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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5401 - 5420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5401 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers for the diagnosis of chronic kidney disease (CKD) with dilated cardiomyopathy (DCM) by bioinformatics analysis and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1562891
PMID:40520229
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和机器学习识别慢性肾脏病合并扩张型心肌病的生物标志物并开发诊断模型 | 首次结合多组学数据和多种机器学习方法识别MNS1和HERC6作为CKD合并DCM的新型生物标志物，并构建了诊断列线图 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 开发慢性肾脏病合并扩张型心肌病的早期诊断方法和识别相关生物标志物 | 慢性肾脏病和扩张型心肌病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 慢性肾脏病,扩张型心肌病 | 生物信息学分析,机器学习,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM-RFE,RF | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE57338,GSE29819,GSE104954,GSE145154) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5402 | 2025-10-06 |
Integrative transcriptomics and single-cell transcriptomics analyses reveal potential biomarkers and mechanisms of action in papillary thyroid carcinoma
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1536198
PMID:40520228
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研究论文 | 通过整合转录组学和单细胞转录组学分析，揭示甲状腺乳头状癌的潜在生物标志物和细胞机制 | 首次结合RNA-seq和scRNA-seq技术系统识别PTC的转录组生物标志物，并在单细胞水平解析关键细胞类型及其相互作用机制 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证和前瞻性临床队列验证 | 识别PTC的可靠诊断生物标志物并阐明其发病机制 | 甲状腺乳头状癌转录组数据 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 差异表达分析, GO/KEGG富集分析, WGCNA, 机器学习, ROC分析, 细胞通讯分析, 伪时序分析 | 机器学习, 加权基因共表达网络 | 基因表达数据 | 5个RNA-seq数据集和1个scRNA-seq数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5403 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell and cell-free plasma RNA transcriptomics identifies biomarkers for early non-invasive AD screening
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1571783
PMID:40520536
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研究论文 | 整合单细胞和血浆游离RNA转录组学识别用于早期非侵入性阿尔茨海默病筛查的生物标志物 | 首次整合血浆cfRNA-seq和脑组织scRNA-seq数据，识别出34个在两种数据集中一致失调的基因，并开发了基于机器学习的高精度AD早期诊断模型 | cfRNA稳定性问题对临床转化带来挑战 | 开发非侵入性阿尔茨海默病早期筛查工具 | 阿尔茨海默病患者和年龄匹配的对照人群 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序，单细胞RNA测序，机器学习 | 支持向量机，随机森林，逻辑回归 | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 血浆cfRNA-seq数据337个样本（172例AD患者和165例对照），脑组织scRNA-seq数据88个样本（46例AD患者和42例对照） | NA | 单细胞RNA-seq，游离RNA测序 | NA | NA |
| 5404 | 2025-10-06 |
scFocus: Detecting branching probabilities in single-cell data with SAC
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.04.036
PMID:40520594
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研究论文 | 提出一种基于强化学习的单细胞数据分析算法scFocus，用于检测细胞分化轨迹中的分支概率 | 结合强化学习和无监督分支分析，在单细胞低维潜在空间中划分细胞亚群，能更有效地捕捉分化过程 | NA | 开发单细胞数据分析算法以精确检测细胞分化轨迹中的分支概率 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 强化学习 | 单细胞基因表达数据 | 十个单细胞数据集，包括小规模、常规规模和多批次数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5405 | 2025-10-06 |
The complex interplay of TROP2 and PD-L1 in immune regulation and drug resistance in lung cancer
2025, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/NHFJ1535
PMID:40520853
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研究论文 | 本研究探讨了TROP2和PD-L1在肺腺癌中的相互作用及其对免疫调节和耐药性的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示TROP2和PD-L1在肺腺癌中的复杂相互作用机制，并发现其与CD8 T细胞浸润和癌症相关成纤维细胞的关联 | 研究主要聚焦于PC9细胞系及其耐药变体，样本类型相对有限 | 阐明TROP2和PD-L1在肺腺癌免疫调节和耐药性中的分子机制 | 肺癌细胞系、肿瘤组织和免疫细胞，特别是PC9亲本和耐药变体 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织图像、单细胞测序数据 | 肺癌细胞系、肿瘤组织和免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5406 | 2025-10-06 |
Notable influences of estrogen and sex-specific microenvironment in colorectal cancer revealed by single-cell transcriptome analysis
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.106133
PMID:40520886
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示雌激素和性别特异性微环境在结直肠癌中的显著影响 | 首次在单细胞水平系统揭示结直肠癌中性别特异性的细胞组成、功能和细胞间相互作用差异，并验证雌激素信号通路与凋亡活性的关联 | 样本量相对有限(32例)，需要在更大队列中验证发现 | 探究结直肠癌中性别特异性预后差异的生物学机制 | 结直肠癌患者组织样本和细胞系 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,Western blot,TUNEL检测 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质印迹数据,免疫组化图像 | 32例结直肠癌样本,共167,437个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5407 | 2025-10-06 |
PDGF-BB/EGR1 Axis Drives Fibroblast Activation Protein Expression to Promote Abdominal Aortic Aneurysm
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.114429
PMID:40520892
|
研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞活化蛋白在腹主动脉瘤发展过程中对血管平滑肌细胞的作用机制 | 首次揭示了PDGF-BB通过转录因子EGR1调控FAP表达的新机制，并证实靶向FAP可抑制动脉瘤形成 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证有限 | 阐明FAP在腹主动脉瘤发病机制中的分子作用 | 血管平滑肌细胞、小鼠AAA模型、临床AAA患者 | 分子生物学 | 腹主动脉瘤 | RNA测序、PET/CT成像 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 动物模型及有限临床病例 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5408 | 2025-10-06 |
FOS as a biomarker for myocardial infarction treatment with Deng's Yangxin Decoction: a systems biology-based analysis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1488684
PMID:40520937
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研究论文 | 本研究通过系统生物学方法探索邓氏养心汤治疗心肌梗死的潜在生物标志物FOS及其作用机制 | 首次将FOS鉴定为邓氏养心汤治疗心肌梗死的核心生物标志物，并通过分子对接和单细胞RNA测序验证其与免疫细胞浸润的关联 | 机制研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索邓氏养心汤治疗心肌梗死的生物标志物和作用机制 | 心肌梗死患者和对照组的基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 系统药理学分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、分子对接、免疫浸润分析、单细胞RNA测序 | 蛋白-蛋白相互作用网络、分子对接模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于公开数据集的心肌梗死患者和对照组基因表达数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5409 | 2025-10-06 |
Extrachromosomal circular DNA drives dynamic genome plasticity: emerging roles in disease progression and clinical potential
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.111765
PMID:40521196
|
综述 | 本文系统综述了染色体外环状DNA(eccDNA)在基因组动态可塑性中的关键作用及其在疾病进展和临床应用中的潜力 | 提出了应激选择理论，将eccDNA视为增强细胞适应环境压力的适应性储备库 | 在理解组织特异性作用、实现临床转化和方法学标准化方面仍面临挑战 | 系统总结eccDNA的分类、生物发生、检测方法、生物学功能和临床意义 | 染色体外环状DNA(eccDNA)及其亚型如microDNA、双微体和ecDNA | 基因组学 | 癌症、心血管疾病、神经系统疾病、自身免疫疾病、代谢疾病 | 长读长测序、单细胞测序、CRISPR合成、计算工具 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序、空间生物学、多组学 | NA | NA |
| 5410 | 2025-10-06 |
Spatial diversity of in vivo tissue immunity
2024-12-26, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxae051
PMID:39177484
|
综述 | 本文探讨了免疫系统在活体组织中的空间多样性及其功能意义 | 通过前沿空间分析技术揭示免疫细胞与非免疫细胞在特定营养和氧气环境中形成功能性免疫生态位 | NA | 理解组织内免疫细胞的空间分布规律及其与微环境的相互作用机制 | 肝脏、肾脏、肠道和肺等器官中的免疫细胞及组织微环境 | 空间转录组学 | 炎症性疾病 | 活体成像、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、活体成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5411 | 2025-10-06 |
Endothelial response to blood-brain barrier disruption in the human brain
2024-Dec-26, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187328
PMID:39724015
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和透射电子显微镜分析，揭示了人类脑内皮细胞对超声介导血脑屏障破坏的急性反应机制 | 首次在人类临床试验中直接观察脑内皮细胞对血脑屏障破坏的转录组和超微结构响应 | 样本量有限，仅针对复发性胶质母细胞瘤患者进行研究 | 探究人类脑内皮细胞对血脑屏障破坏的分子和结构响应机制 | 复发性胶质母细胞瘤患者的脑内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | I期临床试验患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5412 | 2025-10-06 |
Detecting Rhythmic Gene Expression in Single-cell Transcriptomics
2024-12, Journal of biological rhythms
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/07487304241273182
PMID:39377613
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研究论文 | 评估常用节律检测方法在单细胞RNA测序数据中的可靠性，并提出适用于单细胞数据的昼夜节律基因检测策略 | 首次系统评估昼夜节律检测方法在单细胞转录组数据中的应用效果，并提出结合子采样和谐波回归的新策略 | 未明确说明使用的具体数据集规模和验证方法 | 开发适用于单细胞RNA测序数据的昼夜节律基因检测方法 | 单细胞转录组数据中的节律性基因表达 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谐波回归 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5413 | 2025-10-06 |
Polybacterial Intracellular Macromolecules Shape Single-Cell Epikine Profiles in Upper Airway Mucosa
2024-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617279
PMID:39416216
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了上呼吸道黏膜上皮细胞中多菌种胞内大分子(PIMs)的存在及其对细胞因子表达和药物反应的影响 | 首次在单细胞水平发现多菌种胞内大分子(PIMs)持续存在于黏膜上皮细胞中，并线性驱动效应细胞因子表达 | 研究主要关注口腔黏膜，结果在其他黏膜部位的普适性需要进一步验证 | 探究宿主-微生物相互作用在黏膜上皮细胞类型中的机制 | 人类口腔黏膜上皮细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 慢性炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 人类口腔黏膜单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5414 | 2025-10-06 |
Immune profiling-based targeting of pathogenic T cells with ustekinumab in ANCA-associated glomerulonephritis
2024-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52525-w
PMID:39300109
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组分析识别ANCA相关性肾小球肾炎中的致病性T细胞，并验证ustekinumab靶向治疗的潜力 | 首次通过空间和单细胞转录组分析揭示ANCA-GN中致病性T细胞的分子特征，并应用数字药理学方法识别ustekinumab作为潜在治疗药物 | 样本量较小（34例分析样本，4例治疗病例），随访时间较短（26周），需要更大规模的临床试验验证 | 开发针对ANCA相关性肾小球肾炎的精准免疫治疗方法 | ANCA相关性血管炎患者的肾脏组织和外周血样本 | 数字病理学 | ANCA相关性血管炎/肾小球肾炎 | 空间转录组分析,单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据,临床数据 | 34例ANCA-GN患者肾脏样本，4例复发患者接受治疗 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5415 | 2025-10-06 |
Detecting anomalous anatomic regions in spatial transcriptomics with STANDS
2024-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52445-9
PMID:39300113
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研究论文 | 提出基于生成对抗网络的STANDS框架，用于从多样本空间转录组数据中检测和对齐异常组织区域 | 首个能够从多样本空间转录组数据中进行从头异常组织区域检测与解析的方法，整合了多模态学习、迁移学习和风格迁移技术 | 需要正常空间转录组数据集进行对比分析，但这些数据集通常稀缺 | 开发空间转录组数据分析方法，检测和解析异常组织区域 | 多样本空间转录组数据中的异常组织区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | GAN | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5416 | 2025-10-06 |
PRDM3/16 regulate chromatin accessibility required for NKX2-1 mediated alveolar epithelial differentiation and function
2024-09-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52154-3
