单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28561 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-06-04 |
Recent advances in cancer-associated fibroblast: Biomarkers, signaling pathways, and therapeutic opportunities
2024-Mar-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003031
PMID:38420743
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综述 | 本文总结了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的研究进展，重点关注其表型和功能的异质性、特定信号通路以及涉及CAFs的治疗策略 | 综述了CAFs的异质性、信号通路和表观遗传变化，并探讨了CAFs作为治疗靶点的潜力 | CAFs在肿瘤微环境中的复杂性仍知之甚少，针对CAFs的临床试验结果大多不理想 | 探讨CAFs在肿瘤微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、基因工程小鼠模型 | NA | NA | NA |
| 522 | 2025-06-04 |
Mapping inherited genetic variation with opposite effects on autoimmune disease and cancer identifies candidate drug targets associated with the anti-tumor immune response
2023-Dec-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.12.23.23300491
PMID:38234717
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研究论文 | 通过系统性分析遗传变异与自身免疫性疾病和癌症的相反关联，识别出潜在的癌症免疫治疗靶点 | 首次系统地识别出与自身免疫性疾病风险和癌症保护相关的遗传变异，并验证了五个基因作为潜在的癌症免疫治疗靶点 | 研究主要基于GWAS数据，功能验证仍需进一步实验 | 识别具有相反自身免疫性疾病和癌症效应的遗传变异，以发现新的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌患者及自身免疫/自身炎症性疾病患者 | 遗传学 | 癌症 | GWAS, RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 240,540例癌症患者/317,000例对照和112,631例自身免疫/自身炎症性疾病患者/895,386例对照 |
| 523 | 2025-06-04 |
An atlas of immune cell transcriptomes in human immunodeficiency virus-infected immunological non-responders identified marker genes that control viral replication
2023-Nov-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002918
PMID:37914674
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了HIV感染免疫无应答者的免疫细胞亚型特征，并鉴定了与病毒复制相关的标志基因 | 首次在单细胞水平上比较了HIV感染免疫应答者和无应答者的免疫细胞转录组差异，并发现了一组与HIV复制相关的单核细胞标志基因 | 样本量相对较小，仅分析了外周血单个核细胞，未涉及其他组织中的免疫细胞 | 探究HIV感染免疫无应答者特定免疫细胞亚型的特征 | HIV感染免疫应答者和无应答者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 免疫应答者(CD4+T细胞计数>500)和免疫无应答者(CD4+T细胞计数<300)的外周血单个核细胞 |
| 524 | 2025-06-04 |
Ovarian cancer mutational processes drive site-specific immune evasion
2022-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05496-1
PMID:36517593
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研究论文 | 该研究通过整合全基因组测序、单细胞RNA测序、数字组织病理学和多重免疫荧光技术，分析了42名未经治疗的高级别浆液性卵巢癌患者的160个肿瘤部位，揭示了突变过程和肿瘤解剖位置如何决定肿瘤微环境的免疫状态 | 首次揭示了卵巢癌突变过程与解剖位置如何共同决定肿瘤微环境的免疫状态，并发现了不同突变类型肿瘤的免疫逃逸机制差异 | 样本量相对有限（42名患者），且仅针对治疗初治患者进行研究 | 评估突变过程和肿瘤解剖位置如何决定肿瘤微环境的免疫状态 | 42名未经治疗的高级别浆液性卵巢癌患者的160个肿瘤部位 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 全基因组测序、单细胞RNA测序、数字组织病理学、多重免疫荧光 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像数据 | 42名患者的160个肿瘤部位 |
| 525 | 2025-06-03 |
Paricalcitol plus hydroxychloroquine enhances gemcitabine activity and induces mesenchymal to epithelial transition in pancreatic ductal adenocarcinoma: A single cell RNA-seq analysis
2025-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217809
PMID:40409452
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研究论文 | 本研究探讨了帕立骨化醇、羟氯喹与吉西他滨联合治疗对胰腺导管腺癌中上皮-间质转化（EMT）的影响 | 首次在单细胞RNA测序水平上揭示了GPH联合治疗通过下调纤维连接蛋白（Fn1）和相关信号通路减少EMT的分子机制 | 研究仅基于KPC-Luc小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索针对胰腺导管腺癌EMT过程的新型联合治疗方案 | KPC-Luc原位小鼠模型中的胰腺导管腺癌细胞 | 肿瘤学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、细胞间通讯分析 | KPC-Luc小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量（基于KPC-Luc小鼠模型） |
| 526 | 2025-06-03 |
Decoding the corneal immune microenvironment in healthy and diabetic mice during corneal wound healing
2025-Jul, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2025.02.010
PMID:40023495
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了健康和糖尿病小鼠角膜在稳态和伤口愈合过程中免疫细胞的转录变化 | 首次建立了健康和糖尿病小鼠角膜伤口愈合过程中免疫细胞的全面单细胞RNA测序转录组图谱 | 研究仅针对小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究糖尿病角膜病变(DK)中免疫微环境的变化机制 | 健康和糖尿病小鼠的角膜免疫细胞 | 生物医学 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 健康和糖尿病小鼠的角膜样本 |
| 527 | 2025-06-03 |
Investigating the molecular mechanisms and clinical potential of APO+ endothelial cells associated with PANoptosis in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma using single-cell sequencing data
2025-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102402
PMID:40318262
|
研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序数据探索了肝细胞癌肿瘤微环境中与PANoptosis相关的APO+内皮细胞的分子机制及临床潜力 | 首次系统性地研究了PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的细胞分布和功能，并揭示了APO+内皮细胞在改善预后和免疫治疗效果中的潜在机制 | 样本量相对较小（16例患者），且研究结果需要进一步的实验验证 | 探究PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的具体功能和分子机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | AUCell算法、CytoTRACE、scMetabolism | 单细胞RNA测序数据 | 16例肝细胞癌患者的单细胞RNA测序样本 |
| 528 | 2025-06-03 |
SARS-CoV-2 Infection of Human Lung Air-Liquid Interface Cultures Reveals Basal Cells as Relevant Targets
2025-Jun-02, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf125
PMID:40065723
|
research paper | 该研究通过感染人类原代鼻和支气管上皮细胞的空气-液体界面培养物，揭示了基底细胞在SARS-CoV-2感染中的重要作用 | 研究发现基底细胞是SARS-CoV-2的重要靶点，并证实了局部应用Camostat mesylate可有效抑制病毒感染和免疫激活 | 研究结果可能受供体特异性影响，且样本来源仅限于鼻和支气管上皮细胞 | 探究SARS-CoV-2感染上呼吸道时涉及的多种上皮细胞类型及其免疫反应 | 人类原代鼻和支气管上皮细胞的空气-液体界面培养物 | NA | COVID-19 | 病毒复制分析、单细胞RNA测序、光谱显微镜 | NA | RNA测序数据、显微镜图像 | 人类原代鼻和支气管上皮细胞培养物（未提供具体样本数量） |
| 529 | 2025-06-03 |
Cxcr3 promotes protection from colorectal cancer liver metastasis by driving NK cell infiltration and plasticity
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI184036
PMID:40168086
|
research paper | 该研究探讨了CXCR3在促进NK细胞浸润和可塑性中的作用，从而保护免受结直肠癌肝转移的影响 | 揭示了CXCR3/配体轴在促进巨噬细胞依赖性NK细胞积累和功能维持中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究NK细胞在结直肠癌肝转移中的抗肿瘤机制 | 结直肠癌肝转移中的NK细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | MC38小鼠模型和SL4诱导的CRC转移模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量，包括小鼠模型和人类患者样本 |
| 530 | 2025-06-03 |
Perivascular Niche-Resident Alveolar Macrophages Promote Interstitial Pneumonitis Related to Trastuzumab Deruxtecan Treatment
2025-Jun-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2021
PMID:40300097
|
research paper | 该研究揭示了曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）通过肺泡巨噬细胞引发间质性肺炎的机制，并提出了预防策略 | 首次发现T-DXd通过肺泡巨噬细胞的Fc-FcγR相互作用触发促间质性肺炎表型转变，并证实血管周围微环境预处理可减轻ADC肺部毒性 | 研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 阐明抗体药物偶联物T-DXd引发间质性肺病的机制并开发预防策略 | 曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）及其诱导的间质性肺病 | 免疫病理学 | 间质性肺病/乳腺癌 | 单细胞RNA测序、活体显微镜成像 | 免疫活性小鼠模型 | 基因表达数据/显微成像数据 | NA |
| 531 | 2025-06-03 |
Vascular Normalization Augments the Anti-tumor Efficacy of Combined HDAC Inhibitor with Immunotherapy in Solid Tumors
2025-Jun-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1033
PMID:40452600
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研究论文 | 本文探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi）与免疫疗法联合使用在实体瘤治疗中的效果，并提出了通过抗血管生成疗法来增强其协同作用的新策略 | 提出了一种结合HDACi、抗血管生成疗法和免疫疗法的新治疗策略，并通过单细胞RNA测序数据验证了其机制 | 研究主要基于患者样本的scRNA-seq数据，未涉及大规模临床试验 | 优化实体瘤的免疫治疗效果 | 实体瘤患者样本 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 患者样本（具体数量未提及） |
| 532 | 2025-06-03 |
Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development
2025-Jun-02, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251336191
PMID:40454459
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research paper | 该研究探讨了Wnt1信号通路在小鼠颅面骨和牙齿发育中的不同作用 | 揭示了Wnt1在不同发育阶段对颅面骨和牙齿发育的差异性影响，并发现了其对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制作用 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类 | 探究Wnt1信号通路在颅面骨和牙齿发育中的具体机制 | 小鼠颅面骨和牙齿 | 发育生物学 | 颅面发育异常 | 单细胞测序、RNA测序、显微CT | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、影像数据 | NA |
| 533 | 2025-06-03 |
CD300A+ CD8+ T Cells as Predictive Biomarkers for Achieving Functional Cure in Chronic Hepatitis B Patients Undergoing Pegylated Interferon-Alpha Therapy
2025-Jun-02, Alimentary pharmacology & therapeutics
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/apt.70214
PMID:40454546
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研究论文 | 本研究探讨了CD300A+ CD8+ T细胞作为慢性乙型肝炎患者接受聚乙二醇干扰素-α治疗实现功能性治愈的预测生物标志物 | 首次发现CD300A+ CD8+ T细胞在功能性治愈患者中显著富集，并具有更强的克隆扩增能力和细胞毒性 | 研究样本量有限，且仅针对HBsAg水平<3000 IU/mL的患者 | 寻找能够预测慢性乙型肝炎患者对聚乙二醇干扰素-α治疗反应的生物标志物 | 慢性乙型肝炎患者 | 免疫学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞转录组分析、T细胞受体测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 发现队列和独立验证队列的慢性乙型肝炎患者 |
| 534 | 2025-06-03 |
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00296.2024
PMID:39772753
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mini-review | 本文探讨了肺内皮细胞（ECs）在健康和肺血管疾病中的异质性，特别关注单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的应用 | 通过scRNA-seq技术揭示了肺内皮细胞的异质性，发现了新的细胞类型如aerocytes和general capillary ECs，并识别了与肺动脉高压（PH）发病机制相关的多个新途径和机制 | NA | 探索肺内皮细胞异质性在肺血管疾病中的作用，特别是肺动脉高压（PH）的发病机制 | 肺内皮细胞（ECs） | 生物医学研究 | 肺动脉高压（PH） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 535 | 2025-06-03 |
Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice
2025-Jun-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00049.2025
PMID:40327412
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研究论文 | 本研究描述了Prop1-iCre敲入小鼠在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的重组活性 | 通过CRISPR/Cas9系统引入IRES-Cre盒，实现了Prop1和Cre重组酶的双顺反子表达，展示了在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的特异性重组活性 | Prop1-iCre小鼠在卵巢颗粒细胞中的重组活性可能会对数据解释造成复杂影响 | 研究Prop1-iCre敲入小鼠的重组活性，为垂体生物学提供基因操作工具 | Prop1-iCre敲入小鼠的垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞 | 分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统，单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据 | Prop1-iCre小鼠及其与Rosa-tdTomato报告鼠的杂交后代 |
| 536 | 2025-06-03 |
Oncostatin-M: a novel leukocyte-derived factor facilitating the ovulatory process in the human ovary
2025-Jun-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf076
PMID:40327872
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研究论文 | 研究探讨了白细胞衍生的Oncostatin-M (OSM)在人类优势卵泡排卵过程中的调控作用 | 首次揭示了OSM在人类排卵过程中的关键作用，特别是在激活信号通路、调节类固醇生成和前列腺素合成方面的功能 | 研究使用的是体外培养的人类颗粒/黄体细胞(hGLCs)，可能无法完全模拟体内排卵动态，且结果仅适用于人类样本，需要在其他哺乳动物物种中验证 | 探索白细胞衍生的OSM是否调控人类优势卵泡的排卵过程 | 人类优势卵泡和体外培养的人类颗粒/黄体细胞(hGLCs) | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量PCR(qPCR)、免疫组化、Western blotting、RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 自然周期女性优势卵泡(n=19)和IVF患者卵泡抽吸物(n=12) |
| 537 | 2025-06-03 |
Dynamics of T Cell-Mediated Immune Signaling Network During Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun, Yonsei medical journal
IF:2.6Q1
DOI:10.3349/ymj.2024.0227
PMID:40414827
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序技术分析了慢性阻塞性肺病（COPD）从轻度到重度阶段的免疫信号网络动态，并探讨了COPD与COVID-19之间的相关性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了COPD从轻度到重度阶段的免疫反应变化，并发现中度COPD与COVID-19具有相似的生物学模式 | 样本量相对较小，尤其是重度COPD患者仅3例，可能影响结果的普遍性 | 识别COPD病情进展的特征标志物，并探索COPD与COVID-19之间的相关性 | 健康个体（43例）、COPD患者（39例）和COVID-19患者（20例） | 生物医学 | 慢性阻塞性肺病（COPD）和COVID-19 | Bulk RNA测序、单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 总计119例样本（43健康人+39 COPD+7轻度+7中度+3重度+20 COVID-19） |
| 538 | 2025-06-03 |
One probe fits all: a highly customizable modular RNA in situ hybridization platform expanding the application of SABER DNA probes
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204775
PMID:40446186
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OneSABER的统一开放平台，用于RNA原位杂交（ISH），扩展了SABER DNA探针的应用 | OneSABER平台使用单一类型的DNA探针，适用于多种单重和多重、比色和荧光ISH方法，提供了高度可定制的模块化解决方案 | 未明确提及具体限制，但可能需要进一步验证在不同样本类型中的广泛适用性 | 开发一个统一的开放平台，简化RNA原位杂交流程，降低研究成本 | 再生扁虫Macrostomum lignano和Schmidtea mediterranea的整体样本，以及福尔马林固定、石蜡包埋的小鼠肠道切片 | 分子生物学 | NA | RNA原位杂交（ISH），信号放大交换反应（SABER） | NA | NA | 未明确提及具体样本数量，但包括扁虫和小鼠肠道切片 |
| 539 | 2025-06-03 |
Anoikis in hepatocellular carcinoma: genetic alterations and immune microenvironment insights from single-cell and computational analysis
2025-May-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02770-2
PMID:40447878
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和计算分析探讨了肝细胞癌中失巢凋亡的遗传变异和免疫微环境特征，并构建了一个基于机器学习的预后模型 | 利用单细胞测序技术揭示肝细胞癌中失巢凋亡相关基因的细胞异质性，并开发了一个基于101种机器学习算法的预后模型 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制 | 分析肝细胞癌的细胞异质性并构建失巢凋亡相关的预后模型 | 肝细胞癌患者和Hep-3B细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、qPCR、shRNA介导的基因敲除 | 机器学习算法（101种） | 单细胞测序数据、临床样本数据 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的数据集及临床样本 |
| 540 | 2025-06-03 |
GSTM1 suppresses cardiac fibrosis post-myocardial infarction through inhibiting lipid peroxidation and ferroptosis
2025-May-31, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00610-6
PMID:40448227
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research paper | 该研究探讨了GSTM1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其机制，发现GSTM1通过抑制脂质过氧化和铁死亡来减轻纤维化 | 首次揭示了GSTM1通过调节脂质代谢和铁死亡相关通路抑制纤维化的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证 | 探究GSTM1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其机制 | 心肌梗死后的小鼠心脏成纤维细胞和人类扩张型心肌病患者的心脏组织 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 蛋白质组学/scRNA-seq、Western blotting、免疫荧光、实时定量PCR、AAV9介导的基因过表达 | 小鼠冠状动脉结扎模型 | 蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据、分子生物学实验数据 | 小鼠模型和人类扩张型心肌病患者的心脏组织 |