单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5441 - 5460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5441 | 2025-06-17 |
Data-informed insights into sex differences in peripheral blood mononuclear cells from single-cell transcriptomics
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101525
PMID:40520998
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5442 | 2025-06-17 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals epithelial cell alterations in benign prostatic hyperplasia following finasteride treatment
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101526
PMID:40520997
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5443 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and machine learning reveal the role of dioxin-interacting genes in HCC prognosis and immune microenvironment
2025-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118484
PMID:40483782
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研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习揭示二噁英相互作用基因在肝细胞癌预后和免疫微环境中的作用 | 首次结合单细胞和批量转录组分析识别二噁英相互作用差异表达基因，并建立预后模型 | 未提及样本量限制或验证队列的详细信息 | 探究二噁英在肝细胞癌发展中的分子机制及预后评估 | 肝细胞癌患者样本和体外细胞实验 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 批量转录组分析, 机器学习, 分子对接, 体外实验 | 预后风险模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5444 | 2025-10-06 |
Plaque erosion risk and JAK2 V617F variant
2025-Jun-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf114
PMID:40053703
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研究论文 | 本研究探讨JAK2 V617F突变与斑块侵蚀风险之间的关联及其潜在机制 | 首次明确JAK2 V617F突变与心肌梗死特定机制——斑块侵蚀的强相关性，并通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞活化在其中的作用机制 | 病例对照研究设计无法确定因果关系，样本来源单一 | 探究JAK2 V617F突变与心肌梗死不同机制（斑块侵蚀vs斑块破裂）的关联性 | 728例斑块侵蚀患者、919例斑块破裂患者和804例对照个体 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 数字滴液PCR, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归分析 | 基因测序数据, 临床数据 | 2451例（728侵蚀+919破裂+804对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5445 | 2025-10-06 |
Identification of potential drug targets for erectile dysfunction with single-cell RNA sequencing: A Mendelian randomization study
2025-Jun-15, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70082
PMID:40518741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法识别勃起功能障碍的潜在药物靶点 | 首次结合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术系统识别ED治疗靶点 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别勃起功能障碍的新型治疗靶点 | 勃起功能障碍患者和相关细胞类型 | 生物信息学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据, 基因组数据 | eQTLGen联盟31,684人；ED研究229,980人（6,175病例）和95,178人（1,154病例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集GSE206528 |
| 5446 | 2025-10-06 |
Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis
2025-Jun, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05216-1
PMID:40131629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学数据分析，探讨了乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的作用并构建诊断模型 | 首次将乳酸化修饰与PMOP发病机制联系起来，结合单细胞测序、孟德尔随机化分析和多种机器学习算法构建诊断模型 | 研究样本量有限，需要更大规模的数据验证模型的泛化能力 | 探索乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症发病机制中的作用并开发诊断标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的单细胞RNA测序数据和转录组数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化分析 | 多种机器学习算法组合 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5447 | 2025-10-06 |
Longitudinal single-cell analysis reveals RUNX1T1 as an early driver in treatment-induced neuroendocrine transdifferentiation
2025-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653660
PMID:40463134
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研究论文 | 通过纵向单细胞转录组测序揭示RUNX1T1是治疗诱导神经内分泌转分化的早期驱动因子 | 首次发现t-NEPC发展过程中的早期中间过渡细胞状态，并鉴定RUNX1T1作为NEPC转分化的关键转录调节因子 | 研究基于单一PDX模型（LTL331/331R），需要更多模型验证 | 探究治疗诱导神经内分泌前列腺癌的时序动态和分子驱动机制 | 前列腺癌患者来源异种移植模型（PDX） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7个时间点的纵向样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5448 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics highlights B cells as key contributors to a complete and durable response to chemo-immunotherapy in a patient with resectable NSCLC
2025-May-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011563
PMID:40350207
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研究论文 | 通过空间转录组学等多组学技术分析一例可切除NSCLC患者对化疗免疫治疗的完全病理反应机制 | 首次通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和血清蛋白质组学揭示B淋巴细胞在介导肿瘤完全消退中的关键作用 | 单病例研究，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索可切除非小细胞肺癌患者对化疗免疫治疗产生完全病理反应的免疫机制 | 一例ALK/EGFR野生型可切除NSCLC伴同步脑转移患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 1例患者（治疗前脑转移灶和治疗后原发肺肿瘤组织） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 5449 | 2025-10-06 |
Hepatic stellate cell heterogeneity: Functional aspects and therapeutic implications
2025-May-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001386
PMID:40338161
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综述 | 本文综述了肝星状细胞在健康和疾病状态下的异质性及其功能作用 | 整合单细胞测序和空间转录组学等多组学数据，系统阐述肝星状细胞亚群及其在肝脏稳态和疾病中的双向通讯机制 | NA | 探讨肝星状细胞异质性对肝脏稳态和疾病的贡献及其治疗靶向潜力 | 肝星状细胞及其与肝细胞、内皮细胞、巨噬细胞/单核细胞、T细胞和肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 临床前数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5450 | 2025-10-06 |
Revolutionizing cancer treatment: Navigating the intricate landscape of cellular signaling networks
2025-May, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/205024
PMID:40418208
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征稿启事 | 探讨癌症治疗中细胞信号网络的可塑性及其对治疗抵抗的影响，并征集相关前沿研究 | 整合单细胞多组学、空间转录组学和人工智能网络建模等创新技术解析肿瘤适应性机制 | NA | 解析癌症信号网络的动态重编程机制并开发适应性疗法 | 肿瘤细胞、非编码基因组、肿瘤微环境 | 系统生物学 | 癌症 | 单细胞多组学、空间转录组学、AI网络建模 | 人工智能网络模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5451 | 2025-10-06 |
Single-cell chromatin accessibility landscape profiling reveals the diversity of epigenetic regulation in the rat nervous system
2025-Jan-24, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-04432-y
PMID:39856121
|
研究论文 | 通过单细胞ATAC-seq技术构建大鼠神经系统染色质可及性图谱，揭示表观遗传调控的多样性 | 首次在大鼠16个脑区生成大规模单细胞染色质可及性图谱，整合scATAC-seq和snRNA-seq数据构建基因调控网络 | 研究仅针对成年大鼠，未涵盖发育过程或其他物种 | 解析哺乳动物神经系统的分子结构和表观遗传调控机制 | 成年大鼠16个脑区的174,593个高质量细胞核 | 表观遗传学 | 神经系统疾病 | 单细胞ATAC-seq, 单核RNA-seq | 基因调控网络(GRN) | 表观基因组数据, 转录组数据 | 174,593个高质量细胞核来自16个成年大鼠脑区 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 5452 | 2025-10-06 |
Integration of scHi-C and scRNA-seq data defines distinct 3D-regulated and biological-context dependent cell subpopulations
2024-09-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52440-0
PMID:39333113
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研究论文 | 开发了一种整合scHi-C和scRNA-seq数据的计算方法，用于定义3D染色质结构调控的细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下整合3D染色质结构和基因表达数据，提出了拓扑整合亚群(TISPs)的新概念 | 方法主要在乳腺癌细胞模型系统中验证，需要进一步在其他癌症类型中测试 | 研究3D染色质结构如何调控细胞异质性，特别是在癌症发展中的作用 | 乳腺癌细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scHi-C, scRNA-seq, 多组学数据整合 | MUDI算法 | 单细胞3D基因组数据, 单细胞转录组数据 | 公开数据和新生成数据，包含20个TISPs | NA | 单细胞Hi-C, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5453 | 2025-10-06 |
Single Cell Expression Analysis of Ductal Carcinoma in Situ Identifies Complex Genotypic-Phenotypic Relationships Altering Epithelial Composition
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.10.561724
PMID:39386437
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺导管原位癌，揭示基因型与表型关系的复杂性及其对上皮细胞组成的影响 | 首次在DCIS中结合单细胞RNA测序和推断的拷贝数变异进行系统发育分析，揭示肿瘤内克隆异质性与基因表达差异的关联 | 样本量相对有限，且主要基于回顾性档案样本分析 | 探索DCIS生长机制及向浸润性癌进展的关键特性 | 乳腺导管原位癌病变及匹配的正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异推断, 系统发育分析, 反卷积分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | DCIS病变和匹配正常组织的临床标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5454 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals a myeloid cell-related regulon predicting neoadjuvant immunotherapy response across cancers
2024-05-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05123-9
PMID:38773508
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，发现与髓系细胞相关的PPARG调控子可预测多种癌症中新辅助免疫治疗的应答 | 首次发现PPARG调控子作为免疫检查点抑制剂应答的预测标志物，并构建了髓系细胞图谱和在线资源平台 | 样本量有限，主要基于公共数据集验证 | 探索免疫治疗应答机制并开发预测生物标志物 | 肺癌、结直肠癌、乳腺癌等多种癌症患者 | 生物信息学 | 肺癌、结直肠癌、乳腺癌等多种癌症 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 | pySCENIC、Symphony参考映射 | 基因表达数据、单细胞数据、转录组数据 | 1例治疗前和1例治疗后达到病理完全缓解的肺腺癌患者，多个公共数据集（TCGA泛癌队列、5个ICI转录组队列等） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5455 | 2025-10-06 |
Human surface ectoderm and amniotic ectoderm are sequentially specified according to cellular density
2024-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7748
PMID:38427729
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研究论文 | 本研究开发了人类多能干细胞模型，揭示了羊膜外胚层和表面外胚层根据细胞密度顺序分化的机制 | 首次提出人类羊膜外胚层和表面外胚层沿着共同的非神经外胚层轨迹基于细胞密度进行分化的新机制 | 研究基于体外干细胞模型，可能与体内实际发育过程存在差异 | 研究人类羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 | 人类多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5456 | 2025-10-06 |
Integration of scHi-C and scRNA-seq data defines distinct 3D-regulated and biological-context dependent cell subpopulations
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.29.560193
PMID:37873257
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研究论文 | 开发了一种整合scHi-C和scRNA-seq数据的计算方法，用于定义3D染色质结构调控的细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下整合3D染色质结构和基因表达数据，提出了拓扑整合亚群(TISPs)的新概念 | 研究主要基于乳腺癌细胞模型系统，需要在更多癌症类型中验证 | 研究3D染色质结构如何调控细胞异质性和生物学功能 | 乳腺癌细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scHi-C, scRNA-seq | MUDI算法 | 单细胞3D基因组数据, 单细胞转录组数据 | 公开数据和新生成的scHi-C及scRNA-seq数据 | NA | 单细胞Hi-C, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5457 | 2025-10-06 |
Mechanism of Dihydroartemisinin in activating macrophages to enhance host resistance to malaria
2025-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156913
PMID:40450979
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研究论文 | 本研究揭示了双氢青蒿素通过激活NLRP12促进巨噬细胞向M1表型极化的分子机制 | 首次发现双氢青蒿素通过上调NLRP12表达促进巨噬细胞M1极化，并鉴定出Lcn2高表达M1巨噬细胞新亚群 | 研究主要基于小鼠巨噬细胞系和动物模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明双氢青蒿素激活巨噬细胞增强宿主抗疟疾抵抗力的分子机制 | 小鼠巨噬细胞系RAW 264.7和小鼠原代巨噬细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 基因敲低 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 小鼠巨噬细胞系和原代巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学 | NA | NA |
| 5458 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape Deciphers Intratumoral Heterogeneity and Subtypes of Acral and Mucosal Melanomas
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3164
PMID:40192737
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肢端黑色素瘤和黏膜黑色素瘤的瘤内异质性及分子亚型 | 首次在单细胞水平系统比较肢端和黏膜黑色素瘤的肿瘤异质性，发现两种黑色素瘤具有不同的进化路径和微环境特征 | 样本量相对有限（42例），需要更大规模研究验证发现 | 解析肢端和黏膜黑色素瘤的瘤内异质性及微环境特征，为精准治疗提供依据 | 42例黑色素瘤样本（28例肢端黑色素瘤，11例黏膜黑色素瘤，3例非肢端皮肤黑色素瘤） | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，全外显子测序，体外迁移实验，共培养系统，异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据，基因组数据 | 42例黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，全外显子测序 | NA | NA |
| 5459 | 2025-10-06 |
Exploring the molecular mechanisms of lactylation-related biological functions and immune regulation in sepsis-associated acute kidney injury
2025-Jun-12, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01745-5
PMID:40504273
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索乳酸化修饰相关基因在脓毒症相关急性肾损伤中的表达模式、免疫功能及分子机制 | 首次系统研究乳酸化修饰在SA-AKI中的作用，发现PECR和TP53I3两个关键LRGs及其在肾小管细胞中的特异性表达 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探究乳酸化修饰相关基因在脓毒症相关急性肾损伤中的分子机制和免疫功能 | 脓毒症相关急性肾损伤患者样本 | 生物信息学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | Lasso回归, 随机森林, WGCNA, 共识聚类 | 基因表达数据 | GSE232404数据集中的SA-AKI样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5460 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of SELPLG as a potential immunotherapy target and prognostic biomarker in oncology
2025-Jun-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02934-0
PMID:40504320
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研究论文 | 通过生物信息学方法全面分析SELPLG作为潜在免疫治疗靶点和预后生物标志物在肿瘤学中的作用 | 首次对SELPLG进行泛癌分析，整合多组学数据揭示其在肿瘤免疫微环境中的表达模式和临床意义 | 基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量依赖于公共数据库 | 评估SELPLG作为肿瘤免疫治疗靶点和预后生物标志物的潜力 | 多种癌症类型（乳腺癌、胆管癌、食管癌、头颈癌、肾癌、胃癌、甲状腺癌等）的肿瘤组织和正常组织 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析、单细胞测序、基因集富集分析、Cox回归分析 | Cox比例风险回归模型 | mRNA表达数据、单细胞测序数据、突变数据、临床数据 | 多种癌症类型的肿瘤和正常组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞测序、bulk RNA-seq | TIMER2, Sangerbox 3.0 | 多种生物信息学分析工具整合 |