PMID:39284798
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研究论文 | 本研究揭示了PRDM3和PRDM16通过调控染色质可及性介导NKX2-1依赖的肺泡上皮细胞分化机制 | 首次发现PRDM3/PRDM16组蛋白甲基转移酶通过调控染色质可及性影响NKX2-1转录靶点，从而介导肺泡上皮细胞分化 | 研究主要关注围产期肺泡上皮细胞分化，对其他发育阶段的影响尚未明确 | 探究PRDM3和PRDM16在肺泡上皮细胞分化和功能中的调控机制 | 小鼠肺内胚层细胞和AT2肺泡上皮细胞 | 表观遗传学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CUT&RUN | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq | NA | NA |
| 5417 | 2025-10-06 |
Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2024-Jun-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4559348/v1
PMID:38978578
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序监督细胞类型识别的目标导向参考构建方法 | 首次提出针对目标数据集选择和构建参考数据的方法，缓解参考数据与目标数据之间数据分布和细胞类型组成的差异 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中监督细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 模拟数据和真实数据分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5418 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Uncovers Striking Cellular Heterogeneity of Lung-Infiltrating Regulatory T Cells during Eosinophilic versus Neutrophilic Allergic Airway Inflammation
2024-Jun-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300646
PMID:38647384
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了嗜酸性粒细胞与中性粒细胞过敏性气道炎症中肺部浸润调节性T细胞的显著异质性 | 首次发现不同类型过敏性气道炎症会塑造表型不同的肺部常驻调节性T细胞，揭示了炎症信号通过组织适应机制塑造浸润Treg组成的新机制 | Treg特异性ST2缺陷不影响嗜酸性过敏性炎症的发展或肺部常驻Treg的生成，具体调控机制仍需进一步研究 | 探究不同类型过敏性气道炎症对肺部浸润调节性T细胞异质性和组织驻留特性的影响 | 小鼠肺部浸润的Foxp3+调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 过敏性气道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 嗜酸性和中性粒细胞过敏性气道炎症模型中的肺部浸润Treg细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5419 | 2025-10-06 |
Identification of epigenetic silencing of the SFRP2 gene in colorectal cancer as a clinical biomarker and molecular significance
2024-05-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05329-x
PMID:38802858
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中SFRP2基因表现遗传沉默作为临床生物标志物的潜力 | 首次在大型生物样本队列中系统评估SFRP2甲基化水平，并发现其在血液中可作为癌症分期、淋巴结侵袭和复发的预测指标 | 样本量相对有限（健康参与者110例，CRC患者85例），需要更大规模研究验证 | 研究SFRP2基因甲基化在结直肠癌中的诊断价值和临床意义 | 结直肠癌患者和健康参与者的血液、脂肪和结肠组织样本 | 分子生物学 | 结直肠癌 | qPCR, 450K DNA阵列, DNA焦磷酸测序, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 单细胞RNA测序数据 | 健康参与者110例（男48/女62），CRC患者85例（男61/女24） | Illumina | DNA甲基化阵列, 单细胞RNA测序 | 450K DNA阵列 | Illumina 450K DNA甲基化阵列 |
| 5420 | 2025-10-06 |
A new integrative analysis of histopathology and single cell RNA-seq reveals the CCL5 mediated T and NK cell interaction with vascular cells in idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-05-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05304-6
PMID:38797830
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研究论文 | 通过组织病理学和单细胞RNA测序的整合分析，揭示了特发性肺动脉高压中CCL5介导的T细胞和NK细胞与血管细胞的相互作用 | 首次结合组织病理学评分和多种生物信息学方法识别IPAH中的关键炎症基因，并通过单细胞RNA测序解析了CCL5介导的细胞间相互作用机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，实验验证仅限于动物模型 | 探索特发性肺动脉高压中炎症和免疫失调的分子机制 | IPAH患者肺组织、对照组肺组织、野百合碱诱导的大鼠肺动脉高压模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 差异表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 功能富集分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | IPAH患者和对照组的肺组织转录组数据（具体样本数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |