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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5421 | 2025-10-06 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534017
PMID:37034704
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研究论文 | 开发了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性调控元件 | 首次将高度多重化的CRISPRa扰动与单细胞RNA测序相结合,能够同时测试增强子和启动子对邻近基因表达的调控作用 | 调控元件的CRISPRa响应性可能受到染色质景观和辅助因子的限制 | 开发识别细胞类型特异性CRISPRa响应调控元件的方法 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因编辑与单细胞分析 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 使用493个gRNAs靶向候选调控元件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5422 | 2025-10-06 |
Glutamine antagonist DRP-104 suppresses tumor growth and enhances response to checkpoint blockade in KEAP1 mutant lung cancer
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9859
PMID:38536921
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研究论文 | 本研究探讨谷氨酰胺拮抗剂DRP-104在KEAP1突变肺癌中抑制肿瘤生长并增强免疫检查点阻断疗效的作用机制 | 首次揭示DRP-104通过抑制谷氨酰胺依赖性核苷酸合成和促进抗肿瘤T细胞反应的双重机制治疗KEAP1突变肺癌 | 研究基于临床前动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对KEAP1突变肺癌的靶向治疗方法 | KEAP1突变肺癌的临床前模型 | 癌症代谢与免疫治疗 | 肺癌 | 多模态单细胞测序,离体功能实验 | NA | 单细胞测序数据,功能实验数据 | 患者来源异种移植模型和抗原性原位肺癌模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
5423 | 2025-10-06 |
Spatially resolved single-cell atlas of ascidian endostyle provides insight into the origin of vertebrate pharyngeal organs
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi9035
PMID:38552007
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研究论文 | 本研究通过构建海鞘内柱的空间分辨单细胞图谱,探索脊椎动物咽部器官的进化起源 | 首次构建海鞘内柱的空间分辨单细胞图谱,发现血淋巴区域的混合祖先结构及与脊椎动物毛细胞相似的细胞群 | 研究主要基于海鞘模型,在脊椎动物中的直接证据仍需进一步验证 | 探究脊椎动物咽部器官的进化起源 | 海鞘内柱(咽部器官) | 空间转录组学 | NA | Stereo-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
5424 | 2025-10-06 |
Multiple parallel cell lineages in the developing mammalian cerebral cortex
2024-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn9998
PMID:38536915
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和条形码谱系追踪技术揭示了哺乳动物大脑皮层发育中存在的多平行细胞谱系 | 发现了多个顶端放射状胶质细胞类别启动平行谱系,这些平行谱系在脑回和脑沟中重复存在且在雪貂和人类中保守 | 研究未涉及小鼠模型中的类似机制,限制了跨物种比较的全面性 | 探究具有扩展生发区和折叠皮层的物种中皮质神经发生的细胞谱系机制 | 雪貂和人类大脑皮层生发区的祖细胞和神经元 | 发育生物学 | 大脑皮质畸形 | 单细胞RNA测序, 条形码谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | 雪貂和人类大脑皮层生发区单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5425 | 2025-10-06 |
Gastrulation-stage gene expression in Nipbl+/- mouse embryos foreshadows the development of syndromic birth defects
2024-03-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4239
PMID:38507484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Nipbl+/-小鼠胚胎原肠胚期的基因表达变化,揭示了Cornelia de Lange综合征出生缺陷的早期发育机制 | 首次在原肠胚期和早期心新月阶段发现Nipbl缺陷导致的胚层细胞比例异常和基因表达失调,建立了Nipbl缺陷与谱系分配错误之间的联系 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;样本数量未明确说明 | 探究Nipbl单倍体不足如何导致胚胎发育异常和出生缺陷 | 野生型和Nipbl+/-小鼠胚胎 | 发育生物学 | Cornelia de Lange综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5426 | 2025-10-06 |
Kidins220 and Aiolos promote thymic iNKT cell development by reducing TCR signals
2024-03-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj2802
PMID:38489359
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研究论文 | 本研究揭示了支架蛋白Kidins220通过调控TCR信号强度在iNKT细胞发育中的双重作用机制 | 首次发现Kidins220在iNKT细胞发育不同阶段对TCR信号具有双向调控作用,并鉴定出转录因子Aiolos是其下游效应因子 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证;具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Kidins220在iNKT细胞发育过程中的功能及其调控TCR信号的分子机制 | 小鼠胸腺iNKT细胞和常规T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 基因敲除技术 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | T细胞特异性Kidins220敲除小鼠和Aiolos敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5427 | 2025-10-06 |
Single-cell nanobiopsy enables multigenerational longitudinal transcriptomics of cancer cells
2024-03-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl0515
PMID:38446884
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研究论文 | 本研究开发了一种基于扫描离子电导显微镜的单细胞纳米活检平台,能够对单个癌细胞及其后代进行多代纵向转录组分析 | 首次实现了从单个活细胞及其后代进行多代纵向细胞质采样和转录组分析,突破了传统单细胞RNA测序需要细胞裂解的局限 | 目前仅在体外胶质母细胞瘤细胞中进行了概念验证,尚未在体内或临床样本中应用 | 开发能够追踪单个癌细胞动态转录组变化的技术平台 | 胶质母细胞瘤(GBM)脑肿瘤细胞 | 单细胞分析技术 | 脑癌 | 扫描离子电导显微镜(SICM), 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 体外培养的胶质母细胞瘤细胞,观察时间超过72小时 | NA | 单细胞RNA-seq, 纵向采样技术 | 纳米活检平台 | 基于扫描离子电导显微镜(SICM)的纳米活检平台,支持外源分子注射和多代纵向细胞质采样 |
5428 | 2025-10-06 |
ACC1-mediated fatty acid biosynthesis intrinsically controls thymic iNKT cell development
2024-02-21, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad049
PMID:38041796
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研究论文 | 本研究揭示了乙酰辅酶A羧化酶1通过调控细胞存活在胸腺恒定自然杀伤T细胞发育中的关键作用 | 首次发现ACC1介导的脂肪酸生物合成通路对胸腺iNKT细胞发育具有内在调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类iNKT细胞发育的代谢调控机制尚需验证 | 探究代谢通路在iNKT细胞发育过程中的调控机制 | 小鼠胸腺iNKT细胞 | 免疫代谢学 | NA | 单细胞RNA测序,骨髓嵌合体实验 | NA | 基因表达数据 | T细胞特异性ACC1敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5429 | 2025-10-06 |
Techniques for Rapidly Sampling Six Crucial Organs in Adult Xenopus
2024-02-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66489
PMID:38436453
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研究论文 | 本文介绍了成年非洲爪蟾六个关键器官的快速采样技术 | 首次系统性地建立了成年非洲爪蟾器官识别和解剖的标准化方法,满足现代定量蛋白质组学和单细胞转录组学的研究需求 | 仅针对六种特定器官,未涵盖所有器官系统;方法主要适用于成年阶段 | 建立标准化的器官识别和解剖技术,促进多实验室对成年器官系统的研究 | 成年非洲爪蟾的心脏心室、肝脏、脂肪体、胰腺、成对肾脏和皮肤 | 发育生物学 | NA | 器官解剖、组织采样、定量蛋白质组学、单细胞转录组学、原位杂交、免疫组织化学、组织学 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 定量蛋白质组学 | NA | NA |
5430 | 2025-10-06 |
Identification of immune-related gene signatures for chronic obstructive pulmonary disease with metabolic syndrome: evidence from integrated bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-01-29, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad043
PMID:37878760
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研究论文 | 通过整合批量和单细胞RNA测序数据识别慢性阻塞性肺疾病合并代谢综合征的免疫相关基因标志物 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别出13个COPD与MetS共有的免疫相关枢纽基因,并发现肺泡巨噬细胞中活性氧的潜在关键作用 | 研究基于公共数据集,需要进一步实验验证枢纽基因的功能机制 | 识别慢性阻塞性肺疾病合并代谢综合征的共享免疫相关生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病和代谢综合征患者 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 | WGCNA, 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
5431 | 2025-10-06 |
Utilization of donor CLL-1 CAR-T cells for the treatment of relapsed of acute myeloid leukemia following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491341
PMID:39896798
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研究论文 | 评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的疗效和安全性 | 首次在临床试验中评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗移植后复发AML的疗效,并使用单细胞RNA测序分析CAR-T细胞动态 | 样本量较小(仅12例患者),缺乏对照组 | 评估供体来源CLL-1 CAR-T细胞治疗移植后复发AML的疗效和安全性 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病患者 | 细胞治疗 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞治疗 | NA | 临床数据,单细胞测序数据 | 14例入组患者,12例完成治疗 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5432 | 2025-10-06 |
Advances in epigenetic studies of plant cadmium stress
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1489155
PMID:40520647
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综述 | 本文综述了植物对镉胁迫的表观遗传响应机制研究进展 | 整合基因组学、单细胞测序和空间转录组学等先进技术研究植物镉胁迫表观遗传机制 | NA | 为分析主要作物重金属胁迫的表观遗传机制提供理论见解 | 植物 | 植物表观遗传学 | NA | 基因组学, 单细胞测序, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
5433 | 2025-10-06 |
Glutamine antagonist DRP-104 suppresses tumor growth and enhances response to checkpoint blockade in KEAP1 mutant lung cancer
2023-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.27.546750
PMID:37425844
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研究论文 | 本研究探讨了谷氨酰胺拮抗剂DRP-104在KEAP1突变肺癌中的抗肿瘤效果及其与免疫检查点抑制剂的协同作用 | 首次发现DRP-104通过抑制谷氨酰胺依赖性核苷酸合成和逆转T细胞耗竭来增强抗PD1疗法反应 | 临床前研究阶段,尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对KEAP1突变肺癌的靶向治疗策略 | KEAP1突变肺癌模型 | 癌症治疗 | 肺癌 | 多模式单细胞测序,功能分析 | NA | 测序数据,功能实验数据 | 患者来源异种移植模型和抗原性原位肺癌模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
5434 | 2025-06-17 |
Data-informed insights into sex differences in peripheral blood mononuclear cells from single-cell transcriptomics
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101525
PMID:40520998
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
5435 | 2025-06-17 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals epithelial cell alterations in benign prostatic hyperplasia following finasteride treatment
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101526
PMID:40520997
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
5436 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and machine learning reveal the role of dioxin-interacting genes in HCC prognosis and immune microenvironment
2025-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118484
PMID:40483782
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研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习揭示二噁英相互作用基因在肝细胞癌预后和免疫微环境中的作用 | 首次结合单细胞和批量转录组分析识别二噁英相互作用差异表达基因,并建立预后模型 | 未提及样本量限制或验证队列的详细信息 | 探究二噁英在肝细胞癌发展中的分子机制及预后评估 | 肝细胞癌患者样本和体外细胞实验 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 批量转录组分析, 机器学习, 分子对接, 体外实验 | 预后风险模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
5437 | 2025-10-06 |
Plaque erosion risk and JAK2 V617F variant
2025-Jun-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf114
PMID:40053703
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研究论文 | 本研究探讨JAK2 V617F突变与斑块侵蚀风险之间的关联及其潜在机制 | 首次明确JAK2 V617F突变与心肌梗死特定机制——斑块侵蚀的强相关性,并通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞活化在其中的作用机制 | 病例对照研究设计无法确定因果关系,样本来源单一 | 探究JAK2 V617F突变与心肌梗死不同机制(斑块侵蚀vs斑块破裂)的关联性 | 728例斑块侵蚀患者、919例斑块破裂患者和804例对照个体 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 数字滴液PCR, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归分析 | 基因测序数据, 临床数据 | 2451例(728侵蚀+919破裂+804对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5438 | 2025-10-06 |
Identification of potential drug targets for erectile dysfunction with single-cell RNA sequencing: A Mendelian randomization study
2025-Jun-15, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70082
PMID:40518741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法识别勃起功能障碍的潜在药物靶点 | 首次结合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术系统识别ED治疗靶点 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别勃起功能障碍的新型治疗靶点 | 勃起功能障碍患者和相关细胞类型 | 生物信息学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据, 基因组数据 | eQTLGen联盟31,684人;ED研究229,980人(6,175病例)和95,178人(1,154病例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集GSE206528 |
5439 | 2025-10-06 |
Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis
2025-Jun, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05216-1
PMID:40131629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学数据分析,探讨了乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的作用并构建诊断模型 | 首次将乳酸化修饰与PMOP发病机制联系起来,结合单细胞测序、孟德尔随机化分析和多种机器学习算法构建诊断模型 | 研究样本量有限,需要更大规模的数据验证模型的泛化能力 | 探索乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症发病机制中的作用并开发诊断标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的单细胞RNA测序数据和转录组数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化分析 | 多种机器学习算法组合 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5440 | 2025-10-06 |
Longitudinal single-cell analysis reveals RUNX1T1 as an early driver in treatment-induced neuroendocrine transdifferentiation
2025-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653660
PMID:40463134
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研究论文 | 通过纵向单细胞转录组测序揭示RUNX1T1是治疗诱导神经内分泌转分化的早期驱动因子 | 首次发现t-NEPC发展过程中的早期中间过渡细胞状态,并鉴定RUNX1T1作为NEPC转分化的关键转录调节因子 | 研究基于单一PDX模型(LTL331/331R),需要更多模型验证 | 探究治疗诱导神经内分泌前列腺癌的时序动态和分子驱动机制 | 前列腺癌患者来源异种移植模型(PDX) | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7个时间点的纵向样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |