单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5321	2024-12-14	Multi-omics analysis unveils the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in chordoma progression 2025-Jan, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6369 PMID:39611243	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了炎症性癌症相关成纤维细胞在脊索瘤进展中的作用	首次通过单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、多重定量免疫荧光以及体内外实验，全面揭示了炎症性癌症相关成纤维细胞在脊索瘤中的异质性、空间分布及其临床意义	研究主要集中在脊索瘤中炎症性癌症相关成纤维细胞的作用，未涉及其他类型癌症中的类似机制	探讨炎症性癌症相关成纤维细胞在脊索瘤进展中的作用及其潜在的临床意义	脊索瘤中的癌症相关成纤维细胞及其与肿瘤细胞和其他细胞类型的相互作用	数字病理学	脊索瘤	单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、多重定量免疫荧光	NA	RNA	87,693个单细胞来自7个肿瘤样本和4个对照椎间盘核样本，以及126名患者的批量RNA测序数据和116名患者的多重定量免疫荧光验证数据
5322	2024-12-14	3D printed PGCL@PLA/10CSPL composite scaffolds loaded with fibronectin 1 for intervertebral disc degeneration treatment 2024-Dec-13, Biofabrication IF:8.2Q1 DOI:10.1088/1758-5090/ad998f PMID:39668784	研究论文	本文设计并制造了一种新型3D打印PGCL@PLA/10CSPL复合支架，用于椎间盘退行性疾病的治疗	本文创新性地设计了一种具有良好生物相容性和电活性的PGCL@1PAP/10CSPL支架，并加载了从单细胞转录组数据中识别出的纤维连接蛋白1（FN1），以加速异常髓核退变	NA	研究目的是开发一种新型植入系统，用于椎间盘退行性疾病的治疗	研究对象是椎间盘退行性疾病及其治疗	生物医学工程	椎间盘退行性疾病	3D打印技术	NA	单细胞转录组数据	NA
5323	2024-12-14	Paired-Related Homeobox 1-Positive Cells Are Needed for Osseointegration 2024-Dec-11, The International journal of oral & maxillofacial implants DOI:10.11607/jomi.10852 PMID:38498783	研究论文	研究Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中对种植体诱导骨整合过程的贡献及其潜在机制	首次揭示了Prrx1阳性细胞在骨整合过程中的作用，并发现Sema3C在Prrx1阳性细胞驱动的成骨过程中起关键作用	研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人类中验证	探讨Prrx1阳性细胞在种植体诱导骨整合过程中的作用及其机制	Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中的作用	NA	NA	Cre重组酶诱导的谱系追踪、细胞消融、单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	使用小鼠牙种植体模型进行实验
5324	2024-12-14	EEE1F1 could serve as a prognostic biomarker for patients with endometrial cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing 2024-Dec-11, Asian journal of surgery IF:3.5Q1 DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.065 PMID:39668036	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
5325	2024-12-14	Parallel labeled-line organization of sympathetic outflow for selective organ regulation in mice 2024-Dec-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54928-1 PMID:39658565	研究论文	本文通过结合单细胞转录组数据和病毒遗传工具包，在小鼠中识别出两种亚型的脊髓交感神经节前神经元（SPNs），并研究了它们在交感神经系统中的特定输出调控	首次在分子水平上定义了两种亚型的SPNs，并揭示了它们在交感神经系统中的非重叠投射模式和选择性调控功能	研究仅限于小鼠模型，尚未在其他物种中验证	揭示交感神经系统中负责特定器官调控的神经回路组织	脊髓交感神经节前神经元（SPNs）及其在交感神经系统中的特定输出调控	神经科学	NA	单细胞转录组测序，病毒遗传工具包	NA	基因表达数据	小鼠
5326	2024-12-14	Unraveling pathogenesis and potential biomarkers for autism spectrum disorder associated with HIF1A pathway based on machine learning and experiment validation 2024-Dec-08, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2024.106763 PMID:39657846	研究论文	本文通过机器学习和实验验证，揭示了HIF1A通路在自闭症谱系障碍（ASD）中的病理机制及其潜在的生物标志物	首次通过机器学习识别出与HIF1A通路相关的ASD诊断标志物，并验证了IL-6/JUN/HIF1A通路在ASD发病机制中的作用	研究主要基于小鼠模型，结果的临床应用仍需进一步验证	探讨HIF1A通路在ASD中的病理机制及其潜在的生物标志物	自闭症谱系障碍（ASD）及其相关基因和通路	机器学习	自闭症谱系障碍	单细胞RNA测序、Western Blot、qPCR、免疫荧光	NA	基因表达数据	ASD小鼠模型及微胶质细胞BV-2细胞
5327	2024-12-14	Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes 2024-Dec, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.mucimm.2024.08.005 PMID:39147277	研究论文	研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，尽管存在不同的免疫环境，但发现了保守的B细胞动态	首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并发现尽管存在不同的免疫环境，B细胞动态在肠道位置间是保守的	研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches，未涉及其他物种或其他肠道区域	探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并研究其在不同肠道位置的保守性	猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞	免疫学	NA	单细胞和空间转录组学	NA	转录组数据	猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞
5328	2024-12-14	GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model 2024-Dec, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-024-01034-y PMID:39375485	研究论文	本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass，用于解析普遍的基因调控机制	GeneCompass通过整合四种先验生物学知识，在自监督学习中增强了基因调控机制的理解，并在多个下游任务中超越了现有模型	NA	解析跨物种的普遍基因调控机制，推动基础生命过程研究和临床应用	人类和小鼠的单细胞转录组数据	机器学习	NA	单细胞测序	基础模型	转录组数据	12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据
5329	2024-12-14	SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration 2024-Dec, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle DOI:10.1002/jcsm.13607 PMID:39381961	研究论文	本文研究了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长和再生过程中对卫星细胞稳态的维持作用	首次揭示了SRSF1在调节Fgfr1op2剪接中的关键作用，以及其对有丝分裂纺锤体组织和细胞衰老的影响	研究主要集中在新生小鼠的横膈膜和C2C12细胞系，可能无法完全代表所有骨骼肌的情况	探讨SRSF1缺失对卫星细胞功能和肌肉再生的影响机制	卫星细胞（SCs）及其在骨骼肌生长和再生中的作用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、免疫染色、EdU掺入实验	NA	RNA	新生小鼠横膈膜的单核细胞悬液（KO和对照组）、C2C12肌母细胞和原代肌母细胞
5330	2024-12-14	Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis 2024-Dec, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241271934 PMID:39382116	综述	本文综述了空间转录组学（ST）在口腔病理学中的应用，展示了其在不同颅面区域疾病发展中的研究进展	空间转录组学结合了全局基因表达和空间信息的分析，提供了传统转录组学方法所缺乏的空间分辨率，能够更好地研究疾病和健康组织状态中细胞区域的复杂相互关系	本文主要为综述性质，未提供具体的研究数据或实验结果	探讨空间转录组学在颅面区域疾病发展中的应用，并展示其在不同组织中的研究进展	颅面区域的组织，包括颅骨、腭、唾液腺、舌头、口腔底、口咽和牙周组织	数字病理学	NA	空间转录组学（ST）	NA	基因表达数据	NA
5331	2024-12-14	Electroacupuncture Slows Experimental Myopia Progression by Improving Retinal Mitochondrial Function: A Study Based on Single-Cell RNA Sequencing 2024-Dec, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400269 PMID:39404059	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序构建了晶状体诱导性近视和电针干预下的视网膜细胞图谱，并探讨了电针改善实验性近视进展的潜在机制	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了电针通过改善视网膜线粒体功能来减缓实验性近视进展的机制	研究仅在豚鼠模型上进行，结果的普适性有待进一步验证	探讨电针干预对实验性近视进展的影响及其潜在机制	晶状体诱导性近视和电针干预下的豚鼠视网膜细胞	NA	近视	单细胞RNA测序	NA	RNA	晶状体诱导性近视和电针干预下的豚鼠视网膜细胞
5332	2024-12-14	Insufficient Mechanical Loading Downregulates Piezo1 in Chondrocytes and Impairs Fracture Healing Through ApoE-Induced Senescence 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400502 PMID:39418070	研究论文	研究探讨了机械负荷不足对软骨细胞中Piezo1表达的影响及其在骨折愈合中的作用	首次揭示了Piezo1在软骨细胞中的表达下调通过ApoE诱导的衰老影响骨折愈合的机制，并开发了一种可注射的热敏水凝胶来缓解这一问题	研究主要集中在体外实验和动物模型上，尚未在人体中验证其有效性	探讨机械负荷不足如何通过Piezo1和ApoE影响骨折愈合	软骨细胞、骨折愈合过程	NA	骨折	单细胞测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
5333	2024-12-14	Quantum Dots-caused Retinal Degeneration in Zebrafish Regulated by Ferroptosis and Mitophagy in Retinal Pigment Epithelial Cells through Inhibiting Spliceosome 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202406343 PMID:39420512	研究论文	本研究探讨了典型金属量子点（InP/ZnS QDs）对斑马鱼视网膜的影响及其机制	首次揭示了InP/ZnS QDs通过抑制剪接体导致视网膜色素上皮细胞中的铁死亡和线粒体自噬，从而引起视网膜退化	研究仅在斑马鱼模型中进行，可能无法完全反映人类视网膜的反应	阐明典型金属量子点对视网膜的影响及其机制	斑马鱼视网膜及视网膜色素上皮细胞	NA	NA	单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9系统	NA	RNA	斑马鱼样本
5334	2024-12-14	Pericytes Modulate Third-Generation Tyrosine Kinase Inhibitor Sensitivity in EGFR-Mutated Lung Cancer Cells Through IL32-β5-Integrin Paracrine Signaling 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405130 PMID:39435643	研究论文	研究探讨了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号调节EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂敏感性的机制	首次揭示了周细胞通过IL32-β5-整合素旁分泌信号影响EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂的敏感性	研究主要基于细胞和动物实验，临床证据有限	探讨周细胞如何影响EGFR突变肺癌细胞对第三代酪氨酸激酶抑制剂的敏感性	EGFR突变肺癌细胞和周细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序，多重免疫染色	NA	RNA，蛋白质	来自EGFR突变患者的周细胞和肺癌细胞
5335	2024-12-14	Hepatocyte-Targeted Lipid Nanoparticle Delivery of HERC2 Plasmid Controls Drug-Induced Hepatotoxicity by Limiting β-Catenin-Regulated CYP2E1 Expression 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202401633 PMID:39440550	研究论文	研究探讨了HERC2在药物诱导的肝损伤中的保护作用，通过脂质纳米颗粒递送HERC2质粒，调控CYP2E1表达，减轻肝损伤	首次揭示了HERC2在药物代谢紊乱相关的急性肝损伤中的保护作用，并展示了脂质纳米颗粒递送HERC2质粒的治疗潜力	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨HERC2在药物诱导肝损伤中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力	HERC2在肝细胞中的表达及其对CYP2E1调控的影响	NA	肝损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA	APAP挑战的小鼠模型
5336	2024-12-14	The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice 2024-Dec, Molecular and cellular neurosciences DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976 PMID:39580061	研究论文	研究了成年雌性和雄性小鼠中甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta的mRNA表达谱	首次详细分析了甘氨酸受体亚基在不同脑区和脊髓中的表达模式，并比较了雌雄小鼠在特定脑区的表达差异	Glra4的表达水平过低，无法通过qRT-PCR检测到	探讨甘氨酸受体亚基在中枢神经系统中的表达模式及其在雌雄小鼠中的差异	甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达	NA	NA	单细胞RNA测序、定量实时PCR (qRT-PCR)、RNAscope	NA	mRNA表达数据	成年雌性和雄性小鼠
5337	2024-12-14	Investigating intra-tumoural heterogeneity and microenvironment diversity in primary cardiac angiosarcoma through single-cell RNA sequencing 2024-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70113 PMID:39658531	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境多样性	首次通过单细胞RNA测序揭示了原发性心脏血管肉瘤的复杂细胞景观和免疫微环境，并识别了潜在的分子治疗靶点	样本量较小，仅基于四个患者的肿瘤样本进行分析	揭示原发性心脏血管肉瘤的细胞异质性和肿瘤微环境，为开发新型疗法提供分子靶点	原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境	数字病理学	心脏肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	四个患者的肿瘤样本和五个正常心脏组织样本
5338	2024-12-14	Oxygen, angiogenesis, cancer and immune interplay in breast tumour microenvironment: a computational investigation 2024-Dec, Royal Society open science IF:2.9Q1 DOI:10.1098/rsos.240718 PMID:39665095	研究论文	本研究利用乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT）的数据，探讨了乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的相互作用	引入了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据估算乳腺癌微环境中免疫细胞比例的方法，并通过混合遗传算法（HGA）进行参数估计	NA	研究乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的复杂动态相互作用	乳腺癌微环境中的内皮细胞、氧气、血管内皮生长因子（VEGF）以及免疫细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	混合遗传算法（HGA）	单细胞RNA测序数据	乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT）
5339	2024-12-14	Single-cell transcriptomics: a new frontier in plant biotechnology research 2024-Nov-25, Plant cell reports IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s00299-024-03383-9 PMID:39585480	综述	本文综述了单细胞转录组技术在植物生物技术研究中的最新进展及其对植物发育理解的深远影响	单细胞转录组技术提供了前所未有的细胞分辨率，揭示了复杂的细胞过程和发育途径	单细胞转录组技术在植物研究中面临样本准备、细胞分离、数据复杂性和计算分析等挑战	探讨单细胞转录组技术在植物生物技术中的应用及其未来发展前景	植物细胞的基因表达、发育过程和环境响应	植物生物技术	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
5340	2024-12-14	Expression of Anoikis-Related Genes and Potential Biomarkers in Colon Cancer Based on RNA-seq and scRNA-seq 2024-Nov, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-024-04957-9 PMID:38727936	研究论文	本研究整合了结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据，评估了患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建了结肠癌风险模型	首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，评估了结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建了结肠癌风险模型	研究仅基于现有数据集，未进行体外或体内实验验证	通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，评估结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建结肠癌风险模型	结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据	数字病理学	结肠癌	RNA测序，单细胞RNA测序	NA	转录组数据，单细胞转录组数据	结肠癌样本