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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5321 - 5340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5321 | 2025-10-06 |
Fast Encapsulation of Microbes into Dissolvable Hydrogel Beads Enables High-Throughput Microbial Single-Cell RNA Sequencing of Clinical Microbiome Samples
2025-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202500481
PMID:40200683
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研究论文 | 开发了一种名为smGel-seq的高通量微生物单细胞RNA测序方法，用于临床微生物组样本分析 | 使用可溶解水凝胶珠封装单个微生物，显著提高微生物回收率并降低样本输入需求 | NA | 开发适用于临床微生物组样本的高通量单细胞RNA测序方法 | 临床微生物组样本（肠道和痰液微生物组） | 单细胞测序 | 微生物组相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微流控平台与可溶解水凝胶珠封装技术 |
| 5322 | 2025-10-06 |
Perinatal Exposure to Lead or Diethylhexyl Phthalate in Mice: Sex-Specific Effects on Cardiac DNA Methylation and Gene Expression across Time
2025-Jun, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP15503
PMID:40315424
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨围产期铅或DEHP暴露对心脏DNA甲基化和基因表达的性别特异性影响 | 首次系统研究围产期环境污染物暴露对心脏表观基因组和转录组的终身影响，并揭示性别特异性差异 | 需要更多研究确认表观遗传和转录差异对心血管健康的具体影响，特别是在老年阶段 | 研究围产期铅和DEHP暴露对心脏DNA甲基化和基因表达的终身影响 | 小鼠心脏组织 | 表观遗传学 | 心血管疾病 | ERRBS, RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq数据反卷积 | MuSiC算法, MethylSig, edgeR | DNA甲基化数据, 基因表达数据 | 每个性别每个暴露组至少5个样本，在3周、5个月和10个月时间点收集 | NA | 全基因组甲基化测序, 转录组测序 | NA | 增强型简化代表性亚硫酸氢盐测序(ERRBS)和RNA-Seq技术 |
| 5323 | 2025-10-06 |
Multi-omics approaches for identifying the PANoptosis signature and prognostic model via a multimachine-learning computational framework for intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Apr-15, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001352
PMID:40233411
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研究论文 | 本研究通过多组学方法和机器学习框架识别肝内胆管癌的PANoptosis特征并构建预后模型 | 整合Cox回归分析和5种机器学习算法识别关键基因，构建的PANoptosis风险评分在多中心队列中表现出优异性能 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证 | 表征肝内胆管癌患者的PANoptosis特征，构建临床诊疗指导模型并探索耐药机制 | 肝内胆管癌患者 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 转录组测序、蛋白质组测序、单细胞转录组分析 | Cox回归, 机器学习算法 | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 来自OEP001105公共队列和重庆医科大学附属第一医院的多中心队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 5324 | 2025-10-06 |
Cell states and neighborhoods in distinct clinical stages of primary and metastatic esophageal adenocarcinoma
2025-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.17.608386
PMID:39229240
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研究论文 | 通过多组学分析揭示食管腺癌原发和转移性肿瘤的细胞状态、表观遗传可塑性及空间定位特征 | 首次在食管腺癌中整合单核转录组、染色质可及性测序和空间分析，识别了五种恶性细胞程序及其与表观遗传可塑性的关联 | 样本量未明确说明，需依赖外部数据集进行验证 | 解析食管腺癌疾病进展和治疗反应的细胞机制 | 原发性和转移性食管腺癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单核转录组测序, 染色质可及性测序, 空间分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据, 空间数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5325 | 2025-10-06 |
Platelet-mediated circulating tumor cell evasion from natural killer cell killing through immune checkpoint CD155-TIGIT
2025-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000934
PMID:38779918
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研究论文 | 本研究揭示了血小板通过CD155-TIGIT免疫检查点帮助循环肿瘤细胞逃避自然杀伤细胞杀伤的新机制 | 首次发现血小板黏附通过FAK/JNK/c-Jun信号通路上调CTC的CD155表达，并特异性通过TIGIT受体（而非CD96或DNAM1）抑制NK细胞活性 | NA | 探索循环肿瘤细胞在血液传播过程中如何逃避免疫监视的机制 | 循环肿瘤细胞、血小板、自然杀伤细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、体外实验、离体实验、体内实验 | NA | RNA测序数据、图像数据 | 多种癌症类型的血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5326 | 2025-10-06 |
scFTAT: a novel cell annotation method integrating FFT and transformer
2025-Feb-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06061-z
PMID:39994539
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研究论文 | 提出了一种整合快速傅里叶变换和增强Transformer的新型单细胞注释方法scFTAT | 首次将FFT与增强Transformer结合用于单细胞注释，通过LDA降维、核近似、位置编码增强和注意力增强模块提升模型性能 | 仅在六种典型数据集上验证，未在其他组织或物种数据上进行广泛测试 | 开发自动单细胞注释方法以解决数据高稀疏性和大规模手动注释的挑战 | 人类和小鼠组织的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, FFT, LDA | 单细胞RNA测序数据 | 六个典型数据集（包括人类肾脏数据） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5327 | 2025-10-06 |
Telomemore enables single-cell analysis of cell cycle and chromatin condensation
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf031
PMID:39878215
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研究论文 | 开发了Telomemore工具，通过分析ATAC-seq数据中的端粒样读段来量化染色质凝聚状态并辅助细胞周期推断 | 发现ATAC-seq端粒样读段不能用于推断端粒长度但可作为染色质凝聚生物标志物，修正了Tn5转座酶不复制9bp靶序列的传统认知 | 未明确说明样本数量的统计意义和工具在更多细胞类型中的验证情况 | 开发从单细胞ATAC-seq数据中提取染色质凝聚信息的新方法 | 成纤维细胞、B细胞、单核细胞等 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 长读长测序 | NA | 基因组测序数据 | 多个公共数据集及新生成的成纤维细胞和B细胞图谱 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5328 | 2025-10-06 |
Integration of Machine Learning and Experimental Validation to Identify Anoikis-Related Prognostic Signature for Predicting the Breast Cancer Tumor Microenvironment and Treatment Response
2024-Nov-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15111458
PMID:39596658
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研究论文 | 通过整合机器学习与实验验证，开发了失巢凋亡相关预后特征用于预测乳腺癌肿瘤微环境和治疗反应 | 首次构建了包含5个失巢凋亡相关基因的预后特征，并系统评估其与肿瘤微环境、药物敏感性和免疫治疗的关系 | 需要更大样本量的前瞻性研究进一步验证预后特征的临床适用性 | 探索失巢凋亡相关基因在乳腺癌预后预测和治疗指导中的价值 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RT-PCR, Western blot, ELISA, 单细胞分析, 空间转录组学 | 多种机器学习方法 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5329 | 2025-10-06 |
Genomic and immune heterogeneity of multiple synchronous lung adenocarcinoma at different developmental stages
2024-09-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52139-2
PMID:39256403
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析多发性同步肺癌在不同发展阶段的基因组和免疫异质性 | 首次在单细胞分辨率揭示多发性同步肺癌从癌前病变到浸润性腺癌演变过程中的克隆独立性、趋同进化和免疫微环境动态变化 | 样本量较小（8例患者16个肿瘤），需要更大队列验证发现 | 探索多发性同步肺癌不同病理阶段的基因组和免疫异质性 | 8例多发性同步肺癌患者的16个肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,全外显子组测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,免疫组库数据 | 8例患者的16个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞TCR测序,全外显子组测序 | NA | NA |
| 5330 | 2025-10-06 |
Glioblastoma cells increase expression of notch signaling and synaptic genes within infiltrated brain tissue
2024-09-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52167-y
PMID:39251578
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析胶质母细胞瘤恶性细胞在肿瘤核心区和浸润脑组织中的基因表达差异 | 首次揭示浸润脑组织中的恶性细胞表现出神经发育通路和胶质细胞分化相关基因表达增加的空间特征 | 样本量较小(n=11)，且浸润脑组织的特征描述仍不够全面 | 探索胶质母细胞瘤恶性细胞在肿瘤核心区和浸润脑组织中的空间基因表达差异 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织和浸润脑组织中的恶性细胞 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 11例样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5331 | 2025-10-06 |
ST-GEARS: Advancing 3D downstream research through accurate spatial information recovery
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51935-0
PMID:39242563
|
研究论文 | 提出ST-GEARS系统通过精确空间信息恢复推进3D空间转录组学研究 | 引入分布式约束优化方案和数学证明的双截面场应用，实现跨截面锚点的超精确连接和原始空间谱系恢复 | 未明确说明系统在不同组织类型或复杂变形场景下的适用性限制 | 解决3D空间转录组学中空间信息丢失和实验变形导致的下游分析不可靠问题 | 三维空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 优化模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 3D空间转录组学 | NA | NA |
| 5332 | 2025-10-06 |
Intracellular spatial transcriptomic analysis toolkit (InSTAnT)
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49457-w
PMID:39242579
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研究论文 | 开发了一种用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT | 首个专门用于单分子分辨率空间转录组数据分析的工具包，能够检测基因对和模块在细胞内及细胞间的共定位模式 | NA | 开发计算工具以解锁空间转录组数据在发现亚细胞生物模式方面的潜力 | 五个不同数据集，代表两种细胞系、两个脑结构、两个物种和三种不同技术 | 空间转录组学 | NA | 多重误差稳健荧光原位杂交(MERFISH)，空间转录组学 | 统计检验和算法 | 空间转录组数据 | 五个数据集 | NA | 空间转录组学，单分子分辨率成像 | NA | NA |
| 5333 | 2025-10-06 |
MerlinS13 phosphorylation controls meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2023-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2577844/v1
PMID:36993679
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质质谱分析，揭示了Merlin蛋白S13磷酸化调控脑膜瘤Wnt信号通路及MRI特征的机制 | 首次发现Merlin通过S13去磷酸化激活Wnt信号通路，并建立了基于扩散加权成像ADC值的非侵入性影像学生物标志物 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证 | 阐明Merlin完整型脑膜瘤的生长机制并开发预测临床结果的生物标志物 | 脑膜瘤细胞、异种移植模型和人类患者 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 邻近标记蛋白质质谱, 磁共振成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 医学影像 | 脑膜瘤细胞系、异种移植模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质质谱, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5334 | 2025-10-06 |
Intracellular Spatial Transcriptomic Analysis Toolkit (InSTAnT)
2023-Jan-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2481749/v1
PMID:36747718
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研究论文 | 开发用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT | 首个专门针对细胞内分辨率空间转录组数据的计算分析工具包，能够检测基因对和模块在细胞内外的共定位模式 | NA | 开发计算工具以充分挖掘成像空间转录组技术的潜力 | 人类癌细胞系和小鼠下丘脑视前区 | 空间转录组学 | 癌症 | 成像空间转录组技术 | 图挖掘算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 5335 | 2025-10-06 |
Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs
2025-Jul-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205
PMID:40209410
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究孕期暴露于氟氯氰菊酯对后代神经发育的毒性作用机制 | 首次构建了孕期暴露氟氯氰菊酯后代大脑海马区的单细胞图谱，揭示了神经干细胞命运改变是发育毒性的主要机制 | 研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探索孕期氟氯氰菊酯暴露引起后代神经发育毒性的分子机制 | 孕期暴露氟氯氰菊酯的大鼠后代海马组织 | 单细胞生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同年龄阶段的大鼠后代海马组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5336 | 2025-10-06 |
[Integrating single-cell analysis and epharmalib reverse virtual screening to predict novel vascular endothelial cell targets of dapagliflozin in treating diabetic cardiomyopathy]
2025-Jun-24, Zhonghua xin xue guan bing za zhi
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析与反向虚拟筛选技术，探索达格列净治疗糖尿病心肌病时对血管内皮细胞的潜在作用靶点 | 首次结合ePharmaLib反向虚拟筛选、单细胞RNA测序和芯片数据分析，系统识别达格列净在糖尿病心肌病血管内皮细胞中的多组学靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床验证尚不充分 | 探究糖尿病心肌病中内皮细胞异质性及达格列净的潜在治疗靶点 | 小鼠心脏组织内皮细胞、人脐静脉内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序, 反向虚拟筛选, 微阵列芯片, Western blot, RT-PCR | NA | 基因表达数据, 蛋白质结构数据, 转录组数据 | 野生型小鼠和db/db糖尿病心肌病小鼠模型，人脐静脉内皮细胞多浓度处理组 | Agilent | 单细胞RNA-seq, 微阵列芯片 | Agilent Mouse ceRNA Microarray chip | 单细胞RNA测序数据来自PRJNA1069235数据集 |
| 5337 | 2025-10-06 |
Ginsenoside Compound K Mitigates Mitochondrial Fission Through Bile Acid Receptors/YAP Signaling to Counteract Podocyte Injury in Lupus Nephritis
2025-Jun-18, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.8492
PMID:40528637
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研究论文 | 本研究探讨人参皂苷化合物K通过胆汁酸受体/YAP信号通路调控线粒体分裂，减轻狼疮性肾炎足细胞损伤的机制 | 首次阐明人参皂苷化合物K通过胆汁酸受体-YAP信号轴调控线粒体动力学，揭示其在狼疮性肾炎足细胞保护中的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床试验验证 | 探究人参皂苷化合物K在狼疮性肾炎中保护足细胞的分子机制 | MRL/lpr狼疮易感小鼠和体外培养的足细胞 | 分子生物学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序，代谢组学分析，体外细胞实验 | 动物疾病模型 | 基因表达数据，代谢物数据，病理数据 | MRL/lpr小鼠，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5338 | 2025-10-06 |
Splenic CD169+Tim4+ Marginal Metallophilic Macrophages Are Essential for Wound Healing After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了脾脏CD169+Tim4+边缘金属亲和性巨噬细胞在心肌梗死后伤口愈合中的关键作用 | 首次发现脾脏CD169+Tim4+边缘金属亲和性巨噬细胞通过循环进入心脏，在心肌梗死后发挥免疫调节和组织修复功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据有限 | 探究脾脏特定巨噬细胞亚群在心肌梗死后伤口愈合中的作用机制 | 小鼠模型和人类ST段抬高型心肌梗死患者 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,谱系追踪,细胞追踪,脾切除术,联体共生,细胞过继转移 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 小鼠模型和人类患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5339 | 2025-10-06 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis identifies B-cell subpopulations and associated cancer subtypes with distinct clinical and molecular characteristics
2025-Jun-17, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01082-5
PMID:40526246
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk转录组数据，识别了8个B细胞亚群并构建了与癌症预后和免疫治疗反应相关的预测模型 | 首次在泛癌水平系统鉴定B细胞亚群，并揭示其与临床预后的关联，构建了基于B细胞特征的癌症分型和预测模型 | 研究基于已有数据集，缺乏实验验证；样本来源和数量在不同癌种间存在不平衡 | 探究B细胞亚群在泛癌中的临床相关性和分子特征 | 424名患者的102,504个细胞，涵盖15种癌症类型 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，空间转录组学 | 无监督聚类，轨迹分析，预测模型 | 单细胞转录组数据，bulk转录组数据，空间转录组数据 | 102,504个细胞来自424名患者，15种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 5340 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omics reveals that FABP1 + renal cell carcinoma drive tumor angiogenesis through the PLG-PLAT axis under fatty acid reprogramming
2025-Jun-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02377-9
PMID:40518526
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示FABP1阳性肾癌细胞通过PLG-PLAT轴驱动肿瘤血管生成 | 发现FABP1+肾癌细胞亚群具有独特的空间分布特征，并首次揭示PLG-PLAT功能轴在肿瘤-内皮细胞相互作用中的关键作用 | 对脂肪酸代谢重编程的深入研究仍显不足，需要进一步验证FABP1-PLG-PLAT轴的具体分子机制 | 探究肾细胞癌中脂肪酸代谢重编程对肿瘤血管生成的影响机制 | 肾细胞癌肿瘤组织中的FABP1阳性肿瘤细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞多组学, 空间转录组学, 受体-配体相互作用分析 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |