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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5381 2025-10-06
Integration of Machine Learning and Experimental Validation to Identify Anoikis-Related Prognostic Signature for Predicting the Breast Cancer Tumor Microenvironment and Treatment Response
2024-Nov-12, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合机器学习与实验验证,开发了失巢凋亡相关预后特征用于预测乳腺癌肿瘤微环境和治疗反应 首次构建了包含5个失巢凋亡相关基因的预后特征,并系统评估其与肿瘤微环境、药物敏感性和免疫治疗的关系 需要更大样本量的前瞻性研究进一步验证预后特征的临床适用性 探索失巢凋亡相关基因在乳腺癌预后预测和治疗指导中的价值 乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 RT-PCR, Western blot, ELISA, 单细胞分析, 空间转录组学 多种机器学习方法 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5382 2025-10-06
Genomic and immune heterogeneity of multiple synchronous lung adenocarcinoma at different developmental stages
2024-09-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过多组学技术分析多发性同步肺癌在不同发展阶段的基因组和免疫异质性 首次在单细胞分辨率揭示多发性同步肺癌从癌前病变到浸润性腺癌演变过程中的克隆独立性、趋同进化和免疫微环境动态变化 样本量较小(8例患者16个肿瘤),需要更大队列验证发现 探索多发性同步肺癌不同病理阶段的基因组和免疫异质性 8例多发性同步肺癌患者的16个肿瘤样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,全外显子组测序 NA 基因组数据,转录组数据,免疫组库数据 8例患者的16个肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq,单细胞TCR测序,全外显子组测序 NA NA
5383 2025-10-06
Glioblastoma cells increase expression of notch signaling and synaptic genes within infiltrated brain tissue
2024-09-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析胶质母细胞瘤恶性细胞在肿瘤核心区和浸润脑组织中的基因表达差异 首次揭示浸润脑组织中的恶性细胞表现出神经发育通路和胶质细胞分化相关基因表达增加的空间特征 样本量较小(n=11),且浸润脑组织的特征描述仍不够全面 探索胶质母细胞瘤恶性细胞在肿瘤核心区和浸润脑组织中的空间基因表达差异 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织和浸润脑组织中的恶性细胞 空间转录组学 胶质母细胞瘤 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 11例样本 NA 空间转录组学 NA NA
5384 2025-10-06
ST-GEARS: Advancing 3D downstream research through accurate spatial information recovery
2024-09-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出ST-GEARS系统通过精确空间信息恢复推进3D空间转录组学研究 引入分布式约束优化方案和数学证明的双截面场应用,实现跨截面锚点的超精确连接和原始空间谱系恢复 未明确说明系统在不同组织类型或复杂变形场景下的适用性限制 解决3D空间转录组学中空间信息丢失和实验变形导致的下游分析不可靠问题 三维空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 优化模型 空间转录组数据 NA NA 3D空间转录组学 NA NA
5385 2025-10-06
Intracellular spatial transcriptomic analysis toolkit (InSTAnT)
2024-09-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一种用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT 首个专门用于单分子分辨率空间转录组数据分析的工具包,能够检测基因对和模块在细胞内及细胞间的共定位模式 NA 开发计算工具以解锁空间转录组数据在发现亚细胞生物模式方面的潜力 五个不同数据集,代表两种细胞系、两个脑结构、两个物种和三种不同技术 空间转录组学 NA 多重误差稳健荧光原位杂交(MERFISH),空间转录组学 统计检验和算法 空间转录组数据 五个数据集 NA 空间转录组学,单分子分辨率成像 NA NA
5386 2025-10-06
MerlinS13 phosphorylation controls meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2023-Mar-14, Research square
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质质谱分析,揭示了Merlin蛋白S13磷酸化调控脑膜瘤Wnt信号通路及MRI特征的机制 首次发现Merlin通过S13去磷酸化激活Wnt信号通路,并建立了基于扩散加权成像ADC值的非侵入性影像学生物标志物 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 阐明Merlin完整型脑膜瘤的生长机制并开发预测临床结果的生物标志物 脑膜瘤细胞、异种移植模型和人类患者 数字病理 脑膜瘤 单细胞RNA测序, 邻近标记蛋白质质谱, 磁共振成像 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 医学影像 脑膜瘤细胞系、异种移植模型和人类患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质质谱, 空间转录组学 NA NA
5387 2025-10-06
Intracellular Spatial Transcriptomic Analysis Toolkit (InSTAnT)
2023-Jan-27, Research square
研究论文 开发用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT 首个专门针对细胞内分辨率空间转录组数据的计算分析工具包,能够检测基因对和模块在细胞内外的共定位模式 NA 开发计算工具以充分挖掘成像空间转录组技术的潜力 人类癌细胞系和小鼠下丘脑视前区 空间转录组学 癌症 成像空间转录组技术 图挖掘算法 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学, MERFISH NA NA
5388 2025-10-06
Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs
2025-Jul-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究孕期暴露于氟氯氰菊酯对后代神经发育的毒性作用机制 首次构建了孕期暴露氟氯氰菊酯后代大脑海马区的单细胞图谱,揭示了神经干细胞命运改变是发育毒性的主要机制 研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类中验证 探索孕期氟氯氰菊酯暴露引起后代神经发育毒性的分子机制 孕期暴露氟氯氰菊酯的大鼠后代海马组织 单细胞生物学 神经发育障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 不同年龄阶段的大鼠后代海马组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5389 2025-10-06
[Integrating single-cell analysis and epharmalib reverse virtual screening to predict novel vascular endothelial cell targets of dapagliflozin in treating diabetic cardiomyopathy]
2025-Jun-24, Zhonghua xin xue guan bing za zhi
研究论文 本研究通过整合单细胞分析与反向虚拟筛选技术,探索达格列净治疗糖尿病心肌病时对血管内皮细胞的潜在作用靶点 首次结合ePharmaLib反向虚拟筛选、单细胞RNA测序和芯片数据分析,系统识别达格列净在糖尿病心肌病血管内皮细胞中的多组学靶点 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床验证尚不充分 探究糖尿病心肌病中内皮细胞异质性及达格列净的潜在治疗靶点 小鼠心脏组织内皮细胞、人脐静脉内皮细胞 生物信息学 糖尿病心肌病 单细胞RNA测序, 反向虚拟筛选, 微阵列芯片, Western blot, RT-PCR NA 基因表达数据, 蛋白质结构数据, 转录组数据 野生型小鼠和db/db糖尿病心肌病小鼠模型,人脐静脉内皮细胞多浓度处理组 Agilent 单细胞RNA-seq, 微阵列芯片 Agilent Mouse ceRNA Microarray chip 单细胞RNA测序数据来自PRJNA1069235数据集
5390 2025-10-06
Ginsenoside Compound K Mitigates Mitochondrial Fission Through Bile Acid Receptors/YAP Signaling to Counteract Podocyte Injury in Lupus Nephritis
2025-Jun-18, Phytotherapy research : PTR IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨人参皂苷化合物K通过胆汁酸受体/YAP信号通路调控线粒体分裂,减轻狼疮性肾炎足细胞损伤的机制 首次阐明人参皂苷化合物K通过胆汁酸受体-YAP信号轴调控线粒体动力学,揭示其在狼疮性肾炎足细胞保护中的新机制 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床试验验证 探究人参皂苷化合物K在狼疮性肾炎中保护足细胞的分子机制 MRL/lpr狼疮易感小鼠和体外培养的足细胞 分子生物学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序,代谢组学分析,体外细胞实验 动物疾病模型 基因表达数据,代谢物数据,病理数据 MRL/lpr小鼠,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5391 2025-10-06
Splenic CD169+Tim4+ Marginal Metallophilic Macrophages Are Essential for Wound Healing After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了脾脏CD169+Tim4+边缘金属亲和性巨噬细胞在心肌梗死后伤口愈合中的关键作用 首次发现脾脏CD169+Tim4+边缘金属亲和性巨噬细胞通过循环进入心脏,在心肌梗死后发挥免疫调节和组织修复功能 研究主要基于小鼠模型,人类数据有限 探究脾脏特定巨噬细胞亚群在心肌梗死后伤口愈合中的作用机制 小鼠模型和人类ST段抬高型心肌梗死患者 免疫学 心血管疾病 单细胞RNA测序,流式细胞术,谱系追踪,细胞追踪,脾切除术,联体共生,细胞过继转移 NA 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 小鼠模型和人类患者样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5392 2025-10-06
Single-cell multi-omics reveals that FABP1 + renal cell carcinoma drive tumor angiogenesis through the PLG-PLAT axis under fatty acid reprogramming
2025-Jun-16, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 通过单细胞多组学技术揭示FABP1阳性肾癌细胞通过PLG-PLAT轴驱动肿瘤血管生成 发现FABP1+肾癌细胞亚群具有独特的空间分布特征,并首次揭示PLG-PLAT功能轴在肿瘤-内皮细胞相互作用中的关键作用 对脂肪酸代谢重编程的深入研究仍显不足,需要进一步验证FABP1-PLG-PLAT轴的具体分子机制 探究肾细胞癌中脂肪酸代谢重编程对肿瘤血管生成的影响机制 肾细胞癌肿瘤组织中的FABP1阳性肿瘤细胞亚群 数字病理学 肾癌 单细胞多组学, 空间转录组学, 受体-配体相互作用分析 NA 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
5393 2025-10-06
Role of local complement activation in kidney fibrosis and repair
2025-Jun-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
综述 探讨局部补体激活在肾脏纤维化与修复过程中的作用机制 揭示肾脏局部补体系统在纤维化微环境形成中的关键作用,并提出靶向局部补体治疗慢性肾脏病的新策略 主要依赖动物模型研究,人类临床数据有限 阐明局部补体激活在肾脏疾病进展中的病理机制 肾小球和肾小管间质肾病动物模型及慢性肾脏病患者 病理生理学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 基因敲除小鼠模型 基因表达数据, 蛋白质数据, 组织病理数据 动物模型及人类肾脏活检样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
5394 2025-10-06
From inserts to chips: microfluidic culture and 3D astrocyte co-culture drive functional and transcriptomic changes in hiPSC-derived endothelial cells
2025-Jun-16, Fluids and barriers of the CNS IF:5.9Q1
研究论文 本研究比较了微流体BBB芯片平台与传统细胞培养插入模型对人诱导多能干细胞来源内皮细胞功能和转录组表型的影响 首次系统比较微流体芯片与传统培养系统对hiPSC来源内皮细胞的影响,并发现3D星形胶质细胞共培养对维持内皮细胞单层的关键作用 研究仅聚焦于内皮细胞和星形胶质细胞,未包含BBB的其他重要组分如周细胞 研究不同培养平台如何改变hiPSC来源内皮细胞的功能和转录组表型 人诱导多能干细胞来源的内皮细胞和星形胶质细胞 生物医学工程 神经退行性疾病 单细胞RNA测序,渗透性实验,蛋白表达分析 器官芯片模型,2D/3D细胞培养模型 转录组数据,功能实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq AKITA plate 微流体血脑屏障芯片平台
5395 2025-10-06
Exploring T-cell metabolism in tuberculosis: development of a diagnostic model using metabolic genes
2025-Jun-16, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析结核病患者外周血单个核细胞,开发了基于T细胞代谢基因的诊断模型 首次整合单细胞RNA测序与机器学习算法识别T细胞相关代谢差异表达基因,构建结核病诊断模型并进行分子分型 样本量较小(仅7个个体),需要在更大队列中验证模型的普适性 探索T细胞代谢在结核病中的作用,开发活动性结核与潜伏感染的诊断模型 活动性结核患者、潜伏结核感染者和健康对照者的外周血单个核细胞 生物信息学 结核病 单细胞RNA测序,机器学习算法(XGBoost、SVM-RFE、Boruta) XGBoost、SVM-RFE、Boruta、诺模图预测模型 单细胞RNA测序数据 7个个体(2个健康对照、2个潜伏感染、3个活动性结核) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5396 2025-10-06
Cancer-associated fibroblasts promote drug resistance in ALK-driven lung adenocarcinoma cells by upregulating lipid biosynthesis
2025-Jun-16, Cancer & metabolism IF:6.0Q1
研究论文 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过上调脂质生物合成促进ALK驱动肺腺癌细胞对靶向药物产生耐药性的机制 首次发现CAFs通过HGF和NRG1激活AKT信号通路,增强脂质新生并抑制脂质过氧化,从而介导ALK-TKI耐药 研究主要基于3D球体共培养模型,需要在体内模型中进一步验证 探究CAFs在ALK驱动肺腺癌细胞耐药性形成中的分子机制 ALK重排肺腺癌细胞和癌症相关成纤维细胞 癌症生物学 肺癌 单细胞RNA测序,3D球体共培养,功能分析 3D球体共培养模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
5397 2025-10-06
Elevated CD14 in B cells associates with reduced ovarian cancer risk via CD80 + dendritic cell interaction: a multi-omics study
2025-Jun-15, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学研究揭示B细胞中CD14表达升高通过CD80+树突状细胞相互作用降低卵巢癌风险的机制 首次在B细胞中发现CD14与卵巢癌风险的关联,并通过中介分析揭示CD80在其中的介导作用 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 探究B细胞中CD14表达与卵巢癌风险的关联机制 卵巢癌患者和健康捐赠者的外周血单核细胞 多组学分析 卵巢癌 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 中介分析 NA 单细胞转录组数据, eQTL数据, pQTL数据 卵巢癌患者和健康捐赠者的PBMCs样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5398 2025-10-06
A Prognostic Lysine Crotonylation Signature Shapes the Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun-13, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究开发了一个基于巴豆酰化相关基因的预后特征模型,用于肝细胞癌的风险分层和免疫微环境分析 首次构建了肝细胞癌中巴豆酰化相关基因的预后特征模型,揭示了其在肿瘤免疫微环境塑造中的新作用 需要标准化的巴豆酰化测量方法,需在不同病因的肝细胞癌中进行验证,需机制和纵向研究确认因果关系 探讨巴豆酰化相关基因在肝细胞癌中的预后价值和治疗相关性 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 转录组分析,单细胞测序,Cox回归,LASSO回归,CIBERSORT,OncoPredict 风险评分模型,列线图 转录组数据,临床数据 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
5399 2025-10-06
Systematic Pan-Cancer Analysis of the Oncogenic and Immunological Function of Stanniocalcin-1 (STC1)
2025-Jun-13, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 通过多组学分析系统研究STC1在泛癌中的致癌和免疫学功能 首次系统揭示STC1作为新型泛癌因子在肿瘤进展和免疫微环境重塑中的双重作用 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于胃癌组织 确立STC1的泛癌预后意义并阐明其与免疫特征的关联 33种癌症类型和胃癌组织样本 生物信息学 多种癌症 多组学分析, 单细胞RNA测序, 多重荧光染色, Western blot NA 基因组数据, 蛋白质数据, 组织图像 TCGA泛癌数据集和30例胃癌组织微阵列 NA 单细胞RNA测序, 组织微阵列 NA NA
5400 2025-10-06
Adulthood outcomes of thymic transplantation in a case of congenital athymia due to FOXN1 mutation
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 报告一例因FOXN1突变导致先天性无胸腺患者接受胸腺移植后19年的临床和免疫学结果 首次报道先天性无胸腺患者胸腺移植后的长期成人期结局,通过高维光谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示异体胸腺教育T细胞的独特生物学特征 仅基于单一病例研究,样本量有限,缺乏对照组长期数据 评估胸腺移植在先天性无胸腺患者中的长期免疫重建效果 FOXN1 R255X纯合突变导致的先天性无胸腺患者 免疫学 先天性免疫缺陷 高维光谱流式细胞术,单细胞RNA测序,T细胞受体测序,细胞表面蛋白测序 NA 流式细胞数据,单细胞转录组数据,临床数据 1例患者(随访19年)及年龄匹配对照 NA 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA NA
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