单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 5301 - 5320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5301 | 2025-01-05 |
Single-Cell Sequencing and Machine Learning Integration to Identify Candidate Biomarkers in Psoriasis: INSIG1
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S492875
PMID:39735895
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和机器学习整合，识别了银屑病中的候选生物标志物INSIG1，并验证了其治疗潜力 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法，识别了银屑病中新的候选基因INSIG1，并验证了其与T细胞的负相关性及其在脂肪酸代谢中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，仍需进一步的临床和体内实验验证 | 识别银屑病中的新治疗靶点和候选生物标志物 | 银屑病患者和T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | RNA测序数据 | NA |
| 5302 | 2025-01-05 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and prognostic markers of myeloid precursor cells in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494106
PMID:39737198
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和单细胞RNA测序数据，识别了与急性髓性白血病（AML）预后相关的关键基因，并建立了一个预后评估模型 | 识别了八个与AML预后显著相关的关键基因，并构建了一个有效的预后评估模型，揭示了AML细胞在免疫功能和代谢途径上的差异 | NA | 提高AML预后预测的准确性 | 急性髓性白血病（AML）患者 | 生物信息学 | 急性髓性白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预后评估模型 | RNA测序数据 | NA |
| 5303 | 2025-01-05 |
Identifying the NEAT1/miR-26b-5p/S100A2 axis as a regulator in Parkinson's disease based on the ferroptosis-related genes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0316179
PMID:39739972
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别了与帕金森病（PD）相关的铁死亡相关基因（FRGs），并构建了竞争性内源RNA（ceRNA）网络，以评估PD的发病机制 | 首次识别了NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴作为PD中铁死亡的调控机制，并构建了基于FRGs的诊断模型 | 研究样本量较小，且主要依赖于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 评估帕金森病的发病机制，特别是与铁死亡相关的基因调控网络 | 帕金森病患者的中脑黑质样本 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因集富集分析（GSEA）、一致性聚类分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习算法、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 97个中脑黑质样本 |
| 5304 | 2025-01-05 |
Unraveling Alzheimer's disease: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomic
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1515981
PMID:39741706
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综述 | 本文综述了单细胞测序和空间转录组学在阿尔茨海默病研究中的最新进展 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了阿尔茨海默病的细胞异质性和神经免疫机制，发现了与疾病相关的小胶质细胞亚群和基因表达变化 | 需要进一步整合其他组学数据以实现对阿尔茨海默病的全面理解 | 理解复杂的细胞相互作用，以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病的细胞异质性和神经免疫机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5305 | 2025-01-05 |
Single-Cell and Transcriptome Analysis of Periodontitis: Molecular Subtypes and Biomarkers Linked to Mitochondrial Dysfunction and Immunity
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S498739
PMID:39741754
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组数据分析，揭示了牙周炎中免疫反应与线粒体功能障碍之间的相互作用，并识别了新的分子亚型和生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序和转录组数据分析，识别了牙周炎的四种分子亚型，并发现了与线粒体功能障碍和免疫反应相关的生物标志物 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床样本中进行验证，以确认其普遍性和实用性 | 阐明线粒体功能障碍和免疫反应在牙周炎发病机制中的作用，识别分子亚型并发现诊断生物标志物，以支持精准医学方法 | 牙周炎患者 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析、qPCR、IHC | 机器学习算法 | RNA测序数据、临床样本数据 | 牙周炎患者的单细胞RNA测序和转录组数据 |
| 5306 | 2025-01-05 |
Breast pericytes: a newly identified driver of tumor cell proliferation
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1455484
PMID:39741968
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研究论文 | 本文通过新开发的FACS方法，成功识别并纯化了乳腺组织中的各种细胞类型，包括周细胞，并利用这些数据分析了肿瘤中细胞类型特异性基因表达，揭示了周细胞特异性基因与乳腺癌患者死亡率之间的强关联 | 首次成功识别并纯化乳腺组织中的周细胞，并发现周细胞在乳腺癌中的关键作用，特别是在促进肿瘤细胞增殖方面 | 周细胞的低丰度、固有异质性以及与其他细胞类型的共享标记表达使得识别和纯化周细胞具有挑战性 | 研究乳腺癌微环境中的关键因素，特别是周细胞在肿瘤细胞增殖中的作用 | 乳腺组织中的周细胞和乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | FACS, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5307 | 2025-01-05 |
Hidden features: CD36/SR-B2, a master regulator of macrophage phenotype/function through metabolism
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468957
PMID:39742252
|
review | 本文综述了CD36/Scavenger Receptor B2在巨噬细胞表型和功能中的核心作用，特别是在代谢调控方面 | 强调了CD36在巨噬细胞代谢表达谱中的关键作用，以及其在微环境变化下对巨噬细胞功能的重塑潜力 | 主要基于现有文献综述，缺乏新的实验数据支持 | 探讨CD36/Scavenger Receptor B2在巨噬细胞表型和功能调控中的作用 | 巨噬细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化、肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5308 | 2025-01-05 |
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468875
PMID:39742274
|
研究论文 | 本文通过机器学习方法筛选骨肉瘤中的免疫细胞标志物，构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 | 利用多算法计算框架和单细胞RNA测序数据，开发了基于肿瘤浸润免疫细胞（TIIC）的基因特征，并验证了CLK1作为潜在致癌基因的作用 | 研究样本量较小，仅包含11个骨肉瘤样本，且功能验证仅限于MG63和U2OS细胞系 | 提高骨肉瘤患者的预后预测能力，并探索肿瘤微环境中的关键基因 | 骨肉瘤患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、拷贝数变异（CNV）分析、免疫印迹 | 20种机器学习算法 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 11个骨肉瘤样本 |
| 5309 | 2025-01-05 |
Leveraging single-cell and multi-omics approaches to identify MTOR-centered deubiquitination signatures in esophageal cancer therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490623
PMID:39742278
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学方法，识别了食管癌治疗中以MTOR为中心的去泛素化特征 | 首次开发了基于14个去泛素化相关基因（DUBGs）的基因特征模型，用于预测食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的预后和免疫治疗反应，并验证了MTOR作为潜在治疗靶点 | 研究主要依赖于TCGA-ESCC和GSE53624数据集，样本来源可能有限，且需要进一步临床验证 | 探索去泛素化相关基因在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的作用，并开发预测模型以指导个性化治疗 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 癌症研究 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、Cox回归模型、细胞间通讯分析、基因本体富集分析、突变分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据、突变数据 | TCGA-ESCC和GSE53624数据集中的患者样本 |
| 5310 | 2025-01-05 |
FB5P-seq-mAbs: monoclonal antibody production from FB5P-seq libraries for integrative single-cell analysis of B cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1505971
PMID:39742275
|
研究论文 | 本文提出了一种整合FACS-based 5'-end单细胞RNA测序（FB5P-seq）和单克隆抗体克隆的方法，用于单B细胞的综合分析 | 该方法结合了单细胞RNA测序和单克隆抗体克隆，能够从单B细胞中获取转录组和抗原受体序列，并生产相应的单克隆抗体进行功能分析 | 需要从单B细胞中克隆抗体并进行功能分析，过程较为复杂 | 开发一种用于单B细胞综合分析的集成方法，以追踪B细胞在免疫反应中的激活和成熟 | B细胞 | 单细胞分析 | NA | FACS-based 5'-end单细胞RNA测序（FB5P-seq），单克隆抗体克隆 | NA | RNA-seq数据，抗体序列数据 | 卵清蛋白特异性小鼠生发中心B细胞 |
| 5311 | 2025-01-05 |
Development and validation of a programmed cell death index to predict the prognosis and drug sensitivity of gastric cancer
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1477363
PMID:39744132
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种基于程序性细胞死亡（PCD）的胃癌预后和药物敏感性预测指标 | 开发了一种新的十二基因标志物PCDI，用于预测胃癌患者的预后和药物敏感性，并建立了整合PCDI和临床特征的高性能列线图 | 研究依赖于公开的转录组数据和临床信息，可能受到数据质量和样本量的限制 | 开发一种基于PCD的胃癌预后和药物敏感性预测指标 | 胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 转录组数据分析 | LASSO回归分析 | 转录组数据和临床信息 | TCGA-STAD数据集以及GSE62254、GSE15459和GSE26901微阵列数据用于验证，GSE183904单细胞转录组数据用于分析 |
| 5312 | 2025-01-05 |
ABCA1 promote tumor environment heterogeneity via epithelial mesenchymal transition in Huh7 and HepG2 liver cancer cell
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1498528
PMID:39749197
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）中细胞通讯的内在机制，通过单细胞测序分析了恶性细胞亚群和癌症相关成纤维细胞（CAF）亚群，揭示了它们通过受体-配体相互作用的相互作用，并特别关注了SPP1 | 通过单细胞测序和湿实验室实验揭示了ABCA1在肝细胞癌中的促癌作用，并开发了基因风险评分模型来预测患者预后 | 研究主要基于Huh7和HepG2肝癌细胞系，可能无法完全代表所有肝细胞癌的异质性 | 探讨肝细胞癌中细胞通讯的内在机制及其对肿瘤微环境异质性的影响 | Huh7和HepG2肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 基因风险评分模型 | 单细胞数据 | Huh7和HepG2肝癌细胞系 |
| 5313 | 2025-01-05 |
Single-cell and spatiotemporal transcriptomic profiling of brain immune infiltration following Venezuelan equine encephalitis virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1497839
PMID:39749347
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在小鼠模型中全面分析了Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV)感染后脑部免疫细胞的转录组特征 | 揭示了VEEV感染后脑部免疫细胞的不同亚群及其独特的转录特征，包括一种表达I型干扰素的小胶质细胞亚群，以及髓系细胞和细胞毒性淋巴细胞的顺序浸润 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 阐明VEEV感染后脑部免疫反应的机制，特别是特定免疫细胞亚群的作用 | VEEV感染后的小鼠脑部免疫细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 5314 | 2025-01-04 |
CALB1 and RPL23 Are Essential for Maintaining Oocyte Quality and Function During Aging
2025-Jan-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14466
PMID:39748132
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和蛋白质组分析，揭示了小鼠卵母细胞衰老过程中钙离子稳态失调的关键机制，并鉴定了两个关键基因CALB1和RPL23 | 首次在单细胞分辨率下揭示了小鼠卵母细胞衰老的特定机制，并验证了CALB1和RPL23在维持卵母细胞质量和功能中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类卵母细胞中进行验证 | 探究卵母细胞衰老的分子机制及其对女性生育能力的影响 | 年轻和老年雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞转录组测序，蛋白质组分析 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据 | 年轻和老年雌性小鼠的卵母细胞 |
| 5315 | 2025-01-04 |
Single-cell RNA sequencing: an emerging tool revealing dysregulated innate and adaptive immune response at single cell level in Kawasaki disease
2025-Jan, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2401105
PMID:39230194
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示川崎病（KD）中失调的先天和适应性免疫反应中的关键作用 | 利用scRNA-seq技术，以比以往方法更高的分辨率揭示KD的病理生理学，特别是在免疫细胞转录组特征和信号/反应途径方面的应用 | 尽管scRNA-seq提供了高分辨率的细胞水平数据，但其在KD中的诊断、预后和治疗潜力仍需进一步研究验证 | 探讨scRNA-seq在KD中的诊断、预后和治疗潜力，并重新强调其在KD免疫细胞转录组特征和信号/反应途径中的关键作用 | 川崎病（KD）患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 5316 | 2025-01-04 |
Efficacy of CTLA-4 checkpoint therapy is dependent on IL-21 signaling to mediate cytotoxic reprogramming of PD-1+CD8+ T cells
2025-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02027-0
PMID:39702858
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研究论文 | 本文研究了抗PD-1和抗CTLA-4疗法在晚期黑色素瘤患者中的疗效机制，特别是IL-21信号在T细胞重编程中的作用 | 揭示了IL-21信号在抗CTLA-4疗法中的关键作用，并展示了与抗PD-1单药疗法的主要信号差异 | 研究主要基于晚期黑色素瘤患者，可能不适用于其他类型的癌症 | 探讨抗PD-1和抗CTLA-4疗法的疗效机制 | 晚期黑色素瘤患者的PD-1+CD8+ T细胞 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析、T细胞受体库分析 | NA | 基因表达数据、T细胞受体数据 | 晚期黑色素瘤患者的T细胞样本 |
| 5317 | 2025-01-04 |
Decreased miR-486-5p is involved in lipopolysaccharide-induced HTR-8/SVneo cell dysfunction by promoting SMAD2 expression
2025-Jan-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0502
PMID:39475824
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研究论文 | 本研究揭示了miR-486-5p/Smad2通路在脂多糖（LPS）诱导的绒毛外滋养层细胞（EVT）功能障碍及早期妊娠丢失（EPL）发病机制中的作用 | 首次揭示了miR-486-5p通过调控SMAD2表达在LPS诱导的EVT功能障碍及EPL中的具体分子机制 | 研究主要基于细胞模型，缺乏体内实验验证 | 探讨miR-486-5p在早期妊娠丢失中的作用及其分子机制 | HTR-8/SVneo细胞系及人类蜕膜单细胞RNA测序数据 | 分子生物学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | 细胞模型 | RNA测序数据 | 人类蜕膜单细胞RNA测序数据集及GEO数据库中的转录组数据集 |
| 5318 | 2025-01-04 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in the immune microenvironment of spinal cord injury]
2024-Dec, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:39750053
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示脊髓损伤后局部免疫微环境中的细胞异质性和复杂的细胞间相互作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在脊髓损伤免疫微环境中的应用，以更全面地理解脊髓损伤的病理生理过程 | 脊髓损伤后的局部免疫微环境 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5319 | 2025-01-04 |
Single-cell multi-omic and spatial profiling of human kidneys implicates the fibrotic microenvironment in kidney disease progression
2024-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01802-x
PMID:39048792
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学和空间分析技术，研究了人类肾脏在健康和疾病状态下的空间和分子特征，特别是纤维化微环境在肾脏疾病进展中的作用 | 结合单细胞、单核、空间RNA表达和单核开放染色质数据，首次全面绘制了人类肾脏的空间分子图谱，并揭示了纤维化微环境在疾病分类和预后中的临床价值 | 研究样本数量有限（81个），且主要关注糖尿病和高血压相关的肾脏疾病，可能无法完全代表其他类型的肾脏疾病 | 揭示肾脏健康和疾病状态下的空间和分子特征，特别是纤维化微环境的作用 | 人类肾脏样本（健康、糖尿病和高血压相关疾病） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞多组学、空间RNA表达（Visium、CosMx）、单核开放染色质分析 | NA | 单细胞RNA表达数据、空间RNA表达数据、单核开放染色质数据 | 81个样本（包括健康、糖尿病和高血压相关疾病的肾脏样本） |
| 5320 | 2025-01-04 |
Deciphering the heterogeneity of neutrophil cells within circulation and the lung cancer microenvironment pre- and post-operation
2024-02-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09850-z
PMID:38319415
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了非小细胞肺癌患者手术前后血液和肿瘤组织中的中性粒细胞亚群的分布，并开发了一种过表达率（OER）计算方法来评估中性粒细胞亚群的特异性 | 开发了过表达率（OER）计算方法，用于评估中性粒细胞亚群的特异性，并识别出具有潜在临床应用价值的基因组合 | 研究样本量有限，且仅针对非小细胞肺癌患者，未涵盖其他类型的癌症 | 评估非小细胞肺癌患者手术前后中性粒细胞亚群的分布及其特异性，以帮助诊断和预后评估 | 非小细胞肺癌患者手术前后的血液和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤和癌旁组织、手术前后血液样本 |