单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 5361 - 5380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5361 | 2024-12-14 |
Challenges and opportunities in cancer immunotherapy: a Society for Immunotherapy of Cancer (SITC) strategic vision
2024-Jun-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009063
PMID:38901879
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review | 本文由癌症免疫治疗学会召集的专家组讨论了癌症免疫治疗领域的当前机遇和挑战，并提出了未来十年的战略愿景 | 本文提出了七个高优先级的研究领域，并讨论了可能阻碍进展的潜在障碍，以及三个关键的指导原则 | NA | 识别癌症免疫治疗领域的当前机遇和挑战，并优先考虑具有最高临床影响的领域 | 癌症免疫治疗领域的七个高优先级领域及跨领域的优化工具 | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 5362 | 2024-12-14 |
CTLA-4-expressing ILC3s restrain interleukin-23-mediated inflammation
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07537-3
PMID:38867048
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了IL-23受体表达细胞在肠道中的急性反应，揭示了CTLA-4在ILC3s上的上调及其在调节IL-23介导的炎症中的作用 | 首次发现CTLA-4在ILC3s上的上调，并揭示了其在调节IL-23介导的炎症中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类样本的研究较少，且未探讨CTLA-4在其他炎症性疾病中的作用 | 探讨IL-23介导的炎症反应中CTLA-4的作用机制 | 肠道中的IL-23受体表达细胞及ILC3s | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类ILC3s样本 |
| 5363 | 2024-12-14 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559569
PMID:37808650
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研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经再生的化合物 | 首次使用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子分析，筛选出促进神经再生的化合物 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经再生能力，以恢复视网膜疾病患者的视力 | 小鼠Müller胶质细胞的神经再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 |
| 5364 | 2024-12-14 |
q-Diffusion leverages the full dimensionality of gene coexpression in single-cell transcriptomics
2024-04-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06104-w
PMID:38565955
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研究论文 | 本文介绍了一种名为q-diffusion的框架，用于捕捉单细胞转录组数据中基因共表达的完整维度 | q-diffusion框架在捕捉基因共表达结构方面优于现有的分析工具，能够提供更丰富的细胞生物学理解 | NA | 探索单细胞RNA测序数据的完整维度，以更深入地理解细胞生物学 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达结构 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及CALGB/SWOG 80405临床试验、体外PBMC数据集和人类皮质组织的空间单细胞RNA测序数据 |
| 5365 | 2024-12-14 |
Segregation of morphogenetic regulatory function of Shox2 from its cell fate guardian role in sinoatrial node development
2024-03-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06039-2
PMID:38553636
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研究论文 | 研究探讨了Shox2在窦房结发育中的形态发生调控功能与其细胞命运守护角色之间的分离 | 首次展示了Shox2在窦房结发育中细胞命运决定与形态发生调控功能的分离 | 研究仅限于Shox2和Nkx2-5的共同失活对窦房结发育的影响，未探讨其他可能的调控因子 | 探讨Shox2在窦房结发育中的双重角色及其相互关系 | Shox2在窦房结发育中的形态发生调控功能与细胞命运守护角色 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Shox2突变体、Nkx2-5突变体及两者的共同失活突变体（dKO）的窦房结细胞 |
| 5366 | 2024-12-14 |
Endothelial gene regulatory elements associated with cardiopharyngeal lineage differentiation
2024-03-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06017-8
PMID:38514806
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研究论文 | 研究识别了与心脏咽弓中胚层分化相关的内皮细胞基因调控元件 | 通过整合染色质重塑和基因表达数据与单细胞RNA测序数据，识别了101个内皮细胞基因的潜在调控元件，并使用机器学习策略预测增强子 | 研究主要基于小鼠胚胎数据，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 识别和验证在心脏咽弓中胚层分化过程中激活的内皮细胞基因调控元件 | 内皮细胞基因调控元件及其在心脏咽弓中胚层分化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎 |
| 5367 | 2024-12-14 |
GPU-accelerated Kendall distance computation for large or sparse data
2024-Jan-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae088
PMID:39658191
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研究论文 | 本文介绍了一种GPU加速的Kendall距离矩阵计算软件GADES，适用于大规模或稀疏数据的处理 | 提出了GPU加速的Kendall-$ au$距离矩阵计算方法，并解决了数据稀疏性带来的算法挑战 | 未提及具体的局限性 | 开发高效的计算策略，用于高性能的Kendall距离矩阵计算 | 大规模或稀疏的多维数据集，如单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | GPU加速计算 | NA | 数据矩阵 | 未提及具体的样本数量 |
| 5368 | 2024-12-14 |
Unveiling the role of TGF-β signaling pathway in breast cancer prognosis and immunotherapy
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1488137
PMID:39664194
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β信号通路在乳腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 开发了一种新的TGF-β通路相关预后签名（TSPRS），并验证了其在乳腺癌预后和免疫治疗中的预测能力 | NA | 研究TGF-β信号通路与乳腺癌临床结果及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响 | 乳腺癌患者的转录组和单细胞测序数据 | NA | 乳腺癌 | 转录组测序，单细胞测序，加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌转录组和单细胞测序数据，涉及54个与TGF-β信号通路相关的基因 |
| 5369 | 2024-12-13 |
Computational analysis of the functional impact of MHC-II-expressing triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497251
PMID:39664386
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研究论文 | 研究分析了MHC-II表达的三阴性乳腺癌的功能影响 | 揭示了MHC-II表达的肿瘤细胞在调节免疫环境和影响患者生存结果中的功能重要性，并开发了一个包含40个显著基因的预后标志物，通过机器学习模型成功预测了患者的生存结果和免疫浸润程度 | NA | 理解MHC-II表达的肿瘤细胞在肿瘤微环境中的作用 | 三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | NA |
| 5370 | 2024-12-14 |
Complement C1q is a key player in tumor-associated macrophage-mediated CD8+ T cell and NK cell dysfunction in malignant pleural effusion
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.100607
PMID:39664577
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研究论文 | 本研究探讨了补体C1q在肿瘤相关巨噬细胞介导的CD8+ T细胞和NK细胞功能障碍中的作用 | 首次揭示了C1q在M2巨噬细胞极化中的依赖性作用，并证明了C1q缺乏可以恢复CD8 T细胞的耗竭状态，增强CD8 T细胞和NK细胞的免疫活性 | 实验仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究C1q在恶性胸腔积液中的作用及其对免疫细胞功能的影响 | 恶性胸腔积液中的巨噬细胞、CD8+ T细胞和NK细胞 | 免疫学 | 癌症 | scRNA-seq、代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、代谢物数据 | 使用C1qa小鼠MPE模型进行实验 |
| 5371 | 2024-12-14 |
Harnessing Nanotechnology for Gout Therapy: Colchicine-Loaded Nanoparticles Regulate Macrophage Polarization and Reduce Inflammation
2024, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0089
PMID:39665079
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研究论文 | 本研究探讨了秋水仙碱对巨噬细胞极化的调控作用，并开发了一种基于纳米载体的秋水仙碱递送系统，以增强痛风炎症的治疗效果 | 首次揭示了秋水仙碱通过关键基因AHNAK调控巨噬细胞极化的机制，并开发了一种基于R4F-NM@F127纳米载体的秋水仙碱递送系统，能够靶向调节巨噬细胞极化，减少对正常组织的毒性 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 探讨秋水仙碱对巨噬细胞极化的调控作用，并开发一种新的纳米载体系统以增强痛风的治疗效果 | 痛风小鼠模型中的巨噬细胞极化和炎症反应 | NA | 痛风 | 单细胞RNA测序、分子对接、慢病毒干预、生物化学指标检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、生物化学指标数据 | 小鼠模型和外周血单核细胞样本 |
| 5372 | 2024-12-14 |
A high OXPHOS CD8 T cell subset is predictive of immunotherapy resistance in melanoma patients
2022-01-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20202084
PMID:34807232
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学发现了一种高氧化磷酸化（OXPHOS）的CD8 T细胞亚群，该亚群在黑色素瘤患者中与免疫检查点抑制剂（ICI）疗法的耐药性相关，并开发了一种基于该细胞亚群转录组特征的ICI疗法反应预测模型 | 首次发现并验证了高OXPHOS的CD8 T细胞亚群（CD8+ TOXPHOS细胞）与黑色素瘤患者ICI疗法耐药性的关联，并开发了基于该细胞亚群的预测模型 | NA | 研究黑色素瘤患者中与免疫检查点抑制剂疗法耐药性相关的免疫细胞亚群，并开发预测ICI疗法反应的模型 | 黑色素瘤患者的CD8 T细胞亚群及其与ICI疗法耐药性的关系 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个验证队列中的黑色素瘤患者 |
| 5373 | 2024-12-14 |
Cancer-Associated Fibroblasts and Squamous Epithelial Cells Constitute a Unique Microenvironment in a Mouse Model of Inflammation-Induced Colon Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.878920
PMID:35600339
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和多重免疫荧光成像（MxIF）分析了两种小鼠结直肠癌模型中的肿瘤微环境差异 | 发现了AOM/DSS模型中癌症相关成纤维细胞（CAFs）和鳞状上皮细胞的独特微环境，并揭示了它们与肿瘤细胞的潜在机制联系 | NA | 揭示炎症诱导的结直肠癌模型中肿瘤微环境的复杂性 | 小鼠结直肠癌模型中的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光成像（MxIF） | NA | 基因表达数据，图像 | 两种小鼠结直肠癌模型（Lrig1;Apc和AOM/DSS） |
| 5374 | 2024-12-14 |
STAT3 signaling in myeloid cells promotes pathogenic myelin-specific T cell differentiation and autoimmune demyelination
2020-03-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1913997117
PMID:32094172
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研究论文 | 研究揭示了STAT3信号在髓系细胞中对病理性髓鞘特异性T细胞分化和自身免疫性脱髓鞘的促进作用 | 首次发现髓系细胞中的STAT3信号对髓鞘反应性T细胞的激活至关重要，并提出髓系STAT3作为自身免疫性脱髓鞘疾病的潜在治疗靶点 | NA | 探讨STAT3信号在髓系细胞中对多发性硬化症（MS）发病机制的影响 | 髓系细胞、髓鞘特异性T细胞、实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE） | NA | 多发性硬化症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 野生型和突变型小鼠的髓系细胞 |
| 5375 | 2024-12-13 |
Immune cell-enriched single-cell RNA sequencing unveils the interplay between infiltrated CD8+ T resident memory cells and choroid plexus epithelial cells in Alzheimer's disease
2025-Jan-15, Journal of neuroimmunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jneuroim.2024.578488
PMID:39571412
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研究论文 | 本研究通过免疫细胞富集的单细胞RNA测序，揭示了阿尔茨海默病中浸润的CD8+ T记忆细胞与脉络丛上皮细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析了阿尔茨海默病模型小鼠中CD8+ T记忆细胞和脉络丛上皮细胞的基因表达差异，揭示了T细胞耗竭标志物的显著升高以及脉络丛上皮细胞基因表达模式的改变 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证结果 | 探索阿尔茨海默病脑微环境的特征及其潜在机制 | 阿尔茨海默病模型小鼠的脑实质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,587个单细胞样本，来自12个月大的5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和对照小鼠 |
| 5376 | 2024-12-13 |
SpaInGNN: Enhanced clustering and integration of spatial transcriptomics based on refined graph neural networks
2025-Jan, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.006
PMID:39542070
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研究论文 | 本文提出了一种基于改进图神经网络的空间转录组学聚类与整合方法SpaInGNN，以提高空间域识别的准确性 | SpaInGNN通过整合空间位置数据、组织学信息和基因表达谱，利用图神经网络生成低维潜在嵌入，并结合组织图像距离和欧几里得距离优化空间位置图，从而提高空间域识别的准确性 | NA | 解决空间转录组学中单细胞水平空间域识别的挑战 | 小鼠嗅球和人类外侧前额叶皮层样本 | 空间转录组学 | NA | 图神经网络 | GNN | 空间位置数据、组织学信息、基因表达谱 | 小鼠嗅球和人类外侧前额叶皮层样本 |
| 5377 | 2024-12-13 |
CAR-NK cells derived from cord blood originate mainly from CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK progenitor cells
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101374
PMID:39659759
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研究论文 | 研究探讨了脐血来源的CAR-NK细胞主要来源于CD56-CD7+CD34-HLA-DR-Lin- NK祖细胞 | 首次确定CAR-NK细胞主要来源于CD56 NK祖细胞，并揭示了CD56CD7CD34HLA-DR Lin细胞是人类脐血来源CAR-NK细胞的主要来源 | 研究未详细探讨如何增强从这些NK祖细胞中产生NK细胞的质量和数量 | 探讨CAR-NK细胞在脐血中的起源 | 脐血来源的CAR-NK细胞及其祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 脐血单个核细胞 |
| 5378 | 2024-12-13 |
Tissue Resident CD8+T-cells as mediators of protective immunity in breastmilk transmission of HCMV
2024-Dec-11, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae618
PMID:39661655
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研究论文 | 研究探讨了母乳中CD8+T细胞在预防婴儿通过母乳感染人巨细胞病毒（HCMV）中的作用 | 首次描述了母乳中组织驻留记忆T细胞（Trm）的存在，并发现非传播者母亲母乳中CD8+ Trm T细胞的频率较高，且与母乳中HCMV病毒载量呈负相关 | 研究仅限于母乳中的T细胞，未探讨这些细胞在婴儿体内的作用机制 | 探讨母乳中T细胞在预防婴儿通过母乳感染HCMV中的作用 | 母乳中记忆T细胞的频率及类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及传播者和非传播者母亲的母乳样本 |
| 5379 | 2024-12-13 |
Cancer-associated fibroblasts promote melanoma progression by inducing immune evasion: A risk prediction study based on single-cell RNA-seq and RNA-Seq data
2024-Dec-11, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.12.007
PMID:39665934
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5380 | 2024-12-13 |
Pericancerous cross-presentation to cytotoxic T lymphocytes impairs immunotherapeutic efficacy in hepatocellular carcinoma
2024-Dec-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.10.012
PMID:39547231
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研究论文 | 研究揭示了在肝细胞癌中，癌周巨噬细胞通过内质网相关降解机制介导的细胞质途径交叉呈递抗原给CD103细胞毒性T淋巴细胞，导致CD103 CTLs滞留在癌周区域，激活NLRP3炎症小体，促进肝癌进展并抵抗免疫治疗 | 首次揭示了癌周巨噬细胞通过内质网相关降解机制交叉呈递抗原给CD103 CTLs，并阐明了这一过程如何促进肝癌进展和免疫治疗抵抗 | 研究主要集中在单细胞RNA测序和空间转录组学分析，可能需要进一步的实验验证 | 探讨癌周巨噬细胞与细胞毒性T淋巴细胞在肝细胞癌中的相互作用及其对免疫治疗效果的影响 | 肝细胞癌患者的癌周巨噬细胞和CD103细胞毒性T淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 | NA | RNA | 肝细胞癌患者 |