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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5281 | 2025-10-06 |
Spatially resolved transcriptomics reveal the determinants of primary resistance to immunotherapy in NSCLC with mature tertiary lymphoid structures
2025-Feb-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101934
PMID:39909044
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了非小细胞肺癌中成熟三级淋巴结构患者对免疫检查点抑制剂产生原发性耐药的关键决定因素 | 首次发现两种不同的癌症相关成纤维细胞亚型在mTLS阳性NSCLC中介导ICI原发性耐药,揭示了免疫抑制微环境的新机制 | 样本来源单一(仅来自BIP研究),需要更多独立队列验证研究结果 | 探究mTLS阳性非小细胞肺癌患者对免疫检查点抑制剂产生原发性耐药的决定因素 | 接受ICI治疗的509例非小细胞肺癌患者 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学,多重免疫荧光 | NA | 空间转录组数据,免疫荧光图像 | 509例非小细胞肺癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5282 | 2025-10-06 |
Copper Metabolism-Related Genes as Biomarkers in Colon Adenoma and Cancer
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S521512
PMID:40524750
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研究论文 | 通过生物信息学分析探讨铜代谢在结肠腺瘤进展为结直肠癌中的作用并识别潜在生物标志物 | 首次系统整合铜代谢相关基因与结肠腺瘤-癌进展过程的差异表达基因,结合多种机器学习算法识别生物标志物 | 需要进一步的临床验证 | 阐明铜代谢在结肠腺瘤向结直肠癌进展中的作用,识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 结肠腺瘤和结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,定量PCR | 五种机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的结肠腺瘤数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
5283 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals cellular differences and potential mechanisms in congenital pulmonary airway malformation
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1548177
PMID:40529122
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析先天性肺气道畸形(CPAM)与正常组织的细胞差异 | 首次应用单细胞测序技术系统揭示CPAM病变组织中的关键细胞类型差异和潜在分子机制 | 未明确说明样本数量和具体实验设计细节 | 探究先天性肺气道畸形的病理过程和细胞分子机制 | CPAM病变组织和正常肺组织 | 单细胞组学 | 先天性肺气道畸形 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5284 | 2025-10-06 |
Research advances in the study of traditional Chinese medicine formula granules on signaling pathway-mediated disease mechanisms
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1609211
PMID:40529488
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综述 | 系统综述中药配方颗粒通过信号通路调控疾病机制的研究进展与未来方向 | 整合多组学技术探索复方混合物的超分子协同效应,提出从单一成分分析向复杂系统研究的转变 | 当前研究存在单一成分分析、复方混合物协同机制不明确、转化应用临床证据不足等挑战 | 阐明中药配方颗粒通过信号通路介导的疾病调控机制,推动其在现代精准医疗中的应用 | 中药配方颗粒及其活性成分(如小檗碱、川芎嗪、姜黄素类似物等) | NA | 炎症、肿瘤、代谢紊乱、纤维化、骨关节炎、骨质疏松症、类风湿关节炎、急性肺损伤 | 代谢组学、空间转录组学、多组学技术 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5285 | 2025-10-06 |
Cancer-Derived Exosomal LINC01615 Induces M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages via RBMX-EZH2 Axis to Promote Colorectal Cancer Progression
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S499381
PMID:40529536
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌细胞通过外泌体传递LINC01615诱导肿瘤相关巨噬细胞M2极化的分子机制 | 首次发现外泌体LINC01615通过RBMX-EZH2轴调控巨噬细胞极化,揭示了肿瘤微环境中细胞间通讯的新机制 | 未明确LINC01615在其他癌症类型中的普适性,临床转化潜力需进一步验证 | 探究癌症来源外泌体lncRNA在肿瘤相关巨噬细胞M2极化中的作用机制 | 结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、外泌体 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, RNA免疫沉淀, 染色质免疫沉淀, Western blot, qRT-PCR | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5286 | 2025-10-06 |
Integrated machine learning and single-cell analysis reveal the prognostic and therapeutic potential of SUMOylation-related genes in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577781
PMID:40534859
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析,揭示了SUMOylation相关基因在卵巢癌中的预后和治疗潜力 | 首次将机器学习与单细胞RNA测序数据相结合,系统鉴定卵巢癌中SUMOylation相关基因的预后价值 | 研究样本量相对有限,需要在更大规模队列中验证 | 鉴定卵巢癌中SUMOylation相关基因作为预后生物标志物和治疗靶点 | 卵巢癌患者样本和ID8小鼠模型 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析 | 集成机器学习框架 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 213名卵巢癌患者样本和ID8小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5287 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts in clear cell renal cell carcinoma: functional heterogeneity, tumor microenvironment crosstalk, and therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1617968
PMID:40534854
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综述 | 本文系统阐述了透明细胞肾细胞癌中癌症相关成纤维细胞的功能异质性、与肿瘤微环境的相互作用及治疗机遇 | 首次系统整合CAF在ccRCC中的多功能作用机制,并提出通过单细胞测序和空间多组学技术破解'CAF-TME-耐药'恶性循环的新策略 | CAF异质性和双重功能角色阻碍临床转化,缺乏特异性生物标志物 | 探索CAF在ccRCC肿瘤微环境中的功能机制并开发针对性治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌中的癌症相关成纤维细胞及其肿瘤微环境 | 肿瘤微环境研究 | 肾细胞癌 | 单细胞测序, 空间多组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间多组学 | NA | NA |
5288 | 2025-10-06 |
Role of CD28+ PD-1+ Tc cells in immune response and prognosis prediction in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1576193
PMID:40534863
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨CD28+PD-1+ Tc细胞在肝细胞癌中的免疫应答作用和预后预测价值 | 首次建立肝细胞癌单细胞转录图谱,系统揭示CD28+PD-1+ Tc细胞的分子特征及其与预后的关联 | 样本量有限(仅10例HCC样本),需要更大规模研究验证 | 阐明CD28+PD-1+ Tc细胞在肝细胞癌中的预后意义和分子特征 | 肝细胞癌患者组织样本中的T细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 富集分析 | 轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 10例肝细胞癌样本及对应正常样本,共鉴定25,644个T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
5289 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomics and machine learning reveal REN as a dual regulator of tumor stemness and NK cell evasion in Wilms tumor progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612987
PMID:40534868
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和机器学习技术,揭示REN基因在Wilms肿瘤中同时调控肿瘤干性和NK细胞免疫逃逸的双重作用机制 | 首次发现REN基因在Wilms肿瘤中具有调控肿瘤干性和NK细胞免疫逃逸的双重功能,并开发了癌症干性预后指数(CSPI)用于患者风险分层 | 研究主要基于体外功能验证,缺乏体内动物模型验证;对T细胞功能影响有限 | 探索Wilms肿瘤中肿瘤干性和免疫逃逸的分子驱动机制 | Wilms肿瘤患者样本和肿瘤细胞 | 机器学习 | Wilms肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 分子对接模拟 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
5290 | 2025-10-06 |
Role of ADME genes in breast cancer prognosis: an analysis of risk scoring models based on multi-omics data
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1582862
PMID:40535120
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析构建了基于ADME基因的乳腺癌预后风险评分模型 | 首次将ADME基因与乳腺癌预后关联,并开发了整合临床参数的风险评分模型 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证 | 探索ADME基因在乳腺癌预后评估中的作用并开发预后模型 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组 | Cox回归, stepAIC | 基因表达数据 | TCGA-BRCA、METABRIC和GSE58812队列的患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
5291 | 2025-10-06 |
Current status, hotspots and frontiers of ion channel-related research in glioblastoma: a bibliometric analysis from 2005 to 2024
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1588598
PMID:40535121
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文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析2005-2024年胶质母细胞瘤离子通道研究领域的知识结构和研究热点 | 首次系统性地对胶质母细胞瘤离子通道研究领域进行文献计量分析,识别研究热点和前沿趋势 | 仅基于Web of Science数据库的文献,可能存在收录范围限制 | 探索胶质母细胞瘤离子通道研究领域的发展态势、知识结构和研究前沿 | 胶质母细胞瘤离子通道相关研究文献 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 998篇文献(764篇文章和234篇综述) | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
5292 | 2025-10-06 |
Identifying a prognostic signature for clear cell renal cell carcinoma: the convergence of single-cell and bulk sequencing with machine learning
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1560095
PMID:40535574
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据与机器学习方法,构建了一个用于预测透明细胞肾细胞癌预后的特征模型 | 开发了包含10种方法的整合机器学习流程构建共识特征模型,并首次将单细胞RNA测序分析与功能实验验证相结合 | 需要更多独立队列验证模型的普适性,功能实验仅限于细胞水平验证 | 构建能够预测透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗反应的机器学习特征模型 | 透明细胞肾细胞癌患者和肿瘤细胞 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, CCK-8检测 | 整合机器学习模型 | 基因表达数据 | 四个独立数据集的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
5293 | 2025-10-06 |
Revealing Potential Therapeutic Targets in Gastric Cancer through Inflammation and Protein-Protein Interaction Hub Networks
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.112218
PMID:40535808
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研究论文 | 通过炎症和蛋白质-蛋白质相互作用枢纽网络揭示胃癌潜在治疗靶点 | 发现SPP1-CD44配体-受体轴作为驱动肿瘤进展的新型炎症信号通路 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 识别胃癌的炎症相关生物标志物和治疗靶点 | 胃癌基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据 | 4个bulk RNA-seq数据集和2个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
5294 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Analysis of the Role of DSN1 in Pan-Cancer Prognosis and Immunotherapy
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.111585
PMID:40535813
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研究论文 | 通过多组学数据分析探讨DSN1基因在泛癌预后和免疫治疗中的作用 | 首次在泛癌层面系统分析DSN1的表达模式及其与预后、免疫特征和治疗反应的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证在不同癌种中的具体应用 | 探索DSN1在癌症发生发展及免疫治疗中的作用机制 | 多种癌症类型和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞测序, mRNA表达分析, 蛋白质表达分析, 基因集富集分析, DNA甲基化分析 | 生存分析模型, 相关性分析 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据, 临床预后数据 | 来自公共数据库的多种癌症样本数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
5295 | 2025-10-06 |
Circulating KLRG1+ long-lived effector memory T cells retain the flexibility to become tissue resident
2024-06-28, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj8356
PMID:38941479
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研究论文 | 本研究揭示KLRG1+长效效应记忆T细胞在继发感染时能进入非淋巴组织并建立组织驻留记忆 | 发现长效效应细胞虽不能分化为其他循环记忆亚群,但仍保留进入组织建立驻留记忆的灵活性 | 研究主要基于小鼠病毒感染模型,人类相关性需进一步验证 | 探究KLRG1+记忆T细胞在继发感染中的分化潜力和组织驻留能力 | 小鼠感染模型中的KLRG1+ CD8 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5296 | 2025-10-06 |
Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling
2024-Jun-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.011
PMID:38599212
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研究论文 | 本研究揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮细胞Norrin/β-catenin信号通路调控视网膜血管生成和血-视网膜屏障成熟的新机制 | 首次发现谷氨酸能神经元活动通过Norrin/β-catenin信号通路调控视网膜深层血管丛生成和血-视网膜屏障成熟 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类视网膜中验证 | 探究谷氨酸能神经元活动如何调控视网膜血管生成和血-视网膜屏障成熟 | 小鼠视网膜的神经元-血管相互作用 | 神经血管生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 体内遗传学研究, 功能验证 | 基因修饰小鼠模型(Vglut1和Gnat1) | 基因表达数据, 功能表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5297 | 2025-10-06 |
BOTH THE INFECTION STATUS AND INFLAMMATORY MICROENVIRONMENT INDUCE TRANSCRIPTIONAL REMODELING IN MACROPHAGES IN MURINE LEISHMANIAL LESIONS
2023-05-01, The Journal of parasitology
IF:1.0Q4
DOI:10.1645/22-94
PMID:37270767
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析皮肤利什曼病病灶中感染与未感染巨噬细胞的转录组差异 | 首次在体内模型中同时比较感染与非感染巨噬细胞的转录组特征,揭示寄生虫和炎症微环境对核糖体机制的独立影响 | 研究仅针对利什曼原虫感染模型,未验证其他病原体感染情况 | 探究寄生虫感染和炎症微环境对巨噬细胞转录重编程的独立贡献 | 利什曼原虫感染小鼠皮肤病灶中的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 皮肤利什曼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮肤病灶巨噬细胞(含感染组与未感染组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5298 | 2025-10-06 |
Predictive significance of MPT-driven necrosis-related genes signature in gastric cancer and their impact on the tumor microenvironment
2025-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03832-7
PMID:39690336
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研究论文 | 本研究探讨了MPT驱动坏死相关基因特征在胃癌中的预测意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次构建了基于MPT驱动坏死相关基因的胃癌预后风险模型,并揭示了该特征与肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应的关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 研究MPT驱动坏死相关基因在胃癌预后预测和肿瘤免疫微环境中的作用 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO回归,风险评分模型 | RNA测序数据,突变数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌样本 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
5299 | 2025-10-06 |
Circulating monocytes upregulate CD52 and sustain innate immune function in cirrhosis unless acute decompensation emerges
2025-Jul, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.031
PMID:39818234
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肝硬化患者循环单核细胞中CD52表达变化及其与先天免疫功能的关系 | 首次发现CD52在肝硬化单核细胞中的表达变化及其功能意义,提出CD52可作为免疫治疗新靶点 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证;样本量相对有限 | 解析肝硬化不同阶段循环单核细胞的异质性及CD52基因的功能作用 | 健康人群和肝硬化患者的循环单核细胞 | 单细胞生物学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 功能测定 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 健康对照和肝硬化患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5300 | 2025-10-06 |
The bone marrow NK-cell profile predicts MRD negativity in patients with multiple myeloma treated with daratumumab-based therapy
2025-Jun-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026455
PMID:40019438
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、流式细胞术和功能实验,探讨骨髓NK细胞特征对多发性骨髓瘤患者达雷妥尤单抗治疗后MRD阴性状态的预测价值 | 首次揭示诊断时骨髓CD16+ NK细胞比例与达雷妥尤单抗治疗后MRD阴性率的相关性,并证明这种预测作用具有治疗特异性 | 研究基于CASSIOPEIA临床试验队列,样本来源和治疗方案相对特定 | 评估骨髓NK细胞特征对多发性骨髓瘤免疫治疗疗效的预测作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学, 流式细胞术, 功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 功能实验数据 | CASSIOPEIA临床试验患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |