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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5501 | 2025-12-15 |
O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner
2025-May-15, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae268
PMID:39671515
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研究论文 | 本文探讨了O-GlcNAcylation稳定的WTAP通过N6-甲基腺苷依赖方式促进胶质母细胞瘤恶性进展的机制 | 揭示了WTAP通过O-GlcNAcylation和去泛素化增强稳定性,调控LOXL2的m6A修饰,进而影响胶质母细胞瘤干细胞间充质转化和免疫微环境形成的新机制 | NA | 研究m6A在胶质母细胞瘤免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 间充质胶质母细胞瘤干细胞和髓源性巨噬细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、质谱分析、RNA免疫沉淀、共免疫沉淀 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5502 | 2025-12-15 |
scRegulate: Single-Cell Regulatory-Embedded Variational Inference of Transcription Factor Activity from Gene Expression
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.17.649372
PMID:40654959
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scRegulate的生成式深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性 | scRegulate通过变分推理整合基因调控网络先验知识,提供了一种可扩展且生物学可解释的解决方案,能够捕获新颖、动态和上下文特定的调控相互作用 | NA | 开发一种从单细胞RNA测序数据中准确推断转录因子活性的计算方法 | 转录因子活性和基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成式深度学习框架,变分推理 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共实验和合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5503 | 2025-12-15 |
Exploratory spatial transcriptomic profiling of peritumoral Th2 immune polarization in HPV-positive oropharyngeal cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1732480
PMID:41383514
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析,探索了HPV阳性口咽癌中肿瘤周围Th2免疫极化与淋巴转移的关系 | 首次在HPV阳性口咽癌中应用空间转录组学技术,揭示了肿瘤周围淋巴滤泡区域中Th2偏向性免疫与抑制淋巴转移的潜在关联 | 样本量较小(6例患者),属于探索性研究,需要更大规模的验证 | 阐明HPV阳性口咽癌早期淋巴转移高发但预后良好的矛盾现象背后的免疫机制 | 来自6名腭扁桃体来源口咽鳞状细胞癌患者的福尔马林固定石蜡包埋组织样本 | 空间转录组学 | 口咽癌 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 6例患者 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NA |
| 5504 | 2025-12-15 |
Epigenetic control of antigen presentation failure in osteosarcoma: from single-cell chromatin maps to therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728091
PMID:41383594
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综述 | 本文综述了骨肉瘤中抗原呈递失败的染色质调控机制,并探讨了基于单细胞染色质图谱的治疗策略 | 整合单细胞ATAC-seq与单细胞及空间转录组学,揭示HLA/NLRC5/干扰素轴的可逆性表观遗传抑制机制 | 临床疗效仍需验证,需考虑克隆选择、干扰素信号保留及联合治疗方案的优化 | 阐明骨肉瘤抗原呈递失败的表观遗传机制并开发治疗策略 | 骨肉瘤肿瘤-免疫生态系统中的恶性克隆、分化状态及免疫细胞微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 染色质可及性数据, 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5505 | 2025-12-15 |
Inflammation-driven mechanisms in endometrial cancer: pathways from inflammatory microenvironment remodeling to immune escape
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689114
PMID:41383623
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综述 | 本文综述了炎症微环境在子宫内膜癌进展中的作用,重点阐述了其促进免疫逃逸和治疗抵抗的机制,并探讨了潜在的干预策略 | 系统性地阐述了子宫内膜癌中炎症微环境重塑到免疫逃逸的完整通路,并强调了单细胞分析和空间转录组学等新技术在揭示可操作分子模式和开发个体化策略方面的潜力 | 文中提到的肿瘤内异质性、动态变化的免疫环境以及缺乏可靠的生物标志物等仍是重大挑战 | 阐明炎症微环境在子宫内膜癌免疫逃逸和治疗抵抗中的作用机制,并探索新的治疗干预靶点 | 子宫内膜癌 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞分析,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5506 | 2025-12-15 |
Single-cell transcriptomics identifies FOSL1-regulated IGFBP3+ melanoma subtype as a neuro-immunoregulatory signaling hub facilitating tumor progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662869
PMID:41383633
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,识别出FOSL1调控的IGFBP3+黑色素瘤亚型,该亚型作为神经免疫调节信号枢纽促进肿瘤进展 | 首次将IGFBP3+黑色素瘤亚型与FOSL1转录因子关联,并揭示其作为神经免疫相互作用枢纽在肿瘤微环境中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据,实验验证仅限于体外细胞系模型,缺乏体内动物模型验证 | 揭示黑色素瘤的细胞异质性,识别分子靶点和促肿瘤亚型 | 黑色素瘤细胞及其肿瘤微环境中的其他细胞类型 | 单细胞转录组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Harmony, PySCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的黑色素瘤单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5507 | 2025-12-15 |
Macrophage migration inhibitory factor-CD74 axis drives vascular smooth muscle cell-induced M1 macrophage polarization to exacerbate intracranial aneurysm inflammation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1682762
PMID:41383630
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了颅内动脉瘤中分泌型血管平滑肌细胞通过MIF-CD74轴驱动巨噬细胞M1极化,加剧炎症的新机制 | 首次提供了颅内动脉瘤的单细胞图谱,并发现sVSMC来源的MIF-CD74轴是驱动巨噬细胞M1极化和动脉瘤炎症的新机制 | 研究主要基于转录组和体外实验,体内功能验证和临床转化潜力需进一步探索 | 阐明巨噬细胞迁移抑制因子在颅内动脉瘤炎症中的作用机制 | 颅内动脉瘤组织、正常动脉组织、分泌型血管平滑肌细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、甲基化测序、转录组分析、体外功能实验 | NA | RNA测序数据、甲基化数据、单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,涉及IA和正常动脉组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5508 | 2025-12-15 |
Succinylation heterogeneity in lung adenocarcinoma: from prognostic model to KLK6-driven tumor microenvironment remodeling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1718994
PMID:41383634
|
研究论文 | 本研究描绘了肺腺癌中琥珀酰化的全景图,构建了一个基于琥珀酰化的新型预后模型,并发现KLK6是肿瘤进展和免疫抑制的潜在驱动因子 | 首次在肺腺癌中系统描绘了蛋白质琥珀酰化的全景图及其临床意义,构建了基于7个基因的琥珀酰化预后特征,并利用单细胞和空间转录组学揭示了KLK6通过重塑肿瘤微环境促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,部分机制结论(如KLK6驱动成纤维细胞分化)仍需更多体内实验验证,临床转化潜力有待前瞻性研究评估 | 探索肺腺癌中蛋白质琥珀酰化的全景图、临床预后价值及其对肿瘤微环境的影响,并寻找潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者(来自TCGA和GEO数据库的多个队列)、肺腺癌细胞系 | 生物信息学与计算生物学 | 肺癌 | 多组学整合分析、差异表达分析、Cox回归、PCA、LASSO、单细胞RNA测序、空间转录组学、hdWGCNA、体外细胞实验 | 预后风险模型(基于LASSO和Cox回归) | 基因组、转录组、临床数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | TCGA队列及7个独立的GEO验证队列(具体样本数未在摘要中明确给出) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5509 | 2025-12-15 |
RNA interference shapes stress responses in Arabidopsis thaliana
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1699198
PMID:41383942
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综述 | 本文综述了RNA干扰在拟南芥应激响应中的调控机制,整合了系统性信号传递、应激响应RNAi机制及AGO蛋白多样性的最新进展 | 将系统性sRNA信号传递、应激响应RNAi机制和AGO蛋白多样性整合为一个连贯框架,用于理解RNAi驱动的应激适应 | NA | 理解RNA干扰在植物应激响应中的调控作用与机制 | 拟南芥中的小RNA(包括miRNA和siRNA)及ARGONAUTE蛋白 | 自然语言处理 | NA | 高分辨率sRNA测序、单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 5510 | 2025-12-15 |
Single-cell transcriptome analysis reveals elongation and ossification characteristics of antlers
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1658210
PMID:41383963
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了梅花鹿鹿角尖端的间充质和软骨组织,揭示了鹿角快速伸长和骨化的细胞分化轨迹 | 首次在单细胞分辨率下解析了鹿角尖端间充质和软骨组织的分化轨迹,并鉴定出一种具有多种细胞特征的新型过渡细胞 | 研究仅基于一只5岁健康雄性梅花鹿的样本,样本量较小,且未涉及不同发育阶段或不同个体的比较 | 阐明鹿角快速伸长和骨化过程中的细胞分化机制 | 梅花鹿鹿角尖端的间充质和软骨组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一只5岁健康雄性梅花鹿的鹿角尖端组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5511 | 2025-12-14 |
Fibroblast diversity within human gut-associated lymphoid tissues
2026-Mar-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250471
PMID:41379085
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,绘制了人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性图谱 | 首次识别CD24作为区分GALT成纤维细胞的标记物,并揭示了不同GALT亚型中成纤维细胞的功能差异 | 研究主要基于观察性数据,功能验证实验相对有限 | 探索人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性和功能 | 人类肠道相关淋巴组织(包括Peyer斑块、黏膜孤立淋巴滤泡和黏膜下孤立淋巴滤泡)中的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,共聚焦激光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5512 | 2025-12-14 |
PD-1+/CXCR6+CD8+T lymphocytes promote MASLD malignant progression through inflammatory and immune dysregulation
2026-Jan-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115847
PMID:41253047
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研究论文 | 本研究探讨了PD-1+/CXCR6+ CD8+ T淋巴细胞通过炎症和免疫失调促进代谢功能障碍相关脂肪性肝病恶性进展的机制 | 揭示了在MASLD向HCC进展过程中,CD8 T细胞亚群(特别是PD-1+和CXCR6+亚群)的动态变化及其通过促进炎症和免疫失调驱动恶性转化的新机制 | 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析,具体的分子机制和因果关系的深入验证有待进一步研究 | 阐明CD8 T细胞在MASLD向HCC恶性进展中的作用机制 | MASLD模型小鼠、MASLD/HCC患者的临床样本 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、单细胞测序 | NA | 流式细胞数据、单细胞测序数据、临床生化数据 | 动物模型(HFD和HFD/HCC组小鼠)及MASLD/HCC患者临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5513 | 2025-12-14 |
Breakthroughs of ultrasound-targeted microbubble destruction in treating myocardial ischemia-reperfusion injury: from angiogenesis regulation to precise inflammation suppression
2025-Dec-31, Drug delivery
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/10717544.2025.2594555
PMID:41369269
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综述 | 本文综述了超声靶向微泡破坏技术在治疗心肌缺血再灌注损伤中的最新进展,涵盖从血管生成调控到精准炎症抑制等多个方面 | 系统总结了UTMD技术通过调控HIF-1α/VEGF通路促进血管生成、抑制NLRP3炎症小体激活以减轻炎症反应的双重作用机制,并强调了结合放射组学、人工智能及多组学技术(如单细胞RNA测序)实现精准诊断与治疗的新策略 | 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体临床研究结果,主要基于现有文献进行总结与展望 | 探讨超声靶向微泡破坏技术治疗心肌缺血再灌注损伤的机制、应用及未来研究方向 | 心肌缺血再灌注损伤及其相关的分子通路、细胞过程与治疗策略 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 超声靶向微泡破坏、单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、放射组学、人工智能图像分析 | NA | 多组学数据、医学影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5514 | 2025-12-14 |
Ovarian somatic tissue rejuvenates circulating apolipoproteins and promotes cognitive health in postreproductive female mice
2025-Dec-13, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-02019-4
PMID:41388182
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研究论文 | 本研究通过移植年轻卵巢体细胞组织或细胞,探索了其在改善老年雌性小鼠认知功能和脂质信号方面的作用 | 首次利用单细胞转录组学和拉曼光谱技术,识别出两种卵巢体细胞类型,这些细胞通过脂质信号通路恢复老年雌性小鼠的健康状态 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证,且具体分子机制需进一步阐明 | 探究年轻卵巢体细胞组织或细胞移植对老年雌性小鼠健康,特别是认知功能和脂质信号的影响 | 老年、生殖后雌性小鼠及其血清、组织样本 | 生物医学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学,拉曼光谱 | NA | 转录组数据,光谱数据,生理数据 | 老年雌性小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5515 | 2025-12-14 |
Uncovering the toxicological impact of benzo[a]pyrene on Alzheimer's disease via network toxicology, machine learning, and single-cell transcriptomics
2025-Dec-12, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251405468
PMID:41384939
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研究论文 | 本研究整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,探索苯并[a]芘在阿尔茨海默病中的分子机制 | 首次整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,系统揭示环境神经毒物苯并[a]芘通过靶向EGFR和HSP90AB1促进阿尔茨海默病发展的分子机制,并发现EGFR作为潜在生物标志物的诊断价值 | 研究主要基于生物信息学分析和公开数据集,缺乏体内或体外实验验证;单细胞数据仅来源于一个数据集(GSE157827),样本代表性可能有限 | 探索环境神经毒物苯并[a]芘在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 苯并[a]芘与阿尔茨海默病的共同靶点基因及其分子机制 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq,分子对接 | LASSO,SVM | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 使用了GEO数据库的AD差异表达数据和单细胞RNA-seq数据集(GSE157827),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5516 | 2025-12-14 |
Heterogeneity of the intestinal mononuclear phagocyte compartment in health and inflammatory bowel disease
2025-Dec-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adz8650
PMID:41385609
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,探索了人类肠道单核吞噬细胞在健康和克罗恩病中的异质性 | 发现了具有DC3转录特征的CD1c cDC亚群,并揭示了肠道cDC2s/DC3s在克罗恩病中增加且来源于特定前体细胞 | 研究主要关注回肠和结肠,未全面覆盖其他肠道区域或更广泛的炎症性肠病类型 | 探究人类肠道单核吞噬细胞多样性及其在炎症状态下的变化 | 人类回肠和结肠固有层中的单核吞噬细胞 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 细胞转录组和表位索引测序, 流式细胞术, 成像技术 | NA | 单细胞转录组数据, 表位数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5517 | 2025-12-14 |
Lifestyle shapes preclinical social and microglial deficits in an Alzheimer's disease mouse model
2025-Dec-12, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03368-4
PMID:41388145
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研究论文 | 本研究利用App敲入小鼠模型,探索生活方式干预如何影响阿尔茨海默病临床前阶段的社会行为、小胶质细胞功能及免疫反应 | 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中,通过连续追踪至7月龄,结合单细胞RNA测序技术,揭示了临床前阶段社会行为缺陷与小胶质细胞免疫监视功能受损的早期关联,并发现环境富集可调节干扰素反应性小胶质细胞 | 研究基于还原论的小鼠模型,可能无法完全模拟人类阿尔茨海默病的复杂性;样本量未明确说明;结果主要聚焦于临床前阶段,未延伸至疾病晚期表现 | 探究生活方式因素(通过环境富集模拟)对阿尔茨海默病临床前阶段行为、神经可塑性和免疫系统的影响 | App敲入小鼠(阿尔茨海默病模型小鼠) | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、血浆分析、行为追踪 | NA | 基因表达数据、行为数据、血浆生物标志物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5518 | 2025-12-14 |
Tumor-stromal crosstalk and macrophage enrichment are associated with chemotherapy response in bladder cancer
2025-Dec-12, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70179
PMID:41388608
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研究论文 | 本研究通过功能性离体膀胱癌组织切片模型结合空间转录组学,揭示了肿瘤-基质相互作用和巨噬细胞富集与膀胱癌化疗反应的关系 | 首次使用功能性离体膀胱癌组织切片模型结合空间转录组学分析,发现SPP1基因作为潜在预测生物标志物,并揭示了巨噬细胞招募在化疗耐药中的新机制 | 样本量相对较小(n=64),且为离体模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究肿瘤-基质相互作用和巨噬细胞招募在膀胱癌化疗耐药中的作用机制 | 肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)患者组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 64个空间转录组样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5519 | 2025-12-14 |
Systemic immune activity occurs during human immune system maturation
2025-Dec-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.10.003
PMID:41161316
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析了321个样本中2,868,420个免疫细胞,揭示了人类免疫系统在妊娠中期成熟过程中的系统性免疫活动 | 发现了胸腺外CD4 T细胞亚群介导TOX2前体细胞向成熟初始CD4 T细胞的转变,挑战了胎儿免疫静默的现有范式,揭示了跨器官共享的记忆/活化T细胞和驻留记忆克隆,并识别了两种抑制胎儿T细胞活化的耐受机制 | NA | 探究人类免疫系统在妊娠中期的成熟过程和耐受机制 | 人类胎儿和成人组织中的免疫细胞,包括23个器官的样本 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, T细胞受体测序数据 | 321个样本,涵盖23个器官,包括成人组织作为对照 | NA | 单细胞RNA-seq, T细胞受体测序 | NA | NA |
| 5520 | 2025-12-14 |
RoCK and ROI: single-cell transcriptomics with multiplexed enrichment of selected transcripts and region-specific sequencing
2025-Dec-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66248-z
PMID:41372142
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RoCK和ROI的单细胞转录组测序工作流程,通过靶向捕获和选择性引物技术增强关键转录本和特定区域的检测 | 开发了RoCKseq和ROIseq两种技术,能够在单细胞转录组测序中富集关键转录本并定向测序特定区域,同时不损害整体转录组信息 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 提高单细胞转录组测序中特定转录本和转录区域的检测率,以更好地理解细胞生物学 | 单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),靶向捕获,选择性引物 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |