单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5301 - 5320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5301 | 2025-10-06 |
Elevated 5-HTR7 deteriorates dysregulated megakaryocytopoiesis in immune thrombocytopenic purpura via up-regulating the PKA/Orai1/ERK1/2 pathway
2025-Jun-19, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.287287
PMID:40534501
|
研究论文 | 本研究探讨了5-HTR7通过PKA/Orai1/ERK1/2通路影响免疫性血小板减少性紫癜中巨核细胞成熟障碍的机制 | 首次揭示5-HTR7在ITP发病机制中的具体作用，发现其通过PKA/Orai1/ERK轴抑制钙库操纵性钙内流从而损害巨核细胞成熟 | NA | 阐明5-HTR7在免疫性血小板减少性紫癜中影响巨核细胞成熟的分子机制 | ITP患者巨核细胞和小鼠ITP模型 | 血液病学 | 免疫性血小板减少性紫癜 | 流式细胞术, 免疫荧光, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 共聚焦显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞成像数据 | ITP患者和健康对照的巨核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5302 | 2025-10-06 |
WISP2/CCN5 revealed as a potential diagnostic biomarker for endometriosis based on machine learning and single-cell transcriptomic analysis
2025-Jun-19, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01631-z
PMID:40536575
|
研究论文 | 通过机器学习算法和单细胞转录组分析发现WISP2/CCN5可作为子宫内膜异位症的潜在诊断生物标志物 | 首次将机器学习与单细胞转录组分析相结合，识别出WISP2/CCN5作为子宫内膜异位症的诊断生物标志物，并揭示了其在病变进展中的表达变化规律 | 未提及样本量的具体数值和研究人群特征，需要进一步临床验证 | 寻找子宫内膜异位症的非侵入性诊断生物标志物 | 子宫内膜组织（正常、在位和异位内膜） | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | 单细胞转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5303 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome unveils mesenchymal cell diversity in endometriosis
2025-Jun-18, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf065
PMID:40302519
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示子宫内膜异位症中间充质细胞的多样性及其功能 | 首次构建子宫内膜异位症的单细胞图谱，鉴定出6个间充质细胞亚群并揭示其在疾病中的关键功能 | 样本量较小（仅6个卵巢组织），仅关注间充质细胞而未涉及其他细胞类型 | 探究子宫内膜异位症中间充质细胞的异质性及其在疾病发生中的作用机制 | 人类卵巢组织（3个子宫内膜异位症样本和3个正常卵巢样本） | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个卵巢组织（3个病变，3个正常） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5304 | 2025-10-06 |
Microglial pruning of glycinergic synapses disinhibits spinal PKCγ interneurons to drive pain hypersensitivity in mice
2025-Jun-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk8096
PMID:40531965
|
研究论文 | 本研究揭示脊髓小胶质细胞通过修剪抑制性突触导致PKCγ中间神经元去抑制，从而驱动神经病理性疼痛的机制 | 首次阐明小胶质细胞通过特异性修剪甘氨酸能突触导致脊髓PKCγ中间神经元去抑制，并鉴定出参与此过程的LXR/ApoE/C1q信号通路 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；机制研究主要聚焦于脊髓水平 | 探究脊髓小胶质细胞在神经病理性疼痛相关神经环路调控中的具体作用机制 | 小鼠脊髓小胶质细胞和PKCγ中间神经元 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序, 药理学干预, 光遗传学, 基因操作, 行为学测试, 共聚焦成像, 膜片钳记录 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 行为学数据, 影像数据 | 小鼠神经病理性疼痛模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5305 | 2025-10-06 |
Rescue of naïve porcine circovirus type 3 and its pathogenesis in CD pigs
2025-Jun-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00341-25
PMID:40353661
|
研究论文 | 本研究成功拯救了天然猪圆环病毒3型并揭示了其在剖腹产仔猪中的致病机制 | 首次通过透射电镜观察PCV3病毒颗粒，并阐明其在CD仔猪中的免疫抑制机制 | 研究仅使用剖腹产仔猪作为实验对象，未涉及自然感染情况 | 阐明天然PCV3病毒的致病机制和免疫抑制特性 | 猪圆环病毒3型(PCV3)和剖腹产仔猪 | NA | 猪圆环病毒感染 | 免疫荧光检测, 蛋白质印迹, 透射电镜, 单细胞RNA测序 | NA | 分子生物学数据, 组织病理学数据, 单细胞测序数据 | 剖腹产仔猪感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5306 | 2025-10-06 |
Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites
2025-Jun-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.02308-24
PMID:40366173
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了鳜鱼急性蛙病毒感染引发幽门盲肠浆膜炎并导致腹水的分子机制 | 首次在单细胞分辨率水平解析鳜鱼幽门盲肠对MRV感染的全局响应，发现病毒特异性感染免疫细胞和基质细胞并驱动细胞外基质形成 | 研究聚焦于急性感染阶段，未涉及慢性感染过程；物种特异性机制仍需进一步验证 | 探究鳜鱼急性蛙病毒感染引发严重腹水的病理机制 | 鳜鱼幽门盲肠组织及其细胞组成 | 单细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5307 | 2025-10-06 |
Unraveling the cross-talk between a highly virulent PEDV strain and the host via single-cell transcriptomic analysis
2025-Jun-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00555-25
PMID:40396761
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示高毒力PEDV毒株与宿主之间的相互作用机制 | 首次使用单细胞测序技术系统分析PEDV感染后宿主肠道细胞的组成变化、基因表达和细胞间通讯，并发现PEDV可在B和T淋巴细胞中启动复制 | 未明确说明样本数量的具体分配和实验设计的详细信息 | 研究PEDV与宿主的相互作用机制及其对疾病进程和组织再生的影响 | 猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染的仔猪空肠细胞 | 单细胞转录组学 | 猪流行性腹泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19,612个空肠细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5308 | 2025-10-06 |
ECT2+ cell group acts as cancer stem cell in malignant pleomorphic adenoma
2025-Jun-17, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00974-x
PMID:40523903
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了恶性多形性腺瘤中的癌症干细胞群ECT2+细胞 | 首次在恶性多形性腺瘤中鉴定出ECT2+细胞作为癌症干细胞，并证明其与肿瘤侵袭性和预后的关联 | NA | 探索恶性多形性腺瘤中癌症干细胞的特性及其临床意义 | 恶性多形性腺瘤肿瘤组织和细胞系 | 数字病理学 | 唾液腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5309 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics analysis of the healing process of ligament rupture
2025-Jun-17, Bone & joint research
IF:4.7Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了韧带断裂修复过程中的细胞组成和遗传特征 | 首次在韧带组织中明确区分了肌腱细胞和成纤维细胞，并发现了人类前交叉韧带组织中肌腱细胞的10种不同亚型 | 样本量较小（仅6例），时间点有限（仅三个时间点） | 研究韧带断裂修复和愈合过程中的细胞和遗传学特征 | 前交叉韧带组织（来自3名健康个体和3名韧带断裂患者） | 单细胞组学 | 韧带损伤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6例样本（3例健康，3例患者），83,195个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5310 | 2025-10-06 |
Single-cell dissection of prognostic architecture and immunotherap response in Helicobacter pylori infection-associated gastric cancer
2025-Jun-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.99337
PMID:40525824
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示幽门螺杆菌感染相关胃癌的细胞异质性及其对免疫治疗反应的影响 | 首次在单细胞水平系统解析HpGC的细胞组成异质性，发现iCAF与Angio-TAM的相互作用机制，并建立可预测免疫治疗疗效的分子标志 | 样本量有限（共24例），缺乏独立验证队列 | 解析幽门螺杆菌感染相关胃癌的细胞分子特征与免疫治疗反应机制 | 胃癌患者（当前感染/既往感染/未感染）和健康对照的胃组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24例样本（9例HpGC、3例ex-HpGC、6例non-HpGC、6例健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5311 | 2025-10-06 |
Single-Cell Expression Analysis of Ductal Carcinoma In Situ Identifies Complex Genotypic-Phenotypic Relationships Altering Epithelial Composition
2025-Jun-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3023
PMID:40101158
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺导管原位癌，揭示肿瘤内克隆异质性与细胞状态变化对基底膜完整性的影响 | 首次在单细胞水平揭示DCIS中克隆异质性与细胞状态分化的关系，发现基底膜完整性失衡是侵袭转化的关键机制 | 样本量有限，需要更大队列验证细胞状态比例与预后的关联 | 探究乳腺导管原位癌向浸润性乳腺癌转化的分子机制 | 乳腺导管原位癌病变组织与匹配的正常乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 系统发育分析 | 单细胞转录组数据 | DCIS病变和匹配正常组织的临床标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5312 | 2025-10-06 |
A multi-type programmed cell death gene signature predicts survival and reveals therapeutic targets in osteosarcoma
2025-Jun-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02944-y
PMID:40522389
|
研究论文 | 本研究通过整合多种程序性细胞死亡相关基因，构建了一个能够预测骨肉瘤患者生存期的预后模型 | 首次整合18种程序性细胞死亡类型相关基因，建立了四基因预后特征模型，并利用单细胞RNA测序技术验证基因在不同细胞类型中的表达 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 | 开发骨肉瘤预后预测模型并识别潜在治疗靶点 | 骨肉瘤患者 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 转录组分析，单细胞RNA-seq，LASSO回归，功能富集分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据，临床数据 | 来自GEO和TARGET数据库的骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5313 | 2025-10-06 |
Whole genome sequencing and single-cell transcriptomics identify KMT2D inactivation as a potential new driver for pituitary tumors: a case report
2025-Jun-16, BJC reports
DOI:10.1038/s44276-025-00155-0
PMID:40523964
|
病例报告 | 通过全基因组测序和单细胞转录组学识别KMT2D失活作为垂体肿瘤潜在新驱动因子的病例研究 | 首次发现组蛋白甲基转移酶KMT2D可能是垂体神经内分泌肿瘤的新驱动基因，并揭示了其与转移性癌症相似的分子特征 | 仅基于单个病例报告，需要更大样本量验证 | 探索垂体神经内分泌肿瘤的分子驱动机制 | 一名50多岁混合性生长激素-催乳素细胞瘤患者 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 1例垂体肿瘤患者样本 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5314 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of bulk and single-cell gene expression profiles to identify bone marrow mesenchymal cell heterogeneity and prognostic significance in multiple myeloma
2025-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06637-6
PMID:40524208
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk转录组数据分析多发性骨髓瘤中骨髓间充质细胞的异质性及其预后意义 | 首次发现并定义了表达高迁移率族蛋白的独特间充质干细胞亚群HMGhMSC，并基于此构建了预后模型 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探究多发性骨髓瘤中骨髓间充质细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 健康供体和多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，bulk转录组测序 | COX回归，LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用GSE4581和GSE136337数据集作为训练集和验证集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 5315 | 2025-10-06 |
Prognostic analysis of bladder cancer with neddylation-related genes
2025-Jun-16, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00463-y
PMID:40524221
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析鉴定膀胱癌中与neddylation相关的关键基因，并构建预后预测模型 | 首次系统分析neddylation相关基因在膀胱癌中的预后价值，识别出六个关键基因并构建具有良好诊断效能的预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多临床样本验证模型的普适性 | 探索neddylation在膀胱癌进展中的作用及其预后意义 | 膀胱癌患者基因表达数据和临床样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | WGCNA, LASSO回归, Cox回归分析, PPI网络分析, GSEA, 单细胞测序, RT-qPCR | 预后预测模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据库中的膀胱癌样本和临床验证样本 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 5316 | 2025-06-20 |
Spatial transcriptomics of Hirschsprung disease resection margins marks differential gene expression in myenteric plexus
2025-Jun-16, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.06.012
PMID:40532828
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5317 | 2025-10-06 |
Exploring the role of LFNG in hepatoblastoma using multiomics and raise a query in proof link
2025-Jun-09, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149604
PMID:40499700
|
研究论文 | 通过多组学分析探索LFNG在肝母细胞瘤中的作用机制 | 首次结合单细胞转录组数据揭示LFNG作为细胞间通讯靶点促进肝母细胞瘤发展的机制 | 研究样本量有限，仅基于两个公共数据集 | 识别肝母细胞瘤中异常表达的基因并探索影响肿瘤免疫微环境的细胞间通讯靶点 | 肝母细胞瘤组织和HUH6细胞系 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,差异表达分析,GO/KEGG富集分析,PPI网络构建,细胞迁移和侵袭实验 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 基于GSE133039和GSE180664两个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5318 | 2025-10-06 |
scMetaIntegrator: a meta-analysis approach to paired single-cell differential expression analysis
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657898
PMID:40501846
|
研究论文 | 提出一种用于配对单细胞RNA测序数据的元分析方法，解决传统差异表达分析的局限性 | 开发了首个考虑生物学重复和细胞变异性的配对单细胞RNA测序元分析方法 | 方法验证主要基于真实和合成数据集，需要更广泛的实验验证 | 改进配对单细胞RNA测序数据的差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 元分析模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5319 | 2025-10-06 |
Exosomal PKM2: A Noninvasive Diagnostic Marker Linking Macrophage Metabolic Reprogramming to Gastric Cancer Pathogenesis
2025-Jun, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70056
PMID:40126044
|
研究论文 | 本研究探讨血浆外泌体PKM2作为胃癌诊断标志物的潜力及其通过调控巨噬细胞代谢重编程促进胃癌发展的机制 | 首次发现血浆外泌体PKM2可作为胃癌早期诊断和预后评估的新型无创生物标志物，并阐明其通过抑制SCAP多聚泛素化激活SREBP1脂质合成通路促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化的新机制 | 样本量相对有限（216例），需要更大规模的多中心研究验证；机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验证实 | 探究外泌体PKM2在胃癌诊断中的价值及其在肿瘤微环境调控中的作用机制 | 胃癌患者和健康捐赠者的血浆样本、肿瘤相关巨噬细胞、胃癌细胞系 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序、Kaplan-Meier分析、免疫印迹、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、临床数据、蛋白质数据 | 216份血液样本（来自胃癌患者和健康捐赠者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5320 | 2025-10-06 |
Association of Obesity and Innate Immune Markers With Resistance to Biologic Therapy in Psoriasis
2025-Jun-01, JAMA dermatology
IF:11.5Q1
DOI:10.1001/jamadermatol.2025.0288
PMID:40172874
|
研究论文 | 本研究探讨肥胖和先天免疫标志物与银屑病患者对生物制剂治疗耐药性的关联 | 首次通过空间转录组学分析揭示表皮先天免疫信号和中性粒细胞活性增强是导致生物制剂治疗反应持续性下降的关键因素 | 横断面研究设计无法确定因果关系，样本量相对较小（87例患者） | 阐明影响严重银屑病患者持续治疗反应的炎症微环境因素 | 18岁及以上斑块型严重银屑病患者，PASI评分>10且体表面积>10 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学，免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 87例患者（24例女性，63例男性） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |