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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-06-19 |
Non-invasive radiogenomic mapping of the SMARCAL1-driven ferroptotic niche is associated with longitudinal MRD-negative surveillance in early-stage NSCLC
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1835413
PMID:42266691
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研究论文 | 通过术前CT影像组学特征构建Rad-Score,非侵入性捕捉SMARCAL1驱动的铁死亡免疫微环境,并与早期非小细胞肺癌术后持续MRD阴性监测相关 | 首次将术前CT影像组学特征与SMARCAL1驱动的铁死亡免疫微环境空间组织相关联,建立非侵入性预测术后持续MRD阴性的放射组学评分,并通过空间转录组学、CRISPR-Cas9敲除和功能验证确认机制 | 单中心回顾性队列研究,样本量有限(71例患者),需前瞻性验证;Rad-Score在外部验证中性能略有下降(C-index从0.812降至0.741-0.783) | 探讨术前CT影像组学特征能否非侵入性捕捉与术后持续MRD阴性相关的铁死亡富集、免疫活跃的肿瘤微环境空间组织 | 完全切除的IB-IIIA期非小细胞肺癌患者(71例),术后两个时间点MRD阴性 | 计算机视觉 | 非小细胞肺癌 | CT成像, 全外显子测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 免疫组化, CRISPR-Cas9敲除 | NA | 图像, 文本 | 71例患者(14例用于空间转录组学,40例用于多重免疫荧光,60例用于免疫组化) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学 |
| 522 | 2026-06-19 |
Multisite Assessment of Methods for Cell Preservation Upstream of Single-Cell RNA Sequencing
2026, Journal of biomolecular techniques : JBT
DOI:10.7171/001c.162768
PMID:42281660
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研究论文 | 通过跨平台、多中心研究评估三种细胞保存方法(10x Genomics FLEX、Parse Biosciences Evercode WT v2、Honeycomb Bio HIVE)在上游单细胞RNA测序中的性能和可重复性 | 首次进行多平台、多中心的系统性比较,评估不同细胞保存方法对单细胞RNA测序结果的影响,并为研究者提供选择最合适保存工作流程的资源 | 平台特异性的表达特征存在于部分基因亚组,且FLEX工作流程在站点样本处理中表现出更高的技术变异性 | 评估和比较不同商业细胞保存方法在单细胞RNA测序中的性能、可重复性和适用性 | 从单一健康个体分离的总白细胞和外周血单核细胞(PBMCs) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1位健康个体的细胞样本,包括总白细胞和PBMCs,由2名技术人员并行制备 | 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Bio | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Parse Biosciences Evercode WT v2, Honeycomb Bio HIVE | 10x Chromium Single Cell 3' v3.1 (3pGEX) 化学试剂作为参考,FLEX和HIVE为保存方法 |
| 523 | 2026-06-19 |
Metabolic Reprogramming in Recurrent Spontaneous Abortion: Key Biomarkers Identification and Diagnostic Model Development
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70078
PMID:42309513
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研究论文 | 本研究整合多个数据集,通过生物信息学方法鉴定与复发性流产相关的代谢重编程关键生物标志物,并构建诊断模型 | 首次从代谢重编程角度系统识别复发性流产的诊断生物标志物,结合多种机器学习算法构建诊断模型,并通过单细胞测序和体外实验验证免疫-代谢互作关系 | 未提及具体局限性 | 探究复发性流产中的代谢重编程机制,鉴定诊断生物标志物并构建诊断模型 | 复发性流产患者及其蜕膜组织样本 | 机器学习 | 复发性流产 | RNA测序, 单细胞RNA测序, PCR, 蛋白质印迹, CCK-8, Transwell实验 | 逻辑回归, 支持向量机递归特征消除, 最小绝对收缩和选择算子 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE26787和GSE165004数据集(具体样本数未提供),GSE214607单细胞RNA测序数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2026-06-19 |
The "Three-Tier Regulatory Network" of Orthokeratology in Myopia Control: Evidence Weight of Underlying Mechanisms, Controversies, and New Perspectives for Clinical Translation--A Review
2026, Clinical ophthalmology (Auckland, N.Z.)
DOI:10.2147/OPTH.S600353
PMID:42311277
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综述 | 本文系统综述了角膜塑形镜控制近视的机制,并提出基于证据权重的“初始驱动-中间信号整合-终端效应”三级调控网络模型 | 创新性地提出了基于证据权重的三级调控网络模型,整合了光学离焦、角膜生物力学、神经血管调节和分子信号通路等多途径协同调控机制 | 文中指出当前领域存在关键争议(如个体反应差异),但未详细讨论自身研究方法的局限性 | 系统梳理角膜塑形镜延缓近视进展的核心机制,并为临床转化和个性化治疗策略提供可行建议 | 角膜塑形镜及其控制近视的机制 | NA | 近视 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2026-06-19 |
Metabolic reprogramming of glutamine is associated with M2 macrophage polarization in allergic rhinitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1815245
PMID:42311656
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研究论文 | 结合人类鼻黏膜代谢组学、动物模型、单细胞转录组学和蛋白质分析,探究谷氨酰胺在过敏性鼻炎病理生理中的作用 | 首次发现谷氨酰胺与过敏性鼻炎中M2型巨噬细胞极化及FGFR1的非经典修饰相关联,提出免疫代谢调控鼻黏膜微环境的新机制 | 研究结果仅为假设生成性质,关联模型需进一步验证因果关系 | 探究代谢信号如何整合到过敏性鼻炎的免疫信号中 | 过敏性鼻炎患者鼻黏膜组织、小鼠模型、巨噬细胞 | 数字病理学 | 过敏性鼻炎 | 代谢组学分析、单细胞转录组测序、批量RNA测序、蛋白质检测 | NA | 代谢组数据、单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 人类鼻黏膜样本(数量未明确)、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2026-06-19 |
Swimming ameliorates intervertebral disc degeneration accompanied by Rpl23a downregulation and changes in its immune-inflammatory pathway
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819987
PMID:42311670
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研究论文 | 本研究探讨了核糖体蛋白L23a在椎间盘退变中调控免疫相互作用的机制,并评估了游泳运动干预对该信号轴的影响 | 首次揭示了Rpl23a在椎间盘免疫微环境中的作用及其通过NF-κB通路介导的炎症机制,并证实游泳运动可通过下调Rpl23a改善椎间盘退变 | 未提及具体局限性 | 研究Rpl23a在椎间盘退变免疫相互作用中的机制,并评估运动干预的调控效果 | 大鼠椎间盘退变模型及体外细胞实验 | 机器学习 | 椎间盘退变 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 两个公开数据集(GSE189551, GSE153066)及大鼠体内实验 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 527 | 2026-06-19 |
Pan-Cancer Analysis of a Depression-Related Gene Signature Identifies an Immunosuppressive Tumor Microenvironment and Links to Immunotherapy Response in Breast Cancer
2026, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S578930
PMID:42311838
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研究论文 | 通过泛癌分析抑郁相关基因特征,发现其与免疫抑制性肿瘤微环境及乳腺癌免疫治疗反应相关 | 首次系统探讨抑郁相关基因特征在33种癌症中的表达模式及其与肿瘤免疫微环境、免疫治疗反应的关系,并识别出CACNA1H作为重要候选基因 | 基于公共数据库的分析需进一步实验验证;抑郁相关基因特征的临床转化价值需更多前瞻性研究 | 探究抑郁相关基因特征在不同癌症中的分子和免疫相关性,特别是其与肿瘤微环境、免疫治疗反应的关系 | TCGA中33种癌症类型的超过10,000个肿瘤样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单样本基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个肿瘤样本,来自33种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 528 | 2026-06-19 |
Intrinsic elaboration of prefrontal modularity: a dual-control model of axon bundling and synaptic docking
2026, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2026.1761080
PMID:42311937
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综述 | 本文综合经典神经解剖学框架与空间转录组学和连接组学的最新进展,提出了前额叶皮质模块化内在精细化的双控制模型 | 提出了前额叶皮质通过轴突束化和突触对接的双控制模型实现内在精细化的新框架,强调共享分子工具包的组合逻辑而非新基因的作用 | 主要基于经典神经解剖学数据与组学数据的整合推断,缺乏直接的实验验证该模型的具体机制 | 揭示前额叶皮质在缺乏直接感觉模板的情况下如何实现高度有序模块化架构的机制 | 前额叶皮质的模块化架构及其与视觉系统、嗅觉系统、海马体的对比分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 连接组学, 轴突束化成像 | NA | 转录组数据, 连接组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 连接组学 | NA | NA |
| 529 | 2026-06-19 |
Identification of Immune-Related Genes in Predicting the Progression of Colitis-Associated Colorectal Cancer: An Integrated Bioinformatics and Experimental Validation Study
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S588177
PMID:42312092
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研究论文 | 通过整合生物信息学和实验验证,识别与免疫相关的基因以预测结肠炎相关结直肠癌的进展 | 首次利用WGCNA、弹性网络逻辑回归和单细胞RNA测序综合分析,鉴定出与中性粒细胞和树突状细胞相关的13个关键免疫细胞相关CAC基因,并构建了20基因预后签名 | 当前研究主要依赖公共数据库和临床样本验证,尚未进行大规模前瞻性队列验证;免疫疗法反应预测基于TIDE评分,需要进一步实验验证 | 探索免疫细胞相关基因在结肠炎相关结直肠癌进展中的作用及其诊断和预后价值 | 溃疡性结肠炎和结直肠癌患者的数据集及临床样本 | 生物信息学 | 结直肠癌, 溃疡性结肠炎 | WGCNA, 弹性网络逻辑回归, 单细胞RNA测序, AUCell算法, Cox回归, LASSO回归, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 临床样本 | 未明确说明具体样本数量,涉及公共数据集和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 530 | 2026-06-19 |
Development and functional adaptation of intestinal macrophages across the lifespan
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70111
PMID:42312249
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综述 | 系统整合了从产前到衰老期肠道巨噬细胞的起源、功能多样性和生命周期特异性作用 | 提出了一个统一框架来理解生命周期各阶段肠道巨噬细胞的生物学,整合了谱系追踪、单细胞转录组学和功能研究的最新证据 | 未明确提及局限性 | 提供从产前发育到成年和衰老阶段肠道巨噬细胞起源、异质性和功能的全面综合 | 肠道巨噬细胞 | NA | 炎症性肠病 | 谱系追踪、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2026-06-19 |
Mitochondrial complex II orchestrates divergent effects in CD4+ and CD8+ T cells
2025-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194134
PMID:41392980
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研究论文 | 探究线粒体复合体II在CD4+和CD8+ T细胞中发挥的差异性调控作用 | 首次揭示线粒体复合体II在CD4+和CD8+ T细胞中产生截然相反的效果,为代谢调控T细胞功能提供了新见解 | 未提及 | 阐明线粒体复合体II在T细胞亚群中的特异性作用及其机制 | T细胞特异性SDHA缺陷小鼠的CD4+和CD8+ T细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2026-06-19 |
MicroRNA-mediated neuronal detargeting alters astrocyte cell fate conversion trajectories in vivo
2025-Dec-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09169-3
PMID:41350397
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研究论文 | 本文通过引入microRNA-124靶序列,提高了星形胶质细胞向神经元重编程的特异性,并揭示了重编程轨迹的分子机制 | 创新点在于利用microRNA-124靶序列实现神经元去靶向,提高了AAV介导的星形胶质细胞重编程的特异性,并通过单细胞转录组学揭示了不同的重编程轨迹 | 目前仅在小鼠体内验证,尚未在人类细胞中验证;重编程效率仍需进一步优化 | 提高星形胶质细胞向神经元重编程的特异性,并解析重编程轨迹的分子机制 | 小鼠大脑中的星形胶质细胞和神经元 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学, AAV介导的基因传递, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2026-06-19 |
STING agonists drive recruitment and intrinsic type I interferon responses in monocytic lineage cells for optimal anti-tumor immunity
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf131
PMID:40633091
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research paper | 研究STING激动剂通过募集单核细胞系细胞并诱导其内在I型干扰素反应以实现最佳抗肿瘤免疫的机制 | 发现STING激动剂治疗通过CCR5依赖性方式将携带肿瘤抗原的单核细胞从肿瘤迁移至淋巴结,并揭示了IL-18-IL-18R1相互作用在CD8+ T细胞和自然杀伤细胞与单核细胞系细胞之间的关键作用 | 未明确提及局限性 | 探究单核细胞系细胞在STING激动剂诱导的I型干扰素信号传导中的作用及其对肿瘤治疗效率的影响 | 小鼠(MC38和B16F10肿瘤模型)及其单核细胞系细胞 | machine learning | melanoma | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | 小鼠模型,包括Ccr2缺陷小鼠和Lyz2-Cre-IFNAR1fl/fl小鼠 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 534 | 2026-06-19 |
Lipid-laden macrophages in atherosclerosis and cancer
2025-12, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.09.007
PMID:41005549
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综述 | 综述了脂质负载巨噬细胞在动脉粥样硬化和癌症中的双重作用,强调其在生理和病理条件下的共有和相异功能 | 比较了动脉粥样硬化和癌症中脂质负载巨噬细胞的分子机制和基因表达谱,并评估了脂质调节策略在癌症治疗中的潜力 | NA | 探讨脂质负载巨噬细胞在动脉粥样硬化和癌症中的功能与潜在治疗策略 | 脂质负载巨噬细胞 | 机器学习 | 动脉粥样硬化, 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2026-06-19 |
Simultaneous Measurement of RNA Synthesis and Degradation Rates in Single Cells Unveils the Regulatory Mechanisms of Temporal RNA Dynamics
2025-11-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202510939
PMID:41017207
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研究论文 | 开发了scDUAL-seq技术,能够同时测量单细胞中RNA合成与降解速率,揭示时间动态RNA的调控机制 | 首次在单细胞水平实现同时测量RNA合成和降解速率,通过双核苷类似物脉冲标记、化学核苷转化和单细胞RNA测序整合,提供更准确的RNA动力学速率和调控策略 | 文中未明确说明局限性 | 解决当前转录组学方法无法同时测量单细胞中全转录组RNA合成和降解速率的问题 | 单细胞中的RNA合成与降解速率 | 机器学习 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | scDUAL-seq | 整合双核苷类似物脉冲标记、化学核苷转化和单细胞RNA测序 |
| 536 | 2026-06-19 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics identifies shared and specific immune signatures in Takayasu Arteritis
2025-11-11, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03673-x
PMID:41219777
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研究论文 | 通过整合外周血T细胞亚群的批量RNA测序和主动脉组织的单细胞RNA测序,鉴定高安动脉炎中共享和特异的免疫特征 | 首次整合批量与单细胞转录组学揭示CD4+和CD8+ T细胞在高安动脉炎中的共享和特异性信号通路,并发现EGR1作为跨组织一致上调的关键分子开关和治疗靶点 | 样本量较小(8例治疗初治患者和3例健康对照用于批量测序,3例TAK患者和3例动脉粥样硬化对照用于单细胞测序),可能限制发现的普遍性 | 识别高安动脉炎的机械性生物标志物和治疗靶点 | 高安动脉炎患者和健康对照的外周血CD4+和CD8+ T细胞以及主动脉组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 8例治疗初治TAK患者和3例健康对照(外周血),3例TAK患者和3例动脉粥样硬化对照(主动脉组织) | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | 外周血T细胞亚群的批量RNA-seq和主动脉组织的单细胞RNA-seq均采用Illumina NovaSeq平台 |
| 537 | 2026-06-19 |
Inflammatory factor CCL2 enhances the interaction between monocyte-macrophage cells and liver parenchymal cells to promote liver inflammation and fibrosis in biliary atresia
2025-08-23, BMC pediatrics
IF:2.0Q2
DOI:10.1186/s12887-025-05984-z
PMID:40849451
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析,揭示CCL2在胆道闭锁肝纤维化中的关键促炎作用及其与单核-巨噬细胞的相互作用 | 首次通过多组学整合方法(scRNA-seq+ST+MR)系统解析CCL2驱动的单核-巨噬细胞与肝实质细胞互作在胆道闭锁肝纤维化进展中的动态机制 | 样本量较小(仅4例BA纤维化组织、2例胆总管囊肿和2例正常对照),且空间转录组与单细胞数据的整合分析存在技术可重复性挑战 | 探究胆道闭锁肝纤维化的快速进展中,CCL2介导的炎症-免疫微环境调控机制 | 不同纤维化程度的胆道闭锁肝组织、胆总管囊肿肝组织和正常对照肝组织 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 8例样本(4例BA纤维化+2例胆总管囊肿+2例正常对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | NA |
| 538 | 2026-06-19 |
Reviewing the Developing Significance of the Serine Protease PRSS23
2025-08-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL27294
PMID:40917042
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综述 | 综述丝氨酸蛋白酶PRSS23在正常生理、疾病及实验条件下的表达与功能,汇总其主要研究成果并展望未来方向 | 首次系统整合PRSS23从发现至今的研究进展,包括其在癌症、心脏发育、纤维化疾病等不同场景中的作用,并引入单细胞RNA测序等新技术带来的新发现 | 未提及具体研究局限性,但综述性质决定其依赖现有文献,可能缺乏原始实验数据支撑 | 总结PRSS23当前研究知识并探讨未来研究方向 | 丝氨酸蛋白酶PRSS23 | 机器学习和生物信息学 | 乳腺癌、胃癌、局限性硬皮病等 | 单细胞RNA测序、生物信息学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics等 | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium等 | 单细胞RNA测序技术具体配置未提及 |
| 539 | 2026-06-19 |
Co-development of mesoderm and endoderm enables organotypic vascularization in lung and gut organoids
2025-Aug-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.041
PMID:40592324
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研究论文 | 本研究通过共分化中胚层和内胚层,在相同球体中血管化肺和肠道类器官,重现器官特异性血管和间质的发育过程 | 首次在诱导多能干细胞来源的类器官中通过共分化中胚层和内胚层实现器官型血管化,并揭示BMP信号调控内胚层-中胚层比例的关键作用 | 未详细提及,但可能包括体外模型与体内环境的差异及移植效率的局限性 | 开发多谱系类器官平台,研究人类器官发生中细胞间通讯及疾病机制 | 诱导多能干细胞(iPSCs)来源的血管化肺和肠道类器官 | 数字病理学 | FOXF1突变相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本量,涉及iPSCs来源类器官及小鼠移植实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 540 | 2026-06-19 |
Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β
2025-07, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017
PMID:40359720
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研究论文 | 该研究探讨了连翘苷通过抑制GSK-3β信号缓解脓毒症相关急性肺损伤的作用机制 | 首次结合公共数据库筛选、分子对接、孟德尔随机化分析及体内外实验,系统阐明连翘苷通过靶向抑制GSK-3β促进M2巨噬细胞极化和减少中性粒细胞招募来治疗急性肺损伤 | 研究主要基于LPS诱导的模型,未在临床试验中验证;GSK-3β抑制剂的长期安全性和其他潜在靶点未充分探讨 | 揭示连翘苷缓解脓毒症相关急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的分子机制 | 脓毒症相关急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 | 机器学习 | 急性肺损伤,脓毒症 | 单细胞测序,分子对接,分子动力学模拟,孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据,单细胞数据,蛋白质结构数据 | 公共数据库筛选8331个靶基因,体内实验使用斑马鱼和小鼠模型,体外实验使用巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |