单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5281 - 5300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5281 | 2025-10-06 |
Identification of core genes in acute kidney injury: evidence from multi-omics human transcriptomic data and in vivo models
2025-May-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2024-677
PMID:40529024
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学人类转录组数据和体内实验验证，识别了急性肾损伤的核心基因 | 首次将人类多组学数据与小鼠模型验证相结合，识别出SUGCT作为与肾小管线粒体代谢和免疫平衡相关的新型AKI核心基因 | 样本量相对有限（67例AKI患者和20例对照），需要在更大队列中进一步验证 | 识别急性肾损伤的核心基因并探索其机制 | 急性肾损伤患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 转录组测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 | 列线图模型, WGCNA | 转录组数据, 基因表达数据 | 67例AKI患者和20例对照的人类样本，以及小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5282 | 2025-10-06 |
Development of a prognostic model for overall survival in neuroblastoma based on Schwann cell-specific genes, clinical predictors, and MYCN amplification
2025-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-2048
PMID:40530123
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研究论文 | 开发基于雪旺细胞特异性基因、临床预测因子和MYCN扩增的神经母细胞瘤总体生存预后模型 | 首次将肿瘤微环境中雪旺细胞特异性基因与临床因素和分子标志物整合构建神经母细胞瘤预后模型 | 样本量相对有限，训练集和测试集患者年龄分布存在差异 | 提高神经母细胞瘤总体生存预测准确性 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,Cox回归分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据,临床数据 | 训练集238例,测试集106例,单细胞数据16例患者(160,910个细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5283 | 2025-10-06 |
Tolerance and heteroresistance to echinocandins in Candida auris: conceptual issues, clinical implications, and outstanding questions
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00161-25
PMID:40237528
|
综述 | 探讨耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药现象及其临床意义 | 首次系统阐述耳念珠菌对棘白菌素的耐受性与异质性耐药概念差异及其临床关联 | 临床意义尚不明确，缺乏与治疗失败相关的数据支持 | 阐明耳念珠菌对棘白菌素的适应性耐药机制及其临床影响 | 耳念珠菌及其对棘白菌素的耐药表型 | 微生物耐药性研究 | 真菌感染 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5284 | 2025-10-06 |
3D organoids containing endothelial and neural cells generation by serial inductions of differentiation on human iPSC-derived embryoid bodies
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.653559
PMID:40475416
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研究论文 | 通过在人iPSC衍生的胚状体上连续诱导分化，生成包含内皮细胞和神经细胞的3D类器官 | 开发了同时包含神经细胞和内皮细胞的3D脑类器官模型，模拟体内神经和内皮细胞发育过程 | 未明确说明类器官的长期稳定性和功能成熟度 | 研究大脑发育和神经感染性疾病中内皮细胞与神经细胞的相互作用 | 人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的3D类器官 | 发育生物学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), RNA测序(RNA-Seq), 免疫染色, siRNA抑制 | 3D类器官模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5285 | 2025-10-06 |
Efficient profiling of total RNA in single cells with STORM-seq
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.03.14.484332
PMID:40475517
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研究论文 | 开发了一种名为STORM-seq的单细胞总RNA测序技术，能够高效分析单细胞中的非编码转录本和全长RNA | 提出了首个使用随机六聚体引物和核糖体RNA去除的单细胞总RNA测序方案，无需专业液体处理设备即可构建迄今为止复杂度最高的单细胞RNA测序文库 | 未明确说明技术验证的样本规模和适用范围 | 开发更准确、易用的单细胞总RNA测序技术以解决现有方法的局限性 | 单细胞中的总RNA，包括非编码转录本、转座子元件和增强子RNA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞总RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | STORM-seq | 基于随机六聚体引物的核糖体RNA去除单细胞总RNA测序方案 |
| 5286 | 2025-10-06 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
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研究论文 | 提出一种基于着色de Bruijn图的基因组序列变异识别方法 | 开发了名为klue的伪组装方法，能够将k-mer组装成与变异感知伪比对扩展兼容的序列 | NA | 识别基因组序列中的变异 | 小鼠黑色素瘤模型的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 着色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5287 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome atlas of spontaneous dry age-related macular degeneration in macaques
2025-May, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.02.028
PMID:40528953
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研究论文 | 构建了老年非人灵长类自发性干性年龄相关性黄斑变性的单细胞视网膜转录图谱 | 首次在非人灵长类模型中建立SD-AMD的单细胞转录图谱，揭示了铁死亡在疾病发病机制中的新作用 | 研究基于非人灵长类模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 阐明自发性干性年龄相关性黄斑变性的发病机制 | 老年非人灵长类（猕猴）的视网膜组织 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年猕猴视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5288 | 2025-10-06 |
Spatially resolved transcriptomics reveal the determinants of primary resistance to immunotherapy in NSCLC with mature tertiary lymphoid structures
2025-Feb-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101934
PMID:39909044
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了非小细胞肺癌中成熟三级淋巴结构患者对免疫检查点抑制剂产生原发性耐药的关键决定因素 | 首次发现两种不同的癌症相关成纤维细胞亚型在mTLS阳性NSCLC中介导ICI原发性耐药，揭示了免疫抑制微环境的新机制 | 样本来源单一（仅来自BIP研究），需要更多独立队列验证研究结果 | 探究mTLS阳性非小细胞肺癌患者对免疫检查点抑制剂产生原发性耐药的决定因素 | 接受ICI治疗的509例非小细胞肺癌患者 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学，多重免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 509例非小细胞肺癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5289 | 2025-10-06 |
Copper Metabolism-Related Genes as Biomarkers in Colon Adenoma and Cancer
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S521512
PMID:40524750
|
研究论文 | 通过生物信息学分析探讨铜代谢在结肠腺瘤进展为结直肠癌中的作用并识别潜在生物标志物 | 首次系统整合铜代谢相关基因与结肠腺瘤-癌进展过程的差异表达基因，结合多种机器学习算法识别生物标志物 | 需要进一步的临床验证 | 阐明铜代谢在结肠腺瘤向结直肠癌进展中的作用，识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 结肠腺瘤和结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，定量PCR | 五种机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的结肠腺瘤数据集 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5290 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals cellular differences and potential mechanisms in congenital pulmonary airway malformation
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1548177
PMID:40529122
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术分析先天性肺气道畸形(CPAM)与正常组织的细胞差异 | 首次应用单细胞测序技术系统揭示CPAM病变组织中的关键细胞类型差异和潜在分子机制 | 未明确说明样本数量和具体实验设计细节 | 探究先天性肺气道畸形的病理过程和细胞分子机制 | CPAM病变组织和正常肺组织 | 单细胞组学 | 先天性肺气道畸形 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5291 | 2025-10-06 |
Research advances in the study of traditional Chinese medicine formula granules on signaling pathway-mediated disease mechanisms
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1609211
PMID:40529488
|
综述 | 系统综述中药配方颗粒通过信号通路调控疾病机制的研究进展与未来方向 | 整合多组学技术探索复方混合物的超分子协同效应，提出从单一成分分析向复杂系统研究的转变 | 当前研究存在单一成分分析、复方混合物协同机制不明确、转化应用临床证据不足等挑战 | 阐明中药配方颗粒通过信号通路介导的疾病调控机制，推动其在现代精准医疗中的应用 | 中药配方颗粒及其活性成分（如小檗碱、川芎嗪、姜黄素类似物等） | NA | 炎症、肿瘤、代谢紊乱、纤维化、骨关节炎、骨质疏松症、类风湿关节炎、急性肺损伤 | 代谢组学、空间转录组学、多组学技术 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5292 | 2025-10-06 |
Cancer-Derived Exosomal LINC01615 Induces M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages via RBMX-EZH2 Axis to Promote Colorectal Cancer Progression
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S499381
PMID:40529536
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌细胞通过外泌体传递LINC01615诱导肿瘤相关巨噬细胞M2极化的分子机制 | 首次发现外泌体LINC01615通过RBMX-EZH2轴调控巨噬细胞极化，揭示了肿瘤微环境中细胞间通讯的新机制 | 未明确LINC01615在其他癌症类型中的普适性，临床转化潜力需进一步验证 | 探究癌症来源外泌体lncRNA在肿瘤相关巨噬细胞M2极化中的作用机制 | 结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、外泌体 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, RNA免疫沉淀, 染色质免疫沉淀, Western blot, qRT-PCR | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5293 | 2025-10-06 |
Integrated machine learning and single-cell analysis reveal the prognostic and therapeutic potential of SUMOylation-related genes in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577781
PMID:40534859
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析，揭示了SUMOylation相关基因在卵巢癌中的预后和治疗潜力 | 首次将机器学习与单细胞RNA测序数据相结合，系统鉴定卵巢癌中SUMOylation相关基因的预后价值 | 研究样本量相对有限，需要在更大规模队列中验证 | 鉴定卵巢癌中SUMOylation相关基因作为预后生物标志物和治疗靶点 | 卵巢癌患者样本和ID8小鼠模型 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，多组学数据分析 | 集成机器学习框架 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 213名卵巢癌患者样本和ID8小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5294 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts in clear cell renal cell carcinoma: functional heterogeneity, tumor microenvironment crosstalk, and therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1617968
PMID:40534854
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综述 | 本文系统阐述了透明细胞肾细胞癌中癌症相关成纤维细胞的功能异质性、与肿瘤微环境的相互作用及治疗机遇 | 首次系统整合CAF在ccRCC中的多功能作用机制，并提出通过单细胞测序和空间多组学技术破解'CAF-TME-耐药'恶性循环的新策略 | CAF异质性和双重功能角色阻碍临床转化，缺乏特异性生物标志物 | 探索CAF在ccRCC肿瘤微环境中的功能机制并开发针对性治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌中的癌症相关成纤维细胞及其肿瘤微环境 | 肿瘤微环境研究 | 肾细胞癌 | 单细胞测序, 空间多组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间多组学 | NA | NA |
| 5295 | 2025-10-06 |
Role of CD28+ PD-1+ Tc cells in immune response and prognosis prediction in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1576193
PMID:40534863
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨CD28+PD-1+ Tc细胞在肝细胞癌中的免疫应答作用和预后预测价值 | 首次建立肝细胞癌单细胞转录图谱，系统揭示CD28+PD-1+ Tc细胞的分子特征及其与预后的关联 | 样本量有限（仅10例HCC样本），需要更大规模研究验证 | 阐明CD28+PD-1+ Tc细胞在肝细胞癌中的预后意义和分子特征 | 肝细胞癌患者组织样本中的T细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 富集分析 | 轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 10例肝细胞癌样本及对应正常样本，共鉴定25,644个T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5296 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomics and machine learning reveal REN as a dual regulator of tumor stemness and NK cell evasion in Wilms tumor progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612987
PMID:40534868
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和机器学习技术，揭示REN基因在Wilms肿瘤中同时调控肿瘤干性和NK细胞免疫逃逸的双重作用机制 | 首次发现REN基因在Wilms肿瘤中具有调控肿瘤干性和NK细胞免疫逃逸的双重功能，并开发了癌症干性预后指数(CSPI)用于患者风险分层 | 研究主要基于体外功能验证，缺乏体内动物模型验证；对T细胞功能影响有限 | 探索Wilms肿瘤中肿瘤干性和免疫逃逸的分子驱动机制 | Wilms肿瘤患者样本和肿瘤细胞 | 机器学习 | Wilms肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 分子对接模拟 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5297 | 2025-10-06 |
Role of ADME genes in breast cancer prognosis: an analysis of risk scoring models based on multi-omics data
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1582862
PMID:40535120
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析构建了基于ADME基因的乳腺癌预后风险评分模型 | 首次将ADME基因与乳腺癌预后关联，并开发了整合临床参数的风险评分模型 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证 | 探索ADME基因在乳腺癌预后评估中的作用并开发预后模型 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组 | Cox回归, stepAIC | 基因表达数据 | TCGA-BRCA、METABRIC和GSE58812队列的患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5298 | 2025-10-06 |
Current status, hotspots and frontiers of ion channel-related research in glioblastoma: a bibliometric analysis from 2005 to 2024
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1588598
PMID:40535121
|
文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析2005-2024年胶质母细胞瘤离子通道研究领域的知识结构和研究热点 | 首次系统性地对胶质母细胞瘤离子通道研究领域进行文献计量分析，识别研究热点和前沿趋势 | 仅基于Web of Science数据库的文献，可能存在收录范围限制 | 探索胶质母细胞瘤离子通道研究领域的发展态势、知识结构和研究前沿 | 胶质母细胞瘤离子通道相关研究文献 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 998篇文献（764篇文章和234篇综述） | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 5299 | 2025-10-06 |
Identifying a prognostic signature for clear cell renal cell carcinoma: the convergence of single-cell and bulk sequencing with machine learning
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1560095
PMID:40535574
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据与机器学习方法，构建了一个用于预测透明细胞肾细胞癌预后的特征模型 | 开发了包含10种方法的整合机器学习流程构建共识特征模型，并首次将单细胞RNA测序分析与功能实验验证相结合 | 需要更多独立队列验证模型的普适性，功能实验仅限于细胞水平验证 | 构建能够预测透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗反应的机器学习特征模型 | 透明细胞肾细胞癌患者和肿瘤细胞 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, CCK-8检测 | 整合机器学习模型 | 基因表达数据 | 四个独立数据集的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5300 | 2025-10-06 |
Revealing Potential Therapeutic Targets in Gastric Cancer through Inflammation and Protein-Protein Interaction Hub Networks
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.112218
PMID:40535808
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研究论文 | 通过炎症和蛋白质-蛋白质相互作用枢纽网络揭示胃癌潜在治疗靶点 | 发现SPP1-CD44配体-受体轴作为驱动肿瘤进展的新型炎症信号通路 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 识别胃癌的炎症相关生物标志物和治疗靶点 | 胃癌基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据 | 4个bulk RNA-seq数据集和2个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |