单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5341 - 5360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5341 | 2025-10-06 |
Intracellular Spatial Transcriptomic Analysis Toolkit (InSTAnT)
2023-Jan-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2481749/v1
PMID:36747718
|
研究论文 | 开发用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT | 首个专门针对细胞内分辨率空间转录组数据的计算分析工具包，能够检测基因对和模块在细胞内外的共定位模式 | NA | 开发计算工具以充分挖掘成像空间转录组技术的潜力 | 人类癌细胞系和小鼠下丘脑视前区 | 空间转录组学 | 癌症 | 成像空间转录组技术 | 图挖掘算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 5342 | 2025-10-06 |
Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs
2025-Jul-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205
PMID:40209410
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究孕期暴露于氟氯氰菊酯对后代神经发育的毒性作用机制 | 首次构建了孕期暴露氟氯氰菊酯后代大脑海马区的单细胞图谱，揭示了神经干细胞命运改变是发育毒性的主要机制 | 研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探索孕期氟氯氰菊酯暴露引起后代神经发育毒性的分子机制 | 孕期暴露氟氯氰菊酯的大鼠后代海马组织 | 单细胞生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同年龄阶段的大鼠后代海马组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5343 | 2025-10-06 |
[Integrating single-cell analysis and epharmalib reverse virtual screening to predict novel vascular endothelial cell targets of dapagliflozin in treating diabetic cardiomyopathy]
2025-Jun-24, Zhonghua xin xue guan bing za zhi
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析与反向虚拟筛选技术，探索达格列净治疗糖尿病心肌病时对血管内皮细胞的潜在作用靶点 | 首次结合ePharmaLib反向虚拟筛选、单细胞RNA测序和芯片数据分析，系统识别达格列净在糖尿病心肌病血管内皮细胞中的多组学靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床验证尚不充分 | 探究糖尿病心肌病中内皮细胞异质性及达格列净的潜在治疗靶点 | 小鼠心脏组织内皮细胞、人脐静脉内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 反向虚拟筛选, 微阵列芯片, Western blot, RT-PCR | NA | 基因表达数据, 蛋白质结构数据, 转录组数据 | 野生型小鼠和db/db糖尿病心肌病小鼠模型，人脐静脉内皮细胞多浓度处理组 | Agilent | 单细胞RNA-seq, 微阵列芯片 | Agilent Mouse ceRNA Microarray chip | 单细胞RNA测序数据来自PRJNA1069235数据集 |
| 5344 | 2025-10-06 |
Ginsenoside Compound K Mitigates Mitochondrial Fission Through Bile Acid Receptors/YAP Signaling to Counteract Podocyte Injury in Lupus Nephritis
2025-Jun-18, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.8492
PMID:40528637
|
研究论文 | 本研究探讨人参皂苷化合物K通过胆汁酸受体/YAP信号通路调控线粒体分裂，减轻狼疮性肾炎足细胞损伤的机制 | 首次阐明人参皂苷化合物K通过胆汁酸受体-YAP信号轴调控线粒体动力学，揭示其在狼疮性肾炎足细胞保护中的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床试验验证 | 探究人参皂苷化合物K在狼疮性肾炎中保护足细胞的分子机制 | MRL/lpr狼疮易感小鼠和体外培养的足细胞 | 分子生物学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序，代谢组学分析，体外细胞实验 | 动物疾病模型 | 基因表达数据，代谢物数据，病理数据 | MRL/lpr小鼠，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5345 | 2025-10-06 |
Splenic CD169+Tim4+ Marginal Metallophilic Macrophages Are Essential for Wound Healing After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了脾脏CD169+Tim4+边缘金属亲和性巨噬细胞在心肌梗死后伤口愈合中的关键作用 | 首次发现脾脏CD169+Tim4+边缘金属亲和性巨噬细胞通过循环进入心脏，在心肌梗死后发挥免疫调节和组织修复功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据有限 | 探究脾脏特定巨噬细胞亚群在心肌梗死后伤口愈合中的作用机制 | 小鼠模型和人类ST段抬高型心肌梗死患者 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,谱系追踪,细胞追踪,脾切除术,联体共生,细胞过继转移 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 小鼠模型和人类患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5346 | 2025-10-06 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis identifies B-cell subpopulations and associated cancer subtypes with distinct clinical and molecular characteristics
2025-Jun-17, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01082-5
PMID:40526246
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk转录组数据，识别了8个B细胞亚群并构建了与癌症预后和免疫治疗反应相关的预测模型 | 首次在泛癌水平系统鉴定B细胞亚群，并揭示其与临床预后的关联，构建了基于B细胞特征的癌症分型和预测模型 | 研究基于已有数据集，缺乏实验验证；样本来源和数量在不同癌种间存在不平衡 | 探究B细胞亚群在泛癌中的临床相关性和分子特征 | 424名患者的102,504个细胞，涵盖15种癌症类型 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，空间转录组学 | 无监督聚类，轨迹分析，预测模型 | 单细胞转录组数据，bulk转录组数据，空间转录组数据 | 102,504个细胞来自424名患者，15种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 5347 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omics reveals that FABP1 + renal cell carcinoma drive tumor angiogenesis through the PLG-PLAT axis under fatty acid reprogramming
2025-Jun-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02377-9
PMID:40518526
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示FABP1阳性肾癌细胞通过PLG-PLAT轴驱动肿瘤血管生成 | 发现FABP1+肾癌细胞亚群具有独特的空间分布特征，并首次揭示PLG-PLAT功能轴在肿瘤-内皮细胞相互作用中的关键作用 | 对脂肪酸代谢重编程的深入研究仍显不足，需要进一步验证FABP1-PLG-PLAT轴的具体分子机制 | 探究肾细胞癌中脂肪酸代谢重编程对肿瘤血管生成的影响机制 | 肾细胞癌肿瘤组织中的FABP1阳性肿瘤细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞多组学, 空间转录组学, 受体-配体相互作用分析 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5348 | 2025-10-06 |
Role of local complement activation in kidney fibrosis and repair
2025-Jun-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188345
PMID:40519169
|
综述 | 探讨局部补体激活在肾脏纤维化与修复过程中的作用机制 | 揭示肾脏局部补体系统在纤维化微环境形成中的关键作用，并提出靶向局部补体治疗慢性肾脏病的新策略 | 主要依赖动物模型研究，人类临床数据有限 | 阐明局部补体激活在肾脏疾病进展中的病理机制 | 肾小球和肾小管间质肾病动物模型及慢性肾脏病患者 | 病理生理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 组织病理数据 | 动物模型及人类肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 5349 | 2025-10-06 |
From inserts to chips: microfluidic culture and 3D astrocyte co-culture drive functional and transcriptomic changes in hiPSC-derived endothelial cells
2025-Jun-16, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-025-00672-7
PMID:40524169
|
研究论文 | 本研究比较了微流体BBB芯片平台与传统细胞培养插入模型对人诱导多能干细胞来源内皮细胞功能和转录组表型的影响 | 首次系统比较微流体芯片与传统培养系统对hiPSC来源内皮细胞的影响，并发现3D星形胶质细胞共培养对维持内皮细胞单层的关键作用 | 研究仅聚焦于内皮细胞和星形胶质细胞，未包含BBB的其他重要组分如周细胞 | 研究不同培养平台如何改变hiPSC来源内皮细胞的功能和转录组表型 | 人诱导多能干细胞来源的内皮细胞和星形胶质细胞 | 生物医学工程 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，渗透性实验，蛋白表达分析 | 器官芯片模型，2D/3D细胞培养模型 | 转录组数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | AKITA plate | 微流体血脑屏障芯片平台 |
| 5350 | 2025-10-06 |
Exploring T-cell metabolism in tuberculosis: development of a diagnostic model using metabolic genes
2025-Jun-16, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02768-0
PMID:40524207
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结核病患者外周血单个核细胞，开发了基于T细胞代谢基因的诊断模型 | 首次整合单细胞RNA测序与机器学习算法识别T细胞相关代谢差异表达基因，构建结核病诊断模型并进行分子分型 | 样本量较小（仅7个个体），需要在更大队列中验证模型的普适性 | 探索T细胞代谢在结核病中的作用，开发活动性结核与潜伏感染的诊断模型 | 活动性结核患者、潜伏结核感染者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，机器学习算法（XGBoost、SVM-RFE、Boruta） | XGBoost、SVM-RFE、Boruta、诺模图预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 7个个体（2个健康对照、2个潜伏感染、3个活动性结核） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5351 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts promote drug resistance in ALK-driven lung adenocarcinoma cells by upregulating lipid biosynthesis
2025-Jun-16, Cancer & metabolism
IF:6.0Q1
DOI:10.1186/s40170-025-00400-7
PMID:40524253
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过上调脂质生物合成促进ALK驱动肺腺癌细胞对靶向药物产生耐药性的机制 | 首次发现CAFs通过HGF和NRG1激活AKT信号通路，增强脂质新生并抑制脂质过氧化，从而介导ALK-TKI耐药 | 研究主要基于3D球体共培养模型，需要在体内模型中进一步验证 | 探究CAFs在ALK驱动肺腺癌细胞耐药性形成中的分子机制 | ALK重排肺腺癌细胞和癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，3D球体共培养，功能分析 | 3D球体共培养模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5352 | 2025-10-06 |
Elevated CD14 in B cells associates with reduced ovarian cancer risk via CD80 + dendritic cell interaction: a multi-omics study
2025-Jun-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02956-8
PMID:40517355
|
研究论文 | 通过多组学研究揭示B细胞中CD14表达升高通过CD80+树突状细胞相互作用降低卵巢癌风险的机制 | 首次在B细胞中发现CD14与卵巢癌风险的关联，并通过中介分析揭示CD80在其中的介导作用 | 样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 探究B细胞中CD14表达与卵巢癌风险的关联机制 | 卵巢癌患者和健康捐赠者的外周血单核细胞 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 中介分析 | NA | 单细胞转录组数据, eQTL数据, pQTL数据 | 卵巢癌患者和健康捐赠者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5353 | 2025-10-06 |
A Prognostic Lysine Crotonylation Signature Shapes the Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun-13, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于巴豆酰化相关基因的预后特征模型，用于肝细胞癌的风险分层和免疫微环境分析 | 首次构建了肝细胞癌中巴豆酰化相关基因的预后特征模型，揭示了其在肿瘤免疫微环境塑造中的新作用 | 需要标准化的巴豆酰化测量方法，需在不同病因的肝细胞癌中进行验证，需机制和纵向研究确认因果关系 | 探讨巴豆酰化相关基因在肝细胞癌中的预后价值和治疗相关性 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析，单细胞测序，Cox回归，LASSO回归，CIBERSORT，OncoPredict | 风险评分模型，列线图 | 转录组数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5354 | 2025-10-06 |
Systematic Pan-Cancer Analysis of the Oncogenic and Immunological Function of Stanniocalcin-1 (STC1)
2025-Jun-13, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过多组学分析系统研究STC1在泛癌中的致癌和免疫学功能 | 首次系统揭示STC1作为新型泛癌因子在肿瘤进展和免疫微环境重塑中的双重作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于胃癌组织 | 确立STC1的泛癌预后意义并阐明其与免疫特征的关联 | 33种癌症类型和胃癌组织样本 | 生物信息学 | 多种癌症 | 多组学分析, 单细胞RNA测序, 多重荧光染色, Western blot | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 组织图像 | TCGA泛癌数据集和30例胃癌组织微阵列 | NA | 单细胞RNA测序, 组织微阵列 | NA | NA |
| 5355 | 2025-10-06 |
Adulthood outcomes of thymic transplantation in a case of congenital athymia due to FOXN1 mutation
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.02.006
PMID:39956280
|
研究论文 | 报告一例因FOXN1突变导致先天性无胸腺患者接受胸腺移植后19年的临床和免疫学结果 | 首次报道先天性无胸腺患者胸腺移植后的长期成人期结局，通过高维光谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示异体胸腺教育T细胞的独特生物学特征 | 仅基于单一病例研究，样本量有限，缺乏对照组长期数据 | 评估胸腺移植在先天性无胸腺患者中的长期免疫重建效果 | FOXN1 R255X纯合突变导致的先天性无胸腺患者 | 免疫学 | 先天性免疫缺陷 | 高维光谱流式细胞术，单细胞RNA测序，T细胞受体测序，细胞表面蛋白测序 | NA | 流式细胞数据，单细胞转录组数据，临床数据 | 1例患者（随访19年）及年龄匹配对照 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | NA |
| 5356 | 2025-10-06 |
Machine learning approach to single cell transcriptomic analysis of Sjogren's disease reveals altered activation states of B and T lymphocytes
2025-Jun, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103419
PMID:40318561
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析和机器学习方法研究干燥综合征患者B细胞和T细胞的异常激活状态 | 首次在干燥综合征中应用非负矩阵分解识别B细胞和T细胞的独特基因表达谱，揭示Th1细胞的关键作用 | 研究样本仅来自外周血单核细胞，未直接研究唾液腺和泪腺中的免疫细胞 | 探索干燥综合征发病机制中免疫细胞的功能变化 | 干燥综合征患者和对照者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据 | 干燥综合征患者和症状对照者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5357 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Macrophage-Endothelial Cell Crosstalk in Viral Myocarditis
2025-Jun, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70440
PMID:40525609
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了病毒性心肌炎中巨噬细胞与内皮细胞之间的相互作用机制 | 首次在病毒性心肌炎模型中系统描绘了免疫细胞与基质细胞的互作网络，发现巨噬细胞通过VEGFA信号通路驱动保护性血管生成的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 阐明病毒性心肌炎中免疫细胞与基质细胞的相互作用机制 | 柯萨奇病毒B3诱导的病毒性心肌炎小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 病毒感染不同时间点的小鼠心脏组织和外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5358 | 2025-10-06 |
Insulin-Degrading Enzyme Regulates mRNA Processing and May Interact with the CCR4-NOT Complex
2025-05-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110792
PMID:40497968
|
研究论文 | 本研究探索胰岛素降解酶在mRNA处理和蛋白质稳态中的新功能 | 首次发现胰岛素降解酶与CCR4-NOT复合物相互作用，并提出其通过协调去腺苷酸化和蛋白酶功能调控蛋白质表达的新机制 | 提出的模型仍为推测性，需要进一步实验验证 | 阐明胰岛素降解酶在细胞生理和蛋白质稳态中的更广泛功能 | 人和小鼠胰岛细胞 | 分子生物学 | NA | 蛋白质组学,转录组学,单细胞转录组,邻近生物素化 | NA | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5359 | 2025-10-06 |
Molecular Fingerprint of Endocannabinoid Signaling in the Developing Paraventricular Nucleus of the Hypothalamus as Revealed by Single-Cell RNA-Seq and In Situ Hybridization
2025-05-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110788
PMID:40497964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术揭示了小鼠下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的分子特征 | 首次在分子定义的神经元和星形胶质细胞中绘制了2-AG和AEA信号传导的时空图谱，发现了从Dagla到Daglb的发育转换 | 研究仅限于小鼠模型，且某些大麻素受体亚型的mRNA未能检测到 | 阐明下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的纳米结构 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的下丘脑室旁核神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5360 | 2025-10-06 |
The cGAS/STING Pathway: Friend or Foe in Regulating Cardiomyopathy
2025-05-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110778
PMID:40497954
|
综述 | 本文系统探讨cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的双重作用及治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序数据与系统文献综述，揭示cGAS/STING通路在心肌病中的调控机制和潜在治疗靶点 | cGAS/STING通路在心肌病中的具体分子机制仍不明确且存在争议，需未来研究验证 | 阐明cGAS/STING信号通路在心肌病炎症反应中的调控作用及治疗干预策略 | 心肌病相关的炎症机制和cGAS/STING信号通路 | 自然语言处理 | 心肌病 | 单细胞RNA测序, 文献综述 | NA | 文本数据, 测序数据 | 公开可用的人类单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |