗传图谱 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5508 | 2025-06-15 |
From spots to cells: Cell segmentation in spatial transcriptomics with BOMS
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311458
PMID:40504785
|
研究论文 | 本文提出了一种基于均值漂移的新方法BOMS，用于空间转录组学中的细胞分割，无需辅助图像 | BOMS方法仅基于mRNA点的空间位置和基因标签进行细胞分割，无需辅助图像，简化了实现过程并显著提高了执行速度 | 未提及方法在特定组织类型或复杂组织中的性能表现 | 改进空间转录组学中的细胞分割准确性 | 空间转录组学数据中的细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 均值漂移 | 空间转录组数据 | 多个公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5509 | 2025-06-15 |
Single-cell transcriptomics for immune profiling of cerebrospinal fluid in neurological diseases
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1599303
PMID:40510352
|
综述 | 本文全面回顾了单细胞转录组学在脑脊液（CSF）中用于理解神经系统疾病的研究 | 整合了scRNA-seq、scTCR-seq和scBCR-seq技术，探索神经系统疾病的免疫细胞角色和相互作用 | 当前单细胞转录组学在CSF和神经系统疾病中的应用仍存在局限性 | 理解神经系统疾病的免疫学机制并探索新的治疗靶点 | 脑脊液中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病（多发性硬化症、阿尔茨海默病、帕金森病等） | scRNA-seq、scTCR-seq、scBCR-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5510 | 2025-06-15 |
Integrative Analysis of Shared Pathogenic Genes and Potential Mechanisms in Gardnerella vaginalis and Persistent HPV16 Infection
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/2582989
PMID:40510586
|
研究论文 | 通过整合加德纳菌和持续性HPV16感染的转录组数据，揭示了共享的致病机制和潜在生物标志物 | 首次鉴定出RSAD2和IFIT1作为HPV相关宫颈病变的潜在生物标志物和治疗靶点，并建立了ceRNA网络 | 研究主要基于体外实验和公共数据集，需要进一步临床验证 | 阐明加德纳菌和HPV16持续性感染的共同致病机制 | 加德纳菌和HPV16感染的转录组数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 转录组分析、单细胞转录组学、孟德尔随机化分析 | Random Forest (RF) | 转录组数据 | GEO数据集GSE75132和体外感染实验数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5511 | 2025-10-06 |
Defining and targeting macrophage heterogeneity in the mammary gland and breast cancer
2024-02, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.7053
PMID:38426622
|
综述 | 探讨乳腺和乳腺癌中巨噬细胞异质性及其靶向治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞亚群的空间分布与功能特异性 | 基于文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 解析巨噬细胞异质性在乳腺发育与乳腺癌中的作用机制 | 乳腺组织驻留巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5512 | 2025-10-06 |
Type 1 immunity enables neonatal thymic ILC1 production
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh5520
PMID:38232171
|
研究论文 | 本研究揭示了1型免疫通过促进新生胸腺ILC1细胞的扩增和外周归巢来应对病毒感染等炎症条件 | 首次发现新生胸腺中存在独特的未成熟ILC1亚群，并证实1型细胞因子能促进其扩增和胸腺外迁 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探究1型免疫对胸腺驻留先天淋巴样细胞的影响 | 新生小鼠胸腺ILC1细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，活体成像，胸腺移植 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 新生小鼠胸腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5513 | 2025-10-06 |
Tenascin-C expressing touch dome keratinocytes exhibit characteristics of all epidermal lineages
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi5791
PMID:38241368
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现触圆顶角质形成细胞特异性表达Tenascin-C，并揭示这些细胞具有自我维持能力和多向分化潜能 | 首次鉴定Tenascin-C作为触圆顶角质形成细胞的标志物，并证明其在稳态维持和损伤修复中的独特功能 | 未明确触圆顶角质形成细胞分子调控机制的具体细节 | 探究触圆顶角质形成细胞的稳态维持机制和分子特征 | 小鼠皮肤触圆顶角质形成细胞 | 细胞生物学 | NA | scRNA-seq, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5514 | 2025-06-14 |
New insights into cancer immune checkpoints landscape from single-cell RNA sequencing
2025-07, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189298
PMID:40088992
|
review | 本文通过单细胞RNA测序技术深入探讨了癌症免疫检查点的异质性及其在免疫检查点阻断疗法中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术高分辨率地描绘了免疫检查点之间以前未被认识的功能性相互作用，并识别了新的免疫检查点作为癌症免疫治疗的潜在靶点 | 未提及具体样本量或实验设计的局限性 | 探讨免疫检查点阻断疗法中肿瘤微环境的异质性及其对治疗效果的影响 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5515 | 2025-06-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals altered placental microenvironment due to maternal high-fat diet
2025-Jun-26, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.04.011
PMID:40381453
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了母体高脂饮食对胎盘微环境的改变 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细分析了母体高脂饮食对胎盘细胞组成和功能的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 探究母体高脂饮食对胎盘微环境的影响及其与子代代谢疾病的关联 | C57BL/6J小鼠的胎盘组织 | 基因组学 | 代谢疾病 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 高脂饮食组和对照组小鼠的胎盘组织 | NA | NA | NA | NA |
| 5516 | 2025-06-14 |
New insights into the pharmacological mechanisms of Jinqi Jiangtang Tablets in the treatment of type 2 diabetes mellitus: A multi-omics approach combined with experimental validation
2025-Jun-26, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120020
PMID:40449695
|
research paper | 本研究采用多组学方法结合实验验证，探讨了金芪降糖片治疗2型糖尿病的药理机制 | 首次结合多组学方法和实验验证，全面解析金芪降糖片的药理活性成分及其在2型糖尿病中的多靶点、多通路作用机制 | 研究虽然发现了多个潜在靶点和通路，但具体分子机制仍需进一步实验验证 | 阐明金芪降糖片在2型糖尿病治疗中的药理活性成分和作用机制 | 金芪降糖片及其在2型糖尿病治疗中的作用 | 药理学 | 2型糖尿病 | LC-MS, 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 代谢组学, 16S rDNA测序 | NA | 化学分析数据, 基因表达数据, 代谢组数据, 微生物组数据 | 161种化合物被鉴定, 56种差异代谢物被发现 | NA | NA | NA | NA |
| 5517 | 2025-06-14 |
The Dynamically Evolving Cell States and Ecosystem from Benign Nevi to Melanoma
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2971
PMID:40094420
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了从良性痣到黑色素瘤的动态演变过程中黑色素细胞亚群的四种不同状态及其功能和调控通路的动态变化 | 首次在单细胞水平上描绘了从痣到黑色素瘤的恶性转化图谱，并识别了关键调控因子和免疫逃逸机制 | 样本量较小（仅5例患者），且仅针对先天性黑色素细胞痣来源的黑色素瘤 | 探究从良性痣到黑色素瘤恶性转化的动态变化机制 | 先天性黑色素细胞痣发展为黑色素瘤的患者组织样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | 恶性进展预测模型 | RNA测序数据 | 5例患者的多个配对组织位点 | NA | NA | NA | NA |
| 5518 | 2025-06-14 |
Impact of HLA alloimmunization on clinical outcomes of severe aplastic anemia treated with immunosuppressive therapy
2025-Jun-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015301
PMID:40085951
|
研究论文 | 研究HLA同种免疫对接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者临床结果的影响 | 首次在大规模患者队列中研究HLA同种免疫与疾病结果的相关性，并使用单细胞RNA测序揭示免疫系统激活机制 | 研究基于观察性数据，无法确定因果关系 | 探讨HLA同种免疫对严重再生障碍性贫血患者预后的影响 | 444名接受免疫抑制治疗的严重再生障碍性贫血患者 | 血液病学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和RNA测序数据 | 444名患者（其中99名存在HLA同种免疫） | NA | NA | NA | NA |
| 5519 | 2025-06-14 |
Multi-omics analysis of tumor necrosis factor superfamily 4 reveals its prognostic value with T cell exhaustion feature in cancer
2025-Jun-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02666-1
PMID:40493100
|
研究论文 | 通过多组学分析探讨肿瘤坏死因子超家族4（TNFSF4）在癌症中的预后价值及其与T细胞耗竭特征的关系 | 首次在泛癌水平上系统研究了TNFSF4的生物学功能及其与免疫治疗反应的关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索TNFSF4在癌症进展和免疫调节中的作用 | 多种癌症类型及其相关临床数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq、免疫组化、单细胞RNA-seq | Cox回归模型、基因集富集分析（GSEA） | 基因表达数据、临床数据 | TCGA数据库中的多种癌症样本及GEO数据库中的免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5520 | 2025-06-14 |
Multi-omics analysis of canine aging markers and evaluation of stem cell intervention
2025-Jun-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08333-z
PMID:40494876
|
研究论文 | 通过多组学技术分析犬类衰老标志物并评估干细胞干预效果 | 鉴定出9个与衰老相关的细胞群和9个跨物种保守的CD8+ T细胞衰老特异性标志物，开发了针对衰老犬的定制代谢评估系统和基于血液的评估框架，并证明过表达NMNAT1的间充质干细胞可延缓或逆转犬类衰老 | NA | 揭示衰老的分子机制并探索干细胞干预在延缓衰老中的应用 | 不同年龄段的犬类 | 生物医学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、多组学技术 | NA | RNA测序数据、蛋白质数据、代谢数据 | NA | NA | NA | NA | NA |