单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27967 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-05-16 |
Protocol for isolation of signet ring cells from human gastric mucosa
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102695
PMID:37925632
|
研究论文 | 本文提出了一种从人类胃黏膜中分离印戒细胞的高活力悬浮液方案 | 提供了一种新的高活力印戒细胞悬浮液制备协议，适用于多种后续应用如免疫组化染色、流式细胞术和单细胞测序 | 未提及该方案在临床样本中的验证效果或适用范围 | 开发一种从胃黏膜组织中分离印戒细胞的标准化流程 | 人类胃黏膜组织中的印戒细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组化染色、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 未明确说明样本数量 |
| 522 | 2025-05-16 |
Protocol to combine brain sections from multiple mice into a single block for spatial transcriptomic analyses
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102617
PMID:37742175
|
研究论文 | 提出一种将多个小鼠大脑切片合并到单个空间转录组学载玻片上的协议 | 通过将不同大脑的海马区冷冻切片合并成单个冷冻块，减少了所需试剂的数量 | NA | 提高空间转录组学分析的样本处理效率并降低成本 | 小鼠大脑海马区切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据和空间标记 | 多个小鼠大脑切片 |
| 523 | 2025-05-16 |
Single-cell isolation from full-thickness human intestinal tissue resections for single-cell RNA sequencing
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102686
PMID:37925636
|
研究论文 | 本文提出了一种从全层肠道组织切除中分离单细胞的方案，用于单细胞RNA测序 | 开发了一种从全层肠道组织中分离单细胞的详细方案，包括预处理标本、分离固有层和肌肉层、红细胞裂解等步骤 | 未提及该方案的适用性限制或潜在问题 | 开发一种从全层肠道组织中分离单细胞的标准化方案 | 全层肠道组织切除样本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 10× Chromium平台 | NA | RNA测序数据 | 未提及具体样本数量 |
| 524 | 2025-05-16 |
Protocol for multispectral imaging on cryosections to map myeloid cell heterogeneity in its spatial context
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102601
PMID:37742177
|
研究论文 | 提出了一种用于原位多光谱成像的协议，以绘制组织冷冻切片中髓系细胞异质性 | 结合多光谱成像技术，保留细胞和分子背景，同时识别细胞类型和亚群 | 需要参考Goossens等人的研究以获取完整执行细节 | 开发一种协议来映射髓系细胞在组织中的异质性 | 组织冷冻切片中的髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 多光谱成像 | NA | 图像 | NA |
| 525 | 2025-05-16 |
Protocol for PPP1R15A-inhibited mouse model establishment with subcutaneous B16F1 tumor and single-cell analysis
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102616
PMID:37756156
|
研究论文 | 本文提出了一种建立PPP1R15A抑制小鼠模型的协议，用于探索Sephin1对B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫的影响 | 使用单细胞转录组和TCR文库构建技术，整合表达和TCR数据，进行基因分化、调控网络和细胞间通讯分析 | 具体实验细节和操作步骤需参考Wang等人的完整研究 | 探索PPP1R15A抑制剂Sephin1对小鼠B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫的影响 | B16F1皮下肿瘤小鼠模型 | 生物医学研究 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序、TCR测序 | 小鼠模型 | 测序数据 | NA |
| 526 | 2025-05-16 |
Protocol for isolating single cells from human pancreatic cancer tissues and analyzing major immune cell populations using flow cytometry
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102679
PMID:37910511
|
研究论文 | 本文提出了一种从人类胰腺癌组织中分离单细胞并使用流式细胞术分析主要免疫细胞群的方案 | 提供了一种详细的胰腺癌组织免疫细胞分离和分析流程，适用于单细胞RNA测序等相关研究 | 未提及样本量的具体信息，且依赖于Zhang等人(2023)的详细执行步骤 | 开发一种标准化流程用于胰腺癌免疫细胞研究 | 人类胰腺癌组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 527 | 2025-05-16 |
TimiGP: An R package to depict the tumor microenvironment from bulk transcriptomics
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102742
PMID:38019649
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研究论文 | 介绍了一个名为TimiGP的R包，用于从批量转录组数据中描绘肿瘤微环境 | 开发了一个基于基因对的肿瘤免疫微环境分析工具，能够推断细胞间相互作用并揭示免疫细胞相对丰度与患者预后的关联 | NA | 探索肿瘤微环境中不同免疫细胞类型的临床相关性，以揭示癌症复杂性并开发治疗方法 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，批量基因表达分析 | NA | 基因表达数据，生存数据 | NA |
| 528 | 2025-05-16 |
Protocol for nuclear dissociation of the adult C. elegans for single-nucleus RNA sequencing and its application for mapping environmental responses
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102756
PMID:38043054
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研究论文 | 介绍了一种用于成年秀丽隐杆线虫核分离的单核RNA测序（snRNA-seq）协议，并应用于酒精暴露环境下的转录组分析 | 提出了一种克服秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序困难的单核RNA测序协议 | 未提及具体样本量或实验验证的局限性 | 开发适用于秀丽隐杆线虫的单核RNA测序方法，以研究外部刺激下的细胞反应 | 成年秀丽隐杆线虫 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 529 | 2025-05-16 |
Heterogeneous murine peribiliary glands orchestrate compartmentalized epithelial renewal
2023-12-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.004
PMID:37909044
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了胆管外分支中腺体的异质性及其在胆管上皮更新中的作用 | 首次明确了胆管外腺体中不同位置胆管细胞的更新机制及其在组织维持中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，人类胆管系统的可比性尚需验证 | 阐明胆管外分支上皮更新的细胞机制 | 小鼠胆管外分支腺体及其上皮细胞 | 细胞生物学 | 胆管疾病 | 无标记克隆命运追踪、单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 530 | 2025-05-16 |
Neural plate progenitors give rise to both anterior and posterior pituitary cells
2023-12-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.018
PMID:37683631
|
research paper | 该研究挑战了垂体腺细胞仅来源于非神经外胚层的传统观点，揭示了神经板前体细胞对垂体前后叶细胞的贡献以及垂体细胞间的相互作用 | 研究发现神经板前体细胞（斑马鱼her4.3+和小鼠Sox1+）不仅贡献于神经垂体细胞，还贡献于部分腺垂体细胞，揭示了垂体细胞分化的新机制 | 研究主要基于斑马鱼和小鼠模型，人类垂体发育是否遵循相同机制尚需验证 | 探究垂体细胞的起源和分化机制 | 斑马鱼和小鼠的垂体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、遗传追踪 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼和小鼠垂体细胞 |
| 531 | 2025-05-16 |
Alpha-1 adrenergic signaling drives cardiac regeneration via extracellular matrix remodeling transcriptional program in zebrafish macrophages
2023-11-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.09.011
PMID:37875117
|
research paper | 本文研究了α-1肾上腺素能信号通过调节斑马鱼巨噬细胞的细胞外基质重塑转录程序驱动心脏再生的机制 | 揭示了肾上腺素能信号通过巨噬细胞表型多样化和细胞外基质重塑转录程序调控心脏再生的新机制 | 研究仅基于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中进行验证 | 探究肾上腺素能信号在心脏修复中的作用机制 | 斑马鱼心脏巨噬细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | 斑马鱼模型 | 转录组数据 | NA |
| 532 | 2025-05-16 |
The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on Clinical Manifestation, Immune Response, and Viral Dynamics in SARS-CoV-2 Coinfection
2023-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.15.567132
PMID:38014096
|
研究论文 | 本研究探讨了SIV诱导的免疫缺陷对SARS-CoV-2共感染的临床表现、免疫反应和病毒动态的影响 | 首次在控制环境下直接评估慢性HIV感染相关的免疫缺陷对COVID-19疾病和病毒持续性的影响 | 样本量较小（仅两只猪尾猕猴），且未观察到临床疾病迹象 | 评估免疫缺陷对SARS-CoV-2感染的影响 | 两只长期感染SIVmac239的猪尾猕猴（PTM） | 免疫学 | HIV感染和COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 临床数据、病毒动力学数据和免疫反应数据 | 两只猪尾猕猴 |
| 533 | 2025-05-15 |
Integrated bioinformatics analysis identifies neutrophils and villous cytotrophoblasts infiltration characterized by BLC6 upregulation as associated with the co-occurrence of gestational diabetes mellitus and pre-eclampsia
2025-Dec, Hypertension in pregnancy
IF:1.5Q4
DOI:10.1080/10641955.2025.2475814
PMID:40122115
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析，发现中性粒细胞和绒毛细胞滋养层细胞浸润以及BLC6上调与妊娠期糖尿病和先兆子痫的共现相关 | 首次鉴定出BCL6、DNAH9和SCG2作为妊娠期糖尿病和先兆子痫的共同枢纽基因，并发现BCL6在中性粒细胞和绒毛细胞滋养层细胞中的高表达 | 研究依赖于公开数据集，未进行实验验证 | 探究妊娠期糖尿病和先兆子痫共现的枢纽基因和通路 | 妊娠期糖尿病和先兆子痫患者 | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病和先兆子痫 | 生物信息学分析、单细胞测序数据分析 | 回归模型、ROC分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 |
| 534 | 2025-05-15 |
The role of lactate metabolism in retinoblastoma tumorigenesis and ferroptosis resistance
2025-Aug, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102893
PMID:40188688
|
研究论文 | 本研究探讨了乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和抗铁死亡中的作用 | 首次揭示了乳酸代谢通过上调MCT1促进视网膜母细胞瘤细胞存活和抗铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证不足 | 阐明乳酸代谢相关基因表达谱对视网膜母细胞瘤发生和抗铁死亡的影响 | 视网膜母细胞瘤细胞系和患者组织样本 | 肿瘤代谢 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠异种移植模型 | 转录组数据 | 患者视网膜组织和视网膜母细胞瘤组织的单细胞RNA测序数据 |
| 535 | 2025-05-15 |
Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease
2025-Jun, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04700-3
PMID:39890696
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索帕金森病的新药物靶点 | 首次结合scRNA-Seq和MR方法探索T细胞相关基因对帕金森病风险的因果效应，并识别出五个潜在药物靶点 | 需要进一步的研究和临床试验来验证这些潜在药物靶点的有效性 | 探索帕金森病的致病机制和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 孟德尔随机化(MR), GWAS | NA | 基因表达数据 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞scRNA-Seq数据集 |
| 536 | 2025-05-15 |
A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia
2025-Jun, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.14397
PMID:39988467
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研究论文 | 通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼的长期治疗反应 | 利用单细胞转录组学等多组学方法，首次在分子水平上探索了伊布替尼治疗期间克隆惰性的机制 | 研究样本量较小，仅包含两名患者的数据 | 评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的长期分子和临床反应 | 两名接受伊布替尼单药治疗的慢性淋巴细胞白血病患者 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | DNA和RNA数据 | 两名患者的血液样本 |
| 537 | 2025-05-15 |
Novel Aortic Dissection Model Links Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2025-May-14, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326230
PMID:40365676
|
research paper | 该研究通过创建一种新型的自发性主动脉夹层小鼠模型，揭示了内皮功能障碍和免疫浸润在主动脉夹层发病机制中的作用 | 首次将非综合征性家族性主动脉夹层患者的FBN1基因错义变异（p.G234D）通过CRISPR/Cas9系统引入小鼠，创建了新型自发性AD模型 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证相关发现 | 揭示主动脉夹层的分子机制，特别是内皮细胞和免疫细胞在疾病起始中的作用 | 携带Fbn1G234D/G234D突变的小鼠主动脉组织 | 分子病理学 | 心血管疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、同步辐射成像、Western blot分析 | 小鼠疾病模型 | 基因测序数据、影像数据、蛋白质印迹数据 | Fbn1G234D/G234D突变小鼠（具体数量未明确说明） |
| 538 | 2025-05-15 |
Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites
2025-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.02308-24
PMID:40366173
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了急性MRV感染对鳜鱼幽门盲囊的全球响应机制，特别是浆膜炎的形成及其后续腹水症状的病理过程 | 首次在单细胞分辨率水平解析MRV感染诱导鳜鱼幽门盲囊浆膜炎的细胞组成变化及关键免疫细胞亚群的作用 | 研究仅聚焦于急性感染阶段的病理变化，未涉及慢性感染或不同鱼种间的比较分析 | 阐明MRV感染导致鳜鱼特征性腹水症状的分子病理机制 | 感染MRV病毒的鳜鱼幽门盲囊组织 | 鱼类病理学 | 病毒性鱼病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量（鳜鱼个体及幽门盲囊组织） |
| 539 | 2025-05-15 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Functional Exhaustion of T Cells in Oral Lichen Planus
2025-May-14, Molecular oral microbiology
IF:2.8Q3
DOI:10.1111/omi.12495
PMID:40366262
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了口腔扁平苔藓中T细胞的功能耗竭状态 | 首次在口腔扁平苔藓中使用单细胞RNA测序技术分析T细胞的组成和异质性，揭示了CD8+耗竭T细胞的关键作用 | 样本量较小（仅3名患者和3名健康对照），且小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 探究口腔扁平苔藓免疫微环境中T细胞的组成和功能状态 | 口腔扁平苔藓患者和小鼠模型的T细胞 | 免疫学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、HE染色、免疫荧光染色 | 小鼠慢性炎症模型 | 单细胞转录组数据、组织病理学数据 | 3名口腔扁平苔藓患者和3名健康对照的口腔黏膜组织 |
| 540 | 2025-05-15 |
Identifying Immunomodulatory Subpopulations of Adipose Stromal Vascular Fraction and Stem/Stromal Cells Through Single-Cell Transcriptomics and Bulk Proteomics
2025-May-14, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10889-6
PMID:40366552
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和批量蛋白质组学技术，识别脂肪基质血管部分和干细胞/基质细胞中具有免疫调节功能的亚群 | 整合单细胞RNA测序和批量蛋白质组学数据，首次识别出脂肪基质血管部分中具有不同免疫调节表型的干细胞亚群 | 研究主要基于体外实验数据，需要进一步体内验证 | 解析脂肪来源干细胞/基质细胞的异质性免疫调节潜能 | 脂肪基质血管部分(SVF)和脂肪来源干细胞/基质细胞(ASCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA seq), 批量蛋白质组学 | Scissor算法 | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确提及具体样本数量 |