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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5421 | 2025-10-06 |
Polybacterial Intracellular Macromolecules Shape Single-Cell Epikine Profiles in Upper Airway Mucosa
2024-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617279
PMID:39416216
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了上呼吸道黏膜上皮细胞中多菌种胞内大分子(PIMs)的存在及其对细胞因子表达和药物反应的影响 | 首次在单细胞水平发现多菌种胞内大分子(PIMs)持续存在于黏膜上皮细胞中,并线性驱动效应细胞因子表达 | 研究主要关注口腔黏膜,结果在其他黏膜部位的普适性需要进一步验证 | 探究宿主-微生物相互作用在黏膜上皮细胞类型中的机制 | 人类口腔黏膜上皮细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 慢性炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 人类口腔黏膜单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5422 | 2025-10-06 |
Immune profiling-based targeting of pathogenic T cells with ustekinumab in ANCA-associated glomerulonephritis
2024-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52525-w
PMID:39300109
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组分析识别ANCA相关性肾小球肾炎中的致病性T细胞,并验证ustekinumab靶向治疗的潜力 | 首次通过空间和单细胞转录组分析揭示ANCA-GN中致病性T细胞的分子特征,并应用数字药理学方法识别ustekinumab作为潜在治疗药物 | 样本量较小(34例分析样本,4例治疗病例),随访时间较短(26周),需要更大规模的临床试验验证 | 开发针对ANCA相关性肾小球肾炎的精准免疫治疗方法 | ANCA相关性血管炎患者的肾脏组织和外周血样本 | 数字病理学 | ANCA相关性血管炎/肾小球肾炎 | 空间转录组分析,单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据,临床数据 | 34例ANCA-GN患者肾脏样本,4例复发患者接受治疗 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
5423 | 2025-10-06 |
Detecting anomalous anatomic regions in spatial transcriptomics with STANDS
2024-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52445-9
PMID:39300113
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研究论文 | 提出基于生成对抗网络的STANDS框架,用于从多样本空间转录组数据中检测和对齐异常组织区域 | 首个能够从多样本空间转录组数据中进行从头异常组织区域检测与解析的方法,整合了多模态学习、迁移学习和风格迁移技术 | 需要正常空间转录组数据集进行对比分析,但这些数据集通常稀缺 | 开发空间转录组数据分析方法,检测和解析异常组织区域 | 多样本空间转录组数据中的异常组织区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | GAN | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5424 | 2025-10-06 |
PRDM3/16 regulate chromatin accessibility required for NKX2-1 mediated alveolar epithelial differentiation and function
2024-09-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52154-3
PMID:39284798
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研究论文 | 本研究揭示了PRDM3和PRDM16通过调控染色质可及性介导NKX2-1依赖的肺泡上皮细胞分化机制 | 首次发现PRDM3/PRDM16组蛋白甲基转移酶通过调控染色质可及性影响NKX2-1转录靶点,从而介导肺泡上皮细胞分化 | 研究主要关注围产期肺泡上皮细胞分化,对其他发育阶段的影响尚未明确 | 探究PRDM3和PRDM16在肺泡上皮细胞分化和功能中的调控机制 | 小鼠肺内胚层细胞和AT2肺泡上皮细胞 | 表观遗传学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CUT&RUN | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq | NA | NA |
5425 | 2025-10-06 |
Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2024-Jun-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4559348/v1
PMID:38978578
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序监督细胞类型识别的目标导向参考构建方法 | 首次提出针对目标数据集选择和构建参考数据的方法,缓解参考数据与目标数据之间数据分布和细胞类型组成的差异 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中监督细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 模拟数据和真实数据分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5426 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Uncovers Striking Cellular Heterogeneity of Lung-Infiltrating Regulatory T Cells during Eosinophilic versus Neutrophilic Allergic Airway Inflammation
2024-Jun-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300646
PMID:38647384
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了嗜酸性粒细胞与中性粒细胞过敏性气道炎症中肺部浸润调节性T细胞的显著异质性 | 首次发现不同类型过敏性气道炎症会塑造表型不同的肺部常驻调节性T细胞,揭示了炎症信号通过组织适应机制塑造浸润Treg组成的新机制 | Treg特异性ST2缺陷不影响嗜酸性过敏性炎症的发展或肺部常驻Treg的生成,具体调控机制仍需进一步研究 | 探究不同类型过敏性气道炎症对肺部浸润调节性T细胞异质性和组织驻留特性的影响 | 小鼠肺部浸润的Foxp3+调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 过敏性气道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 嗜酸性和中性粒细胞过敏性气道炎症模型中的肺部浸润Treg细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5427 | 2025-10-06 |
Identification of epigenetic silencing of the SFRP2 gene in colorectal cancer as a clinical biomarker and molecular significance
2024-05-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05329-x
PMID:38802858
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中SFRP2基因表现遗传沉默作为临床生物标志物的潜力 | 首次在大型生物样本队列中系统评估SFRP2甲基化水平,并发现其在血液中可作为癌症分期、淋巴结侵袭和复发的预测指标 | 样本量相对有限(健康参与者110例,CRC患者85例),需要更大规模研究验证 | 研究SFRP2基因甲基化在结直肠癌中的诊断价值和临床意义 | 结直肠癌患者和健康参与者的血液、脂肪和结肠组织样本 | 分子生物学 | 结直肠癌 | qPCR, 450K DNA阵列, DNA焦磷酸测序, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 单细胞RNA测序数据 | 健康参与者110例(男48/女62),CRC患者85例(男61/女24) | Illumina | DNA甲基化阵列, 单细胞RNA测序 | 450K DNA阵列 | Illumina 450K DNA甲基化阵列 |
5428 | 2025-10-06 |
A new integrative analysis of histopathology and single cell RNA-seq reveals the CCL5 mediated T and NK cell interaction with vascular cells in idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-05-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05304-6
PMID:38797830
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研究论文 | 通过组织病理学和单细胞RNA测序的整合分析,揭示了特发性肺动脉高压中CCL5介导的T细胞和NK细胞与血管细胞的相互作用 | 首次结合组织病理学评分和多种生物信息学方法识别IPAH中的关键炎症基因,并通过单细胞RNA测序解析了CCL5介导的细胞间相互作用机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,实验验证仅限于动物模型 | 探索特发性肺动脉高压中炎症和免疫失调的分子机制 | IPAH患者肺组织、对照组肺组织、野百合碱诱导的大鼠肺动脉高压模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 差异表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 功能富集分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | IPAH患者和对照组的肺组织转录组数据(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5429 | 2025-10-06 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534017
PMID:37034704
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研究论文 | 开发了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性调控元件 | 首次将高度多重化的CRISPRa扰动与单细胞RNA测序相结合,能够同时测试增强子和启动子对邻近基因表达的调控作用 | 调控元件的CRISPRa响应性可能受到染色质景观和辅助因子的限制 | 开发识别细胞类型特异性CRISPRa响应调控元件的方法 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因编辑与单细胞分析 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 使用493个gRNAs靶向候选调控元件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5430 | 2025-10-06 |
Glutamine antagonist DRP-104 suppresses tumor growth and enhances response to checkpoint blockade in KEAP1 mutant lung cancer
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9859
PMID:38536921
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研究论文 | 本研究探讨谷氨酰胺拮抗剂DRP-104在KEAP1突变肺癌中抑制肿瘤生长并增强免疫检查点阻断疗效的作用机制 | 首次揭示DRP-104通过抑制谷氨酰胺依赖性核苷酸合成和促进抗肿瘤T细胞反应的双重机制治疗KEAP1突变肺癌 | 研究基于临床前动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对KEAP1突变肺癌的靶向治疗方法 | KEAP1突变肺癌的临床前模型 | 癌症代谢与免疫治疗 | 肺癌 | 多模态单细胞测序,离体功能实验 | NA | 单细胞测序数据,功能实验数据 | 患者来源异种移植模型和抗原性原位肺癌模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
5431 | 2025-10-06 |
Spatially resolved single-cell atlas of ascidian endostyle provides insight into the origin of vertebrate pharyngeal organs
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi9035
PMID:38552007
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研究论文 | 本研究通过构建海鞘内柱的空间分辨单细胞图谱,探索脊椎动物咽部器官的进化起源 | 首次构建海鞘内柱的空间分辨单细胞图谱,发现血淋巴区域的混合祖先结构及与脊椎动物毛细胞相似的细胞群 | 研究主要基于海鞘模型,在脊椎动物中的直接证据仍需进一步验证 | 探究脊椎动物咽部器官的进化起源 | 海鞘内柱(咽部器官) | 空间转录组学 | NA | Stereo-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
5432 | 2025-10-06 |
Multiple parallel cell lineages in the developing mammalian cerebral cortex
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn9998
PMID:38536915
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和条形码谱系追踪技术揭示了哺乳动物大脑皮层发育中存在的多平行细胞谱系 | 发现了多个顶端放射状胶质细胞类别启动平行谱系,这些平行谱系在脑回和脑沟中重复存在且在雪貂和人类中保守 | 研究未涉及小鼠模型中的类似机制,限制了跨物种比较的全面性 | 探究具有扩展生发区和折叠皮层的物种中皮质神经发生的细胞谱系机制 | 雪貂和人类大脑皮层生发区的祖细胞和神经元 | 发育生物学 | 大脑皮质畸形 | 单细胞RNA测序, 条形码谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | 雪貂和人类大脑皮层生发区单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5433 | 2025-10-06 |
Gastrulation-stage gene expression in Nipbl+/- mouse embryos foreshadows the development of syndromic birth defects
2024-03-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4239
PMID:38507484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Nipbl+/-小鼠胚胎原肠胚期的基因表达变化,揭示了Cornelia de Lange综合征出生缺陷的早期发育机制 | 首次在原肠胚期和早期心新月阶段发现Nipbl缺陷导致的胚层细胞比例异常和基因表达失调,建立了Nipbl缺陷与谱系分配错误之间的联系 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;样本数量未明确说明 | 探究Nipbl单倍体不足如何导致胚胎发育异常和出生缺陷 | 野生型和Nipbl+/-小鼠胚胎 | 发育生物学 | Cornelia de Lange综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5434 | 2025-10-06 |
Kidins220 and Aiolos promote thymic iNKT cell development by reducing TCR signals
2024-03-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj2802
PMID:38489359
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研究论文 | 本研究揭示了支架蛋白Kidins220通过调控TCR信号强度在iNKT细胞发育中的双重作用机制 | 首次发现Kidins220在iNKT细胞发育不同阶段对TCR信号具有双向调控作用,并鉴定出转录因子Aiolos是其下游效应因子 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证;具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Kidins220在iNKT细胞发育过程中的功能及其调控TCR信号的分子机制 | 小鼠胸腺iNKT细胞和常规T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 基因敲除技术 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | T细胞特异性Kidins220敲除小鼠和Aiolos敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5435 | 2025-10-06 |
Single-cell nanobiopsy enables multigenerational longitudinal transcriptomics of cancer cells
2024-03-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl0515
PMID:38446884
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研究论文 | 本研究开发了一种基于扫描离子电导显微镜的单细胞纳米活检平台,能够对单个癌细胞及其后代进行多代纵向转录组分析 | 首次实现了从单个活细胞及其后代进行多代纵向细胞质采样和转录组分析,突破了传统单细胞RNA测序需要细胞裂解的局限 | 目前仅在体外胶质母细胞瘤细胞中进行了概念验证,尚未在体内或临床样本中应用 | 开发能够追踪单个癌细胞动态转录组变化的技术平台 | 胶质母细胞瘤(GBM)脑肿瘤细胞 | 单细胞分析技术 | 脑癌 | 扫描离子电导显微镜(SICM), 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 体外培养的胶质母细胞瘤细胞,观察时间超过72小时 | NA | 单细胞RNA-seq, 纵向采样技术 | 纳米活检平台 | 基于扫描离子电导显微镜(SICM)的纳米活检平台,支持外源分子注射和多代纵向细胞质采样 |
5436 | 2025-10-06 |
ACC1-mediated fatty acid biosynthesis intrinsically controls thymic iNKT cell development
2024-02-21, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad049
PMID:38041796
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研究论文 | 本研究揭示了乙酰辅酶A羧化酶1通过调控细胞存活在胸腺恒定自然杀伤T细胞发育中的关键作用 | 首次发现ACC1介导的脂肪酸生物合成通路对胸腺iNKT细胞发育具有内在调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类iNKT细胞发育的代谢调控机制尚需验证 | 探究代谢通路在iNKT细胞发育过程中的调控机制 | 小鼠胸腺iNKT细胞 | 免疫代谢学 | NA | 单细胞RNA测序,骨髓嵌合体实验 | NA | 基因表达数据 | T细胞特异性ACC1敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5437 | 2025-10-06 |
Techniques for Rapidly Sampling Six Crucial Organs in Adult Xenopus
2024-02-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66489
PMID:38436453
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研究论文 | 本文介绍了成年非洲爪蟾六个关键器官的快速采样技术 | 首次系统性地建立了成年非洲爪蟾器官识别和解剖的标准化方法,满足现代定量蛋白质组学和单细胞转录组学的研究需求 | 仅针对六种特定器官,未涵盖所有器官系统;方法主要适用于成年阶段 | 建立标准化的器官识别和解剖技术,促进多实验室对成年器官系统的研究 | 成年非洲爪蟾的心脏心室、肝脏、脂肪体、胰腺、成对肾脏和皮肤 | 发育生物学 | NA | 器官解剖、组织采样、定量蛋白质组学、单细胞转录组学、原位杂交、免疫组织化学、组织学 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 定量蛋白质组学 | NA | NA |
5438 | 2025-10-06 |
Identification of immune-related gene signatures for chronic obstructive pulmonary disease with metabolic syndrome: evidence from integrated bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-01-29, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad043
PMID:37878760
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研究论文 | 通过整合批量和单细胞RNA测序数据识别慢性阻塞性肺疾病合并代谢综合征的免疫相关基因标志物 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别出13个COPD与MetS共有的免疫相关枢纽基因,并发现肺泡巨噬细胞中活性氧的潜在关键作用 | 研究基于公共数据集,需要进一步实验验证枢纽基因的功能机制 | 识别慢性阻塞性肺疾病合并代谢综合征的共享免疫相关生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病和代谢综合征患者 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 | WGCNA, 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
5439 | 2025-10-06 |
Utilization of donor CLL-1 CAR-T cells for the treatment of relapsed of acute myeloid leukemia following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491341
PMID:39896798
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研究论文 | 评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的疗效和安全性 | 首次在临床试验中评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗移植后复发AML的疗效,并使用单细胞RNA测序分析CAR-T细胞动态 | 样本量较小(仅12例患者),缺乏对照组 | 评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗移植后复发AML的疗效和安全性 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病患者 | 细胞治疗 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞治疗 | NA | 临床数据,单细胞测序数据 | 14例入组患者,12例完成治疗 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5440 | 2025-10-06 |
Advances in epigenetic studies of plant cadmium stress
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1489155
PMID:40520647
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综述 | 本文综述了植物对镉胁迫的表观遗传响应机制研究进展 | 整合基因组学、单细胞测序和空间转录组学等先进技术研究植物镉胁迫表观遗传机制 | NA | 为分析主要作物重金属胁迫的表观遗传机制提供理论见解 | 植物 | 植物表观遗传学 | NA | 基因组学, 单细胞测序, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |