单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 40374 篇文献,本页显示第 521 - 540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
521 2026-06-09
Single-cell atlas of AML reveals age-related gene regulatory networks in t(8;21) AML
2026-Feb-11, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过大规模整合已发表的单细胞RNA测序数据集,创建了AML单细胞转录组图谱,并揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络 构建了迄今最大的人类AML单细胞数据资源(含748,679个细胞),并首次利用该图谱揭示t(8;21) AML中年龄相关的基因调控网络特征,发现BCLAF1作为有前景的预后指标 主要基于已发表数据的整合分析,缺乏前瞻性实验验证;年龄相关发现在t(8;21)亚型中验证,对其他AML亚型的推广性有待确认 研究急性髓系白血病中t(8;21)亚型与年龄相关的基因调控网络及其临床意义 来自159名AML患者和51名健康供体的748,679个细胞,以及t(8;21) AML患者的额外多组学数据集(scRNA-seq和scATAC-seq) 数字病理学, 机器学习 急性髓系白血病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 基因调控网络 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 批量转录组数据 159名AML患者和51名健康供体(共748,679个细胞),来自20项研究;额外包含多组学数据集 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 NA NA
522 2026-06-09
KLHDC4 serves as a novel prognostic biomarker and drives tumor progression via PI3K/AKT signaling in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-11, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 整合多组学数据系统评估KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床意义和功能作用,并通过实验验证其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 首次揭示KLHDC4在肾透明细胞癌中通过PI3K/AKT信号通路驱动肿瘤进展,并鉴定为其独立预后标志物和治疗预测因子 未在更大规模队列或不同种族人群中验证,且KLHDC4抑制剂ledipasvir的临床有效性仍需深入研究 阐明KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床相关性、功能作用和分子机制,评估其作为预后标志物和治疗靶点的价值 肾透明细胞癌肿瘤组织、细胞系及小鼠模型 数字病理学 肾癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, Western blot, 分子对接 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 多个癌症类型数据集,具体样本量未详述 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
523 2026-06-09
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity in sepsis and down-regulation of SNHG5/miR-324-5p/CDK16 axis in T cells
2026-Feb-11, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示脓毒症中转录异质性及T细胞中SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴的下调 首次利用单细胞RNA测序绘制脓毒症患者外周血单核细胞图谱,并揭示SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在T细胞凋亡及T淋巴细胞减少中的作用 样本量较小(仅3名患者和3名健康对照),需进一步验证机制并扩大样本 研究脓毒症诱导T淋巴细胞减少的分子机制,降低脓毒症感染发病率和死亡率 脓毒症患者和健康志愿者的外周血单核细胞 机器学习 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 6个样本(3名脓毒症患者和3名健康捐赠者) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3端测序
524 2026-06-09
Single-cell transcriptomics reveal mechanisms of skeletal muscle differentiation across duck embryonic development
2026-Feb-11, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞转录组学揭示鸭胚胎发育过程中骨骼肌分化的机制 首次发现慢肌纤维可通过LEF1+亚型转分化成快肌纤维,并证明该过程在不同脊椎动物中保守 未提及具体局限性 探究鸭胚胎发育中骨骼肌纤维类型多样性的发育起源和调控机制 鸭胚胎发育过程中的骨骼肌 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
525 2026-06-09
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 该研究首次生成了宫颈癌中碱基分辨率的m⁵C转录组图谱,揭示了m⁵C修饰通过稳定SERPINB5 mRNA促进宫颈癌进展和化疗耐药的新机制 首次在宫颈癌中绘制碱基分辨率的m⁵C转录组图谱,并发现m⁵C-SERPINB5轴作为驱动宫颈癌恶性进展和化疗耐药的核心机制 未提及具体限制 探究m⁵C修饰在宫颈癌进展和化疗耐药中的功能机制及治疗意义 宫颈癌组织和细胞系 数字病理学 宫颈癌 RNA甲基化测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 10x Visium用于空间转录组,10x Chromium单细胞3'用于单细胞RNA测序
526 2026-06-09
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors IF:3.0Q1
研究论文 通过单细胞转录组测序揭示重组细粒棘球蚴P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 首次利用单细胞转录组测序技术系统研究了重组Eg.P29蛋白对过敏性哮喘小鼠肺组织免疫细胞的影响,特别是发现Treg细胞中Lag3+Tnfrsf9+亚群的潜在免疫抑制作用 研究仅在小鼠模型中进行,临床转化仍需进一步验证;未涉及人类样本或长期治疗效果评估 研究重组Eg.P29蛋白如何缓解过敏性哮喘小鼠的气道炎症及其免疫机制 过敏性哮喘小鼠和重组Eg.P29蛋白处理的过敏性哮喘小鼠 单细胞转录组学 过敏性哮喘 单细胞转录组测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、细胞因子微球阵列、细胞通讯分析 NA 单细胞基因表达数据、血清抗体水平、炎症因子水平 过敏性哮喘小鼠(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
527 2026-06-09
TCF21-WNT5A axis drives metastasis of colorectal cancer via stromal-tumor cell communication
2026-Feb-11, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,揭示TCF21-WNT5A轴通过基质-肿瘤细胞通讯驱动结直肠癌转移的机制 首次发现TCF21在结直肠癌转移中的高表达及其通过调控WNT5A促进转移的机制,并鉴定了12个与结直肠癌肝转移相关的关键基因 研究主要基于公共数据库数据,需进一步在更多临床样本和动物模型中验证 阐明结直肠癌肝转移的分子机制并发现潜在治疗靶点 结直肠癌组织样本、HCT116细胞系及GEO数据库中的单细胞和批量RNA测序数据 机器学学习 结直肠癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 正常、原发肿瘤和转移组织三组样本 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
528 2026-06-09
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 对空间转录组学中识别差异表达基因的统计方法进行比较研究,并提出基于广义估计方程的方法 提出广义估计方程框架替代Wilcoxon秩和检验,有效纳入空间相关性以降低假阳性率,并在模拟和真实数据中验证了其优越性 研究未评估方法在不同空间转录组平台或更大规模数据集上的泛化能力 开发更稳健的统计方法用于空间转录组数据中的差异表达分析 空间转录组数据中的基因表达模式 机器学习 乳腺癌, 前列腺癌 空间转录组学 广义估计方程 基因表达数据 模拟数据集及乳腺癌、前列腺癌空间转录组数据集 NA 空间转录组学 NA NA
529 2026-06-09
Environmental flame retardant EHDPP stabilizes EGFR to accelerate lung cancer progression: Integrated network toxicology, bioinformatics, and in vitro evidence
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 通过整合网络毒理学、生物信息学和体外实验,揭示环境阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR加速肺癌进展的分子机制 首次阐明EHDPP通过与EGFR结合抑制其泛素化降解,稳定EGFR蛋白并部分激活下游PI3K-AKT信号通路,从而促进肺癌细胞增殖和迁移的分子机制 研究主要基于体外细胞模型和生物信息学分析,缺乏体内动物实验和临床样本验证 探究环境阻燃剂EHDPP促进肺癌进展的分子机制 EHDPP、肺癌细胞(如A549等)、EGFR蛋白、PI3K-AKT信号通路 生物信息学 肺癌 网络毒理学、分子对接、肿瘤生物信息学分析、单细胞RNA测序分析、体外细胞实验 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、分子对接数据 体外细胞模型,具体样本量未在摘要中提及 NA 单细胞RNA测序 NA 公开的单细胞RNA测序数据
530 2026-06-09
Workshop Introduction: Advances of AI Methods in Single Cell Spatial Omics
2026, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
会议简介 介绍在单细胞空间组学中应用人工智能和机器学习的最新进展,涵盖空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学 聚焦AI方法在单细胞空间组学中的前沿应用,包括数据整合、细胞间相互作用建模及转化医学应用 NA 展示AI和机器学习在单细胞空间组学领域的最新方法进展 单细胞空间组学数据,包括转录组、蛋白质组和代谢组 机器学习 NA 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 NA 空间组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
531 2026-06-09
Anti-PD-1 blockade reverses low-intensity electric stimulation-driven pancreatic cancer progression
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 探索低强度电刺激联合抗PD-1阻断对胰腺癌免疫微环境的影响及协同抗肿瘤效应 首次使用原位胰腺导管腺癌模型系统评估低强度电刺激的免疫调节和巨噬细胞极化作用,并发现抗PD-1阻断可逆转低强度电刺激驱动的肿瘤进展 未提及研究局限性 探究低强度电刺激后的肿瘤免疫微环境重塑并评估其与抗PD-1阻断联合的抗肿瘤效果 胰腺导管腺癌小鼠原位模型及肿瘤细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、多色免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据、图像数据 小鼠原位胰腺癌模型 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
532 2026-06-09
A tryptophan metabolism-related gene signature predicts prognosis and immune features in cutaneous melanoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 构建色氨酸代谢相关基因风险模型预测皮肤黑色素瘤预后和免疫特征 首次基于色氨酸代谢相关基因构建五基因风险模型,结合bulk和单细胞RNA测序数据全面分析免疫微环境差异,并通过体外实验验证IDO1对黑色素瘤细胞功能的影响 未明确说明局限性 探索色氨酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤预后和免疫状态中的预测价值 皮肤黑色素瘤患者样本及黑色素瘤细胞系 机器学习 黑色素瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Cox回归风险模型 转录组数据, 临床数据 457例皮肤黑色素瘤患者 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
533 2026-06-09
Molecular heterogeneity of HPV-associated cancers and strategies to overcome treatment resistance
2026, Cancer heterogeneity and plasticity
综述 本文总结了HPV相关癌症的分子异质性及其导致的治疗耐药机制,并探讨了克服这些挑战的新型联合治疗策略 整合单细胞转录组学与HPV整合图谱,揭示病毒和宿主异质性如何共同塑造免疫逃逸和治疗响应,为个性化联合疗法提供框架 未详细讨论具体临床试验数据或定量分析不同联合策略的疗效差异 阐述HPV相关癌症的分子异质性及其对治疗耐药的影响,提出应对策略以改善患者预后 HPV相关癌症(包括宫颈癌、口咽癌、肛门癌及其他肛门生殖器癌)及其肿瘤微环境 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
534 2026-06-09
Piezo1-Fstl1 Axis in Fracture Healing: Modulation of the Chondrocyte Inflammation-ROS-Mitochondrial Damage Cascade and Application of Smart Delivery System
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了智能递药系统通过Piezo1-Fstl1信号轴促进骨折愈合的调控机制,并验证了其对软骨细胞炎症反应、线粒体氧化应激和成骨细胞分化的调节作用 首次揭示了Piezo1-Fstl1轴在骨折愈合中调控软骨细胞炎症-活性氧-线粒体损伤级联反应的作用,并开发了含软骨细胞靶向脂质纳米颗粒的HA-PBA/TA自愈合水凝胶作为智能递药系统 研究主要基于小鼠模型,在人体内的验证尚未进行;智能递药系统的长期安全性和有效性需要进一步评估 探究Piezo1-Fstl1信号轴在骨折愈合中的作用机制并开发智能递药系统促进骨折修复 小鼠股骨骨折模型中的软骨细胞和骨折愈合过程 机器学习和数字病理学 骨折 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠股骨骨折部位组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
535 2026-06-09
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing reveals divergent T-cell immune circuits and a shared osteo-immune pathway in spinal tuberculosis and brucellar spondylitis
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 整合单细胞和批量RNA测序揭示脊柱结核和布鲁氏菌性脊柱炎中不同的T细胞免疫回路和共享的骨免疫通路 首次通过整合单细胞和批量RNA测序比较脊柱结核和布鲁氏菌性脊柱炎的免疫病理机制,发现病原体特异的T细胞回路和共享的骨免疫通路 样本量较小,需要更大规模研究验证结果 阐明脊柱结核和布鲁氏菌性脊柱炎的免疫病理机制差异和共性 脊柱结核和布鲁氏菌性脊柱炎患者的感染椎间盘组织 单细胞转录组学 脊柱结核,布鲁氏菌性脊柱炎 单细胞RNA测序,批量RNA测序,AUCell,伪时间轨迹分析,调控网络推断,细胞间通讯分析 NA 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 单细胞RNA测序:脊柱结核n=3,布鲁氏菌性脊柱炎n=3;批量RNA测序:脊柱结核n=7,布鲁氏菌性脊柱炎n=5;共67,274个高质量细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序,批量RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
536 2026-06-09
Identification of a lactylation-related gene signature in microsatellite stable gastric cancer based on bulk and single-cell RNA-seq
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于批量与单细胞RNA-seq数据,识别微卫星稳定型胃癌中乳酰化相关基因特征并评估其预后和治疗预测价值 首次在微卫星稳定型胃癌中构建乳酰化相关基因特征,并通过单细胞分析揭示关键基因在癌症相关成纤维细胞亚型中的功能角色 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏多中心独立验证队列;功能验证仅通过计算机模拟敲除进行,缺乏体外或体内实验证实 探索乳酰化相关基因特征在微卫星稳定型胃癌中的预后和治疗预测潜力 微卫星稳定型胃癌患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚型 机器学习 胃癌 RNA-seq,单细胞RNA-seq NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 微卫星稳定型胃癌患者数据来自TCGA和GEO数据库 NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
537 2026-06-09
Single-cell landscape of immune remodeling in alopecia areata suggests MIF + fibroblasts and their potential ligand-receptor crosstalk with dendritic cells
2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示斑秃中免疫重塑的特征,特别是MIF+成纤维细胞与树突状细胞之间的配体-受体相互作用 首次发现并鉴定斑秃病变中新型促炎成纤维细胞亚群FB3,该亚群通过高表达MIF参与免疫炎症调控,并提出MIF-(CD74+CXCR4/CD44)信号轴是连接FB3与树突状细胞的核心机制 研究基于公开数据集,样本量有限(15份头皮样本),功能验证和体内实验缺失,亚群特异性标记物尚未完全验证 探究斑秃微环境中基质和上皮细胞在炎症维持中的作用及其与免疫细胞的相互作用 斑秃患者的头皮组织样本(正常皮肤、非病变区和病变区) 单细胞转录组学 斑秃 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 15份头皮样本(包括正常皮肤、非病变区和斑秃病变区) Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 10x Genomics平台生成的scRNA-seq数据,来源于GEO数据库GSE212450和GSE233906数据集
538 2026-06-09
Trainable clustering framework for spatial transcriptomics
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 介绍了一种用于空间转录组学的可训练聚类框架,结合自编码器与聚类层实现空间域识别 提出了一种统一四种互补策略(ACT、FACT、Scatter和Ensemble)的可训练聚类框架,通过自编码器驱动特征学习与Mclust辅助聚类层的联合优化实现端到端训练 未明确讨论模型在大规模数据集上的计算效率或对高度噪声数据的鲁棒性 开发一种用于空间转录组空间域识别的可训练聚类框架 人类DLPFC、小鼠前脑、人类乳腺癌样本 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 自编码器、Mclust 空间转录组数据 人类DLPFC、小鼠前脑和人类乳腺癌数据集,以及Stereo-seq和Slide-seq数据集 NA 空间转录组学 Stereo-seq, Slide-seq NA
539 2026-06-09
Myeloid HDAC7 drives liver inflammation and systemic glucose dysregulation during diet-induced obesity
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 该研究探讨了髓系HDAC7在饮食诱导的肥胖过程中驱动肝脏炎症和全身性葡萄糖失调的作用 首次通过遗传功能获得和缺失实验在小鼠中明确证实髓系HDAC7在肥胖驱动的代谢疾病中促进肝脏炎症和全身性葡萄糖失调,并与人类晚期慢性肝病特征相关 主要基于小鼠模型,尚未完全阐明HDAC7在人类代谢疾病中的具体机制和临床转化价值 研究髓系HDAC7在肥胖驱动的代谢疾病中的功能,特别是在肝脏炎症和葡萄糖代谢中的作用 小鼠模型及人类晚期慢性肝病患者肝脏样本 机器学习 代谢性疾病、慢性肝病 空间转录组学、基因敲除和过表达技术 NA 基因表达数据、空间转录组学数据 小鼠模型(包括转基因和敲除小鼠)及人类晚期慢性肝病患者肝脏样本 NA 空间转录组学 NA NA
540 2026-06-09
Single-cell and repertoire profiling reveals immune remodelling in paediatric upper airway: insights from adenoid hypertrophy
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序和配对B/T细胞受体分析揭示了儿童腺样体肥大中的免疫重塑特征 首次在单细胞分辨率下联合分析腺样体肥大中B细胞和T细胞受体库,发现免疫细胞组成和功能改变 样本量较小(每组4例),且未进行功能性验证实验 解析儿童腺样体肥大中的免疫细胞景观和配对B/T细胞受体谱系变化 儿童腺样体组织(肥大组和对照组各4例) 数字病理学 儿科疾病 10x Genomics 5'单细胞RNA测序,配对VDJ分析 NA 单细胞转录组和免疫受体库数据 8例腺样体组织(4例肥大,4例对照),共72,076个高质量细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞VDJ分析 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 5'试剂盒,含配对V(D)J分析
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