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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-06-07 |
SM3DD with segmented PCA: a comprehensive method for interpreting 3D spatial transcriptomics
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag007
PMID:41608733
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研究论文 | 开发了一种名为SM3DD的细胞分割/注释无关方法，用于分析三维空间转录组数据，并比较正常肺组织与SARS-CoV-2患者肺组织 | 提出了一种完全无需细胞分割或注释的标准化最小三维距离分析方法，并结合分段主成分分析解读空间转录组数据 | 标题和摘要中未明确提及本文的局限性 | 开发并验证一种解释三维空间转录组数据的综合方法，以揭示疾病相关的生物学通路 | 16名临床正常个体和18名死于急性呼吸窘迫综合征的SARS-CoV-2患者的肺组织 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 34个肺组织样本（16个正常，18个SARS-CoV-2患者） | 布鲁克空间生物学 | 空间转录组学 | CosMx空间分子成像仪 | CosMx空间分子成像仪（布鲁克空间生物学，美国）用于确定RNA空间坐标 |
| 522 | 2026-06-07 |
Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases
2026-Feb-28, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.034
PMID:41611568
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综述 | 系统总结了截至2025年9月的77种空间转录组技术和594种分析工具，并开发了SpatialToolDB平台以支持技术和方法选择 | 首次全面整合空间转录组技术、分析工具和相关数据库，创建了动态更新的SpatialToolDB平台，便于研究者进行方法比较和工具选择 | 未提及具体局限性 | 为空间转录组技术选择和分析策略提供数据驱动的指导，支持多样化的生物学和转化研究应用 | 空间转录组技术平台和分析工具 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 594个分析工具，77种技术 | 10x Genomics, Visium, 等 | 空间转录组学 | 10x Visium, 等 | 涵盖多种空间转录组平台，包括但不限于10x Visium，具体平台因技术而异 |
| 523 | 2026-06-07 |
Activated CD38+ mast cells promote gastric cancer progression by suppressing CD8+ T cell cytotoxic activity through adenosine metabolism
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116863
PMID:41579372
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研究论文 | 通过对幽门螺杆菌感染相关胃癌进展四个典型阶段的21个胃粘膜进行单细胞RNA测序，揭示了激活的CD38+肥大细胞通过腺苷代谢抑制CD8+ T细胞细胞毒性活性从而促进胃癌进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序系统描绘了幽门螺杆菌感染下胃癌进展过程中胃粘膜微环境的动态变化，并鉴定出激活的肥大细胞通过CD38和COX2上调增加腺苷和前列腺素E分泌，进而抑制CD8+ T细胞杀伤功能的新机制 | NA | 阐明幽门螺杆菌感染相关胃癌进展过程中胃粘膜微环境的动态变化及免疫细胞相互作用机制 | 幽门螺杆菌感染相关胃癌进展四个典型阶段的胃粘膜组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21个胃粘膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 524 | 2026-06-07 |
Evaluation of statistical differential analysis methods for identification of senescent cells using single-cell transcriptomics
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101264
PMID:41576958
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研究论文 | 系统评估了10种基于Seurat的DGE方法在单细胞转录组数据中识别衰老细胞的表现 | 首次全面评估了Seurat包中多种差异表达（DGE）分析方法在衰老细胞识别场景下的性能 | 研究未考虑真实数据中的批次效应等技术噪声，且仅基于模拟和有限真实数据集 | 评估统计差异分析方法在单细胞转录组数据识别衰老细胞中的性能 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集的差异表达分析结果 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数值（基因表达矩阵） | 模拟数据集包含多个样本规模，真实数据集未明确说明具体数量 | NA | 单细胞RNA测序 | Seurat | 基于Seurat包实现的10种DGE方法（Wilcox, Wilcox-limma, bimod, roc, t, negbinom, Poisson, LR, MAST, DESeq2） |
| 525 | 2026-06-07 |
RORγt+ dendritic cells are a distinct lymphoid-derived lineage
2026-Feb-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aed7439
PMID:41591258
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研究论文 | 本文鉴定RORγt+树突状细胞为一种独特的淋巴来源细胞谱系，可维护肠道免疫耐受 | 首次揭示RORγt DC源自淋巴祖细胞，并发现其发育依赖特定的增强子和转录因子调控网络 | 研究仅限于小鼠模型，人类中是否存在类似谱系尚待验证 | 阐明耐受性树突状细胞谱系的建立机制，以防止对共生菌和食物抗原的不适当免疫反应 | 小鼠RORγt+树突状细胞及其前体细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨髓和前体细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 526 | 2026-06-07 |
PM2.5 impairs gliovascular coupling via endothelial AHR-mitochondrial signaling in mice
2026-Feb-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141275
PMID:41621300
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研究论文 | 该研究揭示PM2.5通过内皮AHR-线粒体信号通路损害小鼠胶质血管耦合的机制 | 首次证明内皮AHR作为PM2.5的关键传感器，通过线粒体应激和Parkin依赖性线粒体自噬导致血管收缩和脑灌注减少，并利用空间转录组学揭示了区域和细胞特异性损伤，弥补了常规RNA测序的不足 | 该研究基于动物模型，可能无法完全模拟人类长期暴露于PM2.5的复杂情况；未涉及人类样本验证 | 探究PM2.5污染导致神经血管功能障碍的细胞机制 | 小鼠（通过吸入和气管滴注模型暴露于PM2.5） | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学、高分辨率成像、体外检测 | NA | 图像、文本、基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 527 | 2026-06-07 |
Breast Cancer Brain Metastases: Current Understanding and Future Directions
2026-Feb-05, Current oncology reports
IF:4.7Q1
DOI:10.1007/s11912-026-01753-y
PMID:41642399
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综述 | 综述乳腺癌脑转移的最新进展，包括转移机制、肿瘤微环境相互作用、受体不一致性、诊断创新及治疗策略 | 整合了JAK-STAT信号、同源重组缺陷、神经元拟态等新机制，并强调受体不一致性对系统治疗的影响以及液体活检、空间转录组学等新兴诊断工具的应用 | 机器学习外部验证有限，前瞻性试验证据不足 | 阐明乳腺癌脑转移的精准管理策略并确定未来研究优先方向 | 乳腺癌脑转移的分子机制、诊断方法和治疗策略 | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像， 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 528 | 2026-06-07 |
Integrative metabolomic and single-cell transcriptomic analysis of recurrent condyloma acuminatum in humans
2026-Feb-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37989-8
PMID:41639275
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研究论文 | 结合代谢组学和单细胞转录组学分析复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制 | 首次整合代谢组学与单细胞RNA测序，揭示复发尖锐湿疣中角质细胞、M2巨噬细胞和树突状细胞中代谢基因失调及精氨酸-多胺通路改变的协同作用 | NA | 探究尖锐湿疣复发的分子和免疫机制 | 人类尖锐湿疣复发患者的病变组织 | 单细胞转录组学 | 尖锐湿疣 | 代谢组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据，单细胞转录组数据 | 人类复发尖锐湿疣病变组织和对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2026-06-07 |
STransfer: a transfer learning-enhanced graph convolutional network for clustering spatial transcriptomics data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag049
PMID:41601194
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研究论文 | 提出一种基于迁移学习的图卷积网络STransfer，用于空间转录组数据聚类 | 结合图卷积网络与正点互信息分别建模局部和全局空间依赖，利用注意力机制融合多图特征，并引入跨切片知识迁移提升未标记切片聚类精度 | 未明确提及局限性（摘要中仅聚焦方法优势与实验验证） | 提升空间转录组多切片数据集的聚类准确性并降低人工标注成本 | 空间转录组组织切片数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络（GCN） | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 530 | 2026-06-07 |
Inference of marker genes of subtle cell state changes via iLR: iterative logistic regression
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag051
PMID:41627891
|
研究论文 | 提出迭代逻辑回归（iLR）方法，用于从单细胞RNA测序数据中识别微小细胞状态变化的标记基因 | 结合帕累托前沿优化平衡基因集大小和分类性能，能识别跨器官、跨物种的转录特征 | 仅在模拟数据和特定疾病数据集上验证，实际临床适用性需进一步测试 | 开发一种能从复杂单细胞数据中推断可解释转录特征的方法 | 神经元亚型（健康vs自闭症患者）、不同肿瘤微环境中的细胞类型 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍， 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2026-06-07 |
TOP2A drives T-cell infiltration and immune remodeling in cyclophosphamide-induced cystitis: a single-cell sequencing study with potential implications for interstitial cystitis
2026-Feb-02, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-026-02061-0
PMID:41622168
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研究论文 | 利用环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型，通过单细胞测序揭示TOP2A驱动T细胞浸润和免疫重塑的机制，为间质性膀胱炎提供潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序联合节律基因和免疫微环境分析，发现TOP2A是连接节律基因簇和免疫基因簇的唯一重叠基因，并验证其与T细胞浸润的强相关性 | 研究仅限于动物模型，尚未在人类间质性膀胱炎组织中进行验证，且机制探究未深入阐明TOP2A调控T细胞浸润的具体信号通路 | 探讨环磷酰胺诱导的膀胱炎模型中节律基因和免疫微环境重塑的作用，重点关注TOP2A对T细胞浸润的影响 | 环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型及膀胱组织 | 数字病理学 | 间质性膀胱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型（具体样本量未提供） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 532 | 2026-06-07 |
Single-nucleus transcriptional and chromatin accessibility analyses of maturing mouse Achilles tendon uncover the molecular landscape of tendon stem/progenitor cells
2026-Feb-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104768
PMID:41627310
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研究论文 | 通过单细胞核转录组和染色质可及性分析，揭示了小鼠成熟跟腱中肌腱干/祖细胞的分子特征 | 首次鉴定出CD55和CD248作为肌腱干/祖细胞的新型表面抗原标志物 | 未提及具体局限性 | 研究肌腱修复能力随生长下降的分子机制，鉴定肌腱干/祖细胞特征标志物 | 2周龄和6周龄小鼠的跟腱细胞 | 单细胞组学 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 2周龄和6周龄小鼠跟腱组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序, 单细胞核ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞核ATAC测序系统 |
| 533 | 2026-06-07 |
A single-nucleus RNA sequencing reveals the differential fate mechanism underlying flavonoid biosynthesis of middle and inner tepals in Chimonanthus praecox
2026-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150307
PMID:41554353
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研究论文 | 通过单核RNA测序揭示蜡梅内层和中层花被片中类黄酮生物合成的差异命运机制 | 首次利用单核RNA测序构建蜡梅花被片的单细胞转录组图谱，并通过伪时间分析发现细胞发育调控决定花被片颜色命运，同时鉴定了多个关键转录因子 | 尚未明确这些调控因子在花被片颜色形成中的具体功能验证 | 理解蜡梅花被片中类黄酮代谢物特定积累的分子机制 | 蜡梅内层和中层花被片 | 数字病理学 | 不适用 | 单核RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 内层花被片13,073个细胞核，中层花被片12,625个细胞核 | 不适用 | 单核RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 534 | 2026-06-07 |
Integrated immune profiling of chordomas reveals spatially organized niches and functional heterogeneity
2026-Feb-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf213
PMID:41586579
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、TCR分析和多重免疫荧光，对脊索瘤的免疫微环境进行整合分析，揭示了空间组织的免疫生态位和功能异质性 | 首次整合空间、转录组和TCR数据，系统揭示脊索瘤免疫景观的异质性和系统性免疫动态，并识别肿瘤特异性TCR基序 | 样本量较小（35例肿瘤和6例配对PBMC），且为单一肿瘤类型，可能限制结果的普适性 | 解析脊索瘤的免疫微环境特征，探索系统性抗肿瘤免疫机制及潜在免疫治疗靶点 | 35例脊索瘤样本和6例配对肿瘤-外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序、T细胞受体谱分析、多重免疫荧光 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据、TCR序列数据、空间蛋白表达数据 | 35例肿瘤样本和6例配对外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2026-06-07 |
Immunomodulatory Mechanism of Baiyaojian Decoction on Periodontitis: Network Pharmacology, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2026-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71034
PMID:41605874
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研究论文 | 通过网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接探讨白药煎剂对牙周炎的免疫调节机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接多种方法，系统阐明白药煎剂治疗牙周炎的多成分、多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏动物模型和临床试验的进一步验证 | 揭示白药煎剂治疗牙周炎的分子免疫调节机制 | 白药煎剂的活性成分及其治疗牙周炎的靶点 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, RNA-seq | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 分子结构数据 | GSE16134包含273个样本, GSE152042和GSE171213包含单细胞RNA-seq样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2026-06-07 |
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.01.006
PMID:41616848
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析树突状细胞-T细胞相互作用位点的配体-受体网络，揭示自身免疫性皮肤炎症中的新靶点F11R | 首次将空间转录组数据与单细胞RNA测序结合，建立树突状细胞-T细胞共定位区域的配体-受体网络分析框架，并识别出与银屑病严重程度相关的空间富集信号F11R | 未提供明确局限性信息，可能包括样本量有限或验证范围局限于特定数据集 | 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的树突状细胞-T细胞通信新兴介质 | 特应性皮炎和银屑病患者的皮肤组织样本 | 计算生物学 | 自身免疫性疾病、银屑病、特应性皮炎 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 包含特应性皮炎和银屑病皮肤样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CITE-seq | 10x Visium、10x Chromium | 10x Visium空间转录组平台、10x Chromium单细胞RNA测序平台、CITE-seq蛋白质组学分析 |
| 537 | 2026-06-07 |
Multi-omics analysis reveals that ginsenoside Rb1 improves prognostic outcomes in sepsis by modulating mitochondrial metabolism MTHFD2 targets
2026-Feb-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37362-9
PMID:41622321
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研究论文 | 通过多组学分析揭示人参皂苷Rb1通过调节线粒体代谢MTHFD2靶点改善脓毒症预后的机制 | 首次发现MTHFD2作为脓毒症关键靶点，并通过分子对接筛选出人参皂苷Rb1与之相互作用，动物实验验证其改善器官功能和生存率的效果 | 未提及具体限制 | 增强脓毒症风险分层并识别潜在治疗靶点 | 脓毒症患者和正常样本的线粒体代谢相关基因差异表达 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 公共数据库的脓毒症和正常样本，以及CLP诱导的脓毒症大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 538 | 2026-06-07 |
Single-cell analysis reveals neuroprotective histone deacetylase inhibitor pathways
2026-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71108
PMID:41630642
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和体外验证，整合分析发现组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A通过DISC1通路对阿尔茨海默病具有神经保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学整合分析，揭示DISC1作为阿尔茨海默病治疗靶点，并阐明曲古抑菌素A通过GSK3β、线粒体转运和突触可塑性通路发挥神经保护作用 | 未明确提及研究局限性 | 识别可用于阿尔茨海默病的药物再利用候选药物，并阐明其作用机制 | 阿尔茨海默病患者的皮层组织单细胞RNA测序数据集、人诱导多能干细胞来源的皮层神经元暴露于β-淀粉样蛋白寡聚体 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，体外验证 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据 | 阿尔茨海默病皮层区域多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 539 | 2026-06-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Network Pharmacology Reveal the Potential Role of Oxidative Phosphorylation Inactivation in Diagnosing and Treating Chronic Tendon Injuries
2026-Feb, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70085
PMID:41610872
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和网络药理学揭示氧化磷酸化失活在慢性肌腱损伤诊断和治疗中的潜在作用 | 首次结合单细胞RNA测序与网络药理学，系统解析氧化磷酸化通路在慢性肌腱损伤不同细胞类型中的下调机制，并筛选出丙戊酸等潜在治疗药物 | 研究主要基于体外实验和分子对接，缺乏体内动物模型验证；未深入探讨丙戊酸激活OXPHOS的具体分子通路机制 | 阐明氧化磷酸化在慢性肌腱损伤中的作用机制，并探索基于该通路的诊断和治疗策略 | 慢性肌腱损伤患者的病变与非病变肌腱组织，包含肌腱细胞、血管内皮细胞、肌腱干细胞、脂肪细胞和神经元 | 单细胞测序 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序, Bulk RNA测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | 多个慢性肌腱损伤患者的病变与非病变肌腱组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序, Bulk RNA测序 | Illumina测序平台 | NA |
| 540 | 2026-06-07 |
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68976-2
PMID:41620440
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研究论文 | 一项评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗治疗临界可切除胰腺导管腺癌的单臂1b/2期临床试验 | 首次在临界可切除胰腺导管腺癌中评估新辅助化疗联合免疫检查点抑制剂的安全性和病理学缓解率，并通过空间转录组学揭示治疗诱导的肿瘤微环境变化 | 单臂设计、样本量较小（28例患者）、缺乏随机对照，且主要终点为安全性和病理学缓解率，生存数据为事后分析 | 评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗在临界可切除胰腺导管腺癌患者中的安全性和疗效 | 28例临界可切除胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、免疫组化图像、空间转录组数据 | 28例患者（其中22例接受手术） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |