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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-05-28 |
Protocol for spatially resolved pathology scores using optimal transport on spatial transcriptomics data
2026-May-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104584
PMID:42160174
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研究方案 | 提供了一种利用最优传输在空间转录组数据上量化病理学评分的方案 | 首次利用最优传输方法将疾病与健康组织的空间转录组点对应，从而生成每个点的病理学评分 | 未明确提及限制，可能需要依赖健康组织参考数据 | 开发一种量化空间转录组数据中病理学评分的新协议 | 人类和小鼠的空间转录组数据集 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 支持向量回归 | 空间转录组数据 | 多个人类和小鼠数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 522 | 2026-05-28 |
A Counterfactual Framework for Directional Cell-Cell Interaction Analysis in Spatial Transcriptomics
2026-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716510
PMID:42005861
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研究论文 | 提出一个基于反事实推理的框架，用于空间转录组学中定向细胞-细胞相互作用分析，无需配体-受体先验知识 | 首次将反事实干预框架引入空间转录组学，用于量化细胞间的定向影响，无需依赖配体-受体对先验信息 | 依赖核心级引导决策和模型假设，在极其复杂的组织微环境中可能忽略更细微的相互作用 | 开发一种统计严谨且可扩展的模型化方法，用于空间转录组学中基于反事实的定向依赖分析 | Xenium胆管癌组织微阵列（38个核心）中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 邻域条件图模型 | 空间转录组学数据（Xenium平台） | 38个核心（Xenium胆管癌组织微阵列） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium组织微阵列（TMA） |
| 523 | 2026-05-28 |
The USP7-VIM axis mediates lipid metabolic remodelling and compromises CD8+ T-cell mitochondrial fitness in glioblastoma
2026-May-19, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152623
PMID:42162598
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中USP7-VIM轴介导的脂质代谢重塑及CD8+ T细胞线粒体功能受损的机制 | 首次发现细胞外肿瘤来源的VIM通过USP7去泛素化酶调控其稳定性，进而影响CD8+ T细胞代谢适应性并抑制抗肿瘤免疫，突破了VIM仅作为细胞骨架蛋白的传统认知 | 未明确提及具体研究限制，但可能包括动物模型与人类临床结局的差异、体外培养条件与体内微环境的复杂性差异 | 阐明胶质母细胞瘤中VIM通过CD8+ T细胞介导免疫抑制的分子机制，并探索潜在治疗靶点 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞、CD8+ T细胞、VIM敲低及过表达的小鼠模型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、功能分析、代谢组学分析、蛋白质稳定性分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、代谢组学数据 | 未明确提及样本数量，但包括VIM高表达及低表达肿瘤微环境中的CD8+ T细胞及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒 |
| 524 | 2026-05-28 |
Turkey oviduct epithelial organoids express region-associated markers and avian influenza virus receptors†
2026-05-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf274
PMID:41369270
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研究论文 | 利用火鸡输卵管上皮类器官研究禽流感病毒受体表达和区域特异性分子特征 | 首次建立火鸡生殖道的单细胞图谱，并验证输卵管上皮类器官保留区域相关分子身份和禽流感病毒受体表达，为体外模型研究提供基础 | 样本量有限（仅两只性成熟母鸡），且类器官模型未能完全覆盖所有输卵管区域 | 验证火鸡输卵管上皮类器官模型的可靠性，并建立生殖道单细胞图谱以支持禽流感病毒感染性研究 | 火鸡（Meleagris gallopavo）的输卵管上皮类器官和生殖道组织 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序，免疫荧光染色 | 类器官（organoids） | 基因表达数据（scRNA-seq和bulk RNA-seq），图像数据（免疫荧光染色） | scRNA-seq来自两只性成熟母鸡的六个输卵管区域；bulk RNA-seq使用两份类器官样本；免疫荧光染色使用四份类器官样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2026-05-28 |
Altered immune and treatment response gene expression signatures among povertyexposed children with B-cell acute lymphoblastic leukemia
2026-May-07, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.289187
PMID:42095251
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析贫困暴露儿童B细胞急性淋巴细胞白血病中白血病母细胞及其微环境的转录特征，发现贫困暴露患者表现出类固醇耐药性转录信号及免疫反应改变 | 首次通过单细胞RNA测序揭示贫困暴露的B-ALL患儿在诊断时即存在类固醇耐药性转录信号，并观察到髓系细胞炎症信号上调及CD8+ T细胞效应信号下调 | NA | 探究贫困暴露对B细胞急性淋巴细胞白血病患儿治疗反应和免疫相关基因表达的影响机制 | 贫困暴露的标准风险B-ALL患儿的白血病母细胞及其微环境 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2026-05-28 |
Identifying batch-integrated domains from spatial transcriptomics via graph autoencoder with contrastive learning based on cross-modality and data augmentation
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag248
PMID:42184117
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研究论文 | 提出一种名为GCAST的图对比自编码器框架，通过跨模态对比学习和数据增强来整合空间转录组学数据，从而识别批次整合的组织域 | 首次将基于组织学图像与基因表达数据的跨模态对比学习引入空间转录组学分析，并采用块对角图构建自动对齐多个数据集以实现批次校正，无需人工干预 | 依赖组织学图像的可用性，在无图像数据时可能限制部分对比学习优势，且未探讨高噪声或低分辨率数据下的性能 | 开发一种统一、生物信息丰富的分析框架，解决空间转录组学中组织学信息利用不足和跨模态对比策略缺失的问题 | 空间转录组学多模态数据（基因表达和组织学图像），以及多个数据集整合分析中的组织域识别 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图对比自编码器（GCAST） | 空间基因表达数据和组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 527 | 2026-05-28 |
A comprehensive survey of computer vision methods for spatial transcriptomics
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag255
PMID:42184118
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综述论文 | 本文首次系统综述了计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用，按架构、学习范式、任务和数据集分类，并追踪了技术演进 | 首次对空间转录组学中的计算机视觉AI模型进行系统综述，提出了超越传统生物信息学的新视角，包括虚拟测序、3D组织重建等创新方向 | 空间转录组学仍面临高成本、临床适用性有限、依赖2D分析等关键限制 | 系统梳理计算机视觉AI在空间转录组学分析中的应用现状与未来方向 | 空间转录组学数据及其对应的组织学图像 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 528 | 2026-05-28 |
Single Cell RNA Transcriptomics of Mantle Cell Lymphoma Reveals the Presence of Treatment-Resistant Subclones at the Time of Diagnosis
2026-05, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70270
PMID:41802856
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研究论文 | 对套细胞淋巴瘤（MCL）进行单细胞RNA测序，揭示了诊断时即存在治疗耐药亚克隆，以及这些亚克隆在复发中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序证实MCL诊断时已存在治疗耐药亚克隆，并发现细胞周期控制通路的失调是患者间共享特征，同时发现惰性MCL（iMCL）的疾病进展可由空间限制性克隆进化驱动 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量较小（仅6对样本）及缺乏功能验证实验 | 研究套细胞淋巴瘤（MCL）早期复发背后的克隆动态机制，特别是治疗耐药亚克隆的起源和演化 | 套细胞淋巴瘤（MCL）患者的配对肿瘤样本（诊断时和首次复发时），包括一例SOX11阴性惰性MCL（iMCL）的骨髓、外周血和肠道样本 | 数字病理学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6对（6名患者的诊断和首次复发配对样本），另加一例iMCL的骨髓、外周血和肠道样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 529 | 2026-05-28 |
Systems Biology Identifies TARS2 as a Cardiomyocyte Regulator of Mitochondrial Oxidative Stress in Dilated Cardiomyopathy
2026-May, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2026.101535
PMID:42048853
|
研究论文 | 通过系统生物学方法鉴定TARS2为扩张型心肌病中心肌细胞线粒体氧化应激的关键调控因子 | 首次通过整合批量、单细胞和空间转录组学与机器学习，鉴定TARS2为心肌细胞富集的线粒体氧化应激调控因子，并揭示其在扩张型心肌病中的病理作用 | 未提及具体局限性 | 阐明扩张型心肌病中线粒体氧化应激的分子驱动因子 | 扩张型心肌病患者心脏组织及心肌细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学, Illumina NovaSeq批量RNA测序 |
| 530 | 2026-05-28 |
Single-Cell Dissection of Malignant Cell Heterogeneity Reveals Functional Programs and Clinically Relevant Subtypes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-May, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70104
PMID:42068156
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示头颈部鳞状细胞癌中恶性细胞的异质性、功能程序及临床相关亚型 | 首次整合58例HNSCC患者的scRNA-seq数据，系统描绘恶性细胞亚群及其分化轨迹、空间定位和临床关联，并开发恶性细胞评分（MCScore）用于预后和免疫治疗反应预测 | 未明确说明，但从研究设计推测可能包括样本量有限、缺乏独立验证队列、scRNA-seq数据整合中的批次效应处理等 | 解析头颈部鳞状细胞癌恶性细胞异质性，识别功能性表达程序及临床相关亚型，以改善预后和治疗分层 | 58例头颈部鳞状细胞癌患者的181,003个恶性细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | hdWGCNA, NMF | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 58例患者，181,003个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2026-05-28 |
Random Projection Methods Outperform Principal Component Analysis for Dimensionality Reduction in Single Cell RNA-Seq
2026 May-Jun, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261436821
PMID:42041160
|
研究论文 | 系统地比较了主成分分析和随机投影方法在单细胞RNA测序数据降维中的性能 | 引入了一种匹配稀疏随机投影算法，可根据输入数据稀疏模式自适应调整投影矩阵密度，并在多个scRNA-seq数据集上综合评估了多种RP方法相比PCA在计算速度和聚类质量方面的优势 | 未提及具体限制 | 为下游分析中平衡计算需求、可扩展性和分析质量的降维策略选择提供关键指导 | 多个公开可用的scRNA-seq数据集，包括有标签和无标签场景 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 主成分分析、随机投影、稀疏随机投影、高斯随机投影、匹配稀疏随机投影 | 基因表达数据 | 多个公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 532 | 2026-05-28 |
Glial multicellular programs reveal distinct patient stratification in Parkinson's disease
2026-Apr-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9520754/v1
PMID:42094040
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研究论文 | 通过整合单核RNA测序和空间转录组学，揭示帕金森病中胶质细胞的多细胞程序，并实现患者分层 | 首次发现帕金森病中胶质细胞存在两种互斥的多细胞程序（炎症相关和内质网应激相关），且这些程序能覆盖传统帕金森病分子变化的不同方面，重新定义了疾病为全脑范围内的系统性胶质细胞多细胞状态 | 未明确提及 | 解析帕金森病背侧纹状体中胶质细胞协调的多细胞反应及其对患者分层的意义 | 56名捐赠者的背侧纹状体样本（涉及不同Lewy小体疾病阶段） | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 56名捐赠者 | 10x Genomics | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序，10x Visium空间转录组学 |
| 533 | 2026-05-28 |
Diverse high-fat diets drive multi-omic reprogramming that persists after dietary reversal
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.708620
PMID:41889866
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研究论文 | 本研究探讨了不同高脂饮食对宿主和肠道微生物组的多组学重编程影响，以及这些变化在饮食逆转后的持久性 | 首次系统揭示了高脂饮食来源、基线微生物组结构和饮食历史如何共同塑造宿主-微生物组相互作用，并发现饮食逆转后部分微生物和宿主基因表达的改变持续存在，形成“微生物组记忆”效应 | 研究仅在动物模型中进行，对人类影响的直接推断需谨慎；饮食逆转观察时间窗口有限，未能完全捕捉所有改变的恢复过程 | 定义高脂饮食中不同脂肪来源对宿主和微生物组的长期影响，并评估这些影响在饮食逆转后的可逆性 | 小鼠及肠道微生物组 | 数字病理学 | NA | 多组学技术，包括粪便宏基因组学、粪便代谢组学、血浆代谢组学、脂质组学和肠道单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据（宏基因组、代谢组、脂质组、单细胞转录组） | 小鼠多个队列，包括一年饲养和饮食逆转实验，具体样本量文中未明述 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于肠道单细胞RNA测序 |
| 534 | 2026-05-28 |
The heterogeneity and sexual-dimorphism of human TCRαβ+CD4-CD8- double negative T cells
2026-Apr-18, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.04.008
PMID:42009279
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研究论文 | 通过单细胞转录组、TCR库和染色质可及性分析，揭示了人类外周血TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞的异质性和性别二态性 | 首次系统描绘了外周血双阴性T细胞的单细胞多组学特征，发现了其亚群在基因表达、转录调控、发育特征和性别异质性方面的差异，并揭示了这些亚群在溃疡性结肠炎和1型糖尿病中的变化 | 仅基于10个健康供体的样本，且未对功能机制进行深入验证 | 探究人类外周血TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞的分子和功能特征及其在疾病中的潜在作用 | 10名健康供体的外周血双阴性T细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎, 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 单细胞ATAC测序 | 未明确提及 | 单细胞转录组数据, TCR库数据, 染色质可及性数据 | 10名健康供体的外周血样本，以及公开数据中的溃疡性结肠炎和1型糖尿病患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞ATAC测序平台 |
| 535 | 2026-05-28 |
RTCB is essential for early mouse embryogenesis
2026-04-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioag008
PMID:41524728
|
研究论文 | 通过条件性敲除小鼠模型，发现RTCB对早期小鼠胚胎发生至关重要，其缺失导致原肠胚形成失败 | 首次揭示RTCB在小鼠胚胎原肠胚形成中的关键作用，并提出了YY1-RTCB-NUSAP1调控轴 | 研究主要基于小鼠模型，人类胚胎中相关机制的验证仍需进一步实验 | 探索RTCB在哺乳动物生殖和早期胚胎发育中的功能 | 小鼠胚胎组织和NIH 3T3细胞 | 机器学习 | NA | 条件性基因敲除、组织学分析、免疫组化、定量PCR、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎样本（E3.5至E7.5）及NIH 3T3细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 536 | 2026-05-28 |
Characterization and regulatory mechanism evaluation of C8orf33 in hepatocellular carcinoma through multiomics profiling
2026-Apr-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04951-z
PMID:41965457
|
研究论文 | 通过多组学分析表征C8orf33在肝细胞癌中的表达谱及其调控机制 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学多组学方法，全面解析C8orf33在肝细胞癌中的表达景观及其与巨噬细胞免疫调节的潜在联系 | 仅使用Huh7细胞系进行功能验证，缺乏其他细胞系及体内模型的深入验证 | 探究C8orf33在肝细胞癌中的生物学功能及调控机制 | C8orf33基因及其在肝细胞癌中的表达与功能 | 计算机视觉 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 多个癌症样本（具体数量未说明）及肝细胞癌细胞系Huh7 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 537 | 2026-04-11 |
Single-cell and spatial transcriptomics analyses reveal tumor microenvironment-driven proliferation of NF2-associated vestibular schwannomas
2026-Apr-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03799-y
PMID:41957607
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2026-05-28 |
Integrating single-cell transcriptomics and epigenetics in a multi-omics MR framework identifies PARK7 as a causal gene in streptococcal septicemia
2026-Apr-05, Epigenetics & chromatin
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s13072-026-00673-2
PMID:41937214
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 539 | 2026-04-06 |
Integration of machine learning-based screening approaches and single-cell sequencing technique to identify cancer stemness genes associated with radiotherapy resistance in lung adenocarcinoma
2026-Apr-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04873-w
PMID:41934581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2026-05-28 |
Helicobacter pylori-linked gene CFAP73 rewires epithelial programs and shapes the gastric cancer microenvironment
2026-Apr-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04891-8
PMID:41934579
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研究论文 | 该研究揭示了HP感染相关基因CFAP73通过重编程上皮程序并塑造胃癌微环境，促进肿瘤抑制和免疫激活的作用 | 首次发现CFAP73作为HP感染过程中进行性下调的肿瘤保护基因，并明确其通过抑制增殖、EMT和激活p53/凋亡通路来维持上皮抑癌状态，同时通过配体-受体分析和空间转录组学揭示其重塑纤维细胞和T细胞状态以维持抗肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要基于公共数据库和体外/体内实验，尚需更大规模的前瞻性队列验证CFAP73作为生物标志物的临床价值，且CFAP73在HP感染早期下调的具体分子机制有待进一步阐明 | 探究胃上皮细胞在HP感染过程中逐渐紊乱的分子程序，并寻找与恶性转化相关的关键基因 | HP感染相关的胃黏膜上皮细胞和胃癌微环境中的免疫细胞、成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq | 随机森林 | 文本 | 多个公共数据集（GSE60662、GSE60427、TCGA-STAD）及单细胞RNA-seq数据集GSE249874 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |