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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5341 | 2025-10-06 |
Role of local complement activation in kidney fibrosis and repair
2025-Jun-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188345
PMID:40519169
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综述 | 探讨局部补体激活在肾脏纤维化与修复过程中的作用机制 | 揭示肾脏局部补体系统在纤维化微环境形成中的关键作用,并提出靶向局部补体治疗慢性肾脏病的新策略 | 主要依赖动物模型研究,人类临床数据有限 | 阐明局部补体激活在肾脏疾病进展中的病理机制 | 肾小球和肾小管间质肾病动物模型及慢性肾脏病患者 | 病理生理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 组织病理数据 | 动物模型及人类肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
5342 | 2025-10-06 |
From inserts to chips: microfluidic culture and 3D astrocyte co-culture drive functional and transcriptomic changes in hiPSC-derived endothelial cells
2025-Jun-16, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-025-00672-7
PMID:40524169
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研究论文 | 本研究比较了微流体BBB芯片平台与传统细胞培养插入模型对人诱导多能干细胞来源内皮细胞功能和转录组表型的影响 | 首次系统比较微流体芯片与传统培养系统对hiPSC来源内皮细胞的影响,并发现3D星形胶质细胞共培养对维持内皮细胞单层的关键作用 | 研究仅聚焦于内皮细胞和星形胶质细胞,未包含BBB的其他重要组分如周细胞 | 研究不同培养平台如何改变hiPSC来源内皮细胞的功能和转录组表型 | 人诱导多能干细胞来源的内皮细胞和星形胶质细胞 | 生物医学工程 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,渗透性实验,蛋白表达分析 | 器官芯片模型,2D/3D细胞培养模型 | 转录组数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | AKITA plate | 微流体血脑屏障芯片平台 |
5343 | 2025-10-06 |
Exploring T-cell metabolism in tuberculosis: development of a diagnostic model using metabolic genes
2025-Jun-16, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02768-0
PMID:40524207
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结核病患者外周血单个核细胞,开发了基于T细胞代谢基因的诊断模型 | 首次整合单细胞RNA测序与机器学习算法识别T细胞相关代谢差异表达基因,构建结核病诊断模型并进行分子分型 | 样本量较小(仅7个个体),需要在更大队列中验证模型的普适性 | 探索T细胞代谢在结核病中的作用,开发活动性结核与潜伏感染的诊断模型 | 活动性结核患者、潜伏结核感染者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,机器学习算法(XGBoost、SVM-RFE、Boruta) | XGBoost、SVM-RFE、Boruta、诺模图预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 7个个体(2个健康对照、2个潜伏感染、3个活动性结核) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5344 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts promote drug resistance in ALK-driven lung adenocarcinoma cells by upregulating lipid biosynthesis
2025-Jun-16, Cancer & metabolism
IF:6.0Q1
DOI:10.1186/s40170-025-00400-7
PMID:40524253
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过上调脂质生物合成促进ALK驱动肺腺癌细胞对靶向药物产生耐药性的机制 | 首次发现CAFs通过HGF和NRG1激活AKT信号通路,增强脂质新生并抑制脂质过氧化,从而介导ALK-TKI耐药 | 研究主要基于3D球体共培养模型,需要在体内模型中进一步验证 | 探究CAFs在ALK驱动肺腺癌细胞耐药性形成中的分子机制 | ALK重排肺腺癌细胞和癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,3D球体共培养,功能分析 | 3D球体共培养模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5345 | 2025-10-06 |
Elevated CD14 in B cells associates with reduced ovarian cancer risk via CD80 + dendritic cell interaction: a multi-omics study
2025-Jun-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02956-8
PMID:40517355
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研究论文 | 通过多组学研究揭示B细胞中CD14表达升高通过CD80+树突状细胞相互作用降低卵巢癌风险的机制 | 首次在B细胞中发现CD14与卵巢癌风险的关联,并通过中介分析揭示CD80在其中的介导作用 | 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探究B细胞中CD14表达与卵巢癌风险的关联机制 | 卵巢癌患者和健康捐赠者的外周血单核细胞 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 中介分析 | NA | 单细胞转录组数据, eQTL数据, pQTL数据 | 卵巢癌患者和健康捐赠者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5346 | 2025-10-06 |
A Prognostic Lysine Crotonylation Signature Shapes the Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun-13, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究开发了一个基于巴豆酰化相关基因的预后特征模型,用于肝细胞癌的风险分层和免疫微环境分析 | 首次构建了肝细胞癌中巴豆酰化相关基因的预后特征模型,揭示了其在肿瘤免疫微环境塑造中的新作用 | 需要标准化的巴豆酰化测量方法,需在不同病因的肝细胞癌中进行验证,需机制和纵向研究确认因果关系 | 探讨巴豆酰化相关基因在肝细胞癌中的预后价值和治疗相关性 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞测序,Cox回归,LASSO回归,CIBERSORT,OncoPredict | 风险评分模型,列线图 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
5347 | 2025-10-06 |
Systematic Pan-Cancer Analysis of the Oncogenic and Immunological Function of Stanniocalcin-1 (STC1)
2025-Jun-13, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过多组学分析系统研究STC1在泛癌中的致癌和免疫学功能 | 首次系统揭示STC1作为新型泛癌因子在肿瘤进展和免疫微环境重塑中的双重作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于胃癌组织 | 确立STC1的泛癌预后意义并阐明其与免疫特征的关联 | 33种癌症类型和胃癌组织样本 | 生物信息学 | 多种癌症 | 多组学分析, 单细胞RNA测序, 多重荧光染色, Western blot | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 组织图像 | TCGA泛癌数据集和30例胃癌组织微阵列 | NA | 单细胞RNA测序, 组织微阵列 | NA | NA |
5348 | 2025-10-06 |
Adulthood outcomes of thymic transplantation in a case of congenital athymia due to FOXN1 mutation
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.02.006
PMID:39956280
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研究论文 | 报告一例因FOXN1突变导致先天性无胸腺患者接受胸腺移植后19年的临床和免疫学结果 | 首次报道先天性无胸腺患者胸腺移植后的长期成人期结局,通过高维光谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示异体胸腺教育T细胞的独特生物学特征 | 仅基于单一病例研究,样本量有限,缺乏对照组长期数据 | 评估胸腺移植在先天性无胸腺患者中的长期免疫重建效果 | FOXN1 R255X纯合突变导致的先天性无胸腺患者 | 免疫学 | 先天性免疫缺陷 | 高维光谱流式细胞术,单细胞RNA测序,T细胞受体测序,细胞表面蛋白测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据,临床数据 | 1例患者(随访19年)及年龄匹配对照 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | NA |
5349 | 2025-10-06 |
Machine learning approach to single cell transcriptomic analysis of Sjogren's disease reveals altered activation states of B and T lymphocytes
2025-Jun, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103419
PMID:40318561
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析和机器学习方法研究干燥综合征患者B细胞和T细胞的异常激活状态 | 首次在干燥综合征中应用非负矩阵分解识别B细胞和T细胞的独特基因表达谱,揭示Th1细胞的关键作用 | 研究样本仅来自外周血单核细胞,未直接研究唾液腺和泪腺中的免疫细胞 | 探索干燥综合征发病机制中免疫细胞的功能变化 | 干燥综合征患者和对照者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据 | 干燥综合征患者和症状对照者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5350 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Macrophage-Endothelial Cell Crosstalk in Viral Myocarditis
2025-Jun, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70440
PMID:40525609
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了病毒性心肌炎中巨噬细胞与内皮细胞之间的相互作用机制 | 首次在病毒性心肌炎模型中系统描绘了免疫细胞与基质细胞的互作网络,发现巨噬细胞通过VEGFA信号通路驱动保护性血管生成的新机制 | 研究仅使用小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 阐明病毒性心肌炎中免疫细胞与基质细胞的相互作用机制 | 柯萨奇病毒B3诱导的病毒性心肌炎小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 病毒感染不同时间点的小鼠心脏组织和外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5351 | 2025-10-06 |
Insulin-Degrading Enzyme Regulates mRNA Processing and May Interact with the CCR4-NOT Complex
2025-05-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110792
PMID:40497968
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研究论文 | 本研究探索胰岛素降解酶在mRNA处理和蛋白质稳态中的新功能 | 首次发现胰岛素降解酶与CCR4-NOT复合物相互作用,并提出其通过协调去腺苷酸化和蛋白酶功能调控蛋白质表达的新机制 | 提出的模型仍为推测性,需要进一步实验验证 | 阐明胰岛素降解酶在细胞生理和蛋白质稳态中的更广泛功能 | 人和小鼠胰岛细胞 | 分子生物学 | NA | 蛋白质组学,转录组学,单细胞转录组,邻近生物素化 | NA | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5352 | 2025-10-06 |
Molecular Fingerprint of Endocannabinoid Signaling in the Developing Paraventricular Nucleus of the Hypothalamus as Revealed by Single-Cell RNA-Seq and In Situ Hybridization
2025-05-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110788
PMID:40497964
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术揭示了小鼠下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的分子特征 | 首次在分子定义的神经元和星形胶质细胞中绘制了2-AG和AEA信号传导的时空图谱,发现了从Dagla到Daglb的发育转换 | 研究仅限于小鼠模型,且某些大麻素受体亚型的mRNA未能检测到 | 阐明下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的纳米结构 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的下丘脑室旁核神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5353 | 2025-10-06 |
The cGAS/STING Pathway: Friend or Foe in Regulating Cardiomyopathy
2025-05-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110778
PMID:40497954
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综述 | 本文系统探讨cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的双重作用及治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序数据与系统文献综述,揭示cGAS/STING通路在心肌病中的调控机制和潜在治疗靶点 | cGAS/STING通路在心肌病中的具体分子机制仍不明确且存在争议,需未来研究验证 | 阐明cGAS/STING信号通路在心肌病炎症反应中的调控作用及治疗干预策略 | 心肌病相关的炎症机制和cGAS/STING信号通路 | 自然语言处理 | 心肌病 | 单细胞RNA测序, 文献综述 | NA | 文本数据, 测序数据 | 公开可用的人类单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5354 | 2025-10-06 |
Dynamic Expression and Functional Implications of the Cell Polarity Gene, Dchs1, During Cardiac Development
2025-05-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110774
PMID:40497950
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研究论文 | 本研究通过构建Dchs1-HA敲入小鼠模型,揭示了Dchs1在心脏发育过程中的动态表达模式和功能意义 | 首次系统阐明Dchs1在心脏发育中的时空表达模式及其在非心肌细胞间的极性延伸和细胞间通讯作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类心脏发育中的直接应用仍需进一步验证 | 探究Dchs1在心脏发育过程中的表达模式和功能机制 | Dchs1-HA敲入小鼠模型的心脏组织 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 免疫组织化学、Western blotting、单细胞转录组学 | NA | 图像数据、蛋白质印迹数据、单细胞转录组数据 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5355 | 2025-10-06 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651101
PMID:40475445
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序方案,用于提高胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 开发了针对胰腺胰岛的单细胞长读长测序优化方案,证明5'端文库制备优于3'端方案,并采用胰岛素转录本靶向去除策略增强信息读长检测 | 未明确说明样本数量和技术重复情况,长读长测序本身存在较高错误率的技术挑战 | 优化单细胞长读长测序技术以改善胰腺胰岛中转录本异构体的检测 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型,特别是产生高水平单一转录本的胰岛内分泌细胞 | 单细胞测序 | 糖尿病 | 单细胞长读长测序,转录本去除策略 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,长读长测序 | NA | NA |
5356 | 2025-10-06 |
Tyrosinase in melanoma inhibits anti-tumor activity of PD-1 deficient T cells
2025-May-15, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02237-4
PMID:40375241
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术敲除黑色素瘤中的酪氨酸酶,发现其能抑制T细胞的抗肿瘤活性,并揭示了酪氨酸酶缺失可逆转免疫冷肿瘤表型 | 首次发现酪氨酸酶在黑色素瘤中抑制T细胞抗肿瘤活性,并证明其缺失可增强PD-1缺陷T细胞的抗肿瘤效果 | 研究基于小鼠B16黑色素瘤模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索黑色素瘤抵抗免疫治疗的分子机制 | B16黑色素瘤细胞、T细胞、PD-1缺陷小鼠 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠黑色素瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5357 | 2025-10-06 |
CAF-derived exosomal LINC01711 promotes breast cancer progression by activating the miR-4510/NELFE axis and enhancing glycolysis
2025-Apr-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402024RRR
PMID:40172996
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌相关成纤维细胞通过外泌体传递LINC01711激活miR-4510/NELFE轴,从而增强乳腺癌细胞糖酵解和恶性进展的分子机制 | 首次发现CAF来源外泌体中的LINC01711通过miR-4510/NELFE轴调控TXN表达并促进糖酵解的新机制 | NA | 探索乳腺癌微环境中CAF通过外泌体lncRNA促进肿瘤进展的分子机制 | 乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞(CAF)及其外泌体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、降维分析、聚类分析、细胞注释 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5358 | 2025-10-06 |
Coordinated regulation of cortical astrocyte maturation by OLIG1 and OLIG2 through BMP7 signaling modulation
2025-Mar-24, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.03.008
PMID:40139307
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研究论文 | 本研究揭示了OLIG1和OLIG2通过调控BMP7信号通路协调调节皮层星形胶质细胞成熟的机制 | 首次发现OLIG1和OLIG2协同调控星形胶质细胞成熟,并阐明其通过直接结合Bmp7增强子抑制表达的作用机制 | 未明确说明样本数量和研究模型的具体细节 | 探索皮层星形胶质细胞成熟的调控机制 | 皮层星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,体内过表达 | 基因敲除模型 | 基因表达数据,形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5359 | 2025-10-06 |
A Potential Contribution of S100A11 to Skin Fibrosis and Pulmonary Involvement in Systemic Sclerosis
2025-Jan, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70026
PMID:40525602
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研究论文 | 本研究探讨了S100A11在系统性硬化症皮肤纤维化和肺部受累中的潜在作用 | 首次发现S100A11在SSc真皮成纤维细胞中高表达,且血清水平与皮肤厚度评分和间质性肺病参数相关 | 研究样本量有限,需要进一步功能实验验证S100A11的具体作用机制 | 探究S100A11在系统性硬化症纤维化过程中的潜在病理生理作用 | 系统性硬化症患者皮肤标本和血清样本 | 病理学 | 系统性硬化症 | 免疫组织化学染色,单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验 | NA | 组织图像,基因表达数据,血清蛋白水平数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤标本及血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5360 | 2025-10-06 |
Cellular origin and clonal evolution of human dedifferentiated liposarcoma
2024-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52067-1
PMID:39266532
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术揭示了人去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化机制 | 首次鉴定出肿瘤脂肪干细胞作为DDLPS的细胞起源,并证明其具有多能性特征 | 研究样本仅来自原发肿瘤,未涉及转移性病灶 | 探究去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化过程 | 人原发去分化脂肪肉瘤的成对分化良好和去分化组分 | 数字病理学 | 脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序, DNA测序, 原位多重免疫荧光, 功能分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 图像数据 | 原发DDLPS肿瘤的成对WD和DD组分 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |