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当前共找到 40705 篇文献,本页显示第 521 - 540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
521 2026-06-17
Stiffness sensing fuels matrix-driven metabolic reboot for kidney repair and regeneration
2025-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过组织工程、遗传和药理学模型及多组学技术,揭示了微纤维相关蛋白2(Mfap2)在急性肾损伤后肾脏修复中通过感知基质刚度驱动代谢重启的关键作用 首次发现Mfap2作为细胞外基质力学传感器通过Esr2-Lats1非经典通路调控肾小管代谢重编程,将组织刚度与肾脏修复的代谢需求联系起来 NA 阐明急性肾损伤后细胞外基质驱动的肾脏修复机制,特别是Mfap2在机械信号转导和代谢调控中的作用 小鼠急性肾损伤模型中的肾脏细胞(成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞)及脱细胞基质 机器学习和多组学分析 急性肾损伤 蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程、遗传模型 NA 蛋白质组、磷酸化蛋白质组、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 NA NA
522 2026-06-17
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2025-Jun-11, Research square
研究论文 通过单细胞转录组学分析,比较早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层细胞、基底板和绒毛膜板细胞滋养层细胞及滋养层干细胞间的差异 首次揭示不同妊娠周龄和胎盘区域(基底板与绒毛膜板)细胞滋养层细胞的转录多样性,并发现滋养层干细胞最类似绒毛外滋养层前体细胞 研究未涉及功能验证实验,且样本量有限,可能限制结果的普适性 探究早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层细胞与滋养层干细胞的转录差异,并明确后者的细胞起源 早期(6-8周)和晚期(12-14周)妊娠早期胎盘绒毛组织,基底板和绒毛膜板区域细胞滋养层细胞,以及三种滋养层干细胞系 单细胞转录组学 正常妊娠 单细胞RNA测序,空间转录组学(GeoMx) NA 基因表达数据,空间转录组数据 多个胎盘组织样本(早期和晚期各阶段)及三种滋养层干细胞系,具体数量未说明 10x Genomics, NanoString 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, NanoString GeoMx 10x Chromium单细胞3'测序,NanoString GeoMx空间转录组学
523 2026-06-17
Aberrant STAT signaling drives T cell dysregulation in a targetable pediatric sepsis endotype
2025-May-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术,在88名危重症儿童的前瞻性队列中鉴定了儿童脓毒症的一个免疫亚型,其特征为IL-6/IFN-γ驱动的T细胞功能异常,并指出JAK/STAT轴作为潜在免疫调节治疗靶点 首次通过整合多组学方法在儿童脓毒症中定义了一个以IL-6/IFN-γ驱动T细胞功能障碍为特征的免疫亚型,并揭示STAT信号异常在其中的关键作用,为靶向治疗提供了新方向 样本量较小(88名儿童),且为单中心研究,可能限制结果的普适性;未对JAK/STAT抑制剂进行干预性验证 阐明儿童脓毒症中导致疾病异质性的免疫机制,并识别可靶向的免疫亚型 88名危重症儿童 机器学习 脓毒症 RNA-seq, 血浆蛋白质组学, 磷酸流式细胞术 无监督聚类 血浆细胞因子数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 88名危重症儿童 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
524 2026-06-17
Spatially Resolved Panoramic in vivo CRISPR Screen via Perturb-DBiT
2025-May-08, Research square
研究论文 提出Perturb-DBiT方法,实现在同一组织切片上同时进行空间全转录组RNA和单导向RNA的共测序,用于全景式体内CRISPR筛选 首次实现空间分辨的体内CRISPR筛选,能够同时测序全转录组总RNA和sgRNA,并检测小RNA和长链非编码RNA的调控变化 当前方法仅能检测小规模扰动面板和少量蛋白编码RNA,本文虽有所突破但可能仍存在组织处理复杂度及适用性限制 开发一种可在天然组织环境中无偏检测基因扰动对RNA调控、细胞动力学及组织结构影响的空间全转录组CRISPR筛选方法 人类癌症转移定植模型和免疫健全同源小鼠模型中的肿瘤组织切片 数字病理学 癌症 空间转录组学、CRISPR筛选、全转录组测序 NA 空间转录组数据、总RNA测序数据、sgRNA测序数据 人类癌症转移定植模型中的肿瘤集落连续组织切片,以及免疫健全同源小鼠模型的肿瘤组织切片 NA 空间转录组学 Perturb-DBiT Perturb-DBiT方法用于空间全转录组总RNA和sgRNA的碱基层面共测序
525 2026-06-17
Exploring OLR1-mediated inflammatory mechanisms in the hematoma microenvironment of acute intracerebral hemorrhage
2025-05-07, Neuroscience IF:2.9Q2
研究论文 探索OLR1介导的急性脑出血血肿微环境中的炎症机制 首次通过单细胞RNA测序和生物信息学分析揭示了OLR1在急性脑出血血肿微环境中的上调及其与单核细胞和巨噬细胞活性的相关性,提出OLR1作为潜在生物标志物和治疗靶点 未明确说明局限性 研究OLR1在急性脑出血血肿微环境中的免疫反应和疾病进展中的作用 急性脑出血患者的外周血、脑组织和血肿样本 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序,实时定量PCR NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 来自GEO数据集的多个数据集,包括外周血、脑组织和血肿样本,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
526 2026-06-17
Harnessing omics data for drug discovery and development in ovarian aging
2025-05-01, Human reproduction update IF:14.8Q1
综述 本文综述了多组学数据在卵巢衰老药物发现与开发中的应用,包括基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和微生物组数据 综合了从组织水平和单细胞视角分析卵巢衰老相关的多组学数据,并探讨如何利用这些新兴数据集识别新药靶点以指导治疗策略 未提及具体限制,但可能包括现有数据源的不足或方法的局限性 综合卵巢衰老相关的多组学数据,探索如何利用这些数据发现新药靶点并指导治疗策略 卵巢衰老相关机制及潜在药物靶点 机器学习 卵巢衰老 多组学、单细胞技术、空间转录组学 深度学习、机器学习 多组学数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Visium 单细胞多组学和空间转录组学平台用于组织分析
527 2026-06-17
Novel insights into kidney disease: the scRNA-seq and spatial transcriptomics approaches: a literature review
2025-04-08, BMC nephrology IF:2.2Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)在肾脏疾病研究中的应用与发展 创新点在于通过整合scRNA-seq与ST技术,以前所未有的分辨率揭示肾脏疾病中的细胞异质性、新型细胞亚群及其空间组织,为靶向治疗和精准医学提供新见解 文献本身未明确提及局限性,但综述类文章通常受限于当前技术的分辨率、样本量或整合分析的挑战 总结scRNA-seq结合ST在肾脏疾病中的应用,阐明其在理解肾脏发育、稳态和疾病进展中的细胞与分子机制 肾脏疾病中的细胞亚群及其在肾微环境中的动态相互作用 数字病理学 肾脏疾病 scRNA-seq, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
528 2026-06-17
CellBouncer, A Unified Toolkit for Single-Cell Demultiplexing and Ambient RNA Analysis, Reveals Hominid Mitochondrial Incompatibilities
2025-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 CellBouncer是一个用于单细胞测序数据解复用和环境RNA分析的计算工具包,揭示了人类和黑猩猩线粒体之间的不相容性 CellBouncer整合了多种功能,包括多物种和多个体细胞混合物的分离与量化、识别未知线粒体单倍型、从脂质结合条形码或CRISPR sgRNA分配处理以及推断池组成,并在这些任务上优于现有方法同时引入了量化每个细胞环境RNA污染、推断个体供体对环境RNA池的贡献以及确定跨数据类型一致的doublet率的新方法 NA 开发一个统一的计算工具包,用于处理来自混合实验的单细胞测序数据,解决解复用和环境RNA分析等关键问题 人类和黑猩猩细胞融合系中的四倍体复合细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 10个不同的细胞融合系 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 基于液滴的单细胞测序平台
529 2026-06-17
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
research paper 本研究探讨了TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 首次阐明YAP/TAZ作为机械敏感转录调控因子在TGF-β诱导的肌肉纤维化中决定纤维/脂肪祖细胞向肌成纤维细胞分化的关键作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养,其结论在人类肌肉纤维化疾病中的适用性尚需进一步验证 探究YAP/TAZ在TGF-β介导的骨骼肌纤维化中的作用及其作为治疗靶点的可能性 骨骼肌纤维/脂肪祖细胞、小鼠模型 machine learning 肌肉纤维化 空间转录组学分析 NA 空间转录组数据 小鼠模型样本 NA spatial transcriptomics NA NA
530 2026-06-17
Endogenously generated Dutch-type Aβ nonfibrillar aggregates dysregulate presynaptic neurotransmission in the absence of detectable inflammation
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究内源性生成的荷兰型Aβ非纤维聚集体在无检测到炎症情况下对突触前神经传递的失调作用 首次揭示荷兰型Aβ非纤维聚集体在无炎症条件下直接导致突触前神经传递异常和线粒体功能障碍 未明确非纤维聚集体如何具体引发突触功能异常的分子机制,且仅关注单一小鼠模型 探究荷兰型Aβ非纤维聚集体对突触前神经传递和线粒体功能的影响及其与炎症的关系 表达荷兰型Aβ突变的小鼠模型(Dutch mice) 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 电子传递链催化测量, 免疫组织化学, 荧光显微镜 NA 基因表达数据, 电生理数据, 代谢数据 多个时间点的小鼠脑组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析兴奋性神经元转录组
531 2026-06-17
Application of scRNA-seq in Dental Research: Seeking Regenerative Clues From the Structure of Tooth and Periodontium in Physical or Pathological States
2025-02-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
综述 全面概述了单细胞RNA测序在牙科研究中的应用,揭示了牙齿和牙周组织的复杂细胞组成、新细胞类型及谱系特征,并总结了组织形成、稳态和再生机制 系统整合了单细胞数据在牙齿和牙周组织稳态、损伤修复及疾病机制中的新发现,从单细胞视角揭示了细胞组成比例变化和细胞间通讯模式的改变 未提及具体局限性 综述单细胞RNA测序在牙齿和牙周组织研究中的应用进展 牙齿和牙周组织 数字病理学 口腔疾病 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
532 2026-06-17
Divergence in cellular markers observed in single-cell transcriptomics datasets between cultured primary trabecular meshwork cells and tissues
2025-Feb-14, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组数据集比较原代小梁网细胞培养物与组织之间的细胞标记差异 首次利用单细胞RNA测序技术系统比较原代人小梁网(hTM)细胞培养物与hTM组织在细胞身份和可转化性方面的差异 未具体说明 揭示原代hTM细胞培养物与组织在单细胞水平上的转录组差异,评估体外研究的可转化性 原代人小梁网细胞培养物和小梁网组织 单细胞转录组学 青光眼 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 14个原代hTM体外样本(包含4名青光眼患者样本),传代1-4代 NA 单细胞RNA测序 NA NA
533 2026-06-17
Regulation of fibroblast phenotype in osteoarthritis using CDKN1A-loaded copper sulfide nanoparticles delivered by mesenchymal stem cells
2025-02-01, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 利用间充质干细胞递送载有CDKN1A质粒的硫化铜纳米颗粒调控骨关节炎中成纤维细胞表型并促进软骨修复 创新性地构建了MSCs@CuS@CDKN1A纳米工程化间充质干细胞平台,通过靶向成纤维细胞表型调控CDKN1A表达,不仅增强软骨修复,还能有效缓解成纤维细胞驱动的炎症,为骨关节炎治疗提供新的策略 研究未提及具体局限性 探讨间充质干细胞递送载有CDKN1A质粒的硫化铜纳米颗粒对骨关节炎中成纤维细胞表型的调控作用及软骨修复效果 骨关节炎中的成纤维细胞、软骨细胞及小鼠模型 NA 骨关节炎 单细胞RNA测序、伪时间分析、GO/KEGG富集分析、WGCNA、微CT扫描、组织学染色、免疫荧光 NA 单细胞RNA测序数据 骨关节炎小鼠模型 Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
534 2026-06-17
A stroke organoids-multiomics platform to study injury mechanism and drug response
2025-Feb, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 建立基于人诱导多能干细胞来源脑类器官的缺氧卒中模型,并结合蛋白质组学、单细胞转录组分析和组织病理学分析,研究卒中损伤机制及药物反应 首次将脑类器官与多组学方法结合,模拟缺氧性卒中,并鉴定出三类星形胶质细胞在缺氧环境中的不同反应,以及中药方剂灯盏生脉胶囊在卒中治疗中的可能作用 NA 利用脑类器官和多组学平台研究卒中损伤机制和药物筛选 人诱导多能干细胞来源的脑类器官 数字病理学 卒中 蛋白质组学, 单细胞转录组分析, 组织病理学分析 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
535 2026-06-17
Single Cell Transcriptome Signatures of Sarcoidosis in Lung Immune Cell Populations
2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 通过对结节病患者和健康对照的支气管肺泡灌洗液细胞进行单细胞RNA测序,揭示了与结节病风险和进展相关的细胞类型、基因表达模式及细胞间相互作用的特征 首次在单细胞水平上系统地描述了结节病中巨噬细胞亚群(包括定居型、高金属硫蛋白定居型、招募型、促纤维化招募型和增殖型)的独特基因表达谱,并发现定居巨噬细胞和招募巨噬细胞中与疾病进展相关的基因表达变化 样本量相对较小,可能限制了检测一些罕见细胞类型或弱效应的能力;未明确提及结节病的具体病因机制 识别与结节病风险和进展相关的细胞特异性分子变化,包括细胞组成、基因表达模式和细胞间相互作用 结节病患者(包括进展性和非进展性)和健康对照者的支气管肺泡灌洗液细胞 machine learning sarcoidosis single-cell RNA-seq NA single-cell RNA-seq data 16例结节病患者(8例进展性、8例非进展性)和14例健康对照 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' protocol (基于CellRanger预处理)
536 2026-06-17
Brain aging and rejuvenation at single-cell resolution
2025-01-08, Neuron IF:14.7Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术在脑衰老与再生研究中的应用,揭示了细胞类型特异性的年龄相关变化及细胞间相互作用,并探讨了组合式再生干预的前景 首次从单细胞分辨率系统总结脑衰老的细胞类型特异性特征,提出神经干细胞作为再生干预焦点的创新方向,并强调组合式再生方法的潜力 未提供原始实验数据,主要基于已发表研究的二次分析;未深入探讨单细胞组学技术在人类脑组织中的技术限制 系统梳理单细胞组学技术对脑衰老机制的研究进展,评估再生干预效果,并展望未来研究方向 大脑中各类细胞,包括神经元、胶质细胞和神经干细胞,以及它们在不同年龄阶段的转录组变化 数字病理学 阿尔茨海默病, 帕金森病 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
537 2026-06-17
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2025-01, The EMBO journal
研究论文 本文利用单细胞RNA测序研究APOBEC3A和APOBEC3B在健康与恶性黏膜上皮中的表达,发现APOBEC3A的表达主要局限于终末分化细胞,并需要GRHL3转录因子,而鳞状细胞癌中GRHL3表达扩展至增殖细胞,导致APOBEC3A突变活性获得 首次揭示APOBEC3A表达受GRHL3调控并在终末分化细胞中特异性表达,以及鳞状细胞癌中GRHL3扩展至增殖细胞导致APOBEC3A突变活性的机制 未明确提及研究限制,但可能受限于样本量或实验方法的局限性 研究APOBEC3A和APOBEC3B在健康与恶性黏膜上皮中的表达模式及其在鳞状细胞癌中的突变机制 健康与恶性黏膜上皮细胞(包括角质形成细胞和鳞状细胞癌细胞) 数字病理学 鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学、空间转录组学 未提及特定模型 单细胞转录组数据、空间转录组数据、免疫组化图像 未明确说明样本数量,但涉及健康与恶性黏膜上皮组织 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学
538 2026-06-17
Novel integrated multiomics analysis reveals a key role for integrin beta-like 1 in wound scarring
2025-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 开发了一种新型高分辨率空间多组学方法,整合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了整合素β样1在伤口瘢痕形成中的关键作用 首次开发了整合空间转录组学与单细胞RNA测序的高分辨率空间多组学方法,识别了修复过程中细胞间通讯和信号传导的新特征 未提供具体局限性信息 探究伤口愈合过程中分子与空间组织在单细胞水平上的关系,以及炎症相关瘢痕形成的机制 PU.1小鼠、转基因小鼠、人类和鼠类原代成纤维细胞 数字病理学 瘢痕形成 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、空间转录组数据 PU.1小鼠数据、转基因小鼠实验、人类和鼠类原代成纤维细胞体外实验 10x Genomics 空间转录组学、单细胞RNA测序 Visium Visium空间转录组学平台
539 2026-06-17
Identification of prognostic biomarkers for endometrioid endometrial carcinoma based on the miRNA and mRNA co-expression network regulated by estradiol
2025, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
研究论文 基于雌二醇调控的miRNA和mRNA共表达网络,鉴定子宫内膜样子宫内膜癌的预后生物标志物 首次通过雌二醇处理的Ishikawa细胞和TCGA数据整合,发现miR-142-5p-SACS和miR-30a-5p-GPR157作为EEC潜在预后标志物,并结合单细胞转录组分析基因表达变化 研究基于有限的细胞系样本(n=3每组)和公共数据库,缺乏大规模临床验证 鉴定与雌二醇调控相关的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 子宫内膜癌Ishikawa细胞,以及TCGA数据库中的EEC患者数据(n=408) 机器学习 子宫内膜癌 RNA-seq, miRNA-seq, 单细胞转录组测序 Kaplan-Meier生存分析 RNA表达谱,miRNA表达谱,单细胞转录组数据 408例TCGA样本,6个细胞样本(雌二醇处理组和对照组各3个) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
540 2026-06-17
Ionizing radiation inhibits zebrafish embryo hatching through induction of tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMPs) expression
2024-12, The FEBS journal
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,揭示电离辐射通过诱导组织金属蛋白酶抑制剂表达抑制斑马鱼胚胎孵化的分子机制 首次通过单细胞RNA测序在脊椎动物发育过程中揭示电离辐射对脑/中枢神经系统和孵化腺细胞簇比例的影响,并发现组织金属蛋白酶抑制剂在孵化腺中上调是导致孵化延迟的关键调控机制 虽然观察到了孵化延迟,但未观察到包括大脑在内的某些器官的形态学变化 揭示电离辐射对水生生物和人类生物学效应的分子机制,特别是在脊椎动物发育过程中的影响 斑马鱼胚胎 生物信息学 辐射损伤 单细胞RNA测序、全胚胎原位杂交 NA 基因表达数据 斑马鱼胚胎,暴露于5戈瑞电离辐射 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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