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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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5501 | 2024-12-11 |
IgG autoantibodies in bullous pemphigoid directly induce a pathogenic MyD88-dependent pro-inflammatory response in keratinocytes
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.616103
PMID:39569141
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研究论文 | 研究探讨了天疱疮(BP)中的IgG自身抗体如何直接诱导角质形成细胞中的病理性MyD88依赖性促炎反应 | 首次揭示了BP-IgG自身抗体依赖的角质形成细胞反应在天疱疮病理中的作用,并证明了MyD88在BP-IgG诱导的炎症反应中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上,尚未完全阐明这些发现在人类中的直接应用 | 探讨天疱疮中IgG自身抗体对角质形成细胞的直接影响及其在疾病病理中的作用 | 天疱疮患者的IgG自身抗体、角质形成细胞、MyD88信号通路 | NA | 天疱疮 | 多重免疫分析、bulk RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括天疱疮患者和对照组的IgG处理过的原代角质形成细胞,以及患病和对照皮肤样本 |
5502 | 2024-12-11 |
Graph-Regularized Non-Negative Matrix Factorization for Single-Cell Clustering in scRNA-Seq Data
2024-08, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3400050
PMID:38787664
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研究论文 | 本文提出了一种基于图正则化的非负矩阵分解方法(Sc-GNNMF),用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 创新点在于采用图正则化的非负矩阵分解算法(GNNMF),通过拉普拉斯核和p-最近邻图估计细胞间和基因间的稀疏相似性,并使用加权p-最近已知邻居优化单细胞RNA测序数据 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性,揭示细胞异质性的潜在机制 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图正则化非负矩阵分解(GNNMF) | 基因表达数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 |
5503 | 2024-12-11 |
Holliday junction recognition protein (HJURP) could reflect the clinical outcomes of lung adenocarcinoma patients, and impact the choice of precision therapy
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1475511
PMID:39649097
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研究论文 | 本文研究了HJURP蛋白在肺腺癌患者中的表达及其对临床结果和精准治疗选择的影响 | 首次揭示了HJURP作为肺腺癌的可靠预后生物标志物,并探讨了其在精准治疗中的潜在作用 | 研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 | 识别肺腺癌的可靠预后生物标志物和潜在治疗靶点,以改善患者预后 | HJURP蛋白在肺腺癌中的表达及其与临床结果、遗传改变、免疫细胞浸润和治疗反应的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共1507例肺腺癌患者(TCGA-LUAD: 453例,GSE31210: 226例,GSE68465: 442例,GSE72094: 386例) |
5504 | 2024-12-11 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear cell renal cell carcinoma tumor microenvironment
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.16.567457
PMID:38014063
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研究论文 | 研究探讨了免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的空间耦合增加 | 首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术,结合空间基因集富集分析和自相关分析,揭示了免疫治疗暴露的肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的高表达耦合 | 研究样本量较小,仅包括21个患者样本,可能影响结果的普适性 | 探讨免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中分子机制 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤及其微环境中的整合素和IV型胶原蛋白 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学、空间分子成像、多重免疫荧光 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 21个患者样本 |
5505 | 2024-12-11 |
Single-cell analysis of human nasal mucosal IgE antibody secreting cells reveals a newly minted phenotype
2023-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.02.008
PMID:36931600
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中的IgE抗体分泌细胞,揭示了一种新的表型 | 本文首次通过单细胞RNA测序揭示了鼻黏膜IgE抗体分泌细胞的新表型,并发现其与IgD和记忆B细胞的发育关系 | 研究样本量较小,仅包括3名患者,可能影响结果的普遍性 | 研究过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻黏膜中IgE抗体分泌细胞的表型和功能 | 过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中的IgE抗体分泌细胞 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3名过敏性真菌性鼻窦炎患者的鼻息肉样本 |
5506 | 2024-12-11 |
Pharmacologic targeting of Nedd8-activating enzyme reinvigorates T-cell responses in lymphoid neoplasia
2023-06, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-01889-x
PMID:37031300
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研究论文 | 本文研究了Nedd8激活酶(NAE)抑制剂pevonedistat在淋巴瘤中的治疗作用,特别是其对CD8 T细胞反应的重新激活 | 首次展示了NAE抑制剂pevonedistat能够直接作用于CD8 T细胞,增强其细胞毒性和细胞因子表达,并在淋巴瘤模型中延缓肿瘤进展 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型,尚未在临床试验中验证其效果 | 探讨NAE抑制剂在淋巴瘤治疗中的潜在作用及其对T细胞反应的影响 | CD8 T细胞、淋巴瘤模型、淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
5507 | 2024-12-11 |
Targeting lymphoid-derived IL-17 signaling to delay skin aging
2023-Jun, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00431-z
PMID:37291218
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研究论文 | 本文研究了皮肤老化过程中IL-17信号通路的作用,并探讨了通过靶向IL-17信号来延缓皮肤老化的可能性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了老年皮肤中T辅助细胞、γδ T细胞和先天淋巴细胞向IL-17表达表型的偏移,并证明了IL-17信号通路的阻断可以减少皮肤炎症并延缓老化特征的出现 | 研究仅在老鼠模型上进行,尚未在人类中验证其效果 | 探讨皮肤老化过程中炎症信号的作用,并寻找延缓皮肤老化的方法 | 皮肤老化过程中的IL-17信号通路及其对皮肤炎症和功能的影响 | NA | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老鼠皮肤样本 |
5508 | 2024-12-11 |
Reprogramming Müller glia to regenerate ganglion-like cells in adult mouse retina with developmental transcription factors
2022-11-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq7219
PMID:36417510
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研究论文 | 研究通过过表达特定的转录因子,在成年小鼠视网膜中重新编程Müller胶质细胞以再生类似神经节细胞的细胞 | 首次展示了通过靶向过表达发育性视网膜神经节细胞转录因子,在成年小鼠视网膜中再生类似神经节细胞的能力 | 研究仅在成年小鼠视网膜中进行,尚未在其他物种或神经系统中验证 | 探索通过转录因子调控在成年哺乳动物视网膜中再生特定类型神经元的可能性 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和神经节样细胞 | 神经科学 | NA | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、单细胞转座酶可及染色质测序和电生理学 | NA | 单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据和电生理数据 | 成年小鼠视网膜样本 |
5509 | 2024-12-11 |
Multiscale PHATE identifies multimodal signatures of COVID-19
2022-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01186-x
PMID:35228707
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Multiscale PHATE的方法,通过扫描数据的所有粒度级别来学习直接预测疾病结果的抽象生物特征 | 提出了Multiscale PHATE方法,结合扩散凝聚过程,能够在不同分辨率下分析数据拓扑结构,从而提取生物学见解 | NA | 开发一种能够处理复杂和高维数据的计算工具,以提取生物学见解 | COVID-19患者的细胞数据,包括5400万细胞来自168名住院患者 | 生物信息学 | COVID-19 | Multiscale PHATE, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单细胞转座酶可及染色质测序 (scATAC-seq) | NA | 细胞数据 | 5400万细胞来自168名住院患者 |
5510 | 2024-12-11 |
SARS-CoV-2 exacerbates proinflammatory responses in myeloid cells through C-type lectin receptors and Tweety family member 2
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.006
PMID:34048708
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2通过C型凝集素受体和Tweety家族成员2在髓系细胞中加剧促炎反应的机制 | 首次识别出SARS-CoV-2刺突蛋白的多个C型凝集素受体和TTYH2作为糖依赖性结合伙伴,并发现这些受体在髓系细胞中的表达与COVID-19严重程度相关 | 研究主要集中在髓系细胞的受体上,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探讨SARS-CoV-2如何通过特定受体在髓系细胞中引发促炎反应,并寻找潜在的治疗靶点 | SARS-CoV-2刺突蛋白与髓系细胞受体的相互作用及其引发的炎症反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的肺部细胞 |
5511 | 2024-12-10 |
Heterogeneity of mature oligodendrocytes in the central nervous system
2025-May-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00055
PMID:38934385
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研究论文 | 本文探讨了中枢神经系统中成熟少突胶质细胞的异质性 | 本文通过回顾早期研究并结合现代分子技术,揭示了成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的多样性及其在不同疾病状态下的变化 | 由于研究的时间限制,对成熟少突胶质细胞的亚分类需谨慎,未来研究需利用更先进的技术 | 研究成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的异质性及其在疾病中的变化 | 中枢神经系统中的成熟少突胶质细胞 | NA | 多发性硬化症、阿尔茨海默病、精神疾病 | 单细胞/核RNA测序 | NA | RNA | 至少六个成熟少突胶质细胞亚群 |
5512 | 2024-12-10 |
Local ablation disrupts immune evasion in pancreatic cancer
2025-Jan-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217327
PMID:39580047
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研究论文 | 研究局部消融技术在胰腺癌中打破免疫逃逸的作用 | 首次探讨了局部消融技术在胰腺癌中激活宿主免疫系统并克服免疫治疗抵抗的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本,需要进一步的临床试验验证 | 探讨局部消融技术在胰腺癌中的免疫调节作用及其与免疫治疗的协同效应 | 胰腺癌模型、人类胰腺癌样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 局部消融技术 | NA | 空间转录组学、组织学技术 | 小鼠模型、人类样本 |
5513 | 2024-12-10 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in ophthalmology]
2024-Dec-11, [Zhonghua yan ke za zhi] Chinese journal of ophthalmology
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼科领域的最新进展 | 单细胞RNA测序技术提供了研究细胞间基因表达和功能特征差异的强大工具 | 本文未提及具体的局限性 | 提供关于眼科疾病发病机制的新见解,并改进诊断和治疗策略 | 眼科疾病的发病机制和诊断治疗策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
5514 | 2024-12-10 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-Dec, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
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研究论文 | 本文讨论了单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的优势 | 利用单细胞和空间转录组学技术,能够以前所未有的细节水平研究共生相互作用 | 主要限制在于同时捕获植物和微生物转录本的技术挑战 | 探讨新型空间和单细胞转录组学技术在研究植物-微生物内共生关系中的应用 | 植物-微生物共生关系 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
5515 | 2024-12-10 |
AOPPs induces EMT and fibrosis by activating oxidative stress through ERK/p38 MAPK signaling pathway in endometriosis
2024-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100950
PMID:39241657
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研究论文 | 研究探讨了高级氧化蛋白产物(AOPPs)通过激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导子宫内膜异位症(EMs)中的上皮-间质转化(EMT)和纤维化的机制 | 首次揭示了AOPPs在EMs中通过氧化应激激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导EMT和纤维化的机制 | 研究主要基于临床样本、单细胞测序和体内外模型,缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨AOPPs在子宫内膜异位症中诱导EMT和纤维化的分子机制 | 子宫内膜异位症(EMs)中的上皮-间质转化(EMT)和纤维化 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 使用正常大鼠进行慢性给药研究 |
5516 | 2024-12-10 |
The relationship between Sjögren's syndrome and recurrent pregnancy loss: a bioinformatics analysis
2024-Dec, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104363
PMID:39299134
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研究论文 | 研究Sjögren综合征与复发性流产之间的基因关联 | 首次揭示Sjögren综合征与复发性流产共享生物学途径,并鉴定出关键基因KCNN3 | NA | 探讨Sjögren综合征与复发性流产之间的基因关联 | Sjögren综合征和复发性流产的基因数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、limma分析、基因本体论和京都基因与基因组百科全书分析 | NA | 基因表达数据 | 从Gene Expression Omnibus数据库获取的基因数据 |
5517 | 2024-12-10 |
ATN-161 alleviates caerulein-induced pancreatitis
2024-Dec, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.002
PMID:39396744
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研究论文 | 研究显示ATN-161通过阻断Integrin-α5信号减轻caerulein诱导的急性胰腺炎病理状况 | 首次揭示了ATN-161作为Integrin-α5拮抗剂在减轻急性胰腺炎症状中的治疗潜力 | NA | 探索减轻急性胰腺炎病理状况的药物干预方法 | ATN-161对caerulein诱导的急性胰腺炎的影响 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
5518 | 2024-12-10 |
Targeting cancer-associated fibroblasts with pirfenidone: A novel approach for cancer therapy
2024-Dec, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102624
PMID:39581071
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研究论文 | 本文探讨了使用吡非尼酮靶向癌症相关成纤维细胞(CAFs)作为癌症治疗的新方法 | 本文提出了一种新的癌症治疗方法,通过吡非尼酮靶向CAFs,并结合化疗药物和纳米载体递送系统,以提高疗效和减少副作用 | 尽管吡非尼酮显示出抗肿瘤潜力,但其安全性和有效性仍需通过临床试验进一步验证 | 研究吡非尼酮在癌症治疗中的应用,特别是通过靶向CAFs来抑制癌症进展 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其在癌症进展中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA |
5519 | 2024-12-10 |
Endothelial KDM5B Regulated by Piezo1 Contributes to Disturbed Flow Induced Atherosclerotic Plaque Formation
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70237
PMID:39643939
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研究论文 | 研究了Piezo1调控的内皮细胞KDM5B在扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的作用 | 首次揭示了Piezo1通过上调KDM5B表达促进动脉粥样硬化斑块形成的机制 | 研究主要集中在细胞和动物模型上,尚未在人体中验证 | 探讨扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的表观遗传调控机制 | 内皮细胞中的KDM5B表达及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了HUVECs细胞和小鼠模型 |
5520 | 2024-12-09 |
Statistical and computational methods for enabling the clinical and translational application of spatial transcriptomics
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70119
PMID:39644148
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |