单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 521 - 540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
521 2026-06-08
Tissue-Derived Extracellular Vesicles Define Diagnostic Biomarkers for Renal Cell Carcinoma
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 通过分析组织来源的细胞外囊泡,确定了肾细胞癌不同亚型的诊断生物标志物 首次系统鉴定组织来源细胞外囊泡中用于区分不同肾细胞癌亚型的生物标志物,并结合单细胞测序揭示标志物来源细胞类型 外部验证队列规模有限,且未明确不同亚型标志物的分子机制 评估组织来源细胞外囊泡作为不同肾细胞癌亚型鉴别诊断标志物的价值 配对肿瘤与正常组织及其对应的组织来源细胞外囊泡 数字病理学 肾细胞癌 单细胞测序 NA RNA测序数据 配对肿瘤与正常组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
522 2026-06-08
Identification of Mitophagy-Related Genes With Diagnostic Value in Atherosclerosis Using Bioinformatics Analysis and Experiment Validation
2026-Feb, Chemical biology & drug design IF:3.2Q3
研究论文 结合批量与单细胞RNA测序数据,分析了线粒体自噬相关基因在动脉粥样硬化中的诊断价值,并构建了诊断模型 首次整合批量与单细胞RNA测序数据系统分析动脉粥样硬化中线粒体自噬相关基因,并利用机器学习方法挖掘出四个关键基因构建诊断模型 NA 识别动脉粥样硬化中具有诊断价值的线粒体自噬相关基因,并揭示其分子机制 人类动脉粥样硬化斑块中的线粒体自噬相关基因及其表达失调 机器学习 心血管疾病 RNA测序 Random Forest, SVM-RFE 基因表达数据 超过106,000个单细胞 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
523 2026-06-08
Identification of potential drug targets for Alzheimer's disease from genetic insights: A Mendelian randomization study
2026-Jan-30, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过孟德尔随机化研究从遗传学角度识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 首次联合孟德尔随机化分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子对接和单细胞测序分析系统识别阿尔茨海默病的关键基因和潜在药物 研究依赖于公开的GWAS汇总统计数据,可能受限于原始数据的样本特征和混杂因素 探索血浆蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关系并预测潜在药物靶点 阿尔茨海默病患者和对照组的血浆蛋白质组数据 机器学习 阿尔茨海默病 NA NA 图像、文本 4907个血浆蛋白作为暴露因素,阿尔茨海默病作为结局 NA 单细胞RNA测序 NA NA
524 2026-06-08
Calcified Artery Preparation and Processing with Preserved Morphology and RNA for Digital Spatial Profiling
2026-Jan-23, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 提出一种针对钙化动脉的样本处理流程,保留形态和RNA完整性,用于数字空间分析 专门优化了钙化血管组织的处理流程,包括脱钙方法、组织微阵列构建和感兴趣区域选择策略,以克服血管组织用于空间转录组学的技术障碍 主要基于人类胫骨动脉样本,可能不适用于其他血管类型或钙化程度不同的样本 建立适用于钙化血管的空间转录组学样本制备协议,使科研人员能够获得层特异性基因表达数据 人类胫骨动脉(具有晚期病变) 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学 NA 图像 人类胫骨动脉样本(具体数量未提及) NanoString Technologies 空间转录组学 NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler NanoString GeoMx DSP系统,结合组织微阵列和感兴趣区域选择策略
525 2026-06-08
BayesRare: Bayesian mixture model for population-level rare cell type detection in multi-subject single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出BayesRare层次贝叶斯框架,用于多受试者单细胞RNA测序数据中群体水平稀有细胞类型的检测 首次将贝叶斯混合模型与稀有簇指示器结合,实现跨受试者信息整合的稀有细胞类型联合聚类与识别,并量化不确定性 未明确说明具体局限性 开发一种能够利用跨受试者信息进行群体水平稀有细胞类型检测的统计方法 单细胞RNA测序数据中的稀有细胞类型 机器学习 NA 单细胞RNA测序 贝叶斯混合模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
526 2026-06-08
Cross-dataset transcriptomic analyses identify a conserved ENPP2+ macrophage-fibroblast activation axis in hypertrophic cardiomyopathy
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过跨数据集转录组分析,在肥厚型心肌病中鉴定出一个保守的ENPP2+巨噬细胞-成纤维细胞活化轴 首次通过跨数据集单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示肥厚型心肌病中巨噬细胞向促炎表型转化并由ENPP2高表达驱动成纤维细胞活化的保守机制 机制验证主要基于初步的组织病理学和分子生物学实验,需要进一步功能研究确定ENPP2下游信号及其作为治疗靶点的可行性 阐明肥厚型心肌病中心肌纤维化的分子机制,特别是巨噬细胞转化为成纤维细胞活化的调控机制 肥厚型心肌病患者的心肌组织样本 数字病理学 肥厚型心肌病 snRNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据 多个公开数据集(包括两种最常见突变类型的snRNA-seq数据、最大现有snRNA-seq和空间转录组学数据集) NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
527 2026-06-08
High-Resolution Laser Microdissection to Investigate Transcriptional States in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Samples
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了如何利用高分辨率激光显微切割结合RNA测序分析福尔马林固定石蜡包埋样本中的转录状态 强调激光显微切割在空间转录组学中仍具有高空间分辨率和成本效益的优势,尤其适用于FFPE样本和回顾性研究 未明确提及,但可推断其通量低于新兴高通量空间转录组技术,且依赖精确的形态学注释 提供一种针对常规组织学样本(如FFPE)的稳健LMD-RNA-seq协议,用于揭示临床上相关的特定分子信息 福尔马林固定石蜡包埋的组织样本 数字病理学 未明确指定,但适用于多种疾病(如癌症) 激光显微切割、RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
528 2026-06-08
Single-Cell Sequencing Reveals the Immunosuppressive Trajectory in the Tumor Microenvironment of Human Giant Cell Tumor of Bone
2026, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示人骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制轨迹 首次通过单细胞测序全面解析骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性和免疫抑制机制,识别出肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞和CD4+ T细胞的新亚型及其相互作用网络 样本量较小(7091个细胞),且未进行功能验证实验 阐明骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制机制及细胞间相互作用 骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 单细胞测序 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 7091个细胞,来源于骨巨细胞瘤手术切除样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
529 2026-06-08
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-Positive, Low-Grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 通过对导管内乳头状黏液性肿瘤进行空间转录组学分析,发现了一个表达恶性特征的角蛋白17阳性低级别上皮细胞亚群 首次在组织学低级别IPMN中发现一个表达恶性转录特征(包括KRT17、S100A10和CEACAM5)的上皮细胞亚群,并验证了该高风险基因特征 NA 研究IPMN进展过程中的转录变化,寻找更准确的风险分层标志物 包含从低级别不典型增生到癌变完整病程的IPMN患者组织样本,以及分支导管和主胰管IPMN活检样本 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 NA 图像数据,空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 包含完整病程的IPMN患者样本和外部空间转录组数据集中的多个IPMN样本 Nanostring 空间转录组学,单细胞RNA测序 Nanostring GeoMx 使用Nanostring GeoMx进行空间转录组学分析,并对分支导管和主胰管IPMN活检样本进行单细胞RNA测序
530 2026-06-08
TIMELESS Promotes LUAD Growth via Suppressing Transferrin-Mediated Ferroptosis and Reprograms the Tumor Microenvironment against Anti-PD-1 Immunotherapy
2026, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究揭示TIMELESS通过抑制转铁蛋白介导的铁死亡促进肺腺癌生长并重编程肿瘤微环境对抗PD-1免疫治疗 首次阐明TIMELESS通过招募CNOT3加速TF mRNA降解抑制铁死亡、促进肺腺癌进展的分子机制,并发现TIMELESS/TF调控轴可作为潜在治疗靶点 NA 探讨高表达RBP TIMELESS在肺腺癌中的分子网络及其在肿瘤进展中的机制作用 肺腺癌细胞系及原位肺癌小鼠模型 机器学习和数字病理学 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 光激活核糖核苷增强交联免疫沉淀测序, 免疫共沉淀-质谱, GST pull-down, RNA免疫沉淀, 流式细胞术, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 组织微阵列图像 TCGA-LUAD, GEO, scRNA-seq数据集;组织微阵列样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
531 2026-06-08
Multi-omics analysis reveals STING activation mediates NLRP3-related pyroptosis and exacerbates myocardial ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过多组学分析揭示STING激活介导NLRP3相关细胞焦亡并加重心肌缺血再灌注损伤 首次结合转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学,全面解析STING激活在心肌缺血再灌注损伤中通过NLRP3炎症小体介导细胞焦亡的机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,需进一步在临床样本中验证STING-NLRP3轴的病理作用 阐明STING激活在心肌缺血再灌注损伤中促进NLRP3相关细胞焦亡的分子机制 小鼠心肌缺血再灌注模型和人心肌细胞缺氧/复氧模型 数字病理学 心血管疾病 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 氧化应激检测 NA 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 小鼠心肌组织样本和人类心肌细胞培养样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
532 2026-06-08
A multifaceted analysis of OTUD5 integrated MAVS in innate immunity of Primary Biliary Cholangitis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过多层面分析揭示了OTUD5整合MAVS在原发性胆汁性胆管炎先天免疫中的作用 首次系统探讨OTUD5与MAVS在PBC免疫机制中的相互作用,结合单细胞转录组和蛋白组学分析,识别出单核巨噬细胞亚群11作为关键效应细胞 RNA干扰实验仅在RAW264.7细胞系进行,未在人体原代细胞或动物模型中验证;样本量较小(16例患者vs 10例对照),可能限制结果的普适性 阐明OTUD5在PBC发病机制中的分子作用,为靶向治疗策略开发提供依据 原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者的外周血和肝组织样本 生物信息学、免疫学 原发性胆汁性胆管炎 微阵列芯片、RT-qPCR、免疫荧光、蛋白组学分析(STRING/InBio Discover)、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质互作数据、单细胞转录组数据 16例PBC患者和10例健康对照的外周血和肝组织样本 Illumina 单细胞RNA测序 Illumina测序平台 基于GEO数据集的微阵列芯片平台,单细胞RNA测序平台(未明确具体型号)
533 2026-06-08
Investigating the Role of TNFSF12 in Thyroid Cancer Progression via Single-Cell RNA Sequencing and Integrated Multiomics Analyses
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和整合多组学分析,研究TNFSF12在甲状腺癌进展中的作用 首次通过整合单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化和功能验证,发现一个肿瘤特异性髓系亚群(C5)并鉴定出MERTK、MSR1和TNFSF12三个枢纽基因,其中TNFSF12被证实为背景依赖性癌基因 研究样本量可能有限,功能验证仅在甲状腺癌细胞系中进行,缺乏体内实验验证 鉴定并验证驱动甲状腺癌进展的关键髓系衍生基因 甲状腺癌组织样本及甲状腺癌细胞系 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、qPCR、CCK-8、集落形成、Transwell实验 NA 图像、文本 甲状腺癌组织样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
534 2026-06-08
Aberrant IL-21/STAT3 signaling disrupts regulatory T cell function and CD4+ T cell homeostasis in children with type 1 diabetes
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了IL-21/STAT3信号通路异常激活导致1型糖尿病儿童调节性T细胞功能受损和CD4+ T细胞稳态失衡的机制 首次在单细胞水平解析IL-21/STAT3通路在儿童1型糖尿病T细胞亚群失衡中的免疫调节作用,并验证STAT3抑制剂的治疗潜力 体外实验主要基于原代细胞,体内实验仅使用NOD小鼠模型,尚需在人体中进一步验证临床转化价值 阐明IL-21/STAT3信号通路在儿童1型糖尿病T细胞免疫失衡中的分子机制 儿童1型糖尿病患者的外周血单核细胞及非肥胖糖尿病小鼠 数字病理学 1型糖尿病 单细胞RNA测序、药理学抑制实验 无特定模型类型 单细胞转录组数据 儿童1型糖尿病患者样本(具体数量未提供),NOD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
535 2026-06-08
Regulatory T cells in vitiligo: a review of functional disequilibrium between peripheral blood and lesional tissue
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 综述白癜风中调节性T细胞在外周血和病变组织之间的功能失衡 从系统到局部的解剖学层级角度综合分析了Treg功能失调,并提出了Treg-黑素细胞相互作用网络及新兴生物标志物 未详细提及综述方法的具体搜索策略或偏倚评估,实际证据来源尚缺乏系统量化分析 综合白癜风中Treg生物学和免疫调节功能的现有证据,重点关注外周血与病变皮肤的对比分析 白癜风患者的外周血和病变皮肤中的调节性T细胞 自然语言处理 白癜风 NA NA 文本 NA NA NA NA NA
536 2026-06-08
Single-cell transcriptomics reveals keratinocyte dynamic processes associated with S100a4 expression in psoriasiform dermatitis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞转录组学揭示S100a4在银屑病样皮炎中调控角质形成细胞动态过程的机制 首次通过S100a4基因敲除小鼠模型结合单细胞RNA测序,揭示了S100a4在银屑病发病中的具体细胞特异性转录调控机制,并发现Klf9介导的Krt15转录失调是角化过度的关键驱动因素 未明确提及实验样本量及人类样本验证,机制研究仅在动物模型中进行 探究S100a4在银屑病发病中的具体功能及分子机制 S100a4基因敲除小鼠的银屑病模型角质形成细胞 数字病理学 银屑病 CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明小鼠样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
537 2026-06-07
Neoplastic CD3⁺ B cells remodel the DLBCL tumor microenvironment via single-cell and spatial transcriptomics
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy IF:4.4Q2
research paper 通过整合单细胞、单核和空间转录组学数据,构建弥漫性大B细胞淋巴瘤的高分辨率多组学图谱,发现了一群表达CD3的恶性B细胞亚群 首次识别出弥漫性大B细胞淋巴瘤中表达CD3的恶性B细胞亚群,并揭示其由BCLAF1、CHURC1、FLI1、NFATC2和ELF2等关键调控基因驱动的遗传回路,以及其在肿瘤微环境重塑和临床预后中的重要作用 未明确提及研究局限性 构建弥漫性大B细胞淋巴瘤的高分辨率多组学图谱,并探索肿瘤微环境中的细胞异质性和分子机制 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的肿瘤样本 machine learning diffuse large B-cell lymphoma single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, spatial transcriptomics NA gene expression data 未明确提及样本数量 10x Genomics single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3' 和 10x Visium 空间转录组学平台
538 2026-06-07
Ubiquitination-anchored signature defines neuroendocrine prostate cancer: hub genes and single-cell ecosystem insights from integrated bioinformatics analysis of public transcriptomic datasets
2026-Dec-31, The aging male : the official journal of the International Society for the Study of the Aging Male
研究论文 通过整合公共转录组数据集,结合生信分析定义泛素化标记基因特征,并揭示其在神经内分泌前列腺癌中的核心基因及单细胞生态系统 首次将泛素化失调与神经内分泌前列腺癌谱系可塑性关联,通过整合 bulk 和单细胞转录组数据定义以泛素化为中心的诊断和治疗相关特征及肿瘤微环境回路 结果依赖于公共数据集,需在前瞻性收集的临床队列中进行外部验证,缺乏蛋白水平评估 定义神经内分泌前列腺癌中的泛素化相关基因特征,并探索其在诊断和治疗中的潜在价值 神经内分泌前列腺癌与前列腺腺癌的转录组数据 生物信息学 神经内分泌前列腺癌 RNA-seq, scRNA-seq 共表达网络、蛋白互作网络 基因表达数据、单细胞转录组数据 GEO发现队列49个组织样本;单细胞数据集25,325个细胞 NA bulk RNA-seq, scRNA-seq NA NA
539 2026-06-07
Zinc-based metal orchestrates early osteoimmune microenvironment to promote angiogenesis via macrophage-derived extracellular vesicles
2026-Nov, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 探究锌基金属通过巨噬细胞来源的细胞外囊泡调控早期骨免疫微环境以促进血管生成的机制 首次揭示锌基金属通过巨噬细胞来源的细胞外囊泡介导的免疫调控促进血管生成的新机制,并利用单细胞RNA测序鉴定关键细胞亚群 未提及具体局限性,但可能包括机制验证的体内模型限制或临床转化挑战 阐明锌基金属在骨再生过程中如何通过免疫调节影响血管生成 巨噬细胞来源的细胞外囊泡及其与内皮细胞的相互作用 机器学习 骨缺损 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
540 2026-06-07
Targeting dysregulated glycolysis in type 2 diabetic osteoporosis: Identification of a diagnostic gene signature and therapeutic validation of calcifediol
2026-Sep-01, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本文结合生物信息学和实验验证,识别了2型糖尿病性骨质疏松症中与糖酵解相关的八个关键诊断基因,并验证了骨化二醇(calcifediol)的治疗潜力 通过整合多种转录组数据、机器学习和单细胞RNA测序分析,首次鉴定出ATN1等八个糖酵解相关基因作为T2DOP的诊断生物标志物,并发现骨化二醇可能同时改善糖尿病高血糖和骨质疏松 骨化二醇的临床价值需在后续研究中进一步验证 探究2型糖尿病性骨质疏松症中糖酵解相关基因的作用,并鉴定诊断标志物和潜在治疗药物 2型糖尿病性骨质疏松症患者及小鼠模型的组织样本和数据 机器学习 2型糖尿病性骨质疏松症 RNA-seq、单细胞RNA测序 WGCNA、机器学习(113种算法) 转录组数据、单细胞转录组数据 合并的骨质疏松症和2型糖尿病数据集,以及T2D小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部